АвторТема: Whole Genome Sequencing дешевле чем за $200  (Прочитано 17561 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн kirroidАвтор темы

  • Выгляда як ядвинга
  • Сообщений: 1070
  • Страна: by
  • Рейтинг +333/-6
  • Из Вайшнории
  • Y-ДНК: I1-M227
Whole Genome Sequencing дешевле чем за $200
« : 02 Ноябрь 2016, 12:19:04 »
Австралийский стартап предлагает полногеномное тестирование за 200 австралийских монет (плюс 35 за пересылки туда/назад) через Macrogen Inc., США. Заявляют прочитку 3 миллиада базовых пар, с минимальным покрытием 30x, по результатам предоставляют BAM/VCF файл.

Условие: набор 500 участников до 31 декабря. Если необходимого количества не наберется - деньги возвращают. В положительном случае - результаты обещают предоставить до конца 2017 года.

Больше информации тут - http://www.genomix.co/get-your-genome-sequenced

P.S. На данный момент заказ сделали 165 человек.
« Последнее редактирование: 03 Ноябрь 2016, 03:19:21 от kirroid »

Онлайн Arthwr

  • Сообщений: 899
  • Страна: ua
  • Рейтинг +369/-5
    • r1b-pf7562.blogspot.com
  • Y-ДНК: R1b-PF7563
Re: Whole Genome Sequencing дешевле чем за $200
« Ответ #1 : 02 Ноябрь 2016, 13:52:16 »

Оффлайн LM1979

  • Сообщений: 680
  • Страна: fr
  • Рейтинг +127/-4
Re: Whole Genome Sequencing дешевле чем за $200
« Ответ #2 : 02 Ноябрь 2016, 13:56:30 »
Более персональных данных, чем ДНК, не существует. Компания Genos собирается платить людям за геном-пробы, которые она будет использовать в своих разработках. Приготовлены и деньги - $6 млн. ;D
https://hightech.fm/2016/11/02/genetics-genos

Оффлайн rLin

  • Сообщений: 811
  • Страна: ru
  • Рейтинг +269/-0
  • Калуга
  • Y-ДНК: R1a1a-Z92 (Y569+)
  • мтДНК: T2b2-С16304T!
Re: Whole Genome Sequencing дешевле чем за $200
« Ответ #3 : 02 Ноябрь 2016, 16:50:25 »
Забавно..В Беларусь не шлют, а в РФ, получается,шлют. Обычно наоборот.

Оффлайн TK

  • Сообщений: 271
  • Страна: ru
  • Рейтинг +157/-0
Re: Whole Genome Sequencing дешевле чем за $200
« Ответ #4 : 02 Ноябрь 2016, 17:46:42 »
Судя по описанию на странице "About us" (перевод примерный):
Цитировать
Для того, чтобы снизить стоимость секвенирования всего генома для человека от нескольких тысяч до всего лишь несколько сотен, мы будем сотрудничать с исследователями, которые по жизни или для расширения медицинских исследований будут субсидировать остальную часть стоимости всего генома для человека. Люди получат доступ к своим собственным необработанным данным генома, а исследователи получают доступ к обезличенным данным, сообщенным физическими лицами.
А в "Privacy Policy" упоминается возможность сбора медицинских данных, этнического происхождения и т.п. - хотя не исключено, что это там просто написано, чтобы было. Как требование там это не упоминается.
Но, судя по всему, низкая стоимость все же объясняется за счет неких инвесторов, которые заинтересованы в сборе данных ДНК.

Оффлайн Шад

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6232
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1096/-4
  • Ex oriente lux
  • Y-ДНК: Q-Y2750
  • мтДНК: J1c2z
Re: Whole Genome Sequencing дешевле чем за $200
« Ответ #5 : 02 Ноябрь 2016, 19:12:59 »
Про Genos (https://www.genosresearch.com/)
✓ $399 for whole exome sequencing
✓ CLIA-compliant, 75x on-target coverage
✓ Visual, browsable map of your genome
✓ Conditions and variants display
✓ Genetic counselor access (preferred rate)

Таким образом, никто ничего платить за ДНК не собирается:)
А собираются платить за использование данных.
Цитировать
We do not monetize your data the way other DNA services sell your information, or how search engines and social media profit from your engagement.
Your DNA inherently belongs to you, but when you sequence through other companies or labs, broad consent allows that information to become theirs.
At Genos, you own your data, always. Forever. No exceptions

То есть, если они используют ваши данные, то поделятся доходом с протестированным. Разумеется, предварительно получив с него много разнообразной информации. А иначе - что продавать?

Вывод: в отличии от других компаний - попытка честно сыграть с клиентом. Но, скорее всего за этим предложением стоит трезвый маркетинговый расчет ("о нас напишут и нас заметят", "будет что продавать, так как клиенту кинуться заполнять отчеты в предвкушении").

Оффлайн Шад

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6232
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1096/-4
  • Ex oriente lux
  • Y-ДНК: Q-Y2750
  • мтДНК: J1c2z
Re: Whole Genome Sequencing дешевле чем за $200
« Ответ #6 : 02 Ноябрь 2016, 23:03:54 »
Австралийский стартап предлагает полногеномное тестирование за 200 австралийских монет (плюс 35 за пересылки туда/назад) через Macrogen Inc., США. Заявляют прочитку 3 миллионов базовых пар, с минимальным покрытием 30x, по результатам предоставляют BAM/VCF файл.

Условие: набор 500 участников до 31 декабря. Если необходимого количества не наберется - деньги возвращают. В положительном случае - результаты обещают предоставить до конца 2017 года.

Больше информации тут - http://www.genomix.co/get-your-genome-sequenced

P.S. На данный момент заказ сделали 165 человек.
Покрытие 30x всего всего?  И Y-dna и аутосомы?

Цитировать
SUMMARY
Number of genes tested  21,000

Types of genes tested  All 21,000 in 23 pairs of chromosomes

Quality  High quality data with minimum 30x coverage

Sequencing platform   Illumina HiSeq X Ten

Testing method   Next Generation Sequencing

Data Storage  Data will be stored in a HIPAA 1996 and Australian Privacy Act 1988 compliant and secure servers

Includes  Data on all 3 billion base pairs of your DNA
BAM/VCF files   Raw data to use with third party services to make your own discoveries on your predisposition to certain diseases and conditions, ability to metabolise certain foods and medications, and preventative actions you can take now to live longer and healthier

Оффлайн Semargl

  • "El sueño de la razón produce monstruos" ©
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 5182
  • Страна: hr
  • Рейтинг +2436/-5
  • www.semargl.me
    • www.semargl.me
  • Y-ДНК: R1a [CTS3402+]
  • мтДНК: U4a2g
Re: Whole Genome Sequencing дешевле чем за $200
« Ответ #7 : 02 Ноябрь 2016, 23:33:18 »
Отлично значит и Y тоже ...
Игрек там если и есть, то стремится к минимуму . К сожалению.

Оффлайн rLin

  • Сообщений: 811
  • Страна: ru
  • Рейтинг +269/-0
  • Калуга
  • Y-ДНК: R1a1a-Z92 (Y569+)
  • мтДНК: T2b2-С16304T!
Re: Whole Genome Sequencing дешевле чем за $200
« Ответ #8 : 02 Ноябрь 2016, 23:38:14 »
Заманчиво всё же. Не знаю, правда, что потом делать с этим геномом, проверять результаты научных статей вроде "сенсация! найден ген любви к зелёному цвету"?) Есть некоторая вероятность, что через год их уже не будет, если бизнес-план окажется провальным. Но BAM-файлы-то останутся) Скорее всего они уже имеют гарантированное финансирование на секвенирование 500 или даже больше полных геномов, так что пользователям, скорее всего, бояться нечего. Заявленное у них где-то оборудование Illumina Xten 150bpPE должно справиться с задачей, хотя для максимально возможного удешевления, 1000$ за геном, у него должна быть загрузка 18 000 геномов в год.
Что-то я пока не вижу, кто им будет платить более 800$ (1000-200) за каждый анонимный геном. Хорошо бы глянуть бизнес-план, но поиск пока ничего не дал.

Оффлайн rLin

  • Сообщений: 811
  • Страна: ru
  • Рейтинг +269/-0
  • Калуга
  • Y-ДНК: R1a1a-Z92 (Y569+)
  • мтДНК: T2b2-С16304T!
Re: Whole Genome Sequencing дешевле чем за $200
« Ответ #9 : 02 Ноябрь 2016, 23:50:26 »
Скорее всего 150bp будет. В спецификации упоминаемого оборудования  Illumina Xten указано в разделе качество:
2 × 150 bp ≥ 75% of bases above Q30

Оффлайн kirroidАвтор темы

  • Выгляда як ядвинга
  • Сообщений: 1070
  • Страна: by
  • Рейтинг +333/-6
  • Из Вайшнории
  • Y-ДНК: I1-M227
Re: Whole Genome Sequencing дешевле чем за $200
« Ответ #10 : 03 Ноябрь 2016, 00:17:11 »
Отлично значит и Y тоже ...
Игрек там если и есть, то стремится к минимуму . К сожалению.
Не могли бы Вы подробнее свои мысли об этом раскрыть? Я думаю, что большинство людей (по крайней мере на нашем форуме) заинтересовалось бы этим тестом именно для Y-DNA тестирования.
Спасибо.

Оффлайн Centurion

  • 100% Earth (Solar System) genofond
  • Администратор
  • *****
  • Сообщений: 10080
  • Страна: ru
  • Рейтинг +566/-2
Re: Whole Genome Sequencing дешевле чем за $200
« Ответ #11 : 03 Ноябрь 2016, 00:46:28 »
Отлично значит и Y тоже ...
Игрек там если и есть, то стремится к минимуму . К сожалению.
Не могли бы Вы подробнее свои мысли об этом раскрыть? Я думаю, что большинство людей (по крайней мере на нашем форуме) заинтересовалось бы этим тестом именно для Y-DNA тестирования.
Спасибо.

в первом сообщ вы сделали ошибку написав "3 млн баз" - в анг тексте вроде как 3 млрд баз - это фактически 100% генома.. думаю Семаргл исходил из этих 3 млн на весь геном - это мало, поэтому решил что на игрек там ничего не останется

Оффлайн kirroidАвтор темы

  • Выгляда як ядвинга
  • Сообщений: 1070
  • Страна: by
  • Рейтинг +333/-6
  • Из Вайшнории
  • Y-ДНК: I1-M227
Re: Whole Genome Sequencing дешевле чем за $200
« Ответ #12 : 03 Ноябрь 2016, 03:20:48 »
Отлично значит и Y тоже ...
Игрек там если и есть, то стремится к минимуму . К сожалению.
Не могли бы Вы подробнее свои мысли об этом раскрыть? Я думаю, что большинство людей (по крайней мере на нашем форуме) заинтересовалось бы этим тестом именно для Y-DNA тестирования.
Спасибо.

в первом сообщ вы сделали ошибку написав "3 млн баз" - в анг тексте вроде как 3 млрд баз - это фактически 100% генома.. думаю Семаргл исходил из этих 3 млн на весь геном - это мало, поэтому решил что на игрек там ничего не останется
Спасибо, я действительно сделал ошибку в описании. Исправлено.

Оффлайн kirroidАвтор темы

  • Выгляда як ядвинга
  • Сообщений: 1070
  • Страна: by
  • Рейтинг +333/-6
  • Из Вайшнории
  • Y-ДНК: I1-M227
Re: Whole Genome Sequencing дешевле чем за $200
« Ответ #13 : 03 Ноябрь 2016, 08:05:44 »
Странно, что из всех постсоветских республик именно Беларусь попала в эту тёплую компанию:

Цитировать
Which countries do you service?
We ship to all countries except:
Afghanistan, Angola, Belarus, Botswana, Burkina Faso, Burundi, Cameroon, Central African Republic, Chad, Congo, Republic of the Cote d'Ivoire, Cuba, Egypt, Gabon, The Gambia, Ghana, Iran, Iraq, Kenya, North Korea, Lesotho,  Liberia, Libya, Malawi, Mali, Mauritania, Myanmar, Niger, Nigeria, Occupied Palestinian Territory, Rwanda, Sierra Leone, Somalia, Sudan, Swaziland, Syria, Togo, Uganda, Zaire (Democratic Republic of Congo), Zambia and Zimbabwe.

Сдаётся мне, что это не из-за каких-то там политических заморочек...
Проблема в существующих дебильных таможенных правилах. Проще рискнуть потерять десяток потенциальных заказчиков, чем потом с создаными беларуской таможней проблемами разбираться.
Хотя, должен заметить, в списке стран на странице заказа есть и Беларусь и Афганистан и прочие.

Оффлайн hart

  • Сообщений: 36
  • Рейтинг +6/-0
Re: Whole Genome Sequencing дешевле чем за $200
« Ответ #14 : 03 Ноябрь 2016, 09:47:16 »
*** Очень хотелось бы, чтобы с постсоветского славянского пространства было бы десяток-два сэмплов.
Форумчане, ау! Цена-то ведь не запредельная. А как хлопцы пишут, инвестирование на всю оставшуюся жизнь.    ::)

Добрый день. Я новичок в теме, но я так понимаю ничего лучше данного продукта нет и не будет в обозримом будущем?
Сделал заказ, они отправят сразу или лишь в случае набора 500 человек?

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.


Rambler's Top100