АвторТема: BigY: pro et contra  (Прочитано 15419 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн XPOMOBАвтор темы

  • Сообщений: 33
  • Страна: ru
  • Рейтинг +6/-0
BigY: pro et contra
« : 18 Апрель 2016, 16:32:58 »
Eсть в этих случаях что-то общее

"...Big Y (, он) вообще окончательно расставит все точки над "ё" в плане Вашего места на дереве Вашей гаплогруппы, протестировав по максимуму Ваши снипы (SNP)."
"если Вы заказываете Big Y, Вы делаете окончательное решение вопроса имеющихся у Вас снипов"
http://forum.molgen.org/index.php/topic,3315.msg337301.html#msg337301

"Сплошное тестирование всех "интересных" участков хромосомы(SNP) относительно дорогое удовольствие, например "bigY" от фирмы FTDNA"
http://forum.molgen.org/index.php/topic,3315.msg337420.html#msg337420

"В таком случае не нужны эти 37 и 67 маркеров. Недостающие все-равно через БАМ-файл посредством Уфайлл вытащим, а совпаденцев найдем."
http://forum.molgen.org/index.php/topic,6255.msg322002.html#msg322002

http://forum.molgen.org/index.php/topic,3983.msg187343.html#msg187343

Оффлайн smal

  • Сообщений: 1051
  • Страна: by
  • Рейтинг +374/-3
  • Y-ДНК: R-CTS9219
  • мтДНК: U4a
Re: BigY: pro et contra
« Ответ #1 : 18 Апрель 2016, 17:15:01 »
Eсть в этих случаях что-то общее

Есть, а вы по какому вопросу?

Оффлайн XPOMOBАвтор темы

  • Сообщений: 33
  • Страна: ru
  • Рейтинг +6/-0
Re: BigY: pro et contra
« Ответ #2 : 18 Апрель 2016, 17:36:26 »
Это пожелание оценивать и описывать возможности тех или иных тестов более реалистично.

Оффлайн Yaroslav

  • Я всего лишь уличный повеса, Улыбающийся встречным лицам
  • Сообщений: 10256
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1718/-7
  • 76% East Europe + 17% Finland
  • Y-ДНК: J1a2b1a-ZS3114 > ZS3084, ЖМ: I2a1b2a1a1a1a-Z16971*
  • мтДНК: K1b1a1-T199C, МЖ: H13a1a1d
Re: BigY: pro et contra
« Ответ #3 : 18 Апрель 2016, 18:25:26 »
Это пожелание оценивать и описывать возможности тех или иных тестов более реалистично.

Хм. Интересно.

Ну что ж, вернёмся тогда к процитированным Вами моим фразам:

Так как Вы, насколько я понял, планируете заказывать Big Y, он вообще окончательно расставит все точки над "ё" в плане Вашего места на дереве Вашей гаплогруппы, протестировав по максимуму Ваши снипы (SNP).

Человек получает результаты Big Y. Если администратор его гаплогруппного проекта не курирует своё дерево данной гаплогруппы, как это делает администратор моего гаплогруппного проекта, то человек отправляет ссылку на свой BAM файл в YFull, и его снипы после интерпретации попадают на дерево этой компании, чётко прочерчивая ветвь этого человека.

Чётко - имею в виду не по гаданиям на всяких-разных STR-деревьях.

Но в Вашем случае, если Вы заказываете Big Y, Вы делаете окончательное решение вопроса имеющихся у Вас снипов и, как я уже сказал выше, Вашего расположения на дереве Вашей гаплогруппы.

Если человек протестировал Big Y, то у него ещё есть какая-то необходимость дальнейшего тестирования снипов в FTDNA?

Ну, кроме того случая, если ближайший к нему на дереве человек протестировался в Full Genome, определяющем большее количество снипов, и тогда протестировавший Big Y может заказать приватные снипы, обнаруженные Full Genome у его соседа, для проверки, делит ли он их с ним.

================================================================

Господин Хромов, так что здесь нереалистичного?

Оффлайн Safonov

  • Сообщений: 50
  • Рейтинг +8/-0
Re: BigY: pro et contra
« Ответ #4 : 18 Апрель 2016, 20:51:16 »
25 апреля - день ДНК
19 июня - день отца
Надеюсь на скидки на BigY в эти дни. Скажите места, где можно раздобыть купоны. Если я правильно понял, купоны дают после приобретения любого продукта FTDNA и действуют они порядка месяца. Основная масса покупок приходится на рождество, соответственно количество выложенных купонов в апреле и июне крайне мала.

Оффлайн XPOMOBАвтор темы

  • Сообщений: 33
  • Страна: ru
  • Рейтинг +6/-0
Re: BigY: pro et contra
« Ответ #5 : 18 Апрель 2016, 20:51:39 »
Уважаемый Ярослав,
как Вам прекрасно известно, после BigY'ка остаётся много белых пятен, которые рано или поздно придётся закрывать дополнительными заказами SNP. Этот тест не является окончательным для определения позиции образца на Дереве.

Оффлайн Yaroslav

  • Я всего лишь уличный повеса, Улыбающийся встречным лицам
  • Сообщений: 10256
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1718/-7
  • 76% East Europe + 17% Finland
  • Y-ДНК: J1a2b1a-ZS3114 > ZS3084, ЖМ: I2a1b2a1a1a1a-Z16971*
  • мтДНК: K1b1a1-T199C, МЖ: H13a1a1d
Re: BigY: pro et contra
« Ответ #6 : 18 Апрель 2016, 21:18:03 »
Уважаемый Ярослав,
как Вам прекрасно известно, после BigY'ка остаётся много белых пятен, которые рано или поздно придётся закрывать дополнительными заказами SNP. Этот тест не является окончательным для определения позиции образца на Дереве.

Не могу Вас понять, XPOMOB. О каких дополнительных заказах снипов после Big Y идёт речь, кроме как в описанной мною выше ситуации:

Ну, кроме того случая, если ближайший к нему на дереве человек протестировался в Full Genome, определяющем большее количество снипов, и тогда протестировавший Big Y может заказать приватные снипы, обнаруженные Full Genome у его соседа, для проверки, делит ли он их с ним.

Или Вы имеете в виду удалённые случаи, как у меня, когда после развилки с ближайшим из протестированных у меня с ним осталось по 50 с лишним пока ещё приватных снипов? Так моя линия на Древе жизни (моей гаплогруппы) всё равно уже чётко прочерчена, дополнительных снипов мне заказывать не нужно. Т.е., то, о чём я и речь вёл.

Оффлайн Lesla

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 8523
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1960/-9
  • FTDNA: 154400 (Big Y - 283049)
  • Y-ДНК: R1a-YP682 (VK01/VK03+)
Re: BigY: pro et contra
« Ответ #7 : 18 Апрель 2016, 23:21:09 »
25 апреля - день ДНК
19 июня - день отца
Надеюсь на скидки на BigY в эти дни. Скажите места, где можно раздобыть купоны. Если я правильно понял, купоны дают после приобретения любого продукта FTDNA и действуют они порядка месяца. Основная масса покупок приходится на рождество, соответственно количество выложенных купонов в апреле и июне крайне мала.
Подпишитесь на эту тему - http://forum.molgen.org/index.php?topic=125.new;topicseen#new
там обычно о текущих скидках и их условиях оперативно сообщают.

Оффлайн XPOMOBАвтор темы

  • Сообщений: 33
  • Страна: ru
  • Рейтинг +6/-0
Re: BigY: pro et contra
« Ответ #8 : 19 Апрель 2016, 13:39:01 »
Уважаемый Ярослав,
« Ответ #189 : 18 Апрель 2016, 21:18:03 »
позиционирование образцов на Дереве осуществляется только на основании проверенных SNP. Известные SNP определяют позицию на существующей на данный момент версии Дерева, новые SNP корректируют её на последующих версиях. Если некоторые SNP будут отсутствовать в результатах BigY, то и точную позицию образца на Дереве без дополнительных тестов определить будет нельзя.

Оффлайн Farroukh

  • Maternal Y-DNA: R1b-L584
  • ...
  • Сообщений: 10238
  • Страна: az
  • Рейтинг +1421/-15
  • Paternal Mt-DNA: M9a1b1
    • Azerbaijan DNA Project
  • Y-ДНК: E-Y37093
  • мтДНК: F2f
Re: BigY: pro et contra
« Ответ #9 : 19 Апрель 2016, 13:48:11 »
Цитировать
Если некоторые SNP будут отсутствовать в результатах BigY, то и точную позицию образца на Дереве без дополнительных тестов определить будет нельзя.
Можно. Позиция будет точной, просто быть может недостаточно глубокой, но это поправимо.

Оффлайн XPOMOBАвтор темы

  • Сообщений: 33
  • Страна: ru
  • Рейтинг +6/-0
Re: BigY: pro et contra
« Ответ #10 : 19 Апрель 2016, 16:18:11 »
Поправимо каким образом, уважаемый Фаррух?

Оффлайн Sylvester

  • European 97% EE:70%_SE:14%_Fin:9%_Sca:4% C.Asia:<2%_Siberia:<2%
  • Сообщений: 1514
  • Страна: ru
  • Рейтинг +480/-0
  • FTDNA:290147 YFull:YF01670 GEDmatch:T532939
  • Y-ДНК: I1-Y16803 Varangians SWE>RUS
  • мтДНК: N1a1a1a1a +{146C,3531A} LBK>Sintashta(RISE391) RUS,KAZ,BGR,HUN
Re: BigY: pro et contra
« Ответ #11 : 19 Апрель 2016, 20:03:31 »
После провала BigY, FTDNA переключилось не бюджетный сегмент, продвигая весьма сомнительный продукт по достаточно высокой цене.
т.е. для вас BigY это "провал"  ???
а вот для меня этот тест был прорыв  :D

после BigY'ка остаётся много белых пятен, которые рано или поздно придётся закрывать дополнительными заказами SNP. Этот тест не является окончательным для определения позиции образца на Дереве.
т.е. ваше описание продукта более реалистичное?  ;D
У меня таких ситуаций пока не возникало, чтобы давать рекомендации дозаказывать какие-либо снипы после BigY.
Предлагаете сейчас NGS тесты не заказывать, а ждать появления идеального и дешевого теста с 100% покрытием?

Поправимо каким образом, уважаемый Фаррух?
например за счет прочтений у других протестированных с этой же ветки

Эта тема то для начинающих, зачем тут вдаваться в детали. А то так "начинающие" никогда не начнут  :)
А для более детального обсуждения и сравнения продуктов на форуме есть специализированные темы.

Оффлайн Farroukh

  • Maternal Y-DNA: R1b-L584
  • ...
  • Сообщений: 10238
  • Страна: az
  • Рейтинг +1421/-15
  • Paternal Mt-DNA: M9a1b1
    • Azerbaijan DNA Project
  • Y-ДНК: E-Y37093
  • мтДНК: F2f
Re: BigY: pro et contra
« Ответ #12 : 19 Апрель 2016, 21:02:22 »
Уважаемый Хромов,
Бигрек, как и любой другой генетико-генеалогический тест, требует наличия как минимум двух протестированных для их взаимосравнения и определения БОПа.
Покрытие там приличное, до 6 поколений (150 лет) пробивает, а это уже архивообозримое прошлое.

Другое дело если гаплотип реликтовый (как у меня или Ярослава), то сиди и жди, пока там какой кореш сподобится тест пройти

Оффлайн Yaroslav

  • Я всего лишь уличный повеса, Улыбающийся встречным лицам
  • Сообщений: 10256
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1718/-7
  • 76% East Europe + 17% Finland
  • Y-ДНК: J1a2b1a-ZS3114 > ZS3084, ЖМ: I2a1b2a1a1a1a-Z16971*
  • мтДНК: K1b1a1-T199C, МЖ: H13a1a1d
Re: BigY: pro et contra
« Ответ #13 : 19 Апрель 2016, 21:09:39 »
Другое дело если гаплотип реликтовый (как у меня или Ярослава), то сиди и жди, пока там какой кореш сподобится тест пройти

Тем не менее, если ранее мы могли только гадать по STR о нашем месте на деревьях наших гаплогрупп, а также гадать о ВБОПах по этим же крайне ненадёжным STR (тем более ненадёжным в наших краснокнижных случаях) с ближайшими к нам, то теперь мы знаем и первое с абсолютной точностью, и второе с максимально возможной точностью.

Вот, что я говорил уважаемому Safonov, и пытаюсь объяснить не менее уважаемому ХРОМОВ :)

Оффлайн Sylvester

  • European 97% EE:70%_SE:14%_Fin:9%_Sca:4% C.Asia:<2%_Siberia:<2%
  • Сообщений: 1514
  • Страна: ru
  • Рейтинг +480/-0
  • FTDNA:290147 YFull:YF01670 GEDmatch:T532939
  • Y-ДНК: I1-Y16803 Varangians SWE>RUS
  • мтДНК: N1a1a1a1a +{146C,3531A} LBK>Sintashta(RISE391) RUS,KAZ,BGR,HUN
Re: BigY: pro et contra
« Ответ #14 : 20 Апрель 2016, 00:03:07 »
Бигрек, как и любой другой генетико-генеалогический тест, требует наличия как минимум двух протестированных для их взаимосравнения и определения БОПа.

А у него такие есть ?

Как уже говорил, недавно получил результаты Y67. В разделе Y-DNA - Matches у меня ни одного совпадения.
Не обязательно иметь близких минимум двух протестированных, бигигреков уже много сделано, свое место на дереве найдет.
Да и STR не всегда показывают более близких на 67, бывает и наоборот из-за гомоплазии. Вот у меня например на 67 один Маклауд, а реально по снипам от меня до него аж 2200 лет. На 37 тоже одни гомоплазники с ВБОП 1750-2200 и даже дальше. А более близкие с ВБОП 900-1300 отражаются только на 25 и 12. Есть даже несколько китов в проекте у которых вообще нет никаких матчей ни на 111 ни на 67,37,25,12 , а по снипам у них ВБОП около 1000 лет. В общем с STRами как повезет.

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.


Rambler's Top100