АвторТема: дДНК из Восточной Европы  (Прочитано 5632 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн Fire

  • 100% child of stardust
  • Сообщений: 7564
  • Страна: gr
  • Рейтинг +613/-123
  • Y-dna G2a1a1a1a1a1b1 Z7947
Re: дДНК из Восточной Европы
« Ответ #15 : 04 Июнь 2017, 10:59:40 »
Вон оно что...живчики, однако. .. In addition, there is evidence that ancient pastoralists may have had healthier genomes than hunter-gatherers and agriculturalists. We also observed a temporal trend whereby genomes from the recent past are more likely to be healthier than genomes from the deep past. This calls into question the idea that modern lifestyles have caused genetic load to increase over time. Focusing on individual genomes, we find that the overall genomic health of the Altai Neandertal is worse than 97% of present day humans and that Otzi the Tyrolean Iceman had a genetic predisposition to gastrointestinal and cardiovascular diseases.
 http://www.biorxiv.org/content/early/2017/06/02/145193?%3Fcollection=
Рост цивилизаций всегда связывали с земледельческими культурами, а тут обратное.
образ жизни и еда влияют на гены, самые живучие были те кто в рационе имел морские (и речьные) продукты, самый худший у земледельцев у которых Углеводы и Глютен


Оффлайн Райзор

  • Сообщений: 131
  • Рейтинг +22/-7
Re: дДНК из Восточной Европы
« Ответ #16 : 04 Июнь 2017, 12:51:07 »
Глютен древних злаков не вреден для употребления. Как пример однозернянка, которую нашли у Отци. Глиадин в которой не токсичен для человека.
И земледельцы Неолита много охотились и рыбачили.
   

Оффлайн rozenblatt

  • Сообщений: 1131
  • Страна: kg
  • Рейтинг +1235/-0
  • Y-ДНК: C-F5481
  • мтДНК: M8a
Re: дДНК из Восточной Европы
« Ответ #17 : 10 Август 2017, 09:05:16 »
Вывесили тезисы конференции EAA 2017: http://www.eaa2017maastricht.nl/download2456

Оффлайн rozenblatt

  • Сообщений: 1131
  • Страна: kg
  • Рейтинг +1235/-0
  • Y-ДНК: C-F5481
  • мтДНК: M8a
Re: дДНК из Восточной Европы
« Ответ #18 : 10 Август 2017, 09:06:54 »
Два интересных тезиса:

НОВЫЕ ДАННЫЕ О ГЕНЕТИЧЕСКОМ ПРОИСХОЖДЕНИИ РАННИХ ВЕНГРОВ (8-10 в. н. э.), И ИХ СРАВНЕНИЕ С АРХЕОЛОГИЧЕСКИМИ, ЛИНГВИСТИЧЕСКИМИ И ИСТОРИЧЕСКИМИ ИСТОЧНИКАМИ

Существуют различные научные теории о происхождении ранних венгров и их миграции из Северной и Центральной Азии в Центральной Европе в 8-9-м веках. Исторические и археологические источники свидетельствуют о смешанном этническом составе венгерских завоевателей, прибывших в Паннонскую равнину в 895 г. н.э., с этническими группами присоединившимися по пути на запад из Уральского региона через Среднее Поволжье (пройдя через Хазарский каганат) и восточно-европейскую степь. Лингвистические исследования поддерживают финно-угорское происхождение венгерского языка, который является единственным уральским языком в Центральной Европе. Тем не менее, есть некоторые свидетельства влияния тюркоязычных групп на венгерский язык, что доказывается древнеюрскими заимствованиями в раннем слое венгерского языка, тюркским происхождением личных имён племенных вождей периода завоевания и некоторыми топонимами. Тем не менее, точный источник, маршрут и хронология миграции из Уральского региона в Паннонскую равнину до сих пор неясны и интенсивно обсуждаются историками, лингвистами и археологами.

Исходя из этого, целью наших исследований (финансируемых грантом OTKA 106369) было подойти к этим различным точкам зрения с археогенетическими методами. Мы исследовали средневековые (8-11 в.) популяции Паннонской равнины и Уральского региона, территории которых были археологически связаны друг с другом и с ранними венграми, обнаруженными в степи. Изученные могильники были раскопаны с восточной стороны Центрального Урала (Уелги), а также с его западной стороны (Бояново, Бартым и Сухой Лог). Мы проанализировали 34 полных митохондриальных генома с использованием метода захвата приманки и секвенирования Illumina и сравнили наши результаты с доступными наборами митохондрий у древних и современных венгров. Наши результаты свидетельствуют о довольно однородном характере исследуемых популяций с различиями в пропорции азиатских линий. Однако они частично соответствуют азиатским гаплотипам в наборе древних венгров, предполагая генетические связи изучаемых популяций.

Оффлайн rozenblatt

  • Сообщений: 1131
  • Страна: kg
  • Рейтинг +1235/-0
  • Y-ДНК: C-F5481
  • мтДНК: M8a
Re: дДНК из Восточной Европы
« Ответ #19 : 10 Август 2017, 09:07:16 »
ПЕРСПЕКТИВЫ АРХЕОГЕНЕТИЧЕСКОЕ ИССЛЕДОВАНИЯ ДЛЯ ИСТОРИЧЕСКОЙ ИДЕНТИФИКАЦИИ. ПРОБНОЕ ИССЛЕДОВАНИЕ.

Целью данного исследования было разработать протокол для извлечения генетического материала и подготовки образцов дДНК для секвенирования следующего поколения, а также программного конвейера для анализа и интерпретации данных, которые могут быть использованы для определения исторического происхождения человека.

Материалом для исследования были зубы из черепов, найденных при раскопках захоронений, датируемых началом XVII века под Радонежем. Важным фактором, определяющим выбор из этих артефактов были условия захоронения, характерные для Центральной России. Опыт работы с этими останками может стать основой для работы с другими образцами из этого важного исторического региона. Историческое значение Радонежа связано с тем, что это было бывшее новгородское поселение, откуда может происходить современное русское население Московской области(?). Подробное генотипирование археологических останков позволяет определить их идентификацию, т. е. определить генетическую связь между жителями Радонежа XVI-XVII веков и их современниками из других регионов России.

Подготовка образца проводилась в специально разработанном блоке, позволяющем минимизировать внутрилабораторное загрязнение, библиотечную подготовку проводили с модифицированными адаптерами, что не допускало образования переходных димерных структур. Последовательность была выполнена с использованием Illumina MiSeq.

Около 22% фрагментов идентифицированных нашими программными средствами относятся к организмам из рода Streptomyces и Bradyrhizobium, которые являются почвенными бактериями. Среди отдельных видов наибольший охват (~ 9% идентифицированных фрагментов) относятся к Ralstonia solanacearum, далее Homo sapiens (~ 5%). Было обнаружено, что только 1,5% сырых прочтений были выровнены по человеческому эталонному геному, но они были отображены на каждую из ядерных хромосом, а также на последовательность мтДНК человека.

Секвенирование отрицательного контрольного образца показало отсутствие загрязнения на стадии пробоподготовки.

Гугление по поводу второй работы дало такие результаты:

http://journals.tsu.ru/rusin/&journal_page=archive&id=1561&article_id=34878

Первые результаты определения Y-хромосомной гаплогруппы для Средневекового захоронения XVI-XVII вв. в Радонеже (Московская область) | Русин. 2017. № 1 (47). DOI: 10.17223/18572685/47/9

Представлен первый результат определения Y-ДНК гаплогруппы из средневекового русского захоронения в окрестностях города Радонеж. Захоронение относится к XVI-XVII вв., периоду Русского царства и Смутного времени. Приводятся описание захоронения, метод генотипирования и результат. Для извлеченного ДНК выявлена гаплогруппа R1a1, типичная для славянского населения России.

Оффлайн Kambic

  • Сообщений: 489
  • Страна: ru
  • Рейтинг +219/-15
  • Y-ДНК: r1b
Re: дДНК из Восточной Европы
« Ответ #20 : 31 Октябрь 2017, 12:44:27 »
http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/oa.2633/abstract
За шо хлопцi?

"Раньше я был людиною, а теперь я - бродячая собака. Нема, хвоста - нема."
"Вы мою жинку штыками закололи, да и в хате сожгли. А я вашего часового каменюкою пристукнул" http://www.kino-teatr.ru/kino/acter/m/sov/4925/foto/i5/30449/

Оффлайн Kambic

  • Сообщений: 489
  • Страна: ru
  • Рейтинг +219/-15
  • Y-ДНК: r1b
Re: дДНК из Восточной Европы
« Ответ #21 : 09 Ноябрь 2017, 21:14:05 »
In our project, we focus on dynamics of human population structure in Eastern Europe during the last four thousand years. We have extracted DNA from 14 teeth representing two temporal layers of today's Belarus territory. One sample belongs to the Bronze Age Corded Ware culture, whereas 13 are from Middle Age (11-13 cc AD) Slavic and Baltic ethnic contexts. Paired-end libraries for all samples were sequenced with Illumina NextSeq500 with the average genome coverage of ~0.3x. Variant calling was done using ANGSD (doHaploCall command) using the list of SNPs from the aDNA data set in Lazaridis et al., 2016. For the initial investigation of the newly generated aDNA sequences we have performed PCA, projecting aDNA samples on the PC, calculated from the modern human variation from Central-East Europe. We also have determined mtDNA haplogroups for all our samples using mtDNA-Server and haplogrep online tools.
To tackle the questions of genetic continuity/discontinuity and the possible reasons thereof (e.g. signals of recent selection) in East Europe during the time period of our interest, we are going to apply allele frequency-based analyses (PCA, ADMIXTURE, f3-statisctics etc) to our low-coverage genomes, available samples from Medieval Central-Eastern Europe and of Bronze Age samples from West Eurasia, as well as today's populations. For the genomes of high coverage, we are planning to run haplotype-based analyses.

Оффлайн Srkz

  • Сообщений: 5328
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2075/-2
  • Y-ДНК: N1c L1025*
  • мтДНК: U4a1e-pre T16093C T16311T
Re: дДНК из Восточной Европы
« Ответ #22 : 10 Ноябрь 2017, 05:34:35 »
In our project, we focus on dynamics of human population structure in Eastern Europe during the last four thousand years. We have extracted DNA from 14 teeth representing two temporal layers of today's Belarus territory. One sample belongs to the Bronze Age Corded Ware culture, whereas 13 are from Middle Age (11-13 cc AD) Slavic and Baltic ethnic contexts.
А где же источник цитаты :)

Оффлайн rozenblatt

  • Сообщений: 1131
  • Страна: kg
  • Рейтинг +1235/-0
  • Y-ДНК: C-F5481
  • мтДНК: M8a
Re: дДНК из Восточной Европы
« Ответ #23 : 10 Ноябрь 2017, 05:57:50 »
In our project, we focus on dynamics of human population structure in Eastern Europe during the last four thousand years. We have extracted DNA from 14 teeth representing two temporal layers of today's Belarus territory. One sample belongs to the Bronze Age Corded Ware culture, whereas 13 are from Middle Age (11-13 cc AD) Slavic and Baltic ethnic contexts.
А где же источник цитаты :)

Это из сборника тезисов конференции Human Evolution 2017 conference (Cambridge, UK, November 20-22).

Оффлайн rozenblatt

  • Сообщений: 1131
  • Страна: kg
  • Рейтинг +1235/-0
  • Y-ДНК: C-F5481
  • мтДНК: M8a
Re: дДНК из Восточной Европы
« Ответ #24 : 10 Март 2018, 09:25:21 »
С учётом новых статей, теперь карта дДНК из Восточной Европы так выглядит:



Но всё равно большая дыра, охватывающая Беларусь и среднюю полосу России, пока в ней только палеолитические Костёнки, Сунгирь и владимиро-суздалец.

Оффлайн Asmat headhunter

  • Биохимическая субстанция
  • Сообщений: 9805
  • Страна: id
  • Рейтинг +511/-34
  • И того казака те тунгусы пальмами тут искололи
Re: дДНК из Восточной Европы
« Ответ #25 : 10 Март 2018, 09:51:22 »
А что, жижицких товарищей выкинули? ???

Оффлайн rozenblatt

  • Сообщений: 1131
  • Страна: kg
  • Рейтинг +1235/-0
  • Y-ДНК: C-F5481
  • мтДНК: M8a
Re: дДНК из Восточной Европы
« Ответ #26 : 10 Март 2018, 10:07:57 »
А что, жижицких товарищей выкинули? ???

Кого? Этих?  Е. М. Чекунова, Н. В. Ярцева, М. К. Чекунов, А. Н. Мазуркевич. «Первые результаты генотипирования коренных жителей и человеческих костных останков из археологических памятников Верхнего Подвинья». С. 287-294. Таблица на с. 294. // Археология озёрных поселений IV—II тыс. до н. э.: хронология культур и природно-климатические ритмы. — СПб.: ООО «Периферия», 2014.

Так там данные нормально не опубликованы, и есть у меня подозрение что там контаминация сплошная.

Оффлайн zastrug

  • ...
  • Сообщений: 10138
  • Страна: tt
  • Рейтинг +1559/-45
  • I2b1c (P78+)=I2a2a1b1a
  • Y-ДНК: I2b1c
  • мтДНК: T2a1a
Re: дДНК из Восточной Европы
« Ответ #27 : 10 Март 2018, 15:12:58 »
С учётом новых статей, теперь карта дДНК из Восточной Европы так выглядит:
Но всё равно большая дыра, охватывающая Беларусь и среднюю полосу России, пока в ней только палеолитические Костёнки, Сунгирь и владимиро-суздалец.
Ну как бы все что нужно знать о работе отечественных лабораторий.

Оффлайн Srkz

  • Сообщений: 5328
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2075/-2
  • Y-ДНК: N1c L1025*
  • мтДНК: U4a1e-pre T16093C T16311T
Re: дДНК из Восточной Европы
« Ответ #28 : 10 Март 2018, 16:29:21 »
С учётом новых статей, теперь карта дДНК из Восточной Европы так выглядит:
Но всё равно большая дыра, охватывающая Беларусь и среднюю полосу России, пока в ней только палеолитические Костёнки, Сунгирь и владимиро-суздалец.
Ну как бы все что нужно знать о работе отечественных лабораторий.
Вот я тоже грешу, что и сами не делают, и иностранцам не дают >:(

Оффлайн zastrug

  • ...
  • Сообщений: 10138
  • Страна: tt
  • Рейтинг +1559/-45
  • I2b1c (P78+)=I2a2a1b1a
  • Y-ДНК: I2b1c
  • мтДНК: T2a1a
Re: дДНК из Восточной Европы
« Ответ #29 : 10 Март 2018, 17:48:51 »

Вот я тоже грешу, что и сами не делают, и иностранцам не дают >:(
А еще у Балановских есть мерзкая привычка долгими годами сидеть на результатах, ну чтоб как хороший  хаукарль вылежались..
Сейчас конечно придут адвокаты и расскажут об объективных трудностях...Я все понимаю, но нельзя так - мариновать уже чуть не десятилетиями некоторые темы. Жизнь человеческая не бесконечна, а знать хочется....при том что это не фантастические мечты. а кто-то уже который год сидит на результатах..

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.


Rambler's Top100