Upper Palaeolithic genomes reveal deep roots of Eurasians - дДНК из Грузии

[rozenblatt]

если в будущей работе не будет образцов западнее Дона ни о какой претензии на "решение индо-европейского вопроса" речи быть не может)

С этим согласен, там от Волги до Карпат огромная дыра:


dnk.png

Вроде бы поляки собираются делать анализ шаровидных амфор. Ну и на трипольцев было бы неплохо взглянуть.

[FenriR]

от трипольцев особых сюрпризов не жду)
да, про шаровидные амфоры слышал - очень интересно.
но лично мне, на данный момент, наиболее любопытными кажутся образцы из, все того же, Среднего Стога и Днепро-донецкой культуры=) мне кажется, у них будет и ANE (интересно посмотреть, есть ли разница между "лесной" и "степной" версией) и "дополнительный", не вошедший в EHG, WHG и, возможно, даже CHG

[Аббат Бузони]

Жалко нет Поочья и верхней Волги, там много чего было найдено.

[сармат]

Иногда нужно включать логику, сравнивая хвалынцев и т.д. с мезолитом и палеолитом Кавказа. Какие хвалынцы? Какие ямники и т.д.? Их и в помине не было когда жили палеолитчик и  мезолитчик на Кавказе. Севернее был лёд, северные олени, белые медведи, северные племена оленеостровцы, антропологически напоминающих хантов, ненцев  и т.д. Какие Евразийские скотоводы? Какие фермеры? Люди собирали корнеплоды, охотились на кабанов и т.д.

Сравнивать нужно ровесников, потом  делать выводы, я имею ввиду мезолитчика с мезолитчиком, бронзовика с бронзовиком и т.д.

[Srkz]

ну, они вряд ли думают, что Кавказ прямо таки родина этого компонента. По-крайней мере, это довольно странное утверждение))
так-то, территория Ирака-Ирана несоизмеримо лучше подходит под источник CHG. Хотя и более восточные регионы исключать нельзя, да - надо еще подождать образцы их Хараппы

Надеюсь, не думают, но как-то это не проговаривается

[FenriR]

Иногда нужно включать логику, сравнивая хвалынцев и т.д. с мезолитом и палеолитом Кавказа. Какие хвалынцы? Какие ямники и т.д.? Их и в помине не было когда жили палеолитчик и  мезолитчик на Кавказе. Севернее был лёд, северные олени, белые медведи, северные племена оленеостровцы, антропологически напоминающих хантов, ненцев  и т.д. Какие Евразийские скотоводы? Какие фермеры? Люди собирали корнеплоды, охотились на кабанов и т.д.

Сравнивать нужно ровесников, потом  делать выводы, я имею ввиду мезолитчика с мезолитчиком, бронзовика с бронзовиком и т.д.

я привел из статьи Н. Маркиной цитату, содержание которой мне показалось не совсем верным...

Надеюсь, не думают, но как-то это не проговаривается

так было и с MAthieson et al. 2015(2):

However, the fact that the Srubnaya also harbored such ancestry indicates that the Anatolian Neolithic
92 or EEF ancestry could have come into the steppe from a more eastern source. Further evidence that
93 migrations originating as far west as central Europe may not have had an important impact on the Late
94 Bronze Age steppe comes from the fact that the Srubnaya possess exclusively (n=6) R1a Y-
95 chromosomes (Extended Data Table 1), and four of them (and one Poltavka male) belonged to
haplogroup R1a-Z93 which is common in central/south Asians12 96 , very rare in present-day Europeans,
97 and absent in all ancient central Europeans studied to date.

когда некоторые посчитали за этот "more eastern source" чуть ли не Центральную Азию)

[Аббат Бузони]

Он был перенесен в Европу миграцией скотоводов-ямников из евразийских степей, которые, в свою очередь, получили его из майкопской культуры, граничащей с Кавказом.

Несколько раз перечитал фразу и не въехал. 

[Asmat headhunter]

Собственно, предположение, что родина CHG это Кавказ и его распространение восточнее - результат eastwards movement, само по себе нуждается в доказательствах.

Всё дело в магии названия - кавказские хантеры-газереры, як же ж не с Кавказу они?

[FenriR]

Он был перенесен в Европу миграцией скотоводов-ямников из евразийских степей, которые, в свою очередь, получили его из майкопской культуры, граничащей с Кавказом.

Несколько раз перечитал фразу и не въехал. 

там еще не факт, что в Европу этот компонент попал единожды - во времена ямников
возможно, "инфильтрация" CHG происходила и в более поздние периоды)

Собственно, предположение, что родина CHG это Кавказ и его распространение восточнее - результат eastwards movement, само по себе нуждается в доказательствах.

Всё дело в магии названия - кавказские хантеры-газереры, як же ж не с Кавказу они?

слабоватое колдунство - на нас не действует))

[df27]

а кто нибудь знает до конца года будут еще палеоданные или все выйдет к началу следующего года ?

[Srkz]

там еще не факт, что в Европу этот компонент попал единожды - во времена ямников
возможно, "инфильтрация" CHG происходила и в более поздние периоды)

Я тут попробовал посмотреть соотношение компонентов калькулятора К27 Gedrosia-Caucasian и Caucasian-Near-Eastern в Европе. У современных кавказцев преобладают оба компонента, у Kotias было больше "Гедрозии", у ямников была только "Гедрозия", у неолитических земледельцев - только CNE. Видимо, миграции через Анатолию должны были неизбежно захватить CNE, поэтому преобладание Гедрозии можно получить только через Степь.
Красное - больше "Гедрозии", зеленое - больше CNE (в Сибири очень мало и того и другого, но соотношение резко в пользу "Гедрозии")

Похоже на объяснение, почему FTDNA рисует жителям Северного Кавказа и Поволжья Британию и Скандинавию в myOrigins Ну и можно вспомнить максимумы "ямного" компонента у норвежцев в работе Haak et al, или что в обсуждаемой работе с удивлением обнаружили большее сходство с CHG  у северных европейцев по сравнению с южными.

[rozenblatt]

а кто нибудь знает до конца года будут еще палеоданные или все выйдет к началу следующего года ?

У меня есть основания считать, что до конца года должны выйти ещё одна статья с палеоданными. Вот какие основания:

Вот тут текст выступления О. Балановского от 3 октября: http://генофонд.рф/?page_id=4715

Интересующий меня отрывок:

Это все были те исследования, которые правильнее называть «широкогеномными». Но проведено и настоящее полное секвенирование, причем не с низким покрытием, как в «1000 геномов», а в среднем с 50-кратным покрытием для сотен геномов. Это исследования трех коллективов – Дэвида Райха в Гарварде, Эске Виллерслева в Дании и Майта Метспалу в Эстонии. На днях эти три статьи одновременно поданы в Nature (мы участвуем в двух из них). И не исключено, что к Рождеству популяционные генетики получат этот роскошный подарок – новые 1000 геномов, но уже секвенированные с хорошим покрытием, равномерно представляющие весь мир и уже тщательно проанализированные ведущими биоинформатиками. Подчеркну важнейший момент. Раньше почти по всем генетическим системам изучение Северной Евразии отставало от других регионов мира. Но на этот раз дело обстоит иначе: из новых 1000 геномов, охватывающих мир, более 300 представляют Россию и ее сопредельные страны. В том числе около 100 полных геномов – из нашего биобанка. В ближайшее время одна из статей будет размещена на biorxiv.org, и одновременно ее разбор появится на нашем сайте генофонд.рф.

Если я правильно понимаю, ни одна из этих статей не вышла. У Райха вышла статья с хвалынцами и т.д., но это судя по всему другая статья. У Виллерслева вышли статьи про чуму и якутских лошадей, т.е. тоже не то. Ну и у Метспалу - я не знаю точно, но не помню такого.

Далее, у Райха и Метспалу статьи могут быть исключительно о современных геномах, но у Виллерслева по моему всегда присутствуют древние ДНК. Так что хоть от него-то должны быть палеоданные.

[FenriR]

Райх месяц назад говорил, что новая статья об ИЕ выйдет "скоро"

[df27]

Райх месяц назад говорил, что новая статья об ИЕ выйдет "скоро"

скоро, но ждем уже 3 месяца  .Интересно что для работы про ИЕ оставили результаты из Ирана , Майкопа и Армении

[Srkz]

Решил загрузить предварительный вариант Kotias на Gedmatch, хотя еще не все БАМы обработаны. Качество уже вполне приличное, а доделка может занять еще месяц. Когда будет готов, удалю этот и загружу новый. Сацурблия полностью обработан, геном плохого качества и лучше не станет (разве что заново отсеквенируют).

M603839    Kotias CHG
M677694    Satsurblia CHG