АвторТема: Whole Genome Sequencing дешевле чем за $200  (Прочитано 17884 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн rLin

  • Сообщений: 808
  • Страна: ru
  • Рейтинг +269/-0
  • Калуга
  • Y-ДНК: R1a1a-Z92 (Y569+)
  • мтДНК: T2b2-С16304T!
Re: Whole Genome Sequencing дешевле чем за $200
« Ответ #45 : 05 Ноябрь 2016, 20:48:09 »
Mich Glitch, я уже вижу себя в Рио-де-Жанейро в белых штанах и с гирей наперевес. :)

Оффлайн Lesla

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 8722
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2087/-9
  • FTDNA: 154400 (Big Y - 283049)
  • Y-ДНК: R1a-YP682 (VK01/VK03+)
Re: Whole Genome Sequencing дешевле чем за $200
« Ответ #46 : 05 Ноябрь 2016, 20:54:55 »
В уме следует еще держать 49$ на интерпретацию в YFull. Без нее (интерпретации) данные будут мертвым грузом лежать для нас, любителей днк-генеалогии.

Оффлайн rLin

  • Сообщений: 808
  • Страна: ru
  • Рейтинг +269/-0
  • Калуга
  • Y-ДНК: R1a1a-Z92 (Y569+)
  • мтДНК: T2b2-С16304T!
Re: Whole Genome Sequencing дешевле чем за $200
« Ответ #47 : 05 Ноябрь 2016, 21:03:18 »
Mich Glitch, файлы можно и порезать. Думаю, что даже я смогу вырезать из BAM-файла часть, описывающую Y-хромосому, не говоря уж об давно готовых утилитах, которые наверняка есть.
У меня уже в планах сгенерировать файл формата 23andme, чтобы сравнить результат (как я уже делал с mtDNA).
Опять же, чисто для себя, самостоятельно в bam-файле можно поискать снипы, которые хотелось бы проверить, но по каким-то причинам не получилось.
Lesla, интерпретацию держим в уме. Из миллионов, которые польются рекой от продажи генома, вполне можно выделить немного и на интерпретацию. :)

Я какого-то практического смысла для себя всё же не вижу в этом всём. Просто будет с чем покопаться и узнать немножко больше среднего человека, чтоб потом, когда мне рассказывают про то, как по вибрации зерна можно определить ГМО оно или не ГМО, можно было дальше не слушать.

Оффлайн Centurion

  • 100% Earth (Solar System) genofond
  • Администратор
  • *****
  • Сообщений: 10074
  • Страна: ru
  • Рейтинг +566/-2
Re: Whole Genome Sequencing дешевле чем за $200
« Ответ #48 : 05 Ноябрь 2016, 21:07:07 »
все равно из полного генома вырезается только игрек-хромосома
у фгц файлы тоже не маленькие, я думаю по ширине покрытия больше все равно не просеквенировать, вес файла может увеличиваться, только если будет бОльшая длина ридов, и/или глубина покрытия, скажем 100x или 200х

Оффлайн rLin

  • Сообщений: 808
  • Страна: ru
  • Рейтинг +269/-0
  • Калуга
  • Y-ДНК: R1a1a-Z92 (Y569+)
  • мтДНК: T2b2-С16304T!
Re: Whole Genome Sequencing дешевле чем за $200
« Ответ #49 : 08 Ноябрь 2016, 23:59:18 »
Нашёл заметку, что австралийцы в прошлом году собрались заняться поддержкой использования геномной медицины в своей стране, хотят стать лидерами.
https://www.mcri.edu.au/news/25-million-grant-prepare-australia-genomics-medicine-revolution
Для этого, пожалуй, маловато $25 млн долларов в масштабах страны, но, наверное, всё это не с проста, и интересные новости из Австралии будут появляться.

Оффлайн Lesla

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 8722
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2087/-9
  • FTDNA: 154400 (Big Y - 283049)
  • Y-ДНК: R1a-YP682 (VK01/VK03+)
Re: Whole Genome Sequencing дешевле чем за $200
« Ответ #50 : 10 Ноябрь 2016, 17:47:15 »
Проявил интерес. Надо поддержать начинание.

Оффлайн hart

  • Сообщений: 36
  • Рейтинг +6/-0
Re: Whole Genome Sequencing дешевле чем за $200
« Ответ #51 : 10 Ноябрь 2016, 19:31:50 »
Хорошо бы, если как можно больше людей зарегистрировали интерес.
За это денег не берут. Спрашивают только имя и адрес электронной почты. Максимум рисков - какие-нибудь письма счастья время от времени.

Коллеги, соратники, друзья-сотоварищи, не пожалейте минуты своего времени. Отметьтесь во славу генетической генеалогии.      ::)

Может у меня конечно глаз замылился, но сегодня утром ещё можно было купить вроде-бы.

Написал им вопрос почему нет кнопки покупки.

Оффлайн hart

  • Сообщений: 36
  • Рейтинг +6/-0
Re: Whole Genome Sequencing дешевле чем за $200
« Ответ #52 : 10 Ноябрь 2016, 20:10:01 »
Написал им вопрос почему нет кнопки покупки.

Потому как что-то пошло не так. См. версии выше.    :)

с сайта исчезли слова про 31 декабря 2016

Оффлайн hart

  • Сообщений: 36
  • Рейтинг +6/-0
Re: Whole Genome Sequencing дешевле чем за $200
« Ответ #53 : 11 Ноябрь 2016, 06:56:09 »
Hi

Thanks for your interest. Due to lots of interest, we are oversubscribed and have closed pre-orders for this campaign. You can still register your interest and we are happy to keep you updated and let you know if future campaigns open.

Kind regards
Alyse Sue

П.С.: Я так понял, файл будет весить 90-120 гб?
« Последнее редактирование: 11 Ноябрь 2016, 08:07:15 от hart »

Оффлайн rLin

  • Сообщений: 808
  • Страна: ru
  • Рейтинг +269/-0
  • Калуга
  • Y-ДНК: R1a1a-Z92 (Y569+)
  • мтДНК: T2b2-С16304T!
Re: Whole Genome Sequencing дешевле чем за $200
« Ответ #54 : 11 Ноябрь 2016, 08:44:33 »
Кто успел - тот молодец!:) Надеюсь на это)

hart, да, ориентировочно где-то так и будет весить. Не представляю как его выкачивать. Торрентами что ли?) "Встаньте кто-нибудь на раздачу" и всё такое прочее)

Оффлайн hart

  • Сообщений: 36
  • Рейтинг +6/-0
Re: Whole Genome Sequencing дешевле чем за $200
« Ответ #55 : 11 Ноябрь 2016, 20:56:02 »
Может хотят набрать согласно требований потенциальных заказчиков? Типа, с исследуемыми болезнями? Или нужных этносов?

Думаю, основные клиенты именно по медицинской части.

Допускаю, что отписка просто хорошая мина при неудачной игре. Не будут же они писать мы хотели сделать всех счастливыми - но не вышло.    :(

Если хотят то где же анкеты с этими параметрами? Если хотеЛИ почему сразу не спрашивали?
Скорее всего заказчиков нет по этому и не может быть никаких ограничений.

Оффлайн hart

  • Сообщений: 36
  • Рейтинг +6/-0
Re: Whole Genome Sequencing дешевле чем за $200
« Ответ #56 : 13 Ноябрь 2016, 19:58:07 »
Зарегистрировано юрлицо 22 августа 2016


Name: GENOMIX CO PTY LTD
ACN: 614 381 467
ABN: 70 614 381 467
Registration Date: 22/08/2016
Next Review Date: 22/08/2017
Status: Registered
Type: Australian Proprietary Company, Limited By Shares
Locality of Registered Office: EVELEIGH NSW 2015
Regulator: Australian Securities & Investments Commission


26/10/2016   7E8467091   
Hide sub documents   (484)
Change to Company Details Appointment or Cessation of A (484E)

22/08/2016   2E4455283   
Application For Registration as a Proprietary Company (201C)

https://www.aus61business.com/company/Genomix-Co-Pty-Ltd
http://www.australian-companies.tsetso.info/company.php?genomix-co-pty-ltd-acn-abn-number-614381467
http://www.datalog.co.uk/browse/detail.php/CompanyNumber/AU70614381467/CompanyName/GENOMIX+CO+PTY+LTD

Оффлайн hart

  • Сообщений: 36
  • Рейтинг +6/-0
« Последнее редактирование: 15 Ноябрь 2016, 08:07:22 от hart »

Оффлайн hart

  • Сообщений: 36
  • Рейтинг +6/-0
Re: Whole Genome Sequencing дешевле чем за $200
« Ответ #58 : 16 Ноябрь 2016, 12:13:53 »
Я новичек, правильно ли я понимаю что единственное чего тут нет это митохондриальная ДНК? Поскольку гены митохондрии хранятся частично в ДНК, возникает вопрос.
1. Они дадут те митогены что в ДНК?
2. Они дадут митогены которые в митоДНК?
« Последнее редактирование: 16 Ноябрь 2016, 12:20:43 от hart »

Оффлайн rLin

  • Сообщений: 808
  • Страна: ru
  • Рейтинг +269/-0
  • Калуга
  • Y-ДНК: R1a1a-Z92 (Y569+)
  • мтДНК: T2b2-С16304T!
Re: Whole Genome Sequencing дешевле чем за $200
« Ответ #59 : 16 Ноябрь 2016, 12:44:28 »
hart, вопросы ваши поставлены некорректно на мой взгляд.
В клетках человека есть ДНК, которая хранится в ядре клетки и ДНК, которая хранится в митохондриях.
Полный геном подразумевает собой секвенирование ДНК, которая хранится в ядре клеток (по крайней мере для меня). Но. В результаты теста BigY от FTDNA (секвенирование только Y-хромосомы) была включена ДНК из митохондрий в качестве недокументированной возможности  (позже убрали). Возможно и тут  так будет. И лично мне это интересно, так как появится возможность сравнить мито от 23andMe, FTDNA и австралийцев (теория заговора и всё такое). Короче, может и будет митохондриальная ДНК, но я бы не надеялся.

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.


Rambler's Top100