АвторТема: Whole Genome Sequencing дешевле чем за $200  (Прочитано 17924 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн Mich Glitch

  • Genus regis
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 34639
  • Страна: ca
  • Рейтинг +2959/-47
  • Y-ДНК: J2b1
  • мтДНК: H6a1a5a
Re: Whole Genome Sequencing дешевле чем за $200
« Ответ #105 : 10 Январь 2017, 16:49:09 »
Похоже мы накануне очередного прорыва.
Ура, товарищи!!!


:)

Оффлайн Mich Glitch

  • Genus regis
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 34639
  • Страна: ca
  • Рейтинг +2959/-47
  • Y-ДНК: J2b1
  • мтДНК: H6a1a5a
Re: Whole Genome Sequencing дешевле чем за $200
« Ответ #106 : 10 Январь 2017, 16:53:20 »
Поправьте меня, коллеги.
Так понял, что 6000 ГБ (6 ТБ, стало быть) - это размеры батча.
А индивидуальный файл выходит около 120 ГБ. Разве не так?

Оффлайн Mich Glitch

  • Genus regis
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 34639
  • Страна: ca
  • Рейтинг +2959/-47
  • Y-ДНК: J2b1
  • мтДНК: H6a1a5a
Re: Whole Genome Sequencing дешевле чем за $200
« Ответ #107 : 10 Январь 2017, 16:54:22 »
Зазипованный будет ещё в 3-5 раз меньше.

Оффлайн Mich Glitch

  • Genus regis
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 34639
  • Страна: ca
  • Рейтинг +2959/-47
  • Y-ДНК: J2b1
  • мтДНК: H6a1a5a
Re: Whole Genome Sequencing дешевле чем за $200
« Ответ #108 : 10 Январь 2017, 16:56:25 »
По поводу отправки клиенту - проблем нет.
Скинул на флэшку, например, если по каким-то причинам интернет не подходит.

Основная проблема, действительно, длительное хранение многих образцов и сравнение гигантских массивов информации.

Онлайн TK

  • Сообщений: 368
  • Страна: ru
  • Рейтинг +249/-0
Re: Whole Genome Sequencing дешевле чем за $200
« Ответ #109 : 10 Январь 2017, 17:03:35 »
Ну, положим, что геном за $100 не сразу будет, но вот за $200 видится уже очень реальным за пару лет.
Сами они считают, что на это уйдет 3<x<10 лет  :(
В таком случае поправка: уровень $200 за весь геном будет достигнут примерно в 3 года.
А уровень $100 - примерно за 5,5 лет - как среднее геометрическое от 3 и 10 лет :)

Оффлайн Mich Glitch

  • Genus regis
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 34639
  • Страна: ca
  • Рейтинг +2959/-47
  • Y-ДНК: J2b1
  • мтДНК: H6a1a5a
Re: Whole Genome Sequencing дешевле чем за $200
« Ответ #110 : 10 Январь 2017, 17:04:51 »
Наконец-то взбодрили наше уже слегка подзакисшее от ожиданий ДНК-генеалогическое болотце!     ::)

Оффлайн Daemon2017

  • Сообщений: 1097
  • Страна: ru
  • Рейтинг +398/-16
  • Y-ДНК: R1a-Y35177/BY89957
  • мтДНК: V7-a2a2a2b*
Re: Whole Genome Sequencing дешевле чем за $200
« Ответ #111 : 10 Январь 2017, 17:05:40 »
Поправьте меня, коллеги.
Так понял, что 6000 ГБ (6 ТБ, стало быть) - это размеры батча.
А индивидуальный файл выходит около 120 ГБ. Разве не так?

Да, точно, все так и есть: ††† All sample throughputs are estimates and are based on dual flow cell runs. Human Genomes assumes > 120 Gb of data per sample to achieve 30x genome coverage. Exomes assumes ≥ 50M reads at ≥ 2 x 75 bp. Transcriptomes assumes ≥ 50M reads at ≥ 2 x 50 bp.

Оффлайн Mich Glitch

  • Genus regis
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 34639
  • Страна: ca
  • Рейтинг +2959/-47
  • Y-ДНК: J2b1
  • мтДНК: H6a1a5a
Re: Whole Genome Sequencing дешевле чем за $200
« Ответ #112 : 10 Январь 2017, 17:08:12 »
Меня более всего интересует:

а) на какую среднюю глубину можно будет уверенно детектировать родство по аутосомам (по реальным данным полного генома, естественно, а не по каким-то моделизационным рассуждалкам);

б) какой точности оценки ВБОПов удастся достичь при полном секвенировании игрек хромосомы.

Оффлайн Daemon2017

  • Сообщений: 1097
  • Страна: ru
  • Рейтинг +398/-16
  • Y-ДНК: R1a-Y35177/BY89957
  • мтДНК: V7-a2a2a2b*
Re: Whole Genome Sequencing дешевле чем за $200
« Ответ #113 : 10 Январь 2017, 17:28:44 »
Меня более всего интересует:

а) на какую среднюю глубину можно будет уверенно детектировать родство по аутосомам (по реальным данным полного генома, естественно, а не по каким-то моделизационным рассуждалкам);

б) какой точности оценки ВБОПов удастся достичь при полном секвенировании игрек хромосомы.

Точно можно сказать, что станет существенно меньше ситуаций, когда с настоящим, документоподтвержденным четвероюродным братом выходит 0 сМ в сумме.


А уверенно отличать того же 3C2R от 3C, думаю, не получится и с полным геномом  :(

Оффлайн hart

  • Сообщений: 36
  • Рейтинг +6/-0
Re: Whole Genome Sequencing дешевле чем за $200
« Ответ #114 : 15 Январь 2017, 18:42:57 »


Thanks for letting us know. This is very exciting and great news for everyone!

We hope to provide an update on the sequencing towards end of January. We are awaiting responses and agreements from researchers and other parties which has been delayed due to the holiday season. This delay has not been ideal however we are doing our best to speed matters up.

Оффлайн Mich Glitch

  • Genus regis
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 34639
  • Страна: ca
  • Рейтинг +2959/-47
  • Y-ДНК: J2b1
  • мтДНК: H6a1a5a
Re: Whole Genome Sequencing дешевле чем за $200
« Ответ #115 : 15 Январь 2017, 18:46:59 »
Прекрасная новость.


:)

Оффлайн Srkz

  • Сообщений: 5436
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2202/-2
  • Y-ДНК: N-L1025*
  • мтДНК: U4a1e-pre T16093C T16311T
Re: Whole Genome Sequencing дешевле чем за $200
« Ответ #116 : 09 Февраль 2017, 05:40:41 »
Пришло письмо, что в течение двух недель вернут деньги. Работа как бы продолжается, но то ли совсем не нашли спонсоров, то ли нашли, но не для образцов вроде моего :)

Цитировать
Hi Sergey

Thank you for your support in the campaign to make whole genome sequencing more accessible and for your patience in waiting for this update. As mentioned in an earlier email, we received overwhelming interest and this campaign became oversubscribed very quickly.

Over the past few months we have had many lengthy and fruitful discussions with researchers. However, as we can not provide a definite date as to when each and every person will be sequenced, we have decided to refund your full payment for your pre-order(s).

Going forward

We will continue to support researchers and continue to work on the research side of genomics under a different brand.

We may run a similar sequencing campaign in the future. We will keep your email in our database and contact you should sequencing be made available again. If you do not wish for this to occur please unsubscribe from communications by clicking the unsubscribe button below.

Refunds

You should expect your full payment to be returned to the card you paid with within 2 weeks. If the refund is not in your account by then please email us your name and order number and we will investigate.

Thanks again for your support and understanding.

Best Regards,

Alyse Sue

Оффлайн Mich Glitch

  • Genus regis
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 34639
  • Страна: ca
  • Рейтинг +2959/-47
  • Y-ДНК: J2b1
  • мтДНК: H6a1a5a
Re: Whole Genome Sequencing дешевле чем за $200
« Ответ #117 : 09 Февраль 2017, 05:49:12 »
 Не удалося
Убить старушке лося...     :(

Тоже скоро разбогатею на 200 австралийских тугриков.    :)

Оффлайн rLin

  • Сообщений: 808
  • Страна: ru
  • Рейтинг +269/-0
  • Калуга
  • Y-ДНК: R1a1a-Z92 (Y569+)
  • мтДНК: T2b2-С16304T!
Re: Whole Genome Sequencing дешевле чем за $200
« Ответ #118 : 09 Февраль 2017, 08:30:27 »
Жаль, конечно, что чуда не произошло... Но я уже придумал, куда потратить эти деньги после их возвращения ко мне...Только жаба душила. А сейчас можно с чистой совестью!

Оффлайн Srkz

  • Сообщений: 5436
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2202/-2
  • Y-ДНК: N-L1025*
  • мтДНК: U4a1e-pre T16093C T16311T
Re: Whole Genome Sequencing дешевле чем за $200
« Ответ #119 : 09 Февраль 2017, 09:25:11 »
Жаль, конечно, что чуда не произошло... Но я уже придумал, куда потратить эти деньги после их возвращения ко мне...Только жаба душила. А сейчас можно с чистой совестью!
Или еще чуть подкопить и заказать полный сиквенс в другой компании ;D

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.


Rambler's Top100