Гаплогруппа D

[осколок империи]

Где бы нам найти ещё образцов веточки Р99, Р47, М533?
По древу YFULL получается
Р99 formed 44700 ybp, TMRCA 41500 ybp
и всего только два образца за последние годы!

[Шад]

Где бы нам найти ещё образцов веточки Р99, Р47, М533?
По древу YFULL получается
Р99 formed 44700 ybp, TMRCA 41500 ybp
и всего только два образца за последние годы!

Всё зависит от того, насколько Вы хотите погрузиться в процесс. Когда-то по Q1b дела выглядели чуть лучше.
Можно искать интересные образцы по научным публикациям, договариваться с учеными относительно более глубокого тестирования образцов, спонсировать...
Хотя по D-P99 ситуация гораздо сложнее, так как субклад редкий и локализован в регионах, где ДНК-тестирование представляет собой непонятную абстракцию для 99% населения...
Вся надежда на ученых. Но китайцы пока молчат.

[Шад]

BAM файл образца монгола HGDP01226 покрывает всего 0.5 Mbp, поэтому позиция мутации M533 оказалась непрочитанной.
Мутация M533 есть в образце другого монгола - из АРВМ (Bai et al., 2014). В области combBED у монгола из АРВМ 18 приватных мутаций, отсутствующих в образце YF02800. У монгола HGDP01226 случайно оказалась прочитанной позиция 23571814 A. В ней - производный аллель G, такой же как и у монгола Bai et al. (2014). А это - один из 18 приватных снипов. Вывод: монголы HGDP01226 и Bai et al. (2014) - из одного и того же мужского рода, с MRCA моложе 2600 лет. Очевидно, что HGDP01226 имеет мутацию M533.

Согласен. У всех трех D-P99 23571814 c предковым значением A.

[осколок империи]

Рэй Бэнкс снова обновил древо гг D, добавив ещё около 20 снипов ниже уровня М533.
Теперь всего около 280 снипов. По всей видимости, следует ожидать в ближайшее время очередное обновление древа. Может быть на нём появятся ещё недостающие 30 снипов.

[осколок империи]

По результатам теста образца К2171 у меня появился теперь один совпаденец в разделе бигУ.
Я посмотрел его снипы, у него действительно отсутствуют Р99, Р47, М533. Как и у крымского татара, у образца К2171 подтверждён только верхний уровень CTS11577.

[asan-kaygy]

Жалко что его на Уфулл не будет.

[Шад]

Жалко что его на Уфулл не будет.

Это уже точно?
Если так, то жаль.

[Шад]

По результатам теста образца К2171 у меня появился теперь один совпаденец в разделе бигУ.
Я посмотрел его снипы, у него действительно отсутствуют Р99, Р47, М533. Как и у крымского татара, у образца К2171 подтверждён только верхний уровень CTS11577.

Можете прислать мне общие с ним снипы и не совпадающие с Вами снипы? У Вас есть такая возможность при анализе совпадений по Вашему BigY

[осколок империи]

Обязательно пришлю.

[Шад]

Не могу вспомнить - обсуждали ли мы D3a среди алтай-кижи?
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3276666/

17 D3a 15 11-11 14 16 25 11 7 13 14 11 13 18 15 17 21 11
18 D3a 15 11-11 14 16 26 11 7 13 14 11 12 19 15 17 21 11
19 D3a 15 11-11 14 16 25 11 7 13 14 11 11 19 15 17 21 11
20 D3a 15 11-11 14 16 25 11 7 13 14 11 12 19 15 17 21 11

Последовательность маркеров: DYS19
DYS385
DYS389I
DYS389b
DYS390
DYS391
DYS392
DYS393
DYS437
DYS438
DYS439
DYS448
DYS456
DYS458
DYS635
Y GATA H4

[Nimissin]

Еще не обсуждали. Гаплотипы похожи на М533.

[осколок империи]

Вот что пишут в интернете об алтайцах:
«Проблема этногенеза тюркоязычных племён Алтая в этнографии народов Сибири относится к числу наиболее трудных и неразработанных».
И далее:
«...уже наиболее ранние данные об этническом составе древних алтайцев свидетельствуют об их сложном и разнородном происхождении и не подтверждают предположения об этнической чистоте тюрков Алтая».
Теперь, однако, стало ясно, где нужно брать генетический материал для дальнейшего сравнения гаплотипов D1a-M533. Нужно организовать экспедицию на Алтай! Вот только бы кто это всё удовольствие оплатил бы? Может японцы профинансируют? А asan-kaygy мог бы поделиться опытом.

[Шад]

Из опыта. Берете статью, пишете авторам, что готовы из филантропических побуждений организовать типирование образцов алтай-кижи в лаборатории YSEQ. C вероятностью >50% Вам могут ответить положительно. Тогда финансируете (сами или с японскими товарищами) проверку образцов по панели снипов, сформированной по результатом последних тестов BigY в Вашей ветви. В итоге - как максимум, находите откуда вышла Ваша ветвь, как минимум - получаете научно значимый результат. Так как до глубокого типирования алтай-кижи D3a могут дойти не скоро...

[осколок империи]

В веточке М533 появился ещё один человек, некто Dandar. Его результаты уже внесли в субклад гг D на ISOGG. На ФТДНА у него нет указания страны, стоит только Unknown Origin.
Знает ли кто-нибудь, кто он такой и откуда родом?

[Шад]

В веточке М533 появился ещё один человек, некто Dandar. Его результаты уже внесли в субклад гг D на ISOGG. На ФТДНА у него нет указания страны, стоит только Unknown Origin.
Знает ли кто-нибудь, кто он такой и откуда родом?

А где здесь чья ветка?

• • • • • • D1a2a1a~  Z34358, Z34359, Z34360, Z34361, Z34362
• • • • • • D1a2a1b~  PH97, Z34364, Z34365
• • • • • • D1a2a1c~  Z42599, Z42600, Z42601, Z42602, Z42603