АвторТема: дДНК с Ближнего Востока и Кавказа - от мезолита до бронзового века  (Прочитано 30607 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн FenriR

  • Сообщений: 1975
  • Страна: 00
  • Рейтинг +512/-2
  • Y-ДНК: N1c1-L1025
  • мтДНК: K1a
Вероятно, самый важный итог статьи:
стр. 30 пдф-документа статьи

...
Авторы также коснулись происхождения северо-индийского ANI,
ожидаемо, он получился смесью Ближнего Востока/Ирана с некими степными популяциями:
supplementary information, p. 123
Цитировать
This section places
constraints on the possible sources of ANI ancestry in India by showing that single populations of
ancient West Eurasia are not feasible sources (Table S9.1) while pairs of populations involving
Steppe/Iran ancestry are
(Tables S9.2 and S9.3). The geographical interpretation of this finding is
unclear; mixtures of Steppe/Iran-related ancestry (such as Steppe_EMBA and Steppe_Eneolithic)
were formed in West Eurasia and it is possible that a currently unsampled such mixed population is
responsible for the ANI ancestry in South Asia. Alternatively, admixture may have taken place by
combinations of Steppe/Iran-related groups in central or south Asia

некоторым сюрпризом оказалось то, что на роль степной популяции лучше подходят группы ранней Бронзы, а не средней (навроде, Андроновской, Синташтинской или Срубной культур):
Цитировать
While the Early/Middle Bronze Age ‘Yamnaya’-related group (Steppe_EMBA) is a good genetic
match (together with Neolithic Iran) for ANI
, the later Middle/Late Bronze Age steppe population
(Steppe_MLBA) is not
. Steppe_MLBA includes Sintashta and Andronovo populations who have been
proposed as identical to or related to ancestral Indo-Iranians9,19, as well as the Srubnaya from eastern
Europe which are related to South Asians by their possession of Y-chromosome haplogroup
R1a1a1b2-Z935
учитывая, что у нас пока нет образцов Бронзы южнее северного Казахстана (Гонур-Депе на подходе), а также то, что те же андроновцы формируются при, условно, схожем с "кшк"-влиянии на "ямно-подобный" генетический субстрат, а потом накладываются на центрально-азиатские популяции этот вывод перестает так уж сильно удивлять.

Обратите внимание на admixture-анализ, приведенный выше:
основное отличие ранней Бронзы (EMBA) от средней (MLBA) - повышение компонентов, связанных с неолитом Леванта, а также западноевропейскими охотниками-собирателями WHG  и, соответственно, понижение EHG-влияния.
вероятно, именно дополнительный ANE и делает ямников лучшим прокси для моделирования степного вклада в современные южно-азиатские популяции, раз вторым слагаемым выступил Иранский неолит, не обнаруживающий примеси из региона восточного Средиземноморья.
Тут, как обычно, есть несколько вариантов, к примеру: или южно-азиатский субстрат уже имел адмикс северно-евразийского компонента (в том же БМАК), не связанного с миграциями степняков эпохи Бронзы или же сами степняки, двинувшиеся на юго-восток, были более "северо-восточными", по сравнению с другими образцами "ямного"-кластера.
Для второго варианта хорошо бы подошел аномальный образец Срубной культуры (Srubnaya outlier, I0354) из под Самары:
The Srubnaya outlier
Цитировать
I just ran a quick PC/nMonte analysis of 55 individuals from across South Central Asia
...
The input data can be downloaded here. I didn't save the distances, but most of these models were pretty tight largely thanks to three sets of reference samples:

- Mesolithic genome Kotias KK1 from the western Caucasus, Georgia
- present-day Paniya from South India
- Bronze Age genome Srubnaya outlier from Samara, Russia

It's an interesting question why the Srubnaya outlier (Mathieson et al. 2015 sample I0354) is such a good reference in this analysis. I suspect it has something to do, at least in part, with her forager-like genotype and inflated affinity to Siberian Upper Paleolithic Hunter-Gatherer MA1. Check out the formal stats and Principal Component Analysis (PCA) below. Fascinating stuff.
...



Что же касается "туристического" статуса образцов армянской Меди, что-то они слишком похожи на последующие сэмплы Бронзовой эпохи и даже образуют с ними один кластер:
http://biorxiv.org/content/biorxiv/suppl/2016/06/16/059311.DC1/059311-1.pdf, стр. 97
Цитировать
Bronze Age Armenia: Armenia_EBA and Armenia_MLBA
The Bronze Age samples from Armenia cluster with the Chalcolithic ones, but do not overlap with
them; during the Early Bronze Age there is an “eastward” shift away from Europe; and during the
Middle/Late Bronze Age a partial “westward” counter-shift in the opposite direction. This is
confirmed with f4-statistics in Fig. S7.16, 17.
да и от более древнего CHG они не сказать, чтобы очень уж сильно отличались: у них добавляется примесь переднеазиатских земледельцев и некоторый процент WHG-вклада (что довольно сложно интерпретировать, ведь сами древние анатолийцы, вероятно, испытали влияние, сходного с WHG, компонента), что вполне ожидаемо, учитывая географическую близость образцов к собственно Анатолии
Цитировать
Recall that CHG itself
can be modeled as a mixture of EHG and Iran_N, and thus our observation that Armenia_EBA can be
modeled as an Anatolia_N+CHG mixture, while Armenia_ChL could be modeled as an
Anatolia_N+EHG+Iran_N mix
, does not indicate either the “disappearance” or the “appearance” of a
wholly new population element in Armenia at the Bronze Age transition. It only indicates that while
the CHG can account for the non-Anatolian element in the Early Bronze Age mix, it cannot do so in
the Chalcolithic mix (Table S7.18).
дополнительный ANE в данном случае может происходить от соседних же (к востоку) популяций, восходящих к иранскому мезолиту.
т.е. Armenia_ChL вполне себе автохтонное население региона, испытавшее генетическое влияние от соседних групп-  ничего необычного, имхо.

Оффлайн Yaroslav

  • Я всего лишь уличный повеса, Улыбающийся встречным лицам
  • Сообщений: 12805
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2542/-10
  • 76% East Europe + 17% Finland
  • Y-ДНК: J1a2b1a-ZS3114 > ZS3084, ЖМ: I2a1a2b1a1a1a1-Z16971 > Y159653, МЖМ: G2a2b1a1a1a2b2a-FT40739
  • мтДНК: K1b1a1-T199C, МЖ: H13a1a1d
Это техническая метка.

Прошу прощения, не знал, что в Семаргле такое возможно. А я уж подумал, что вот, живут люди в той же самой местности со времён меди ;D

Оффлайн Mail

  • R1B1
  • Сообщений: 112
  • Страна: gb
  • Рейтинг +10/-0
  • SYUNIK
togda sredi armyan seychas takogo subklada netu :D

Есть, но очень мало, ~0,3%.
Karen kit nomera skazhi :)

Оффлайн Mail

  • R1B1
  • Сообщений: 112
  • Страна: gb
  • Рейтинг +10/-0
  • SYUNIK
туристы  ;D
...врядли, учитывая современное распределение гаплогруппы L, кавказ, ближний восток, юг индии...
шумеры тоже были туристами  :( ,да  и земледельцы распространители  :P
...а причем тут шумеры????
A при том что туристы были и в неолите и в энеолите  :-*
...бессмыслица какая... начнем с того что шумеры это бронзовый век... но не в этом дело, распространение субкладов L указывает на вполне нормальное распространение... туристами же называется совсем другое...
 
nu smotrya kto chto podrazumevaet pod slovom turist :D

Оффлайн Mail

  • R1B1
  • Сообщений: 112
  • Страна: gb
  • Рейтинг +10/-0
  • SYUNIK
Вероятно, самый важный итог статьи:
стр. 30 пдф-документа статьи

...
Авторы также коснулись происхождения северо-индийского ANI,
ожидаемо, он получился смесью Ближнего Востока/Ирана с некими степными популяциями:
supplementary information, p. 123
Цитировать
This section places
constraints on the possible sources of ANI ancestry in India by showing that single populations of
ancient West Eurasia are not feasible sources (Table S9.1) while pairs of populations involving
Steppe/Iran ancestry are
(Tables S9.2 and S9.3). The geographical interpretation of this finding is
unclear; mixtures of Steppe/Iran-related ancestry (such as Steppe_EMBA and Steppe_Eneolithic)
were formed in West Eurasia and it is possible that a currently unsampled such mixed population is
responsible for the ANI ancestry in South Asia. Alternatively, admixture may have taken place by
combinations of Steppe/Iran-related groups in central or south Asia

некоторым сюрпризом оказалось то, что на роль степной популяции лучше подходят группы ранней Бронзы, а не средней (навроде, Андроновской, Синташтинской или Срубной культур):
Цитировать
While the Early/Middle Bronze Age ‘Yamnaya’-related group (Steppe_EMBA) is a good genetic
match (together with Neolithic Iran) for ANI
, the later Middle/Late Bronze Age steppe population
(Steppe_MLBA) is not
. Steppe_MLBA includes Sintashta and Andronovo populations who have been
proposed as identical to or related to ancestral Indo-Iranians9,19, as well as the Srubnaya from eastern
Europe which are related to South Asians by their possession of Y-chromosome haplogroup
R1a1a1b2-Z935
учитывая, что у нас пока нет образцов Бронзы южнее северного Казахстана (Гонур-Депе на подходе), а также то, что те же андроновцы формируются при, условно, схожем с "кшк"-влиянии на "ямно-подобный" генетический субстрат, а потом накладываются на центрально-азиатские популяции этот вывод перестает так уж сильно удивлять.

Обратите внимание на admixture-анализ, приведенный выше:
основное отличие ранней Бронзы (EMBA) от средней (MLBA) - повышение компонентов, связанных с неолитом Леванта, а также западноевропейскими охотниками-собирателями WHG  и, соответственно, понижение EHG-влияния.
вероятно, именно дополнительный ANE и делает ямников лучшим прокси для моделирования степного вклада в современные южно-азиатские популяции, раз вторым слагаемым выступил Иранский неолит, не обнаруживающий примеси из региона восточного Средиземноморья.
Тут, как обычно, есть несколько вариантов, к примеру: или южно-азиатский субстрат уже имел адмикс северно-евразийского компонента (в том же БМАК), не связанного с миграциями степняков эпохи Бронзы или же сами степняки, двинувшиеся на юго-восток, были более "северо-восточными", по сравнению с другими образцами "ямного"-кластера.
Для второго варианта хорошо бы подошел аномальный образец Срубной культуры (Srubnaya outlier, I0354) из под Самары:
The Srubnaya outlier
Цитировать
I just ran a quick PC/nMonte analysis of 55 individuals from across South Central Asia
...
The input data can be downloaded here. I didn't save the distances, but most of these models were pretty tight largely thanks to three sets of reference samples:

- Mesolithic genome Kotias KK1 from the western Caucasus, Georgia
- present-day Paniya from South India
- Bronze Age genome Srubnaya outlier from Samara, Russia

It's an interesting question why the Srubnaya outlier (Mathieson et al. 2015 sample I0354) is such a good reference in this analysis. I suspect it has something to do, at least in part, with her forager-like genotype and inflated affinity to Siberian Upper Paleolithic Hunter-Gatherer MA1. Check out the formal stats and Principal Component Analysis (PCA) below. Fascinating stuff.
...



Что же касается "туристического" статуса образцов армянской Меди, что-то они слишком похожи на последующие сэмплы Бронзовой эпохи и даже образуют с ними один кластер:
http://biorxiv.org/content/biorxiv/suppl/2016/06/16/059311.DC1/059311-1.pdf, стр. 97
Цитировать
Bronze Age Armenia: Armenia_EBA and Armenia_MLBA
The Bronze Age samples from Armenia cluster with the Chalcolithic ones, but do not overlap with
them; during the Early Bronze Age there is an “eastward” shift away from Europe; and during the
Middle/Late Bronze Age a partial “westward” counter-shift in the opposite direction. This is
confirmed with f4-statistics in Fig. S7.16, 17.
да и от более древнего CHG они не сказать, чтобы очень уж сильно отличались: у них добавляется примесь переднеазиатских земледельцев и некоторый процент WHG-вклада (что довольно сложно интерпретировать, ведь сами древние анатолийцы, вероятно, испытали влияние, сходного с WHG, компонента), что вполне ожидаемо, учитывая географическую близость образцов к собственно Анатолии
Цитировать
Recall that CHG itself
can be modeled as a mixture of EHG and Iran_N, and thus our observation that Armenia_EBA can be
modeled as an Anatolia_N+CHG mixture, while Armenia_ChL could be modeled as an
Anatolia_N+EHG+Iran_N mix
, does not indicate either the “disappearance” or the “appearance” of a
wholly new population element in Armenia at the Bronze Age transition. It only indicates that while
the CHG can account for the non-Anatolian element in the Early Bronze Age mix, it cannot do so in
the Chalcolithic mix (Table S7.18).
дополнительный ANE в данном случае может происходить от соседних же (к востоку) популяций, восходящих к иранскому мезолиту.
т.е. Armenia_ChL вполне себе автохтонное население региона, испытавшее генетическое влияние от соседних групп-  ничего необычного, имхо.
пришел этот Л-М27 вот именно с юга,а если и еще 300 лет тому назад и влился в местные Мтдна ,то как ты можешь быть уверенным о не туристическом происхождении этих 6000 летних Аренийцев по отцовской линии?

Оффлайн Arame

  • Сообщений: 708
  • Страна: am
  • Рейтинг +260/-1
  • J1-Z1842
У Аренийцев 18% EHG согласно графику.


Оффлайн Mail

  • R1B1
  • Сообщений: 112
  • Страна: gb
  • Рейтинг +10/-0
  • SYUNIK
У Аренийцев 18% EHG согласно графику.
dumaehs ot kogo eti EHG?OT mestnix zhenshin? :)

Оффлайн Farroukh

  • Maternal Y-DNA: R1b-L584
  • ...
  • Сообщений: 11494
  • Страна: az
  • Рейтинг +2143/-15
  • Paternal Mt-DNA: M9a1b1
    • Azerbaijan DNA Project
  • Y-ДНК: E-Y37518
  • мтДНК: F2f
Полагаю, сразу три L-M27 в одном месте можно объяснить семейным захоронением.
То же можно сказать про E-Z830 из Леванта

Оффлайн Arame

  • Сообщений: 708
  • Страна: am
  • Рейтинг +260/-1
  • J1-Z1842
Карен
Мгер проверил кажется у нас нету М27+.
В армянском проэкте есть М357+ два случая. И естественно много в чеченском кластере.  М357 является братом М27-а.

Понтийский кластер вообще далек от них.







Оффлайн Arame

  • Сообщений: 708
  • Страна: am
  • Рейтинг +260/-1
  • J1-Z1842
Фарух

Думаю ты прав. Еще двое имеют мтДНК К1а8
То есть опять скорее всего родственники.

Оффлайн пенелопа

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 5709
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1845/-12
  • мтДНК: H1b
Полагаю, сразу три L-M27 в одном месте можно объяснить семейным захоронением.
Так ведь в зависимости от того, насколько глубок был анализ. Надо будет текст внимательнее почитать... есть ли там что-то о родственности...

P.S. Три L-M27, даты:
407: 1115-895 calBCE (2827±40 BP, UBA-27938)
632: 4230-4000 calBCE (5285±29 BP, OxA-18599)
634: 4330-4060 calBCE (5366±31 BP, OxA-19331)

407-ой выложен, его раньше делали: http://www.ebi.ac.uk/ena/data/view/ERS699099
Двух других пока нет.
« Последнее редактирование: 18 Июнь 2016, 11:58:05 от пенелопа »

Оффлайн Srkz

  • Сообщений: 5523
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2309/-2
  • Y-ДНК: N-L1025*
  • мтДНК: U4a1e-pre T16093C T16311T
Обычно из двух близких родственников отбрасывают тот образец, который прочитан хуже, и в статье не используют. Но не знаю, до какой степени родства проверяют.

Оффлайн пенелопа

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 5709
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1845/-12
  • мтДНК: H1b
Обычно из двух близких родственников отбрасывают тот образец, который прочитан хуже, и в статье не используют. Но не знаю, до какой степени родства проверяют.
То есть о семейных захоронениях можно не говорить.

А вообще реально доказанных близких родственников как до исследований допускать? Хотя они и древние и достойны всяческого уважения :) Это ж какой перекос результатов будет ??? Да быть того не может.
« Последнее редактирование: 18 Июнь 2016, 15:25:26 от пенелопа »

Оффлайн Yaroslav

  • Я всего лишь уличный повеса, Улыбающийся встречным лицам
  • Сообщений: 12805
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2542/-10
  • 76% East Europe + 17% Finland
  • Y-ДНК: J1a2b1a-ZS3114 > ZS3084, ЖМ: I2a1a2b1a1a1a1-Z16971 > Y159653, МЖМ: G2a2b1a1a1a2b2a-FT40739
  • мтДНК: K1b1a1-T199C, МЖ: H13a1a1d
Сейчас не за компом. Подскажите, плиз, раннебронзовый иорданец J1 из какого захоронения?

Онлайн rozenblattАвтор темы

  • Сообщений: 1175
  • Страна: kg
  • Рейтинг +1345/-0
  • Y-ДНК: C-F5481
  • мтДНК: M8a
Сейчас не за компом. Подскажите, плиз, раннебронзовый иорданец J1 из какого захоронения?

Пещера рядом с Айн-Газалем:

The three Early Bronze Age samples analyzed in this study were found in a cave high above the East Field of ‘Ain Ghazal and are probably associated with an Early Bronze Age village about 450 meters south of the Neolithic town.

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.


Rambler's Top100