Вадим, я правильно понимаю, что чем больше сантиМорган, тем меньше вероятность рекомбинации этого участка, а значит и надёжнее значение УПСа.
Я полагаю, что в данном случае, скорее наоборот. Чем больше сантиМорган между участками генов на гомологичной хромосоме, тем больше вероятность перемешивания или перекреста (кроссинговер), который вносит "возмущения" в картину неравновесного сцепленного наследования генов и признаков. Напомню, что под последним понимается неслучайное распределение частот аллелей разных локусов, которое может быть обусловлен
о не только тесным генетическим сцеплением генов, (близким расположением генов на хромосоме), но и наличием
адаптивного преимущества конкретной комбинации аллелей, частота которой соответственно возрастает в сравнении с
частотой, ожидаемой при случайном распределении.В чем же состоит практической значение оценки кроссиговера (который есть частный случай рекомбинации) например для молекулярной генеалогии? По мнению профессора МакМилана, в оценке количества снипов приходящихся на один сантиморган (одну единицу генетического расстояния, прямо пропорциональную проценту кроссоверинга).Если посмотреть его таблицы, то очевидно, что он активно использует эту оценку для вычисления степени родства (каким образом, мне пока еще не доконца ясно), т.е он делит
число снипов на идентичном сегменте хромосомы на величину сантиморгана данного участка, получая тем самым некое число cнипов. Но что это может означать и что из этого следует, я пока не понял.