АвторТема: Найди меня! (Ищем родичей из списка Relative Finder от 23andMe.)  (Прочитано 33972 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн Sergey Lutak

  • Сообщений: 1024
  • Страна: 00
  • Рейтинг +62/-0
  • Carpatho-Rusyn-E1b1b1a1b1a and East.Galindian-H1b*
  • Y-ДНК: E1b1b1a1b1a10 (L142.1+, L539+, L542+, L544+, L618+, L930+, M78+, V13+, V36+, FGC11451+, CTS1489-, L17-, L99-, L143-, L241-, L250-, L540-, P65-, V12-, V22-, V27-, FGC11450-)
  • мтДНК: H1b* (16189C, 16356C, 16519C, 263G, 315.1C)
В http://tr.im/yguys и http://tr.im/mitoguys
Появятся новые имена - добавляйте.
Уже добавил (троих E1b1b1a2*)... :)

Оффлайн Alesh

  • Сообщений: 932
  • Рейтинг +80/-1
Сравнил своих совпаденцев, все имеют общие сегменты, но по разному, установить родство по линиям (м\ж) пока затруднительно.
Нет ли какого-то проекта или  программы (доступной для не специалистов) помогающих выявить семейные связи между совпаденцами?
 ???

Оффлайн Mich GlitchАвтор темы

  • Genus regis
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 34668
  • Страна: ca
  • Рейтинг +2966/-47
  • Y-ДНК: J2b1
  • мтДНК: H6a1a5a
Global similarity хорошо для выявления родового ареала для тех людей у кого предки (мужская и женская линии) не намешаны последних лет 150-200. Так же работает при совсем близком родстве, начиная братьев с двоюродных.
А вот предков в пределах поколений 13-ти ищем только по УПСам. При этом, у Вас может быть хороший УПС (т.е. общий предок) с каким-нибудь нигерийцем, а похожесть при этом быть процентов 69.

Оффлайн Mich GlitchАвтор темы

  • Genus regis
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 34668
  • Страна: ca
  • Рейтинг +2966/-47
  • Y-ДНК: J2b1
  • мтДНК: H6a1a5a
nmash, при желании у Лары можно видеть адыгские корни. (В качестве гипотезы из имеющихся у нас предпосылок.)
То есть мухаджирство (изгнание коренных народов в результате Кавказской войны первой половины 19 века) шло через Турцию (где многие и осели). В Иорданию-Сирию-Ливан.
Учитывая то, что у Лары возможно всего намешанно в плане национальностей, высокий процент общей похожести может выскочить только при самом близком родстве. Начиная братьев с двоюродно-троюродных.

По поводу мито-гаплогрупп Вам не раз говорил, да, Вы как-то не очень слушаете. Отсыл идёт на полтысячи лет вглубь. Минимум! У нас уже есть совпаденцы по FGS не имеющие предков на 350-400 летнем интервале. Оставьте это на дальнее потом, когда разберётесь с ближайшим родственным окружением. Если конечно жанр исторических реконструкций для Вас не является ближе, чем генеалогия.

Основное - это УПСы и релфайндер. А тут по любому пока (!!!) кисло. Мало как протестированных русских, так и представителей народов Северного Кавказа.

Оффлайн Alesh

  • Сообщений: 932
  • Рейтинг +80/-1
А вот предков в пределах поколений 13-ти ищем только по УПСам.

Михаил и я о том же…
Попробовал списаться с совпаденцами по УПСам, найти возможные генеалогические перекрёстки. Результата не получил, голова кругом идёт, у всех предки из общего региона но фамилии разные за последние 300-400 лет. Поэтому и спрашивал, нет ли кроме релфайндера  более тонкой программы для вычисления хотя бы как минимум вероятности линий м или ж.

Оффлайн Alesh

  • Сообщений: 932
  • Рейтинг +80/-1
Что говорят нам эти цифры? Только математическое общие генетические – генеалогические  данные? Можно ли каким то образом по ним  ориентироваться в плане генеалогии, с какой либо предсказуемостью линий и возраста отдаления общего предка?
Какая реальная  польза от знания этих данных?

Comparison
Half IBD 11 cM
# segments 1

Comparison
Half IBD  18 cM
# segments 2

Comparison
Half IBD  21 cM
# segments 3
 ???

Оффлайн I2a1a

  • ...
  • Сообщений: 10999
  • Страна: ee
  • Рейтинг +755/-8
Что говорят нам эти цифры? Только математическое общие генетические – генеалогические  данные? Можно ли каким то образом по ним  ориентироваться в плане генеалогии, с какой либо предсказуемостью линий и возраста отдаления общего предка?
Какая реальная  польза от знания этих данных?

Comparison
Half IBD 11 cM
# segments 1

Comparison
Half IBD  18 cM
# segments 2

Comparison
Half IBD  21 cM
# segments 3
 ???

Если подходить к анализу этих данных объективно, то должен заметить, что на самом деле единственное, что мы можем достоверно определить на основе этих данных  - это наличие совпадающих у двух лиц участков хромомсомы и генетическое "дистанцию" этих участков (т.е. вероятность кроссоверинга (хромосомного перекреста, рекомбинации) в процентах. Чем короче "расстояние" (меньше сантиморган), тем вероятнее неравновесное сцепление, т.е неслучайная комбинация-сцепление генетических признаков.
Тут важно различать 2 понятия длина HIR (Half IBD)-участка и генетическая дистанция (которая выражается в сантоморганах).
Вообще выражение генетическая дистанция не очень удачный, в том смысле, что он сразу ассоциируется в мышлении с топологической размерности (в теминах генетической карты сцепления генов, так он и есть), хотя на самом деле - имеется ввиду процентная вероятность рекомбинации участка хромосомы/гена.
Совершенно очевидно, что чем длинее  совпадащий участок и чем больше таких длинных участков - тем генетически ближе являются сравниваемые индивиды. Однако эмпирическим (опытным) образом  было доказано, что одни участки хромомсомы рекомбинирует быстро, другие -медленее, третьи -характеризуются высокой степенью сцепления генов.  Поэтому, рассуждая об этих участках, необходимо помнить о наличии генетической дистанции между ассоциированными генами, выраженной в вероятности рекомбинации (процентное отношение). То есть, совпадающий фрагмент у тестантов на гомологичной хромосоме может быть и  длинным, но при этом приходится на участок с большой вероятностью случайной рекомбинации (большим сантоморганом). Например, при расстоянии/вероятности в 21 сантоморгана, cуществуют вероятность 21% недетерминированной родством рекомбинации биаллелей.

Теперь о генеалогической трактовке. На самом деле, я не видел еще ни одной работы, где бы ставился вопрос  не только о  методлогии, но хотя бы самой возможности вычисления общего предка тестантов по аутосомным и X-хромосомным снипам. Михаил вот считает, что нужно исходить из положения, что в случае, если 23andme не показывает у сравнимых индивидов хотя бы минимального количества сегментов, то пороговая точка схождения генетических линий (по одной или нескольким из всех возможных генетических линий)  к общему предку -13 поколений. Какова вероятность или %-поправка к этому пороговому значению, мне не совсем ясно.
Я в этой оценке сомневаюсь, но и предложить в качестве альтернативы пока ничего не могу.

Это, конечно, весьма упрощенная схема, но она вполне соответствует духу и букве учения  Томаса Моргана о наследственности.

Оффлайн napobo3

  • Сообщений: 1336
  • Страна: il
  • Рейтинг +337/-2
  • קַח-נָא אֶת-בִּנְךָ אֶת-יְחִידְךָ אֲשֶׁר-אָהַבְתָּ, אֶת-יִצְחָק
  • Y-ДНК: J-FGC5231
  • мтДНК: N1b2
Законтачьтесь с  Michael Schepak'ом, у него дедушка был россиянин.

Оффлайн Аббат Бузони

  • ...
  • Сообщений: 19607
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1481/-56
  • Y-ДНК: I1a2a1a3a1a1a-YP1084+
  • мтДНК: H16
Вот мой список, с кем посоветуйте зашарится?


Оффлайн napobo3

  • Сообщений: 1336
  • Страна: il
  • Рейтинг +337/-2
  • קַח-נָא אֶת-בִּנְךָ אֶת-יְחִידְךָ אֲשֶׁר-אָהַבְתָּ, אֶת-יִצְחָק
  • Y-ДНК: J-FGC5231
  • мтДНК: N1b2
Вот мой список, с кем посоветуйте зашарится?


Законтачивайтесь прямо по списку http://tr.im/23Russia - добавляйте туда новые имена и гг.
Доступно для редактирования.

Оффлайн wertner

  • ...
  • Сообщений: 1404
  • Страна: ru
  • Рейтинг +321/-0
    • YFull
  • Y-ДНК: E-V13->E-S2972->E-Z16661
  • мтДНК: U4a (xU4a3)
Спасибо за подсказку,  Вадим.
А как именно (через какой поисковик сайта) искать по гаплогруппе?
В http://tr.im/yguys и http://tr.im/mitoguys
Появятся новые имена - добавляйте.
А почему в http://tr.im/mitoguys два похожих списка?

Оффлайн napobo3

  • Сообщений: 1336
  • Страна: il
  • Рейтинг +337/-2
  • קַח-נָא אֶת-בִּנְךָ אֶת-יְחִידְךָ אֲשֶׁר-אָהַבְתָּ, אֶת-יִצְחָק
  • Y-ДНК: J-FGC5231
  • мтДНК: N1b2
Спасибо за подсказку,  Вадим.
А как именно (через какой поисковик сайта) искать по гаплогруппе?
В http://tr.im/yguys и http://tr.im/mitoguys
Появятся новые имена - добавляйте.
А почему в http://tr.im/mitoguys два похожих списка?
Потому что ни у кого не нашлось времени упорядочить :(

Оффлайн I2a1a

  • ...
  • Сообщений: 10999
  • Страна: ee
  • Рейтинг +755/-8
Мимоходом в связи с поиском родственников в Релфайндере упомяну о "проблеме" 6 хромосомы. По имеющейся у меня информации, значительный процент "кузенов" приходится на участок этой хромосомы, ассоциированой с иммунным комплексом MHC. Принимая во внимание устойчивость сцепления генов HLA, стоит напомнить о наличии полиморфизмов HLA-генов и HLA гаплотипов, имеющих устойчивую этническую привязку. Это позволяет анализировать данные с помощью анализа матрицы дистанций, которая может визуализироваться в виде дерева удаленности индивидов (с помощью метода Nеigbor-joining).
Поэтому я прошу обратить внимание на самую ценную (imho) статью в последнем JOGG.
Цитировать
HLA polymorphisms in Forros and Angolares from S?o Tom? Island (West Africa): Evidence for the Population Origin

The human leukocyte antigen (HLA) system, the major histocompatibility complex in humans, includes the most highly polymorphic loci in the human genome and is located on the short arm of chromosome 6 (6p21.3), spanning over 4 Mb of DNA (Bodmer, 1987; Klein and Sato, 2000; Naik, 2003).  It consists of a closely linked set of genes highly important for medical purposes, namely in transplantation, autoimmune diseases and allergies (Boehncke et al, 1998; Gilbert et al, 2003; Riley and Olerup, 1992).  The most polymorphic HLA loci (e.g. HLA-A, HLA-B, HLA-DRB1) have been used in population studies in order to assess gene flow on the basis of allele and haplotype frequencies.  HLA loci have been successfully used to analyze populations according to geography which makes them good genetic markers for population studies (Arnaiz-Villena et al, 2002; Cao et al, 2004; Sanchez-Mazas, 2001; Sp?nola et al, 2002; Sp?nola et al, 2005a).  Other molecular markers, like autosomic and Y-chromosome STR loci and mtDNA,  are widely used for this type of research as a complement to HLA loci (Gon?alves et al, 2002; Rosa et al, 2004; Rosa et al, 2006). S?o Tom? and Pr?ncipe islands, located 300 km from the West coast of Africa in the Gulf of Guinea as shown in Figure 1, were discovered uninhabited by Portuguese sailors in 1470 (Peres, 1960).  The archipelago was settled first by people from different regions of sub-Saharan Africa, mostly slaves from the Gulf of Guinea, Congo, and Angola, brought to work in local plantations, and, to a minor extent, Portuguese involved in the slave trade between Africa and the Americas.  In the first centuries after the discovery of S?o Tom? and Pr?ncipe, beside the Portuguese, other Europeans were involved in the slave trade along the coast of Africa, namely French, Spanish, Dutch, and English.  These people could have contributed on a minor scale to the present-day genetic pool of this archipelago (Neves, 1989).  During the settlement process, Portuguese males commonly choose female slaves as mates (Garcia, 1966), and there was also mixing of slaves from different geographic and ethnic origins (Tenreiro, 1961). In the 19th century a new economic cycle based on coffee and cacao plantations brought to the islands a new wave of sub-Saharan African people from Cabo Verde archipelago, Angola and Mozambique (Barata, 1966).

Оффлайн I2a1a

  • ...
  • Сообщений: 10999
  • Страна: ee
  • Рейтинг +755/-8
Цитировать
The second PC identified a North–South gradient from Norway and Sweden to Romania and Spain. Variation of frequencies at markers in three separate genomic regions, surrounding LCT, HLA and HERC2, were strongly associated with this gradient.


Оффлайн Mich GlitchАвтор темы

  • Genus regis
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 34668
  • Страна: ca
  • Рейтинг +2966/-47
  • Y-ДНК: J2b1
  • мтДНК: H6a1a5a
Trish, нет ли в Вашем списке релфайдера Attila Csordas и Panagiotis P?
Первый из них венгр, мой восьмиюродный брат (0.08%, 1 УПС).
Второй грек, мой брат одиннадцатиюродный (0.07%, 1 УПС).
Между собой они односегментные одиннадцатиюродные братья.

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.


Rambler's Top100