АвторТема: Deep Roots for Aboriginal Australian Y Chromosomes  (Прочитано 1361 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн rozenblattАвтор темы

  • Сообщений: 1569
  • Страна: kg
  • Рейтинг +2073/-0
  • Y-ДНК: C-ZQ31
  • мтДНК: M8a
Deep Roots for Aboriginal Australian Y Chromosomes
« : 26 Февраль 2016, 00:37:03 »
http://www.cell.com/current-biology/...2816%2900078-6

Deep Roots for Aboriginal Australian Y Chromosomes

Anders Bergström, Nano Nagle, Yuan Chen, Shane McCarthy, Martin O. Pollard, Qasim Ayub, Stephen Wilcox, Leah Wilcox, Roland A.H. van Oorschot, Peter McAllister, Lesley Williams, Yali Xue, R. John Mitchell, Chris Tyler-Smith

Highlights

•We have sequenced 13 Aboriginal Australian Y chromosomes
•These diverged from Y chromosomes in other continents around 50,000 years ago
•They diverged from Papua New Guinean Y chromosomes soon after this
•We find no evidence for Holocene male gene flow to Australia from South Asia


Summary

Australia was one of the earliest regions outside Africa to be colonized by fully modern humans, with archaeological evidence for human presence by 47,000 years ago (47 kya) widely accepted [ 1, 2 ]. However, the extent of subsequent human entry before the European colonial age is less clear. The dingo reached Australia about 4 kya, indirectly implying human contact, which some have linked to changes in language and stone tool technology to suggest substantial cultural changes at the same time [ 3 ]. Genetic data of two kinds have been proposed to support gene flow from the Indian subcontinent to Australia at this time, as well: first, signs of South Asian admixture in Aboriginal Australian genomes have been reported on the basis of genome-wide SNP data [ 4 ]; and second, a Y chromosome lineage designated haplogroup C∗, present in both India and Australia, was estimated to have a most recent common ancestor around 5 kya and to have entered Australia from India [ 5 ]. Here, we sequence 13 Aboriginal Australian Y chromosomes to re-investigate their divergence times from Y chromosomes in other continents, including a comparison of Aboriginal Australian and South Asian haplogroup C chromosomes. We find divergence times dating back to ∼50 kya, thus excluding the Y chromosome as providing evidence for recent gene flow from India into Australia.

Оффлайн asan-kaygy

  • ...
  • Сообщений: 9609
  • Страна: kz
  • Рейтинг +945/-5
  • Y-ДНК: R1a1a1b2a1a-L657+,Y9+,Y944+
Re: Deep Roots for Aboriginal Australian Y Chromosomes
« Ответ #1 : 26 Февраль 2016, 05:47:00 »
Спасибо за ссылку.

Онлайн Шад

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6334
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1330/-4
  • Ex oriente lux
  • Y-ДНК: Q-Y2750
  • мтДНК: J1c2z
Re: Deep Roots for Aboriginal Australian Y Chromosomes
« Ответ #2 : 26 Февраль 2016, 09:23:38 »
BAM файлы доступны?

Оффлайн Nimissin

  • Сообщений: 2400
  • Рейтинг +759/-0
  • Y-ДНК: N-M178 L839+ P298+ M2019+ M2118+ M1991+ M1988+
  • мтДНК: C4b12a
Re: Deep Roots for Aboriginal Australian Y Chromosomes
« Ответ #3 : 26 Февраль 2016, 12:58:30 »
Из 13 образцов пять относятся к гаплогруппе С, а восемь - к гаплогруппе К. Авторы классифицировали эти 8 образцов как М526 (4), Р308 (2) и М186 (2).
Но среди списка снипов есть мутация 28759645 С Т, известная как Р397. Она выявлена во всех восьми образцах К. На дереве YFull YTree, версия V4.02, эта мутация определяет отдельную ветвь, параллельную парагруппе Р. Если дерево YFull построено правильно, то возраст ветвей Р и МР-Р397 должен быть одинаковым. По многочисленным данным, содержащимся в гаплогруппах R, Q, N, O, возраст ветви Р 43500 лет. С другой стороны, авторы обсуждаемой работы определили возраст разделения ветви австралийских К и ветви гаплогруппы Р в 54300 лет. Константу скорости мутаций авторы выбрали как 0.76 10(-9) в год на базу. Пересчитаем на скорость 0.82 10(-9), используемую YFull: 54300 х 0.76/ 0.82 = 50300 лет. Все равно остается ощутимая разница. Это надо обдумать.

Оффлайн Nimissin

  • Сообщений: 2400
  • Рейтинг +759/-0
  • Y-ДНК: N-M178 L839+ P298+ M2019+ M2118+ M1991+ M1988+
  • мтДНК: C4b12a
Re: Deep Roots for Aboriginal Australian Y Chromosomes
« Ответ #4 : 26 Февраль 2016, 13:09:54 »
Возраст разделения австралийских С и южноазиатской гаплогруппы С5 авторы рассчитали как 54100 лет назад. Пересчет на скорость 0.82 х 10 (-9) дает оценку 50100 лет. В статье Адамова и др. (2015) о калибровке скорости SNP мутаций игрек-хромосомы, возраст австралийских образцов гаплогруппы С оценивался в 49200 лет (по данным о гаплогруппе C-V20). Оценки близки друг к другу.

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.