АвторТема: Whole Genome Test (15x) от YSEQ  (Прочитано 3265 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн Шад

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 5997
  • Страна: ru
  • Рейтинг +943/-4
  • Ex oriente lux
  • Y-ДНК: Q1b1a
  • мтДНК: J1c2
Re: Whole Genome Test (15x) от YSEQ
« Ответ #15 : 13 Июль 2017, 10:57:51 »
А как STR из него выходит? Лучше или хуже чем с BigY? Есть прецеденты?

Оффлайн Mich Glitch

  • Genus regis
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 30834
  • Страна: ca
  • Рейтинг +2275/-38
  • Y-ДНК: J2b1
  • мтДНК: H6a1a5
Re: Whole Genome Test (15x) от YSEQ
« Ответ #16 : 13 Июль 2017, 20:03:38 »
А как STR из него выходит? Лучше или хуже чем с BigY? Есть прецеденты?

Присоединяюсь к вопросу.
Хотелось бы посмотреть на панель 111. Чтобы использовать для оценки качества. А то х15, х30, х50 - всё это слишком абстрактно.
Другое дело посмотреть сколько процентов из 111 маркеров прочлось.

*** Если хоть один сэмпл у ИгрекФулл имеется, то для обеспечения приватности было бы достаточно сказать, сколько маркеров из 111 прочлось / не прочлось. Будем сравнивать с примерно 10 невычитанными процентами от БигИгрек.

Онлайн Oleg V.

  • Сообщений: 686
  • Страна: ru
  • Рейтинг +124/-0
  • Y-ДНК: R1a-Z92>YP569
  • мтДНК: ?
Re: Whole Genome Test (15x) от YSEQ
« Ответ #17 : 06 Ноябрь 2017, 14:34:49 »
Появилась статистика из YFull для WGS 50x от YSEQ (только для Y-хромосомы):

ChrY BAM file size:   0.67 Gb   
Reads (all):   9558654   
Mapped reads:   9541476 (99.82%)   
Unmapped reads:   17178 (0.18%)   
Length coverage:   25592634 bp (99.76%)   
Min depth coverage:   1X   
Max depth coverage:   8039X   
Mean depth coverage:   40.12X   
Median depth coverage:   20X   
Length coverage for age:   8462241 bp   
No call:   60932 bp   

Правда, пока не ясно, что с STR-маркерами.

Оффлайн Semargl

  • "El sueño de la razón produce monstruos" ©
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 5006
  • Страна: hr
  • Рейтинг +2213/-5
  • www.semargl.me
    • www.semargl.me
  • Y-ДНК: R1a [CTS3402+]
  • мтДНК: U4a2g
Re: Whole Genome Test (15x) от YSEQ
« Ответ #18 : 19 Декабрь 2017, 10:35:44 »
Special Price for 30x WGS: $1199 (until Jan. 18th 2018)
YSEQ has new NGS Provider in GERMANY

Оффлайн Semargl

  • "El sueño de la razón produce monstruos" ©
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 5006
  • Страна: hr
  • Рейтинг +2213/-5
  • www.semargl.me
    • www.semargl.me
  • Y-ДНК: R1a [CTS3402+]
  • мтДНК: U4a2g
Re: Whole Genome Test (15x) от YSEQ
« Ответ #19 : 30 Январь 2018, 14:45:47 »
YSEQ последними своими тестами бьет рекорды.
WGS (похоже на 30x)
Определилось 110 STR из 111-ти или 560 из 587-ми!

Оффлайн Centurion

  • 100% Earth (Solar System) genofond
  • Администратор
  • *****
  • Сообщений: 10121
  • Страна: ru
  • Рейтинг +563/-2
Re: Whole Genome Test (15x) от YSEQ
« Ответ #20 : 30 Январь 2018, 15:18:54 »
YSEQ последними своими тестами бьет рекорды.
WGS (похоже на 30x)
Определилось 110 STR из 111-ти или 560 из 587-ми!
пока единичный случай, будем наблюдать :)

Оффлайн Шад

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 5997
  • Страна: ru
  • Рейтинг +943/-4
  • Ex oriente lux
  • Y-ДНК: Q1b1a
  • мтДНК: J1c2
Re: Whole Genome Test (15x) от YSEQ
« Ответ #21 : 30 Январь 2018, 19:09:39 »
Special Price for 30x WGS: $1199 (until Jan. 18th 2018)
YSEQ has new NGS Provider in GERMANY

А есть сервисы, которые обеспечивают адекватную медицинскую интерпретацию полученной информации?
Для  15x WGS ($740) сделана оговорка:
Цитировать
The YSEQ analysis does not contain any medical relevant information since the purpose is genealogy. But of course health related information is contained in the raw data and can be extracted from a third-party expert. When ordering this test, you'll need to sign a written consent form stating that you understand the medical implications and the risks associated with decoding this information. You'll need to indemnify YSEQ from any responsibility associated with health information encoded in your raw data. A 15x coverage is not sufficient for extracting reliable health information from the raw data files![/quote]

30х обеспечивает, но как?

Оффлайн Mich Glitch

  • Genus regis
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 30834
  • Страна: ca
  • Рейтинг +2275/-38
  • Y-ДНК: J2b1
  • мтДНК: H6a1a5
Re: Whole Genome Test (15x) от YSEQ
« Ответ #22 : 30 Март 2018, 19:04:32 »
YSEQ последними своими тестами бьет рекорды.
WGS (похоже на 30x)
Определилось 110 STR из 111-ти или 560 из 587-ми!
пока единичный случай, будем наблюдать :)

Роман
,

Интересует Ваше мнение эксперта.
Что лучше, 30Х от YSEQ, или 30Х от Dante Labs?

Оффлайн Mich Glitch

  • Genus regis
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 30834
  • Страна: ca
  • Рейтинг +2275/-38
  • Y-ДНК: J2b1
  • мтДНК: H6a1a5
Re: Whole Genome Test (15x) от YSEQ
« Ответ #23 : 30 Март 2018, 19:06:38 »
То есть, YSEQ почти в два раза дороже. Быстрее отработка. 4 скребка вместо плёвки.
Предполагается, что и по качеству он должен быть лучше.
Так ли это?

Оффлайн Mich Glitch

  • Genus regis
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 30834
  • Страна: ca
  • Рейтинг +2275/-38
  • Y-ДНК: J2b1
  • мтДНК: H6a1a5
Re: Whole Genome Test (15x) от YSEQ
« Ответ #24 : 30 Март 2018, 19:23:32 »
2360 долларов, ежли по максимуму у YSEQ. Кхе-кхе. Не проглотить.     :-X

Оффлайн TK

  • Сообщений: 167
  • Страна: ru
  • Рейтинг +79/-0
Re: Whole Genome Test (15x) от YSEQ
« Ответ #25 : 30 Март 2018, 19:35:26 »
2360 долларов, ежли по максимуму у YSEQ. Кхе-кхе. Не проглотить.     :-X
За эти деньги можно посмотреть в сторону Long Read у FGC. На антрогенике приводится многообещающая статистика по качеству у него.

Оффлайн Mich Glitch

  • Genus regis
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 30834
  • Страна: ca
  • Рейтинг +2275/-38
  • Y-ДНК: J2b1
  • мтДНК: H6a1a5
Re: Whole Genome Test (15x) от YSEQ
« Ответ #26 : 30 Март 2018, 19:49:46 »
Психологически не готов ни к чему, что превышает 1000 долларов.
Сейчас у меня наметился важный кандидат. Гербо-шляхетный, пересекающийся с рюриковичами, то есть, со всеми.    ;D

По его троюродному брату (также как и новичок, мой семиюродный дядя) уже сделаны 111 маркеров + ФФ. Жду результаты БигИгрека. Затем ИгрекФулл.

Непонятки с ВАМ файлами и желание получить максимум по аутосомам, заставляет изменить ФТДНА.
Вот и думаю, чтобы сварганить.    :)

Оффлайн Semargl

  • "El sueño de la razón produce monstruos" ©
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 5006
  • Страна: hr
  • Рейтинг +2213/-5
  • www.semargl.me
    • www.semargl.me
  • Y-ДНК: R1a [CTS3402+]
  • мтДНК: U4a2g
Re: Whole Genome Test (15x) от YSEQ
« Ответ #27 : 10 Апрель 2018, 08:21:00 »
YSEQ последними своими тестами бьет рекорды.
WGS (похоже на 30x)
Определилось 110 STR из 111-ти или 560 из 587-ми!
пока единичный случай, будем наблюдать :)

Роман
,

Интересует Ваше мнение эксперта.
Что лучше, 30Х от YSEQ, или 30Х от Dante Labs?
Без сомнения - YSEQ. Они продолжают бить свои же рекорды по качеству. Один жирный минус - ценник :)

Оффлайн Mich Glitch

  • Genus regis
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 30834
  • Страна: ca
  • Рейтинг +2275/-38
  • Y-ДНК: J2b1
  • мтДНК: H6a1a5
Re: Whole Genome Test (15x) от YSEQ
« Ответ #28 : 10 Апрель 2018, 08:29:31 »
Один жирный минус - ценник :)

Как будет хороша скидка - закажу один штука.    :)

Оффлайн vladich

  • Сообщений: 18
  • Рейтинг +8/-0
Re: Whole Genome Test (15x) от YSEQ
« Ответ #29 : 19 Июнь 2018, 06:14:33 »
2360 долларов, ежли по максимуму у YSEQ. Кхе-кхе. Не проглотить.     :-X

Вроде $1430 сейчас за 50x

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.


Rambler's Top100