АвторТема: Whole Genome Sequencing дешевле чем за $200  (Прочитано 34206 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн Mich Glitch

  • Genus regis
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 36936
  • Страна: ca
  • Рейтинг +3773/-48
  • Y-ДНК: J2b1
  • мтДНК: H6a1a5a
Re: Whole Genome Sequencing дешевле чем за $200
« Ответ #90 : 25 Декабрь 2016, 19:44:24 »
А чего беспокоиться?
Сделают по дешёвке - здорово!
Не сделают - получим в подарок по 200 австралийских баксов.


:)

Оффлайн grimsvotn

  • Some things in life are too complicated to explain in any language © Murakami
  • Сообщений: 6390
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1771/-1
  • Потомок Морры
    • R-L1280 haplogroup project
  • Y-ДНК: R-Y220521 (RU-BY), Russian-Belorussian borderline cluster
  • мтДНК: T1a1y1 G4820A (RU-UA), Russian-Ukrainian lineage
Re: Whole Genome Sequencing дешевле чем за $200
« Ответ #91 : 25 Декабрь 2016, 19:47:19 »
А чего беспокоиться?
Сделают по дешёвке - здорово!
Не сделают - получим в подарок по 200 австралийских баксов.


:)

Это точно ;D

Оффлайн rLin

  • Сообщений: 769
  • Страна: ru
  • Рейтинг +269/-0
  • Калуга
  • Y-ДНК: R1a1a-Z92 (Y569+)
  • мтДНК: T2b2-С16304T!
Re: Whole Genome Sequencing дешевле чем за $200
« Ответ #92 : 26 Декабрь 2016, 03:30:45 »
Ну...я всегда беспокоюсь обо всём...Не судите строго ;D Так что можете и правда не беспокоиться, я буду беспокоиться за вас)

Оффлайн hart

  • Сообщений: 35
  • Рейтинг +6/-0
Re: Whole Genome Sequencing дешевле чем за $200
« Ответ #93 : 26 Декабрь 2016, 07:58:15 »
Их партнер с похожим логотипом собирает деньги на свой проект. Не очень эффективно.
https://www.lifespan.io/campaigns/cellage-targeting-senescent-cells-with-synthetic-biology/

Будь я потенциальным покупателем данных у меня бы был первый вопрос, а если я доплачу 800 $ то где гарантии что люди заполнят подробные анкеты.

Наверное Геномиксу надо делать рутинную работу - писать сотни/тысячи писем всем кто в индустрии.

Оффлайн gecube_ru

  • Сообщений: 1418
  • Страна: hu
  • Рейтинг +264/-6
  • Незнайка на Луне
  • Y-ДНК: I-A6397 -> I-FGC79161
  • мтДНК: V7a1?
Re: Whole Genome Sequencing дешевле чем за $200
« Ответ #94 : 02 Январь 2017, 20:44:59 »
Чем дело кончилось ?
Кинули или нет ?

Оффлайн Mich Glitch

  • Genus regis
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 36936
  • Страна: ca
  • Рейтинг +3773/-48
  • Y-ДНК: J2b1
  • мтДНК: H6a1a5a
Re: Whole Genome Sequencing дешевле чем за $200
« Ответ #95 : 02 Январь 2017, 21:03:38 »
Чем дело кончилось ?
Кинули или нет ?

Мы Вы не в России церкви. Нас Вас не обманут.    ©


:)

Оффлайн rLin

  • Сообщений: 769
  • Страна: ru
  • Рейтинг +269/-0
  • Калуга
  • Y-ДНК: R1a1a-Z92 (Y569+)
  • мтДНК: T2b2-С16304T!
Re: Whole Genome Sequencing дешевле чем за $200
« Ответ #96 : 02 Январь 2017, 22:37:41 »
Mich Glitch, справедливости ради, в культурной столице одной из европейских стран во время первой прогулки меня пытались обмануть два раза (не в церкви), причём один раз я себя почувствовал героем рассказа О. Генри, т.е. чуть не попался на мошенничество с историей (почти как Геномикс))) шутка). Так что я бы со страной-то не связывал. Попасться можно где угодно. И в Австралии тоже. :) Впрочем, ждём, других вариантов пока нет.

Оффлайн Lesla

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 9628
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2923/-9
  • FTDNA: 154400 (Big Y - 283049)
  • Y-ДНК: R1a-YP682 (VK06+)
Re: Whole Genome Sequencing дешевле чем за $200
« Ответ #97 : 03 Январь 2017, 00:20:59 »
Перенесено - http://forum.molgen.org/index.php/topic,8468.msg362644.html#msg362644
Постараетесь не флудить.

Оффлайн Mich Glitch

  • Genus regis
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 36936
  • Страна: ca
  • Рейтинг +3773/-48
  • Y-ДНК: J2b1
  • мтДНК: H6a1a5a
Re: Whole Genome Sequencing дешевле чем за $200
« Ответ #98 : 03 Январь 2017, 01:14:42 »
Перенесено - http://forum.molgen.org/index.php/topic,8468.msg362644.html#msg362644
Постараетесь не флудить.

Хорошо бы и ура-патриотические исходники в мусор скидывать тоже.     :-\

Оффлайн TK

  • Сообщений: 505
  • Страна: ru
  • Рейтинг +385/-0
Re: Whole Genome Sequencing дешевле чем за $200
« Ответ #99 : 10 Январь 2017, 14:11:01 »
Не про австралийцев, но по теме ветки форума:

Illumina заявила о выпуске в продажу в 2017 году новой серии секвенсоров серии NovaSeq, которые, как они полагают, приведут к возможности секвенировать весь геном за $100:
http://www.illumina.com/company/news-center/press-releases/press-release-details.html?newsid=2236383

Ну, положим, что геном за $100 не сразу будет, но вот за $200 видится уже очень реальным за пару лет.

Оффлайн Daemon2017

  • Сообщений: 2159
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1045/-18
  • Y-ДНК: R1a-Y35174
  • мтДНК: V7-a2a2a2b*
Re: Whole Genome Sequencing дешевле чем за $200
« Ответ #100 : 10 Январь 2017, 16:27:24 »
Не про австралийцев, но по теме ветки форума:

Illumina заявила о выпуске в продажу в 2017 году новой серии секвенсоров серии NovaSeq, которые, как они полагают, приведут к возможности секвенировать весь геном за $100:
http://www.illumina.com/company/news-center/press-releases/press-release-details.html?newsid=2236383

Ну, положим, что геном за $100 не сразу будет, но вот за $200 видится уже очень реальным за пару лет.

Спецификации у НоваСек очень впечатляющие!
Краткие - http://www.illumina.com/systems/sequencing-platforms/novaseq.html
Средние - http://www.illumina.com/systems/sequencing-platforms/novaseq/specifications.html
Полные - http://www.illumina.com/content/dam/illumina-marketing/documents/products/datasheets/novaseq-series-specification-sheet-770-2016-025.pdf

Поставки НоваСек 6000 начнутся в Марте 2017.

6000 Гб выходной файл, 20 миллиардов прочтений, 2 дня работы, до полусотни китов за раз   ::)
Даже не знаю, как
а) их будет хранить ФТДНА и прочие
б) их будет хранить YFull, GedMatch и прочие

Как бы не пришлось доплачивать за хранение...
« Последнее редактирование: 10 Январь 2017, 16:35:40 от Daemon2017 »

Оффлайн Daemon2017

  • Сообщений: 2159
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1045/-18
  • Y-ДНК: R1a-Y35174
  • мтДНК: V7-a2a2a2b*
Re: Whole Genome Sequencing дешевле чем за $200
« Ответ #101 : 10 Январь 2017, 16:37:11 »
Для сервисов вроде Гедматча можно из полного генома делать файл со снипами в формате 23andme или около того.

Если ФТДНА будет оказывать такую услугу (вырезание куска с аутосомами в верном формате), то здорово. А то грузить 6 Тб некогда и некуда  ;D
На этом, кстати, тоже можно делать деньги!)

Оффлайн Daemon2017

  • Сообщений: 2159
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1045/-18
  • Y-ДНК: R1a-Y35174
  • мтДНК: V7-a2a2a2b*
Re: Whole Genome Sequencing дешевле чем за $200
« Ответ #102 : 10 Январь 2017, 16:41:33 »
Ну, положим, что геном за $100 не сразу будет, но вот за $200 видится уже очень реальным за пару лет.

However, deSouza said the $100 number was more a roadmap–something that would probably happen in more than three years and fewer than ten.
http://www.forbes.com/sites/matthewherper/2017/01/09/illumina-promises-to-sequence-human-genome-for-100-but-not-quite-yet/#17612d99690a

Сами они считают, что на это уйдет 3<x<10 лет  :(
Хотя, я психологически согласен на 250. Да и даже на 500 (как бигмак сейчас).
Другое дело, что полный геном не так уж и горит: можно подождать.

Оффлайн Mich Glitch

  • Genus regis
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 36936
  • Страна: ca
  • Рейтинг +3773/-48
  • Y-ДНК: J2b1
  • мтДНК: H6a1a5a
Re: Whole Genome Sequencing дешевле чем за $200
« Ответ #103 : 10 Январь 2017, 16:49:09 »
Похоже мы накануне очередного прорыва.
Ура, товарищи!!!


:)

Оффлайн Mich Glitch

  • Genus regis
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 36936
  • Страна: ca
  • Рейтинг +3773/-48
  • Y-ДНК: J2b1
  • мтДНК: H6a1a5a
Re: Whole Genome Sequencing дешевле чем за $200
« Ответ #104 : 10 Январь 2017, 16:53:20 »
Поправьте меня, коллеги.
Так понял, что 6000 ГБ (6 ТБ, стало быть) - это размеры батча.
А индивидуальный файл выходит около 120 ГБ. Разве не так?

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.