Новая компания: seeq.io

[napobo3]

Люди из DNA.Land. Конкуренты 23andme. 50$ за тест.

http://seeq.io

[Sylvester]

Похоже пока работает только для Штатов:

Do you ship outside the US?
Unfortunately we do not yet ship outside of the US, though we hope to in the future.

[Шад]

Похоже пока работает только для Штатов:

Do you ship outside the US?
Unfortunately we do not yet ship outside of the US, though we hope to in the future.

Ну есть же и обходные пути
https://www.shipito.com/ru/

[Шад]

Люди из DNA.Land. Конкуренты 23andme. 50$ за тест.

http://seeq.io

Так за 50 баксов можно будет не только с родственниками познакомиться, но и с бактериями:)

Ancestry
Find out which parts of the world your ancestors came from

Microbiome
Explore the bacteria, viruses, and food in your mouth

Данные будут доступны для скачивания

Will I have access to my raw data?
Most definitely. We will provide aligned sequencing reads in .bam format.

[rLin]

Микробиом это интересно, можно даже без всего остального...Подожду пока первых отзывов)
Впрочем, есть смысл и поторопиться, так как цена, скорее всего, для привлечения внимания и потом повысится:
"Participating in this study may require you to pay for sequencing and analysis of your sample. This cost may change during the course of the study but will not exceed $100."
Стоит так же отметить, что после получения образца слюны, они не уничтожат его и не удалят ваши данные, даже если их об этом попросить, но образец не будет использоваться в дальнейших исследованиях.

[Teresh]

Правильно ли я понимаю, что это не типирование, а секвенирование, но с низким покрытием. Т.е. там в bam-файле и Y-хромосома может быть (у кого она есть).  Хорошо бы образец bam-файла от этой фирмы где-нибудь достать.

[Шад]

Хорошо бы образец bam-файла от этой фирмы где-нибудь достать.

Нужен подопытный кролик:)

[rLin]

Oleg V., а кто их знает, зачем это им, но тем не менее, пишут следующее: "If you withdraw from Seeq, we will no longer use your data for research, but we will not destroy your sample nor do we delete your data."
А новые услуги будут вводить, да. Проект заявляется исследовательским, а не коммерческим, поэтому всё покажут и расскажут, если будет о чём. Мне немного непонятно, чем их не устроил сбор данных от сторонних лабораторий, видать вирусы и бактерии - немаловажная часть задуманных исследований.
Советую интересующимся скачать приложение для смартфона. Там есть примеры результатов по микробиому и что-то типа Ancestry composition. Не сказать, что результаты сильно информативны и выглядят на свои 50$, но тем не менее.
В связи с наличием тестовых профилей, не исключено, что пример bam-файла по запросу тоже могут выслать, если объяснить зачем.

[Mich Glitch]

Если myheritage начнёт принимать данные от этой лаборатории...
Если myheritage доведёт свою обработку до ума...
Короче говоря, одни если. Но шанс на развитие имеется.   
Ведь в отличии от ДНАлэнд - это лаборатория, а не просто кучка интерпретаторов.

[rLin]

Накопал несколько странные, но таки примеры bam-файлов, которые генерирует эта организация.
Вот ссылка:
http://public.bam.s3.amazonaws.com/list.html
Взято из этой статьи:
https://medium.com/the-seeq-blog/sequencing-the-worlds-first-vegan-hamburger-3b06c17e4e2d#.kl74a2ua6

[rLin]

Я им послал письмо, не меньше недели назад, а то и дней десять, с вопросом о том, как они относятся к пересылке наборов в другие страны через shipito и прочие аналогичные сервисы (ну чтобы не было возвратов и прочего).
Обещали ответить через 24 часа (даже подтверждение прислали на почту), но не ответили. Обычно отвечают хоть что-то, так что скорее всего дело не в моём английском. Ну окей, есть и другие способы потратить 50 баксов.

[Mich Glitch]

Если с полным геномом обломится, в эту лабораторию сунусь. Именно из-за микробов и пр. заразы.   

*** Не к спеху. Речь ведь не идёт о промо акции. Пусть себе руку набивают.

[napobo3]

Из-за микоробов лучше обращаться в ubiome.com
В случае seeq.io микробы - это дешевый гиммик.

[rLin]

napobo3, спасибо! Интересные у них предложения.
А у вас была возможность сравнить результаты выдаваемые seeq.io (примеры есть в их приложении) и ubiome.com? Отчёт ubiome отличается какими-то подробностями (если не учитывать тот факт, что образцы мягко говоря из разных мест берутся)? Я пока нашёл описание результата теста в виде процентного содержания бактерий. В seeq.io есть похожий отчёт с процентным соотношением разных бактерий и вирусов, но правда только для ротовой полости.

Вот тут пишут, что дело это новое и один и тот же образец, посланный в разные лаборатории может приводить к разным результатам:
http://www.healthygutbugs.com/microbiome-analysis-ubiome/
В блоге компании ubiome по этому поводу есть запись: http://www.ubiomeblog.com/american-gut-and-ubiome-data/
Пишут, что на данный момент (2014й год) даже метод транспортировки образца могут влиять на бактерии в нём, поэтому результаты могут отличаться от случая к случаю.

[rLin]

Прислали они мне сегодня письмо:
Hi,
We wanted to do our part in making everyone's new year a bit happier, so we thought every user from 2016 should get a free kit in 2017!
If you haven't ordered a kit from Seeq, you can order one now for free in the Seeq app (https://seeq.io).
If you already have a kit, you can send one free kit to a friend by going to Profile->Invitations in the app.
Happy New Year!
Seeq

Зашёл в приложение (был там зарегистрирован, но ничего не заказывал). И правда, вместо 50$ набор стоит free.
Правда шлют они их только на американские адреса, поэтому с доставкой придётся заморочиться. А на вопрос об их отношении к пересылке через посредников они не ответили.
Вот такие дела. С одной стороны интересно, а с другой как-то я даже и не знаю, надо ли оно мне (шипито, почта и прочие радости).