АвторТема: дДНК с Ближнего Востока и Кавказа - от мезолита до бронзового века  (Прочитано 30583 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн rozenblattАвтор темы

  • Сообщений: 1174
  • Страна: kg
  • Рейтинг +1345/-0
  • Y-ДНК: C-F5481
  • мтДНК: M8a
На biorxiv выложили препринт новой статьи от лаборатории Райха:

http://biorxiv.org/content/early/2016/06/16/059311

The genetic structure of the world's first farmers

Abstract

We report genome-wide ancient DNA from 44 ancient Near Easterners ranging in time between ~12,000-1,400 BCE, from Natufian hunter-gatherers to Bronze Age farmers. We show that the earliest populations of the Near East derived around half their ancestry from a 'Basal Eurasian' lineage that had little if any Neanderthal admixture and that separated from other non-African lineages prior to their separation from each other. The first farmers of the southern Levant (Israel and Jordan) and Zagros Mountains (Iran) were strongly genetically differentiated, and each descended from local hunter-gatherers. By the time of the Bronze Age, these two populations and Anatolian-related farmers had mixed with each other and with the hunter-gatherers of Europe to drastically reduce genetic differentiation. The impact of the Near Eastern farmers extended beyond the Near East: farmers related to those of Anatolia spread westward into Europe; farmers related to those of the Levant spread southward into East Africa; farmers related to those from Iran spread northward into the Eurasian steppe; and people related to both the early farmers of Iran and to the pastoralists of the Eurasian steppe spread eastward into South Asia.

Оффлайн rozenblattАвтор темы

  • Сообщений: 1174
  • Страна: kg
  • Рейтинг +1345/-0
  • Y-ДНК: C-F5481
  • мтДНК: M8a
Быстро пробежался по статье. Основные выводы:

- Ранние земледельцы Анатолии, Ирана и Леванта происходят от местных охотников- собирателей. При этом генетически расстояния между ними огромны - отличия между ранними земледельцами Ирана и Леванта на уровне отличия китайцев от европейцев.
- Вскоре после освоения земледелия начинается экспансия. Анатолийцы идут в Европу, левантийцы в Восточную Африку, иранцы в Южную и возможно Среднюю Азию. На самом Ближнем Востоке популяции смешиваются между собой.

Оффлайн Srkz

  • Сообщений: 5521
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2305/-2
  • Y-ДНК: N-L1025*
  • мтДНК: U4a1e-pre T16093C T16311T
Современные южноазиаты моделируются, как смесь иранского неолита (Загрос), ямников и местного субстрата.
CHG и образец из южного Прикаспия моделируются, как смесь иранского неолита и EHG.

Оффлайн Mail

  • R1B1
  • Сообщений: 112
  • Страна: gb
  • Рейтинг +10/-0
  • SYUNIK

Оффлайн пенелопа

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 5709
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1844/-12
  • мтДНК: H1b

Оффлайн Yaroslav

  • Я всего лишь уличный повеса, Улыбающийся встречным лицам
  • Сообщений: 12754
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2535/-10
  • 76% East Europe + 17% Finland
  • Y-ДНК: J1a2b1a-ZS3114 > ZS3084, ЖМ: I2a1a2b1a1a1a1-Z16971 > Y159653, МЖМ: G2a2b1a1a1a2b2a-FT40739
  • мтДНК: K1b1a1-T199C, МЖ: H13a1a1d
Класс! дДНК J1 полку прибыло. Номенклатура по ISOGG у них?

Оффлайн rozenblattАвтор темы

  • Сообщений: 1174
  • Страна: kg
  • Рейтинг +1345/-0
  • Y-ДНК: C-F5481
  • мтДНК: M8a

Оффлайн FenriR

  • Сообщений: 1974
  • Страна: 00
  • Рейтинг +512/-2
  • Y-ДНК: N1c1-L1025
  • мтДНК: K1a
Вероятно, самый важный итог статьи:
стр. 30 пдф-документа статьи

Разумеется, эти результаты стоит воспринимать с достаточной степенью условности, к примеру:
возможно, EHG и смог бы добраться до южного Прикаспия, однако связь мезолитического образца из пещеры Hotu с охотниками-собирателями Восточной Европы может отражать вклад некой ANE-популяции, вероятно обитавшей в степях Прикавказья и северных районах Центральной Азии, и связь CHG с WHG, в результаты чего
 Iran_HotuIIIb моделируется как 90.6±4.4% Iran_N и 9.4±4.4% EHG, который, в свою очередь выходит на 3/4 ANE (Мальта/Афонтова гора) и 1/4 WHG (вклад западных охотников-собирателей может оказаться меньше, т.к. у них  самих есть примесь EHG:
стр. 10
Цитировать
We also
 document a cline of ANE ancestry across the east-west extent of Eurasia. Eastern Hunter
 Gatherers (EHG) derive ~3/4 of their ancestry from the ANE (Supplementary Information,
section 11); Scandinavian hunter-gatherers7,8,13 (SHG) are a mix of EHG and WHG; and
WHG are a mix of EHG and the Upper Paleolithic Bichon from Switzerland (Supplementary
Information, section 7).

Интересно, что на роль пресловутого "южного компонента" для ранней Бронзы евразийских степей (кластер включает в себя образцы Ямной, Афанасьевской и Полтавской культур) лучше всего подошел Медный век Ирана.
Стоит отметить, что в данном случае южный вклад у древних степняков заметно (~10%) снижается: от ~54% собственно CHG (входящего также и в  Iran_ChL)  до ~43% Iran_ChL.
Вероятно, это снижение может происходить из-за менее выраженного компонента EHG в образцах иранской Меди, что, скорее всего, говорит о более северном источнике адмикса у тех же ямников, если не предполагать "прострела" через Кавказ, когда некие популяции из Ирана проходят прямиком в степь, не цепляя генетического вклада древних насельников региона.
Авторы, как кажется, согласны с такой моделью:
supplementary information, p. 83-84
Цитировать
This led us to try one last model in which we model Steppe_EMBA as a 3-way mix of EHG, CHG,
and Iran_ChL. The P-value for rank=2 is 0.241, so 3 streams of ancestry are consistent with the
quadruple (Steppe_EMBA, EHG, CHG, Iran_ChL) and the fitted mixture proportions are 52.7±2.0%
EHG, 18.1±7.4% CHG, 29.2±5.9% Iran_ChL
. We do not want to overemphasize this 3-way mixture
model as the 2-way one is more parsimonious and consistent with the data (Table S7.11)
. Nonetheless
the 3-way model is also plausible as it suggests an explanation for the shared genetic drift between
Steppe_EMBA and the Anatolian and Levantine Neolithic  (underestimated when CHG alone is the
southern population; Table S7.12), and makes geographical sense as admixture from the Near East
could have arrived on the steppe via the Caucasian isthmus where an addition of CHG ancestry could
have occurred.
Т.е. кажется вполне вероятным наложение групп, схожих с Iran_ChL, на кавказский CHG-субстрат и движение этой новой популяции в степь, где она смешивается с автохтонными EHG.
Причем " shared genetic drift between Steppe_EMBA and the Anatolian and Levantine Neolithic" можно интерпретировать и как минорное (?) влияние собственно европейских (трипольских?) земледельцев на EHG-CHG основу ямников.
Сам же Иранский неолит, без северо-евразийского вклада, на роль источника "южной примеси", видимо, решительно не подходит, что согласуется с выводами
Llorente et al., The Neolithic Revolution developed among geographically adjacent but genetically distinct populations, oral presentation (35146), Society for Molecular Biology and Evolution Conference 2016
Цитировать
...
 Despite their key role in developing the Neolithic package, the inhabitants of Ganj Dareh made little direct genetic contribution to modern European populations, suggesting they were somewhat isolated from other populations in this region. Their high frequency of short runs of homozygosity, comparable to other early Neolithic farmers, suggests that they overwintered the Last Glacial Maximum in a climatically favourable area, where they may have received a genetic contribution from a population basal to modern Eurasians.
...
Удивительно, но ни CHG, ни иранские сэмплы дДНК, ни образцы Медного века Армении (таким образом общее количество дДНК из релевантного региона Кавказа и Закавказья, в широком смысле, достигает 11 образцов) не обнаружили мужских гаплогрупп R1a/R1b, преобладавших среди степняков эпохи Энеолита-Бронзы, в то время как у 4 из 6 образцов до-"курганного" населения Восточной Европы эти гг имелись.
Правда, у I1945 Iran_ChL нашли P (xQ) - ждем более глубокого анализа.

PS Надеюсь, любители сравнят южный вклад у энеолитического Хвалынска и Ямной.


Авторы также коснулись происхождения северо-индийского ANI,
ожидаемо, он получился смесью Ближнего Востока/Ирана с некими степными популяциями:
supplementary information, p. 123
Цитировать
This section places
constraints on the possible sources of ANI ancestry in India by showing that single populations of
ancient West Eurasia are not feasible sources (Table S9.1) while pairs of populations involving
Steppe/Iran ancestry are
(Tables S9.2 and S9.3). The geographical interpretation of this finding is
unclear; mixtures of Steppe/Iran-related ancestry (such as Steppe_EMBA and Steppe_Eneolithic)
were formed in West Eurasia and it is possible that a currently unsampled such mixed population is
responsible for the ANI ancestry in South Asia. Alternatively, admixture may have taken place by
combinations of Steppe/Iran-related groups in central or south Asia

некоторым сюрпризом оказалось то, что на роль степной популяции лучше подходят группы ранней Бронзы, а не средней (навроде, Андроновской, Синташтинской или Срубной культур):
Цитировать
While the Early/Middle Bronze Age ‘Yamnaya’-related group (Steppe_EMBA) is a good genetic
match (together with Neolithic Iran) for ANI
, the later Middle/Late Bronze Age steppe population
(Steppe_MLBA) is not
. Steppe_MLBA includes Sintashta and Andronovo populations who have been
proposed as identical to or related to ancestral Indo-Iranians9,19, as well as the Srubnaya from eastern
Europe which are related to South Asians by their possession of Y-chromosome haplogroup
R1a1a1b2-Z935
учитывая, что у нас пока нет образцов Бронзы южнее северного Казахстана (Гонур-Депе на подходе), а также то, что те же андроновцы формируются при, условно, схожем с "кшк"-влиянии на "ямно-подобный" генетический субстрат, а потом накладываются на центрально-азиатские популяции этот вывод перестает так уж сильно удивлять.

Оффлайн Srkz

  • Сообщений: 5521
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2305/-2
  • Y-ДНК: N-L1025*
  • мтДНК: U4a1e-pre T16093C T16311T
Удивительно, но ни CHG, ни иранские сэмплы дДНК, ни образцы Медного века Армении (таким образом общее количество дДНК из релевантного региона Кавказа и Закавказья, в широком смысле, достигает 11 образцов) не обнаружили мужских гаплогрупп R1a/R1b, преобладавших среди степняков эпохи Энеолита-Бронзы, в то время как у 4 из 6 образцов до-"курганного" населения Восточной Европы эти гг имелись.
Сарказм? :D

Оффлайн FenriR

  • Сообщений: 1974
  • Страна: 00
  • Рейтинг +512/-2
  • Y-ДНК: N1c1-L1025
  • мтДНК: K1a

Оффлайн пенелопа

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 5709
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1844/-12
  • мтДНК: H1b
А недотипированный образец? Он же вполне может быть...

Оффлайн пенелопа

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 5709
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1844/-12
  • мтДНК: H1b
В любом случае, все больше убеждаешься, что наделять игреки какой-либо "национальностью" на такую глубину - дело довольно бессмысленное. И привязывать распространение каких-либо технологий к определенной гаплогруппе - тоже.

Оффлайн Pre Slav

  • Где начало того конца которым оканчивается начало?
  • Сообщений: 1696
  • Страна: 00
  • Рейтинг +122/-92
Iran_N P1(xQ, R1b1a2, R1a1a1b1a1b, R1a1a1b1a3a, R1a1a1b2a2a) так что если он и R, то скорее всего R2...

Оффлайн FenriR

  • Сообщений: 1974
  • Страна: 00
  • Рейтинг +512/-2
  • Y-ДНК: N1c1-L1025
  • мтДНК: K1a
А недотипированный образец? Он же вполне может быть...
строго говоря, да - может.
только статистика не на стороне регионов южнее Кавказа: в Восточной Европе исследовали до-бронзовых образцов меньше, а R1a/R1b все равно обнаружили больше, точнее - только там их до сего дня и находили.
В любом случае, все больше убеждаешься, что наделять игреки какой-либо "национальностью" на такую глубину - дело довольно бессмысленное. И привязывать распространение каких-либо технологий к определенной гаплогруппе - тоже.
наоборот, в древности человеческие коллективы были более изолированы, нежели сегодня, поэтому корреляция  каких-то Y с "национальностью" (более корректно, наверное, с географическим происхождением) вполне может иметь место - посмотрите на таблицу, которую Вы сами привели выше)

Оффлайн Mail

  • R1B1
  • Сообщений: 112
  • Страна: gb
  • Рейтинг +10/-0
  • SYUNIK
Класс! дДНК J1 полку прибыло. Номенклатура по ISOGG у них?
:-*

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.


Rambler's Top100