Модели окончания синташтинско-аркаимской культуры предполагают отток населения: на восток — в Южную Сибирь, на юг — в Центральную Азию, и на запад — в Восточную Европу в XVIII-XVII вв до н.э. Одной из причин называют синташтинско-петровский конфликт неясного содержания. Следы этих миграций обнаруживаются как археологически, так и генетически. С миграцией индоранцев связывают распространение металлургии и колесниц в степной Евразии.
Основная масса населения мигрировала на юг в Центральную Азию, где в результате смешения местного населения с пришельцами из Южного Приуралья сформировалась тазабагъябская культура. В дальнейшем мигранты, видимо, заселили территорию современной Индии и Ирана.
Другая часть населения Южного Приуралья в этот период распространяется на запад. Данное событие приходится на поздний этап Синташты. Отток населения был вызван окончанием культуры Аркаим-Синташта и импульсом в западном направлении. Воздействие восточных миграционных потоков на местные культуры археологически прослеживается в Среднем Поволжье, в лесостепной Украине, и вплоть до Балкан. По данным исследования ДНК срубников Самарского Заволжья, датируемых XVII—XVI вв до н.э., они оказались принадлежащими к гаплогруппам R1a-Z93, R1a-Z2123 и др. По аутосомам срубников можно представить как микс ямников и синташтинцев. В Среднем Подонье обнаружено значительное количество погребений, относимых к довольно узкому промежутку времени — XVIII—XVI вв. до н. э. с характерным воинским инвентарем, керамикой абашевского типа. Переселение срубных племен представляло собой сложный процесс (не всегда мирного) взаимодействия с местным населением. В Поднепровье культура многоваликовой курамики (бабинская) сменяется срубной культурой, часть населения уходит дальше на запад.
А другая часть населения из региона донецко-днепровского региона, по-видимому, возвращается на Южный Урал и далее уходит в Сибирь. Об этом может говорить наличие субклада I1-Z140, отделившегося от остальных I1-Z140
примерно 3700 лет назад, и встречающегося в настоящее время у башкир.
Кроме того, древняя ДНК из таримского бассейна, связываемая с тохарами, показала принадлежность к гаплогруппе R1a (Z93-). Это может говорить о том, что население, мигрировавшее в Сибирь принадлежали не только к субкладу R1a-Z93, но и к R1a (Z93-) (возможно, R1a-Z283). Так как субклад R1a-Z283 не был найден в бронзовом веке Южном Приуралья и почти не встречается среди современных индоиранских народов, возможное появление этого субклада в Таримской впадине следут связывать с миграцией группы населения с запада, региона Поднепровья, где в рассматриваемый промежуток времени, скорее всего, проживали ближайшие носители гаплогруппы R1a-Z283.
Миграция населения из Южного Урала в Сибирь и далее в Таримскую впадину хорошо прослеживается археологически. С данным событием распространение металлургии, колесниц и андроновских жилищ, ставших, по одной из версий, праобразом юрты у тюркских и монгольских народов. По данным исследования древней ДНК часть карасукцев и андроновцев принадлежала к гаплогруппе R1a. По аутосомам некоторые представители карасукской культуры оказались похожими на андроновцев.