0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.
Цитата: Semargl от 06 Октябрь 2016, 12:10:06Цитата: bulatv2 от 06 Октябрь 2016, 11:53:07поискал свои приватные снипы значит моих приватных снипов уже меньше можно считать?Какие ваши приватные снипы вы нашли в научной базе данных?если я все сделал правильно у меня из 8 best qual только один естьи один мой снип отсутствует с какими либо значениями остальные не совпадают
Цитата: bulatv2 от 06 Октябрь 2016, 11:53:07поискал свои приватные снипы значит моих приватных снипов уже меньше можно считать?Какие ваши приватные снипы вы нашли в научной базе данных?
поискал свои приватные снипы значит моих приватных снипов уже меньше можно считать?
вот этот снип ChrY: 19307129 C to Aконвертированный в hg38 chrY:17195198-17195299
Есть один C3(M407+) (позиция - chrY:2882367:A:G), с пометкой - unobserved
уважаемый Лесла отпровлял снипы Мусина-Пушкина в Yseq и один из них оказался известный
Цитата: Lesla от 06 Октябрь 2016, 13:04:56Есть один C3(M407+) (позиция - chrY:2882367:A:G), с пометкой - unobservedПредполагаю, что пометка unobserved означает отсутствие в БД образца с искомой мутацией.
Цитата: bulatv2 от 06 Октябрь 2016, 13:16:23вот этот снип ChrY: 19307129 C to Aконвертированный в hg38 chrY:17195198-17195299Вы наверное что-то не так сделали. Позиция этого вашего приватного снипа по hg38 - 17195249. В научной базе он не представлен.
Будьте так добры и снисходительны, если есть возможность, не могли бы глянуть, есть там кто-нибудь J1-M267 (hg19 22741818 T->G) или J1a3a-Z1842 (hg19 21138032 T->C)? Нет сейчас возможности проверить самому. Был бы крайне признателен.
@Semargl, NimissinСпасибо, получилосьВ базе один Q1b, что составляет менее 0,1% от выборкиПри этом он Q-YP1035https://www.yfull.com/tree/Q-YP1035/
с пометкой - unobserved
Или просто именованный снип, который внесен в базу, но не обнаружен пока ни в одном образце?