АвторТема: BigY: pro et contra  (Прочитано 17520 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн evgivanov

  • Сообщений: 253
  • Страна: ru
  • Рейтинг +66/-0
  • Y-ДНК: R1a-Z92 (YP682+, YP1261+)
Re: BigY: pro et contra
« Ответ #270 : 27 Апрель 2018, 21:35:52 »
Кстати, подтвердили что вышлют все БАМ файлы до 26 мая.
Здравствуйте!
Только вам или всем тем, кто заказал bigY до реформы ?
С уважением, Артём.

мне сегодня тоже подтвердили, что БАМ будут готовы до конца мая.

we are planning on getting BAM files available before the end of May and I believe we are going to be notifying people as well that they can download then again

Оффлайн kaun

  • Сообщений: 119
  • Страна: ru
  • Рейтинг +17/-0
  • Y-ДНК: R-YP5295
Re: BigY: pro et contra
« Ответ #271 : 27 Апрель 2018, 22:02:27 »
Кстати, подтвердили что вышлют все БАМ файлы до 26 мая.
Здравствуйте!
Только вам или всем тем, кто заказал bigY до реформы ?
С уважением, Артём.

мне сегодня тоже подтвердили, что БАМ будут готовы до конца мая.
we are planning on getting BAM files available before the end of May and I believe we are going to be notifying people as well that they can download then again
Если так, то слегка полегачало - у меня двое дореформенных совпаденцев ждут эти файлы и никак всё ещё получить не могут ...
С уважением, kaun.

Оффлайн Юрий C

  • Сообщений: 298
  • Страна: ru
  • Рейтинг +66/-1
  • Y-ДНК: R1a1a R-FGC46016 № 264855
  • мтДНК: T2b
Re: BigY: pro et contra
« Ответ #272 : 02 Июль 2018, 14:27:03 »
Здравствуйте! Если, я сделаю BigY, то смогу ли более точно вычислить общего предка для этих гаплотипов? Шереметевы  изначально выходят из рода Кобылы.

264855   Семен Федорович Кобыла,боярин,г.р.~1360, из Литвы   Russian Federation   R-Z283   14   24   16   10   11-15   12   12   10   13   11   30   15   9-9   11   11   23   14   20   33   12-13-15-16   11   12   19-23   15   16   19   20   33-38   14   11   11   8   17-17   8   12   10   8   11   10   12   22-22   15   10   12   12   13   8   14   22   21   12   12   12   13   11   11   12   14   31   15   9   17   11   26   27   19   12   12   12   12   10   9   12   11   10   11   11   29   12   14   25   14   9   10   19   15   18   11   23   16   12   15   24   12   24   19   10   15   17   9   11   11
MK25643   Федор Шереметев, Краснослободский уезд, 1720-40г.р   Russian Federation   R-M198   14   24   16   10   12-12-12-15   12   12   10   13   11   30   15   9-10     11   11   24   14   20   31   13-13-16-16   11   12   19-23   15   16   19   19   34-42   14   11   11   8   17-17   8   12   10   8   11   10   12   22-22   15   10   12   12   14   8   13   22   21   12   12   12   13   11   11   12   13   31   15   9   15   11   26   27   19   12   11   12   12   10   9   12   11   10   11   11   29   12   13   25   14   9   10   19   15   18   11   24   16   12   15   24   12   24   19   10   15   17   9   11   11

Оффлайн Daemon2017

  • Сообщений: 978
  • Страна: ru
  • Рейтинг +301/-14
  • Y-ДНК: R1a-Y35177/BY89957
  • мтДНК: V7a1
Re: BigY: pro et contra
« Ответ #273 : 02 Июль 2018, 14:48:12 »
Здравствуйте! Если, я сделаю BigY, то смогу ли более точно вычислить общего предка для этих гаплотипов? Шереметевы  изначально выходят из рода Кобылы.

264855   Семен Федорович Кобыла,боярин,г.р.~1360, из Литвы   Russian Federation   R-Z283   14   24   16   10   11-15   12   12   10   13   11   30   15   9-9   11   11   23   14   20   33   12-13-15-16   11   12   19-23   15   16   19   20   33-38   14   11   11   8   17-17   8   12   10   8   11   10   12   22-22   15   10   12   12   13   8   14   22   21   12   12   12   13   11   11   12   14   31   15   9   17   11   26   27   19   12   12   12   12   10   9   12   11   10   11   11   29   12   14   25   14   9   10   19   15   18   11   23   16   12   15   24   12   24   19   10   15   17   9   11   11
MK25643   Федор Шереметев, Краснослободский уезд, 1720-40г.р   Russian Federation   R-M198   14   24   16   10   12-12-12-15   12   12   10   13   11   30   15   9-10     11   11   24   14   20   31   13-13-16-16   11   12   19-23   15   16   19   19   34-42   14   11   11   8   17-17   8   12   10   8   11   10   12   22-22   15   10   12   12   14   8   13   22   21   12   12   12   13   11   11   12   13   31   15   9   15   11   26   27   19   12   11   12   12   10   9   12   11   10   11   11   29   12   13   25   14   9   10   19   15   18   11   24   16   12   15   24   12   24   19   10   15   17   9   11   11

Да, точность +-100 лет (3-4 поколения) BigY обеспечивает точно. Где-то видел точность +-50 (1-2 поколения) лет, но это, возможно, точность Fullgenomes - у них покрытие получше, а значит и снипов новых будет найдено больше.

Оффлайн Юрий C

  • Сообщений: 298
  • Страна: ru
  • Рейтинг +66/-1
  • Y-ДНК: R1a1a R-FGC46016 № 264855
  • мтДНК: T2b
Re: BigY: pro et contra
« Ответ #274 : 02 Июль 2018, 14:55:55 »
Daemon2017, Спасибо за ответ. Думаю, в начале сделать Big Y, может, за это время еще совпаденцы подтянутся.

Оффлайн Юрий C

  • Сообщений: 298
  • Страна: ru
  • Рейтинг +66/-1
  • Y-ДНК: R1a1a R-FGC46016 № 264855
  • мтДНК: T2b
Re: BigY: pro et contra
« Ответ #275 : 08 Июль 2018, 18:52:34 »
У меня складывается впечатление, что по STR - маркерам можно расчеты делать только лет до 300, а далее нарастает дисперсия и доверять , например,  формулам Клесова абсолютно нельзя.

Оффлайн ankr21

  • Сообщений: 2103
  • Страна: ru
  • Рейтинг +437/-0
  • Y-ДНК: I1-L1302
  • мтДНК: U3b1b
Re: BigY: pro et contra
« Ответ #276 : 08 Июль 2018, 20:01:38 »
Здравствуйте! Если, я сделаю BigY, то смогу ли более точно вычислить общего предка для этих гаплотипов? Шереметевы  изначально выходят из рода Кобылы.

264855   Семен Федорович Кобыла,боярин,г.р.~1360, из Литвы   Russian Federation   R-Z283   14   24   16   10   11-15   12   12   10   13   11   30   15   9-9   11   11   23   14   20   33   12-13-15-16   11   12   19-23   15   16   19   20   33-38   14   11   11   8   17-17   8   12   10   8   11   10   12   22-22   15   10   12   12   13   8   14   22   21   12   12   12   13   11   11   12   14   31   15   9   17   11   26   27   19   12   12   12   12   10   9   12   11   10   11   11   29   12   14   25   14   9   10   19   15   18   11   23   16   12   15   24   12   24   19   10   15   17   9   11   11
MK25643   Федор Шереметев, Краснослободский уезд, 1720-40г.р   Russian Federation   R-M198   14   24   16   10   12-12-12-15   12   12   10   13   11   30   15   9-10     11   11   24   14   20   31   13-13-16-16   11   12   19-23   15   16   19   19   34-42   14   11   11   8   17-17   8   12   10   8   11   10   12   22-22   15   10   12   12   14   8   13   22   21   12   12   12   13   11   11   12   13   31   15   9   15   11   26   27   19   12   11   12   12   10   9   12   11   10   11   11   29   12   13   25   14   9   10   19   15   18   11   24   16   12   15   24   12   24   19   10   15   17   9   11   11

Да, точность +-100 лет (3-4 поколения) BigY обеспечивает точно. Где-то видел точность +-50 (1-2 поколения) лет, но это, возможно, точность Fullgenomes - у них покрытие получше, а значит и снипов новых будет найдено больше.
Бывают исключения. Мне и моему троюродному брату насчитали 500 лет до общего предка вместо 125.

Оффлайн Юрий C

  • Сообщений: 298
  • Страна: ru
  • Рейтинг +66/-1
  • Y-ДНК: R1a1a R-FGC46016 № 264855
  • мтДНК: T2b
Re: BigY: pro et contra
« Ответ #277 : 09 Июль 2018, 03:51:32 »
 ankr21, есть мнение , что на коротких временных расстояниях считать лучше по 111 STR- маркерам, а вглубь истории точнее будет по SNP, но для меня все эти подсчеты пока мало понятны. Big Y заказал, поэтому надеюсь, что познания будут увеличиваться и многое проясниться.

Оффлайн Шад

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6067
  • Страна: ru
  • Рейтинг +982/-4
  • Ex oriente lux
  • Y-ДНК: Q1b1a
  • мтДНК: J1c2
Re: BigY: pro et contra
« Ответ #278 : 30 Январь 2019, 21:13:19 »
Скоро обещают BigY-700

+200 STR

Сроки ожидания результатов (бесплатно сделают апгрейд для тех у кого был заказан, но не получен  BigY-500)



Цена для заказа


Оффлайн Evgeny Kolchugin

  • Сообщений: 322
  • Страна: ru
  • Рейтинг +76/-0
  • Y-ДНК: R1a-YP5814; R1a-YP1698; R1a-YP578; R1a-Y16755
  • мтДНК: K1a1b; Т2
Re: BigY: pro et contra
« Ответ #279 : 30 Январь 2019, 22:41:56 »
+200 STR

Сроки ожидания результатов (бесплатно сделают апгрейд для тех у кого был заказан, но не получен  BigY-500)
А остальным они и даром не нужны. В ту ли сторону лаборатория свой Биг развивает?

Оффлайн Ankor

  • Сообщений: 216
  • Страна: ru
  • Рейтинг +89/-0
Re: BigY: pro et contra
« Ответ #280 : 30 Январь 2019, 22:45:06 »
+200 STR

Сроки ожидания результатов (бесплатно сделают апгрейд для тех у кого был заказан, но не получен  BigY-500)
А остальным они и даром не нужны. В ту ли сторону лаборатория свой Биг развивает?
Они еще  обещают лучшее качество и покрытие. Как только кто-нибудь свой BigY-700 зальет на YFull, можно будет делать выводы

Оффлайн Mich Glitch

  • Genus regis
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 32199
  • Страна: ca
  • Рейтинг +2470/-41
  • Y-ДНК: J2b1
  • мтДНК: H6a1a5
Re: BigY: pro et contra
« Ответ #281 : 31 Январь 2019, 01:10:01 »
Как раз под такой случай, один свой предковый гаплотип берёг.

::)


Без суеты и спешки закажу его на рождественские скидки. То есть, через 11 месяцев.

;D

Оффлайн NathanS

  • Сообщений: 83
  • Рейтинг +44/-1
Re: BigY: pro et contra
« Ответ #282 : 31 Январь 2019, 01:44:44 »
+200 STR

Сроки ожидания результатов (бесплатно сделают апгрейд для тех у кого был заказан, но не получен  BigY-500)
А остальным они и даром не нужны. В ту ли сторону лаборатория свой Биг развивает?

Полностью согласен. При наличии SNP менее интересны STR. У меня на Y111-STR нет никаких совпадений (как и на Y67, и на Y37), соответственно интерес в 700 маркерах очень маленький. BigY был бы лучше, если бы увеличили количество  покрытых SNP и/или снизили бы цену на BigY. Снижение цен на WGS продолжается, а это означает, что BigY становится менее привлекательным. Я написал ФТДНА, что им стоит принимать перенос данных WGS и предложить собственный тест, но на это они мне ничего не ответили.

Это чем-то напоминает гонку за мегагерцами и гигагерцами для процессоров. Потом вдруг оказалось, что путь тупиковый и надо повышать скорость памяти и количество ядер. 700 STR - а они интересны сами по себе, без результатов по SNP? Если да, то почему нет панели в так 300-500-700 STR? Если нет, то это просто обманчивая реклама. Купи Феррари, которая может ехать 300 км/ч, но ограничение на дороге 120, да еще большинство ездит на типа Хундай Гетц. Прикольно, статус, понты, но пользы нет. Снижение цены на BigY существенно увеличило бы базу данных и привлекательность теста.

Оффлайн DmitroR-2

  • Сообщений: 292
  • Страна: ru
  • Рейтинг +86/-1
Re: BigY: pro et contra
« Ответ #283 : 31 Январь 2019, 05:43:32 »
+200 STR

Сроки ожидания результатов (бесплатно сделают апгрейд для тех у кого был заказан, но не получен  BigY-500)
А остальным они и даром не нужны. В ту ли сторону лаборатория свой Биг развивает?

Полностью согласен. При наличии SNP менее интересны STR. У меня на Y111-STR нет никаких совпадений (как и на Y67, и на Y37), соответственно интерес в 700 маркерах очень маленький. BigY был бы лучше, если бы увеличили количество  покрытых SNP и/или снизили бы цену на BigY. Снижение цен на WGS продолжается, а это означает, что BigY становится менее привлекательным. Я написал ФТДНА, что им стоит принимать перенос данных WGS и предложить собственный тест, но на это они мне ничего не ответили.

Это чем-то напоминает гонку за мегагерцами и гигагерцами для процессоров. Потом вдруг оказалось, что путь тупиковый и надо повышать скорость памяти и количество ядер. 700 STR - а они интересны сами по себе, без результатов по SNP? Если да, то почему нет панели в так 300-500-700 STR? Если нет, то это просто обманчивая реклама. Купи Феррари, которая может ехать 300 км/ч, но ограничение на дороге 120, да еще большинство ездит на типа Хундай Гетц. Прикольно, статус, понты, но пользы нет. Снижение цены на BigY существенно увеличило бы базу данных и привлекательность теста.
Согласен. >:( >:( >:( Как я уже писал, мне бы хватило 111 STR-маркеров+"голый" БИГ(СНИПы) и цена долларов в 300 за всё это. Все эти 300-400-500-600-700 маркеров сами по себе по-сути та лишняя примочка(ибо когда есть БИГ(СНИПы) они лишние, сравнение уже идёт по СНИПам, а без БИГа отдельно эти 500-700 маркеров и не купишь), которую "втюхивает" тебе продавец вместе с действительно нужным тебе товаром. А у тебя нет возможности отказаться от этой опции, которую ты покупаешь в "нагрузку". Единственный плюс-увеличение покрытия СНИПов. Может что-то будут находить в непрочитанных ранее областях. п.с. А в целом меня тоже удивило странноватое развитие продукта. Увеличьте покрытие, снизьте максимально цену, чтоб сделать его более качественным и массовым. Вот это я ждал от компании в его развитии продукта. Что до увеличения кол-ва STR-маркеров, то сделано это скорее всего в расчёте на основную массу клиентов, которая в большинстве своём не сильно в представленном продукте разбирается и мыслит категориями "чем больше-тем лучше". И ФТДНК им показывает что продукт "развивается", было 500 маркеров, сейчас 700, потом наверное будет 1000. "Прогресс". Ну и вместо того чтоб снизить цену на продукт и сделать его более массовым, ФТДНК старается выжать максимум из каждого клиента, оправдывая поддержание старой цены добавкой ещё 200 никому ненужных "фентифлюшек".
« Последнее редактирование: 31 Январь 2019, 07:54:48 от DmitroR-2 »

Оффлайн Ankor

  • Сообщений: 216
  • Страна: ru
  • Рейтинг +89/-0
Re: BigY: pro et contra
« Ответ #284 : 31 Январь 2019, 06:30:01 »
Тут они про дополнительные маркеры в самом конце пишут:

Big Y-700 at a glance
  • Expanded NGS targeting of genealogically useful Y-chromosome regions
  • Revamped NGS chemistry that provides more uniform coverage within a much broader and targeted region of the Y
  • More consistent coverage improves comparison between any two results and allows more of the identified SNPs to be placed on the tree
  • Increased number of STR markers provides more data points on paternal lineages and can help identify family-specific variants

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.


Rambler's Top100