• Добро пожаловать, Гость
news Новости:


news

Автор Тема: Y-Predictor  (Прочитано 1620 раз)

0 Пользователей и 1 Гость смотрят эту тему.

Offlinewertner

  • Rating 73
  • Сообщений: 460
  • Y-ДНК: E1b1b1a2
  • мтДНК: U4a (xU4a3)
Re: Y-Predictor
« Reply #45 : 08 Июля 2010, 15:11:52 »
  •  
Остались самые сложные гаплогруппы: R1a1, R1b.
Там обучение предиктора занимает много времени.
Записан
YSearch: EUAH6
Татарский ДНК-проект
Умею строить деревья: E1b1b1a2
Предиктор, новая бета-версия в процессе подготовки.

OfflineCenturion

  • Администратор
  • *****
  • Rating 161
  • Сообщений: 4377
  • Джедаи - хранители мира в Галактике.
    • WWW
Re: Y-Predictor
« Reply #46 : 08 Июля 2010, 15:28:35 »
  •  
Остались самые сложные гаплогруппы: R1a1, R1b.
Там обучение предиктора занимает много времени.
Сообщи а какие уже сделал и как глубоко субклады?
Записан
«Чтобы знать, куда мы идем, необходимо понять, кто мы; чтобы понять кто мы, необходимо знать, откуда мы родом».

... Пётр → Никита (1666) → Иван (1698) → Иван (1742) → Андрей (1773) → Фирс (1801) → Николай (1823) → Михаил (1868) → Илья (1890) → Василий → Сергей → Я

Минздрав предупреждает. Чтение "Вестника АКадемии" опасно для вашего здоровья.

Offlineasan-kaygy

  • Rating 54
  • Сообщений: 1406
  • Y-ДНК: R1a1
Re: Y-Predictor
« Reply #47 : 08 Июля 2010, 15:34:53 »
  •  
Остались самые сложные гаплогруппы: R1a1, R1b.
Там обучение предиктора занимает много времени.
А гаплогруппы О (O1, O2, O3) и С3 (и С3с) будут?
Записан
Ysearch ID: EWDFC

Offlinewertner

  • Rating 73
  • Сообщений: 460
  • Y-ДНК: E1b1b1a2
  • мтДНК: U4a (xU4a3)
Re: Y-Predictor
« Reply #48 : 08 Июля 2010, 16:02:21 »
  •  
На этом витке я еще не перешел на субклады :)
Все те же гаплогруппы (A,C,D,E,G,H,I1,I2,J1,J2,L,N,O,P*,Q,R1a*,R1a1,R1b,R2,T), но уже с хорошим предсказанием по 17 маркерам (раньше было по 37,67).
Оказалось очень интересной задачей - особенно на границах, там где на расстоянии 1 были 17-маркерные гаплотипы из совершенно разных групп, например, I1 и G.

А гаплогруппы О (O1, O2, O3) и С3 (и С3с) будут?
На следующем витке будут, в том числе, O1, O2, O3, C3 с хорошим предсказанием по 67 маркерам. C3c позже.
Записан
YSearch: EUAH6
Татарский ДНК-проект
Умею строить деревья: E1b1b1a2
Предиктор, новая бета-версия в процессе подготовки.

Offlineasan-kaygy

  • Rating 54
  • Сообщений: 1406
  • Y-ДНК: R1a1
Re: Y-Predictor
« Reply #49 : 08 Июля 2010, 16:06:53 »
  •  
спасибо.
Записан
Ysearch ID: EWDFC

Offlinewertner

  • Rating 73
  • Сообщений: 460
  • Y-ДНК: E1b1b1a2
  • мтДНК: U4a (xU4a3)
Re: Y-Predictor
« Reply #50 : Сегодня в 19:17:36 »
  •  
Следующая версия.
С хорошим предсказанием по 17, 37 и 67 маркерам все тех же гаплогрупп A, B, C, D, E, G, H, I1, I2, J1, J2, K*, L, N, O, P*, Q, R1a*, R1a1, R1b, R2, T.
Непосредственно в предикторе использовано 1892 различных гаплотипа, выбранных из сотни тысяч. Теперь результатам предиктора можно доверять. Ошибаться должен меньше, чем в 1 случае из 20.

В интерфейсе добавлен вывод снипа гаплогруппы в результатах предсказания.

Откомпилирован под XP.
Centurion, проверь, пожалуйста, глючит ли у тебя эта версия. Если не глючит, то выпущу ее как 1.0.0. Если глючит, то плотно засяду за поиск ошибки.

Версия 0.4
http://ifolder.ru/18728275
« Последнее редактирование: Сегодня в 19:25:53 от wertner »
Записан
YSearch: EUAH6
Татарский ДНК-проект
Умею строить деревья: E1b1b1a2
Предиктор, новая бета-версия в процессе подготовки.

OfflineCenturion

  • Администратор
  • *****
  • Rating 161
  • Сообщений: 4377
  • Джедаи - хранители мира в Галактике.
    • WWW
Re: Y-Predictor
« Reply #51 : Сегодня в 19:56:30 »
  •  
Спасибо, Вадим. Заценим...  :)
Записан
«Чтобы знать, куда мы идем, необходимо понять, кто мы; чтобы понять кто мы, необходимо знать, откуда мы родом».

... Пётр → Никита (1666) → Иван (1698) → Иван (1742) → Андрей (1773) → Фирс (1801) → Николай (1823) → Михаил (1868) → Илья (1890) → Василий → Сергей → Я

Минздрав предупреждает. Чтение "Вестника АКадемии" опасно для вашего здоровья.

OnlineFarroukh

  • Rating 190
  • Сообщений: 3145
  • Y-ДНК: E1b1b1c1* (M34+)
  • мтДНК: F
  • Caucasian branch of E1b1b1c1*
Re: Y-Predictor
« Reply #52 : Сегодня в 20:17:56 »
  •  
Немного мозгоедства.

Итак, запускаю предиктор, вижу это:



Замечания по шагу Source:
1) Порядок маркёров FTDNA смещён - первым отображается DYS391, предыдущие съехали вверх и их не видно. Лучше сделать все маркёры не в два, а в три столбца - так ехать ничего не будет и заодно будет ясно, какие маркёры учитываются для предикции.
(Лучше всё-таки оставить полный формат FTDNA. То есть оставить пустующие 464e, 464f, 464g - это позволит сразу же копипастить гаплотип из того же Ysearch.org без предварительного выцеживания).

Та же петрушка и с окошком About, строчки едут, второго е-мэйла не видно:



Замечания по шагу Input:
1) Необходимо предусмотреть кнопку "Очистить поле/Clear" (вместо существующего Actions-->Clear)



Общее пожелание:

1) Неплохо было бы предусмотреть одновременный ввод гаплотипов разной протяжённости. Попробовал ввести одновременно 67-, 37- и 12-маркёрные гаплотипы -  предиктор взбесился (кстати, и тут строчки опять уехали, часть предупреждений не видно):



Некоторые из пожеланий уже звучали, я лишь освежил их

OfflineCenturion

  • Администратор
  • *****
  • Rating 161
  • Сообщений: 4377
  • Джедаи - хранители мира в Галактике.
    • WWW
Re: Y-Predictor
« Reply #53 : Сегодня в 20:32:40 »
  •  
Цитировать
кстати, и тут строчки опять уехали, часть предупреждений не видно
Ну так прокрутка для чего? все в любом случае не уместится если много строк

ты все про интерфейс, а меня больше беспокоит точность предсказания для 17-маркеров
для не типичных для Европы гаплогрупп точность видимо из-за малого кол-ва данных низкая - это касается гаплотипов востока и юга Азии (O, D, L), а также Африки (A, B)
Записан
«Чтобы знать, куда мы идем, необходимо понять, кто мы; чтобы понять кто мы, необходимо знать, откуда мы родом».

... Пётр → Никита (1666) → Иван (1698) → Иван (1742) → Андрей (1773) → Фирс (1801) → Николай (1823) → Михаил (1868) → Илья (1890) → Василий → Сергей → Я

Минздрав предупреждает. Чтение "Вестника АКадемии" опасно для вашего здоровья.

OnlineFarroukh

  • Rating 190
  • Сообщений: 3145
  • Y-ДНК: E1b1b1c1* (M34+)
  • мтДНК: F
  • Caucasian branch of E1b1b1c1*
Re: Y-Predictor
« Reply #54 : Сегодня в 21:01:00 »
  •  
Точность - это уже целиком на Вадиме и плотности его работы с глубоко проснопованными гаплотипами. Работа титаническая.

Offlinewertner

  • Rating 73
  • Сообщений: 460
  • Y-ДНК: E1b1b1a2
  • мтДНК: U4a (xU4a3)
Re: Y-Predictor
« Reply #55 : Сегодня в 21:34:48 »
  •  
Centurion, пожалуйста, пришли на почту неправильно определившиеся гаплотипы.

Farroukh, ок, спасибо, посмотрю. Видимо в других разрешениях, чем у меня, какие-то элементы съезжают.
« Последнее редактирование: Сегодня в 21:46:50 от wertner »
Записан
YSearch: EUAH6
Татарский ДНК-проект
Умею строить деревья: E1b1b1a2
Предиктор, новая бета-версия в процессе подготовки.
 

Rambler's Top100