АвторТема: Detecting Genome-wide Variants of Eurasian Facial Shape Differentiation...  (Прочитано 1369 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн пенелопаАвтор темы

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 5862
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2092/-12
  • мтДНК: H1b
Detecting Genome-wide Variants of Eurasian Facial Shape Differentiation: DNA based Face Prediction Tested in Forensic Scenario

Lu Qiao, Yajun Yang, Pengcheng Fu, Sile Hu, Hang Zhou, Jingze Tan, Yan Lu, Haiyi Lou, Dongsheng Lu, Sijie Wu, Jing Guo, Shouneng Peng, Li Jin, Yaqun Guan, Sijia Wang, Shuhua Xu, Kun Tang
doi: http://dx.doi.org/10.1101/062950

Abstract

It is a long standing question as which genes define the characteristic facial features among different ethnic groups. In this study, we use Uyghurs, an ancient admixed population to query the genetic bases why Europeans and Han Chinese look different. Facial trait variations were analyzed based on high dense 3D facial images; numerous biometric spaces were examined for divergent facial features between European and Han Chinese, ranging from inner-landmarks to dense shape geometrics. A series of genome-wide association analyses were conducted on a discovery panel of Uyghurs. Six significant loci were identified and four of which, rs1868752, rs118078182, rs60159418 at or near UBASH3B, COL23A1, PCDH7 and rs17868256 were replicated in two independent cohorts of Uyghurs or Southern Han Chinese. We further developed a quantitative model to predict 3D faces based on 277 top GWAS SNPs. In hypothetic forensic scenarios, this model was found to significantly enhance the rate of suspect verification, suggesting a practical potential of related research.

http://biorxiv.org/content/early/2016/07/11/062950

Оффлайн FenriR

  • Сообщений: 2003
  • Страна: 00
  • Рейтинг +526/-2
  • Y-ДНК: N1c1-L1025
  • мтДНК: K1a
PCA   от Eurogenes:

Цитировать
Davidski said...
Here's a PCA done with 105 of the markers, including present-day and a few ancient samples.

https://drive.google.com/file/d/0B9o3EYTdM8lQOFpwbmkyeDl4WGs/view?usp=sharing

https://drive.google.com/file/d/0B9o3EYTdM8lQSVJBVHM1aGQ0UzA/view?usp=sharing
July 11, 2016 at 7:33 PM

Оффлайн FenriR

  • Сообщений: 2003
  • Страна: 00
  • Рейтинг +526/-2
  • Y-ДНК: N1c1-L1025
  • мтДНК: K1a
Цитировать
(a)
the association of rs1868752 with the distance between ExtCan and IntCan
я так понял, что этот снип связывают с расстоянием между внутренним и внешним уголками глаз.

PS у меня тоже T, но форма вполне европейская, вроде бы=))

Оффлайн FenriR

  • Сообщений: 2003
  • Страна: 00
  • Рейтинг +526/-2
  • Y-ДНК: N1c1-L1025
  • мтДНК: K1a
а я вот чем то похож на уйгура
но больше на узбека
интересно,
а со стороны, что говорят?)

PS Поляко попробует сделать PCA, включающий анализ более обширного списка генов, влияющих на "форму лица"
Davidski said...
Цитировать
Yeah, true. I'll try and do a more involved PCA of all of the available markers from the face shape genes.
July 12, 2016 at 3:37 AM

Оффлайн bulatv2

  • Сообщений: 191
  • Страна: ru
  • Рейтинг +54/-0
  • ftdna: 468412
  • Y-ДНК: R1a-YP682
  • мтДНК: H1b2
а я вот чем то похож на уйгура
но больше на узбека
интересно,
а со стороны, что говорят?)

PS Поляко попробует сделать PCA, включающий анализ более обширного списка генов, влияющих на "форму лица"
Davidski said...
Цитировать
Yeah, true. I'll try and do a more involved PCA of all of the available markers from the face shape genes.
July 12, 2016 at 3:37 AM
в прошлом году в шереметьево один вроде узбек или киргиз что то на своем мне сказал)

Оффлайн FenriR

  • Сообщений: 2003
  • Страна: 00
  • Рейтинг +526/-2
  • Y-ДНК: N1c1-L1025
  • мтДНК: K1a
http://генофонд.рф/?page_id=8496
как то читал эту статью
только сново посмотрел там совсем другие гены
их и должно быть больше, т.к. фенотипические признаки, как правило, кодируются "несколькими" генами

вот список некоторых генов, влияющих на такие физические характеристики, как черты лица и пигментация:
DCHS2, RUNX2, GLI3, PAX1, EDAR, OCA2, SLC45A2, SLC24A5, TYRP1, KITLG,  HERC2, M1RC, PAX3, PRDM16, TP63, c5orf50, col17a1, slc35d1, FGFR1, LRP6

в прошлом году в шереметьево один вроде узбек или киргиз что то на своем мне сказал)
так он, может быть, почувствовал в Вас своего "брата" по R1a)

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.


Rambler's Top100