АвторТема: Whole Genome Sequencing дешевле чем за $200  (Прочитано 18042 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн TK

  • Сообщений: 393
  • Страна: ru
  • Рейтинг +267/-0
Re: Whole Genome Sequencing дешевле чем за $200
« Ответ #135 : 19 Сентябрь 2017, 13:53:36 »
В Китае BGI сделали свой секвенсер BGISEQ-500 и уже предлагают делать на нем полный геном 30x за $600. Цитата:
Цитировать
We are currently offering:
  • $600 for 30X 100PE WGS including analysis
  • Standard data deliverables including .fastq, .bam, .vcf
  • Guaranteed data quality with Q30 > 80%
Первоисточник:
https://www.bgi.com/us/sequencing-services/dna-sequencing/whole-genome-sequencing/

Заметим, что Novogene уже имеет 25 Illumina NovaSeq 6000 systems, которые обсуждали выше и в связи с выходом которых также ожидалось снижение стоимости.
Источник: https://en.novogene.com/next-generation-sequencing-services/human-genome/whole-genome-sequencing-service/

Ждем снижения цен и у остальных представителей рынка?

Очень интересно! Скоро Big Y умрёт?..

Он в любом случае обязательно умрёт, так как у этих тестов есть недостаток, который обсуждался ранее: http://forum.molgen.org/index.php/topic,9605.msg363680.html#msg363680

Оффлайн Daemon2017

  • Сообщений: 1107
  • Страна: ru
  • Рейтинг +409/-16
  • Y-ДНК: R1a-Y35177/BY82934
  • мтДНК: V7-a2a2a2b*
Re: Whole Genome Sequencing дешевле чем за $200
« Ответ #136 : 19 Сентябрь 2017, 18:59:20 »
Главный вопрос, интересующий обывателя, есть ли надежды, что ФТДНА в скором времени представит конкурирующий продукт? Сколько ориентировочно лет должно пройти до обновления линейки тестов FTDNA?


Тут все зависит от спроса на конкурента: если конкурент будет раскручивать свою деятельность и светиться в тематической рекламе, то ФТДНА будут действовать быстро ;)

Оффлайн Oleg V.

  • Сообщений: 730
  • Страна: ru
  • Рейтинг +150/-0
  • GEDmatch: T159830; FTDNA: 543061
  • Y-ДНК: R1a-Z92>YP569
  • мтДНК: ?
Re: Whole Genome Sequencing дешевле чем за $200
« Ответ #137 : 22 Сентябрь 2017, 11:04:13 »
У этих акция – говорят, только сегодня за 400 евро можно заказать полный геном 30x. Очень низкая цена!

https://www.dantelabs.com/collections/our-tests/products/whole-genome-sequencing
« Последнее редактирование: 22 Сентябрь 2017, 11:10:39 от Oleg V. »

Оффлайн TK

  • Сообщений: 393
  • Страна: ru
  • Рейтинг +267/-0
Re: Whole Genome Sequencing дешевле чем за $200
« Ответ #138 : 22 Сентябрь 2017, 13:12:23 »
У этих акция – говорят, только сегодня за 400 евро можно заказать полный геном 30x. Очень низкая цена!

https://www.dantelabs.com/collections/our-tests/products/whole-genome-sequencing

Увы, в условиях обслуживания у них сказано, что работают только по Европейскому союзу.

Цитата: "Please note that we only deliver sample collection kits to addresses in the United Kingdom, Ireland, Denmark, Finland, the Netherlands, Sweden, Belgium, Luxembourg or other eligible countries of the European Union."
Источник: https://www.dantelabs.com/pages/terms-of-service (пункт 7).

Кстати, у них тоже уже есть китайские BGISEQ-500 (https://www.dantelabs.com/pages/about-us)

Оффлайн gecube_ru

  • Сообщений: 1005
  • Страна: ru
  • Рейтинг +165/-0
  • Незнайка на Луне
  • Y-ДНК: I-A6397 -> I-FGC79161
  • мтДНК: V7a1?
Re: Whole Genome Sequencing дешевле чем за $200
« Ответ #139 : 22 Сентябрь 2017, 14:06:23 »
Для СЗ России не проблема заказать в Финляндию, Эстонию или другое приграничное государство и оттуда забрать пакет до востребования.

Оффлайн Mich Glitch

  • Genus regis
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 34801
  • Страна: ca
  • Рейтинг +2998/-47
  • Y-ДНК: J2b1
  • мтДНК: H6a1a5a
Re: Whole Genome Sequencing дешевле чем за $200
« Ответ #140 : 22 Сентябрь 2017, 19:33:53 »
Коллеги, посмотрите Shipito.
По моему (могу ошибаться) там был и европейский филиал.

Оффлайн TK

  • Сообщений: 393
  • Страна: ru
  • Рейтинг +267/-0
Re: Whole Genome Sequencing дешевле чем за $200
« Ответ #141 : 07 Октябрь 2017, 21:05:38 »
У этих акция – говорят, только сегодня за 400 евро можно заказать полный геном 30x. Очень низкая цена!

https://www.dantelabs.com/collections/our-tests/products/whole-genome-sequencing

Сегодня снова у Dante Labs наблюдаю тест за 400 евро. Типа скидка, но уже нет заявления, что она только сегодня.

Оффлайн Mich Glitch

  • Genus regis
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 34801
  • Страна: ca
  • Рейтинг +2998/-47
  • Y-ДНК: J2b1
  • мтДНК: H6a1a5a
Re: Whole Genome Sequencing дешевле чем за $200
« Ответ #142 : 07 Октябрь 2017, 21:12:21 »
Вообще-то фунтов.     :)

Оффлайн TK

  • Сообщений: 393
  • Страна: ru
  • Рейтинг +267/-0
Re: Whole Genome Sequencing дешевле чем за $200
« Ответ #143 : 09 Октябрь 2017, 15:08:50 »
Вообще-то фунтов.     :)

Да, не заметил - спасибо!

Однако, цена всё ещё остается той же - 399 фунтов. Но на сайте появилась возможность выбрать и Евро - в них это будет €444.56. (или, при конвертации, соответственно, примерно $522).
Но интересное - с заглавной страницы я сегодня не смог найти ссылку на условия (terms of service), в которой было указано ограничение по Евросоюзу.

При попытке размещения заказа - Россия, Зимбибве и прочие есть в числе стран, в которое может быть выслан кит. Пересылка (по крайней мере с их стороны) - типа бесплатно.
Со станицы заказа доступны terms of service, в которых нет ограничения по стране.
« Последнее редактирование: 09 Октябрь 2017, 15:15:34 от TK »

Оффлайн ilpo

  • Сообщений: 39
  • Страна: fi
  • Рейтинг +8/-0
  • Y-ДНК: N-BY32529
  • мтДНК: U8a1a1b1
Re: Whole Genome Sequencing дешевле чем за $200
« Ответ #144 : 16 Октябрь 2017, 00:26:03 »
У этих акция – говорят, только сегодня за 400 евро можно заказать полный геном 30x. Очень низкая цена!

https://www.dantelabs.com/collections/our-tests/products/whole-genome-sequencing

У них есть большие базы данных для сравнения результатов тестирования? В противном случае математики не будет.

Оффлайн Centurion

  • 100% Earth (Solar System) genofond
  • Администратор
  • *****
  • Сообщений: 10074
  • Страна: ru
  • Рейтинг +566/-2
Re: Whole Genome Sequencing дешевле чем за $200
« Ответ #145 : 16 Октябрь 2017, 02:51:44 »
У них есть большие базы данных для сравнения результатов тестирования? В противном случае математики не будет.
мне кажется, что нет... я знаю, что длина рида у них всего 100 bp, один образец есть в наличии, позже можно будет точнее сказать по техническим характеристикам сиквеенса

Оффлайн TK

  • Сообщений: 393
  • Страна: ru
  • Рейтинг +267/-0
Re: Whole Genome Sequencing дешевле чем за $200
« Ответ #146 : 26 Октябрь 2017, 16:19:35 »
Понимаю, что неблагодарное это дело - ожидать снижения цен на тесты.
Но, планируя свои исследования на следующий год, собрал статистику по ценам FGC за пару лет и попробовал аппроксимировать их на пару лет вперед.
Получились такие ожидаемые значения:

(наименование теста - цена через год - цена через два года):
WGS 15x - $600 - $500
WGS 20x - $650 - $550
WGS 30x - $850 - $650
Y Elite      - $600 - $550
(использовалось округление до $50 от средних значений при разных аппроксимирующих функциях)

Больше всего могут снизиться цены на WGS (в среднем, на 20% в год), но вот снижения цены Y Elite - практически не ожидается.
И такими темпами WGS 30x упадет до $200 лишь через 8 (5-10) лет... Впрочем, это согласуется с иными прогнозами.

Оффлайн Mich Glitch

  • Genus regis
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 34801
  • Страна: ca
  • Рейтинг +2998/-47
  • Y-ДНК: J2b1
  • мтДНК: H6a1a5a
Re: Whole Genome Sequencing дешевле чем за $200
« Ответ #147 : 26 Октябрь 2017, 16:25:42 »
По мне так снижение цен идет скачками.

Оффлайн TK

  • Сообщений: 393
  • Страна: ru
  • Рейтинг +267/-0
Re: Whole Genome Sequencing дешевле чем за $200
« Ответ #148 : 26 Октябрь 2017, 16:37:39 »
Так и есть - скачками - в исходных данных это есть. Однако, на будущее я могу опираться только на результаты аппроксимации, но дискретными функциями я не пользовался (слишком сложно), мне хватит лишь примерных результатов, чтобы понять, что "один фиг - пока надо копить деньги".

Оффлайн Mich Glitch

  • Genus regis
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 34801
  • Страна: ca
  • Рейтинг +2998/-47
  • Y-ДНК: J2b1
  • мтДНК: H6a1a5a
Re: Whole Genome Sequencing дешевле чем за $200
« Ответ #149 : 26 Октябрь 2017, 16:39:47 »
Я в том смысле, что цены могут обвалиться.

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.


Rambler's Top100