Итого:
1. Мы видим уже нам знакомых Василия Фёдорова (тестя Александра Алексеева) и Марию Тимофееву (тёщу Александра Алексеева - восприемницу дочери Александра Глафиры).
2. Александр Алексеев назван в обеих Метриках Васильевым. Как думается, это произошло по ошибке, связанной с именем его тестя.
3. Главное! При крещении Августы, старшей дочери Александра Алексеева, восприемницей указана "д. Мартынова временнообязанная крестьянская девица Марья Алексеева".
Исходя из третьего пункта, получается, что скорее всего Марья Алексеева - это сестра Александра Алексеева.
Выходит, что Александр Алексеевич [Волков] - примак (т.е. пришлый), вероятно, происходит из д. Мартыново Троицкого Кубенского прихода, и, похоже, что там следует искать его корни, т.к. были просмотрены документы за 1858-1859 гг. Крестовоздвиженской Закубенской церкви, но его не обнаружили ни в одной из деревней этого прихода.
Итак, из деревни Перхурьево нить моего поиска предков по Y хромосоме теперь ведёт скорее всего в деревню Мартыново той же Кубенской волости Вологодского уезда Вологодской губернии, только поближе к волостному селу Кубенскому, раз эта деревня относилась к приходу Троицкого храма самого села Кубенского.
К сожалению, деревню Мартыново мне пока что на карте найти не удалось.