АвторТема: Учебники по расчетам TMRCA  (Прочитано 2068 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн NimissinАвтор темы

  • Сообщений: 2038
  • Рейтинг +502/-0
  • Y-ДНК: N-M178 L839+ P298+ M2019+ M2118+ M1991+ M1988+
  • мтДНК: C4b4
Re: Учебники по расчетам TMRCA
« Ответ #30 : 10 Июль 2017, 15:27:05 »
На самом деле я думаю должно быть так: если у отца только один ребенок, то с вероятностью 50 % - это сын, другие 50 % - это дочь. Если у отца два ребенка, то распределение следующее: 25 % - два сына, 25 % - две дочери, 25 % - старший сын, младшая дочь, 25 % - старшая дочь, младший сын. И так далее. Все равно дочерей - 50 %.

Интересно, стоит ли учитывать следующие вроде бы факты:

1) по статистике рождаются 106 мальчиков на 100 девочек
2) на первом году жизни смертность среди мальчиков примерно на 30% выше, чем у девочек
3) возможно, если первыми рождаются девочки, то родители с большей вероятностью захотят еще ребенка, чтобы все-таки был сын

Быть может, перекос в рождении м-ж в 1% сыграет роль в определении общего предка, если речь идет о тысячах лет...
Первый факт я учитываю при компьютерном моделировании. Вероятность рождения дочери полагаю равной 0.485.
Про пункты 2 и 3 ничего не могу сказать. Думаю, что в будущем кто-нибудь займется влиянием этих факторов.

Оффлайн NimissinАвтор темы

  • Сообщений: 2038
  • Рейтинг +502/-0
  • Y-ДНК: N-M178 L839+ P298+ M2019+ M2118+ M1991+ M1988+
  • мтДНК: C4b4
Re: Учебники по расчетам TMRCA
« Ответ #31 : 25 Июнь 2018, 12:02:33 »
Уважаемые форумчане!

Учебное пособие для расчета TMRCA по Y-STR гаплотипам выходит на финишную прямую.
Есть у меня просьба. Прикрепился ли .pdf файл к проекту TMRCA Estimation. Manual.? Я почему-то его не вижу.

https://www.researchgate.net/project/TMRCA-Estimation-Manual

Оффлайн пенелопа

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 5481
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1629/-11
  • Главный редактор RJGG
  • мтДНК: H1b
Re: Учебники по расчетам TMRCA
« Ответ #32 : 25 Июнь 2018, 12:15:57 »
Прикрепился. Скачала только что на смартфон. Все замечательно.

Оффлайн asan-kaygy

  • ...
  • Сообщений: 7862
  • Страна: kz
  • Рейтинг +677/-5
  • Y-ДНК: R1a1a1b2a1a-L657+,Y9+,Y944+
Re: Учебники по расчетам TMRCA
« Ответ #33 : 25 Июнь 2018, 12:27:57 »
Уважаемые форумчане!

Учебное пособие для расчета TMRCA по Y-STR гаплотипам выходит на финишную прямую.
Есть у меня просьба. Прикрепился ли .pdf файл к проекту TMRCA Estimation. Manual.? Я почему-то его не вижу.

https://www.researchgate.net/project/TMRCA-Estimation-Manual
Отлично

Оффлайн NimissinАвтор темы

  • Сообщений: 2038
  • Рейтинг +502/-0
  • Y-ДНК: N-M178 L839+ P298+ M2019+ M2118+ M1991+ M1988+
  • мтДНК: C4b4
Re: Учебники по расчетам TMRCA
« Ответ #34 : 25 Июнь 2018, 12:33:29 »
Прошу не стесняться писать замечания и вопросы. В пособии есть, на мой взгляд, некоторые шероховатости. Просто надоело их разглаживать, слишком долго это было.

Оффлайн NimissinАвтор темы

  • Сообщений: 2038
  • Рейтинг +502/-0
  • Y-ДНК: N-M178 L839+ P298+ M2019+ M2118+ M1991+ M1988+
  • мтДНК: C4b4
Re: Учебники по расчетам TMRCA
« Ответ #35 : 27 Июнь 2018, 00:32:20 »
Прикрепил к проекту статью Адамов, Каржавин (2010) с описанием компьютерной программы для розыгрыша генеалогий методом Монте-Карло.

Оффлайн NimissinАвтор темы

  • Сообщений: 2038
  • Рейтинг +502/-0
  • Y-ДНК: N-M178 L839+ P298+ M2019+ M2118+ M1991+ M1988+
  • мтДНК: C4b4
Re: Учебники по расчетам TMRCA
« Ответ #36 : 15 Август 2018, 12:26:23 »
Сделано обновление учебного пособия. Версия 2018_2:
https://www.researchgate.net/project/TMRCA-Estimation-Manual

Оффлайн Farroukh

  • Maternal Y-DNA: R1b-L584
  • ...
  • Сообщений: 10089
  • Страна: az
  • Рейтинг +1351/-15
  • Paternal Mt-DNA: M9a1b1
    • My report in Yfull.com
  • Y-ДНК: E-Y37093
  • мтДНК: F2f
Re: Учебники по расчетам TMRCA
« Ответ #37 : 16 Август 2018, 23:14:06 »
В сентябре я дорвусь до компьютера и ознакомлюсь с методом.

Оффлайн Farroukh

  • Maternal Y-DNA: R1b-L584
  • ...
  • Сообщений: 10089
  • Страна: az
  • Рейтинг +1351/-15
  • Paternal Mt-DNA: M9a1b1
    • My report in Yfull.com
  • Y-ДНК: E-Y37093
  • мтДНК: F2f
Re: Учебники по расчетам TMRCA
« Ответ #38 : 17 Август 2018, 12:45:17 »
Ознакомливаюсь с темой. В эксель-таблицах при расчёте ВБОП крайне желательно предусмотреть две вещи:
1) выдавать результат в поколениях
2) выдавать результат в годах при варьируемом среднем возрасте поколенного перехода. У Вас он по умолчанию стоит 31,5 лет. Надо дать возможность поиграть возрастами, вводя его вручную (например, 25 или 30 лет).

Оффлайн Farroukh

  • Maternal Y-DNA: R1b-L584
  • ...
  • Сообщений: 10089
  • Страна: az
  • Рейтинг +1351/-15
  • Paternal Mt-DNA: M9a1b1
    • My report in Yfull.com
  • Y-ДНК: E-Y37093
  • мтДНК: F2f
Re: Учебники по расчетам TMRCA
« Ответ #39 : 17 Август 2018, 13:09:32 »
Цитировать
Мутации происходят редко, в среднем один раз за 400-500 мужских поколений.
Таких фраз уже использовать нельзя. В 2010 году, во времена 12-маркёрных гаплотипов можно было, но не на сегодняшний день. Мутации в STR (иными словами, вариации аллелей) позволяют отличить отца от сына на полноформатных гаплотипах. Вы понимаете о чём я.

Цитировать
возраст ближайшего общего предка (TMRCA),
Можно рекомендовать в общем-то устоявшуюся русскую аналогичную аббревиатуру ВБОП.

Также как-то отдельно в тексте (не приложении!) пояснить про константы скорости мутаций, их зависимость от длины гаплотипа.

Оффлайн NimissinАвтор темы

  • Сообщений: 2038
  • Рейтинг +502/-0
  • Y-ДНК: N-M178 L839+ P298+ M2019+ M2118+ M1991+ M1988+
  • мтДНК: C4b4
Re: Учебники по расчетам TMRCA
« Ответ #40 : 18 Август 2018, 01:21:08 »
Уважаемый Farroukh, спасибо за замечания. По мере накопления буду выкладывать новые версии.

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.


Rambler's Top100