АвторТема: Что за аутосомные маркеры такие, CCR5 и D9S919???  (Прочитано 2264 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн AlexanderKАвтор темы

  • Сообщений: 1971
  • Страна: ru
  • Рейтинг +347/-1
  • Y-ДНК: J1-PF7257
  • мтДНК: H11a1
А то FTDNA их продает, а что они означают и зачем нужны - не пишут! :(

Оффлайн пенелопа

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 5675
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1814/-12
  • мтДНК: H1b

Оффлайн AlexanderKАвтор темы

  • Сообщений: 1971
  • Страна: ru
  • Рейтинг +347/-1
  • Y-ДНК: J1-PF7257
  • мтДНК: H11a1
Re: Что за аутосомные маркеры такие, CCR5 и D9S919???
« Ответ #2 : 03 Декабрь 2016, 09:51:43 »
CCR5: https://en.wikipedia.org/wiki/CCR5
Тут обсуждалось: http://forum.molgen.org/index.php/topic,702.0.html
SNPedia в помощь.  :)
Тема: http://forum.molgen.org/index.php/topic,2501.0.html

Я прочитал конечно что CCR5 определяет невосприимчивость к СПИДу, бубонной чуме и нильской лихорадке.  Пытаюсь понять что означает мой  конкретный результат::
CCR5  normal- normal
Первое значение, "normal-", это "нормальный с минусом"? Или это через тире написано нормальный-нормальный (хотя после дефиса стоит пробел)? И "нормальный" означает что я, как все нормальные люди, помру от означенных заболеваний?

С D9S919 еще непонятнее. У меня результат: 16- 17   Смысл этих значений я нигде не нашел, в SNPedia про D9S919 ничего нет. Где-то попалось какие значения этого маркера у американских индейцев но у меня другие :)   Но хоть что-то эти цифры означают?

Оффлайн gecube_ru

  • Сообщений: 1005
  • Страна: ru
  • Рейтинг +165/-0
  • Незнайка на Луне
  • Y-ДНК: I-A6397 -> I-FGC79161
  • мтДНК: V7a1?
Re: Что за аутосомные маркеры такие, CCR5 и D9S919???
« Ответ #3 : 18 Декабрь 2016, 02:14:24 »
Мое мнение.

Цитировать
Первое значение, "normal-", это "нормальный с минусом"? Или это через тире написано нормальный-нормальный (хотя после дефиса стоит пробел)? И "нормальный" означает что я, как все нормальные люди, помру от означенных заболеваний?
Да, получается, что именно так. Нормальное состояние - отсутствие резистентности к указанным болякам.
Цитировать
С D9S919 еще непонятнее. У меня результат: 16- 17   Смысл этих значений я нигде не нашел, в SNPedia про D9S919 ничего нет. Где-то попалось какие значения этого маркера у американских индейцев но у меня другие :)   Но хоть что-то эти цифры означают?
STR - это некие повторяемые участки кода. Получается 16- означает, что 16 повторений (промах). Т.е. у Вас - 17 повторений, что и написано.

Оффлайн gecube_ru

  • Сообщений: 1005
  • Страна: ru
  • Рейтинг +165/-0
  • Незнайка на Луне
  • Y-ДНК: I-A6397 -> I-FGC79161
  • мтДНК: V7a1?
Re: Что за аутосомные маркеры такие, CCR5 и D9S919???
« Ответ #4 : 18 Декабрь 2016, 12:52:56 »
p.s. по-моему тестирование на эти маркеры - выкинутые деньги...  ::) ::) ::)

Оффлайн AlexanderKАвтор темы

  • Сообщений: 1971
  • Страна: ru
  • Рейтинг +347/-1
  • Y-ДНК: J1-PF7257
  • мтДНК: H11a1
Re: Что за аутосомные маркеры такие, CCR5 и D9S919???
« Ответ #5 : 19 Декабрь 2016, 06:08:19 »
STR - это некие повторяемые участки кода. Получается 16- означает, что 16 повторений (промах). Т.е. у Вас - 17 повторений, что и написано.

Это аутосомы. И судя по форуму FTDNA у кого-то результат 14-17, у кого-то 16-19. Но там никто не может ничего объяснить а сотрудники FTDNA как рыбы об лед. Надо будет как-нибудь их саппорт загрузить!  :)

Оффлайн gecube_ru

  • Сообщений: 1005
  • Страна: ru
  • Рейтинг +165/-0
  • Незнайка на Луне
  • Y-ДНК: I-A6397 -> I-FGC79161
  • мтДНК: V7a1?
Re: Что за аутосомные маркеры такие, CCR5 и D9S919???
« Ответ #6 : 19 Декабрь 2016, 17:17:03 »
AlexanderK, а Вы серьезно думаете, что STR только на Y бывает?  :( Мне кажется, что такие цепочки можно найти в любой хромосоме. Повторюсь, что указанное число и есть кол-во повторений триплетов(?)

Оффлайн I2a1a

  • ...
  • Сообщений: 10999
  • Страна: ee
  • Рейтинг +755/-8
Re: Что за аутосомные маркеры такие, CCR5 и D9S919???
« Ответ #7 : 19 Декабрь 2016, 20:33:05 »

Я прочитал конечно что CCR5 определяет невосприимчивость к СПИДу, бубонной чуме и нильской лихорадке.  Пытаюсь понять что означает мой  конкретный результат::
CCR5  normal- normal
Первое значение, "normal-", это "нормальный с минусом"? Или это через тире написано нормальный-нормальный (хотя после дефиса стоит пробел)? И "нормальный" означает что я, как все нормальные люди, помру от означенных заболеваний?

Это мутация CCR5-Δ32, не снип и STR, а совсем другой тип мутации - делеция

Цитировать
[/CCR5-Δ32 представляет собой делецию 32 пар оснований, приводящую к нарушению адгезивных свойств кодируемого ею белка CCR5 Т-клеток. Предполагается, что эта мутация возникла примерно две с половиной тысячи лет назад и со временем распространилась в Европе[3].

Делеция части гена CCR5 приводит к невозможности присоединения вируса иммунодефицита человека (ВИЧ) к Т-клетке. В гетерозиготном состоянии эта мутация сильно уменьшает шанс инфицирования клетки ВИЧ, в гомозиготном, по-видимому, приводит к полной невозможности такого инфицирования[2]. Распространение мутации в Европе, особенно в Северной, может быть связана со средневековыми пандемиями «Чёрной смерти», так как эта мутация повышает сопротивляемость организма чумной палочке[4].

Norm-norm означает то, что у Вас в обеих копиях гена CCR5 этой делеции нет.

Оффлайн gecube_ru

  • Сообщений: 1005
  • Страна: ru
  • Рейтинг +165/-0
  • Незнайка на Луне
  • Y-ДНК: I-A6397 -> I-FGC79161
  • мтДНК: V7a1?
Re: Что за аутосомные маркеры такие, CCR5 и D9S919???
« Ответ #8 : 19 Декабрь 2016, 22:27:08 »
Спасибо! Понятно. Правильно ли, что т.к. это не SNP, то требуется доп.тестирование для определения этой мутации?

Оффлайн FELIX

  • Сообщений: 2526
  • Страна: ru
  • Рейтинг +761/-3
  • Y-ДНК: R-YP569
  • мтДНК: U5a1a1b
Re: Что за аутосомные маркеры такие, CCR5 и D9S919???
« Ответ #9 : 30 Январь 2017, 00:16:11 »
Наверное не в тему, но другой не нашёл.

Вопрос такой: где можно протестировать аутосомные маркеры?
Нужен эконом вариант, на одного человека, без всяких "юридических" заключений.

Оффлайн Mich Glitch

  • Genus regis
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 34632
  • Страна: ca
  • Рейтинг +2956/-47
  • Y-ДНК: J2b1
  • мтДНК: H6a1a5a
Re: Что за аутосомные маркеры такие, CCR5 и D9S919???
« Ответ #10 : 30 Январь 2017, 02:44:14 »
Наверное не в тему, но другой не нашёл.

Вопрос такой: где можно протестировать аутосомные маркеры?
Нужен эконом вариант, на одного человека, без всяких "юридических" заключений.

Речь полагаю о аутосомных СТР маркерах?

Тогда прямая дорога в http://www.dnatribes.com .

Фирма проверена. Протестировал там полдесятка человек.    :)

Оффлайн FELIX

  • Сообщений: 2526
  • Страна: ru
  • Рейтинг +761/-3
  • Y-ДНК: R-YP569
  • мтДНК: U5a1a1b
Re: Что за аутосомные маркеры такие, CCR5 и D9S919???
« Ответ #11 : 30 Январь 2017, 04:51:09 »
Спасибо большое! Сейчас глянем)))

Цитировать
Тогда прямая дорога в http://www.dnatribes.com .

Работают только с США и Канадой? В этом варианте придётся искать варианты пересылки  :(

Оффлайн Mich Glitch

  • Genus regis
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 34632
  • Страна: ca
  • Рейтинг +2956/-47
  • Y-ДНК: J2b1
  • мтДНК: H6a1a5a
Re: Что за аутосомные маркеры такие, CCR5 и D9S919???
« Ответ #12 : 30 Январь 2017, 05:20:56 »
Работают только с США и Канадой?

Честно сказать, не знаю.


В этом варианте придётся искать варианты пересылки  :(

Шипито наверняка подойдёт.    :)

Оффлайн Mich Glitch

  • Genus regis
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 34632
  • Страна: ca
  • Рейтинг +2956/-47
  • Y-ДНК: J2b1
  • мтДНК: H6a1a5a
Re: Что за аутосомные маркеры такие, CCR5 и D9S919???
« Ответ #13 : 30 Январь 2017, 05:24:02 »
Вот мои маркеры для примера:



Оффлайн FELIX

  • Сообщений: 2526
  • Страна: ru
  • Рейтинг +761/-3
  • Y-ДНК: R-YP569
  • мтДНК: U5a1a1b
Re: Что за аутосомные маркеры такие, CCR5 и D9S919???
« Ответ #14 : 30 Январь 2017, 06:29:08 »
Да, еще на родстве публиковалось  ;D

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.


Rambler's Top100