АвторТема: PF7257  (Прочитано 14599 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн YaroslavАвтор темы

  • Я всего лишь уличный повеса, Улыбающийся встречным лицам
  • Сообщений: 11656
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2153/-10
  • 76% East Europe + 17% Finland
  • Y-ДНК: J1a2b1a-ZS3114 > ZS3084, ЖМ: I2a1a2b1a1a1a1-Z16971 > Y159653
  • мтДНК: K1b1a1-T199C, МЖ: H13a1a1d
Re: PF7257
« Ответ #15 : 22 Октябрь 2016, 22:45:40 »
Замечательно, буду очень признателен!

Отредактировал. Также из названия ветки "J1-M267>YSC65>PF7261>PF7257" убрал PF7261, так как после Big Y 445137 Alnasser из Саудовской Аравии оказалось, что PF7261 и PF7257 - это снипы одного уровня.

Хочу попросить модераторов перенести сообщения от Ответ #705 до Ответ #708 включительно в тему PF7257.

Оффлайн AlexanderK

  • Сообщений: 1971
  • Страна: ru
  • Рейтинг +347/-1
  • Y-ДНК: J1-PF7257
  • мтДНК: H11a1
Re: PF7257
« Ответ #16 : 23 Октябрь 2016, 00:18:29 »
Отредактировал. Также из названия ветки "J1-M267>YSC65>PF7261>PF7257" убрал PF7261, так как после Big Y 445137 Alnasser из Саудовской Аравии оказалось, что PF7261 и PF7257 - это снипы одного уровня.

Да, тоже заметил что с PF7261 что-то не то. У FTDNA on "отцовский" по отношению к PF7257 а у Виктара вроде как на одном уровне. Зказал его себе отдельно - если будет PF7261- (а наверняка будет) то буду наезжать на FTDNA :)
 
Кстати - а что за тест 2SGNE    Melik-Ovanesov?  Насколько я понимаю это номер YSearch, но ни в одном из профильных проектов на FTDNA я его не нашел :(

Оффлайн AlexanderK

  • Сообщений: 1971
  • Страна: ru
  • Рейтинг +347/-1
  • Y-ДНК: J1-PF7257
  • мтДНК: H11a1
Re: PF7257
« Ответ #17 : 23 Октябрь 2016, 10:20:21 »
Немного поэкспериментировал. Нашел на дереве Виктара Маса несколько снипов из разных ветвей, которые доступны для заказа в FTDNA (правда там они совсем в других субскладах, и даже не в J1). А именно  CTS8690, F2594, F999 и L87 (брал что дают, остальные заказать просто нельзя). Заказал все четыре.  Результат оказался совсем не тот что предполагался: F999+, остальные по минусам!  Но еще интереснее письмо полученное из FTDNA:
=======
Hi Alexander,
I am writing you about your F2594 test with FTDNA. As you may be aware, F2594 is a G>A mutation, yet you came back as a C. I was able to locate a BigY tester who had a C at this location (and from your same, deep, haplogroup). I believe it was your intention to have that position tested for a C.
Here is the situation. You are F2594-, but you are positive for the private SNP that is currently un-named.
In order to report this result for you, I have to generate a new BY series SNP name. I have done this and it is BY11761. I will be placing a free order on your account for this newly named SNP and it will post as a positive result.
---------------

В общем - по адресу снипа F2594 могут происходить две разные мутации: G>A (это и называется F2594) и G>C, как у меня - и они присвоили этому снипу название BY11761 и сделали доступным для заказа!  Заказал F999 и BY11761 Мадатову, так сказать для закрепления результата ...  ;)
« Последнее редактирование: 23 Октябрь 2016, 10:38:15 от AlexanderK »

Оффлайн YaroslavАвтор темы

  • Я всего лишь уличный повеса, Улыбающийся встречным лицам
  • Сообщений: 11656
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2153/-10
  • 76% East Europe + 17% Finland
  • Y-ДНК: J1a2b1a-ZS3114 > ZS3084, ЖМ: I2a1a2b1a1a1a1-Z16971 > Y159653
  • мтДНК: K1b1a1-T199C, МЖ: H13a1a1d
Re: PF7257
« Ответ #18 : 23 Октябрь 2016, 12:49:17 »
Да, тоже заметил что с PF7261 что-то не то. У FTDNA on "отцовский" по отношению к PF7257 а у Виктара вроде как на одном уровне. Зказал его себе отдельно - если будет PF7261- (а наверняка будет) то буду наезжать на FTDNA :)

Александр, Вы буквально поджигаете свои доллары зажигалкой :) Зачем отдельно заказывать PF7261, когда Вы уже заказали себе Big Y, который и покажет Ваши отношения с этим снипом :)

Насколько я понимаю, PF7261 считался ранее предковым для PF7257 из-за результатов пенджабца из Лахора (проект тысяча геномов). Но в последней версии дерева, после результатов Big Y саудита Альнассера, пенджабца переместили в PF7257. Возможно, что тест 1000 геномов не ловил этот снип. Нужно будет людей из YFull спросить, есть ли у пенджабца PF7257.
 
Кстати - а что за тест 2SGNE    Melik-Ovanesov?  Насколько я понимаю это номер YSearch, но ни в одном из профильных проектов на FTDNA я его не нашел :(

Может, в каких-то закрытых проектах участвует. А может просто выложил результаты в Ysearch, но в проекты не вступает. Точно такая же ситуация с евреями Z1842, в Ysearch их гаплотипы есть, а в проектах их нет.

Оффлайн AlexanderK

  • Сообщений: 1971
  • Страна: ru
  • Рейтинг +347/-1
  • Y-ДНК: J1-PF7257
  • мтДНК: H11a1
Re: PF7257
« Ответ #19 : 23 Октябрь 2016, 13:49:01 »
Да, тоже заметил что с PF7261 что-то не то. У FTDNA on "отцовский" по отношению к PF7257 а у Виктара вроде как на одном уровне. Зказал его себе отдельно - если будет PF7261- (а наверняка будет) то буду наезжать на FTDNA :)

Александр, Вы буквально поджигаете свои доллары зажигалкой :) Зачем отдельно заказывать PF7261, когда Вы уже заказали себе Big Y, который и покажет Ваши отношения с этим снипом :)

Ну так когда это еще будет! :) По срокам которые указали FDTNA готовность попадает как раз на Рождество, то есть в случае малейшей задержки я получу свой ВАМ только после Нового Года. Ну а одиночные снипы делаются быстро. И если будет "минус" - можно будет с фтдна потребовать чтобы\ они свое дерево переделали.   

Насколько я понимаю, PF7261 считался ранее предковым для PF7257 из-за результатов пенджабца из Лахора (проект тысяча геномов). Но в последней версии дерева, после результатов Big Y саудита Альнассера, пенджабца переместили в PF7257. Возможно, что тест 1000 геномов не ловил этот снип. Нужно будет людей из YFull спросить, есть ли у пенджабца PF7257.

Спросите пожалуйста. А то пока у них в дереве я вообще не вижу ни PF7261 ни PF7257. У FTDNA есть, у Виктара есть - а у них нет.
А какой номер кита у этого саудита?

Оффлайн YaroslavАвтор темы

  • Я всего лишь уличный повеса, Улыбающийся встречным лицам
  • Сообщений: 11656
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2153/-10
  • 76% East Europe + 17% Finland
  • Y-ДНК: J1a2b1a-ZS3114 > ZS3084, ЖМ: I2a1a2b1a1a1a1-Z16971 > Y159653
  • мтДНК: K1b1a1-T199C, МЖ: H13a1a1d
Re: PF7257
« Ответ #20 : 23 Октябрь 2016, 14:26:51 »
Спросите пожалуйста. А то пока у них в дереве я вообще не вижу ни PF7261 ни PF7257. У FTDNA есть, у Виктара есть - а у них нет.

Спросил. Задал также и Виктару вопрос в фб группе проекта J1, почему PF7261 ранее считался предковым к PF7257.

А какой номер кита у этого саудита?

445137 Alnasser.

Оффлайн YaroslavАвтор темы

  • Я всего лишь уличный повеса, Улыбающийся встречным лицам
  • Сообщений: 11656
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2153/-10
  • 76% East Europe + 17% Finland
  • Y-ДНК: J1a2b1a-ZS3114 > ZS3084, ЖМ: I2a1a2b1a1a1a1-Z16971 > Y159653
  • мтДНК: K1b1a1-T199C, МЖ: H13a1a1d
Re: PF7257
« Ответ #21 : 23 Октябрь 2016, 15:07:40 »
Спросите пожалуйста. А то пока у них в дереве я вообще не вижу ни PF7261 ни PF7257. У FTDNA есть, у Виктара есть - а у них нет.

Дело в том, что в YFull на ветви J-Z2215+ Z2217- (де факто на сегодняшний день там пока что одна ветвь PF7257) есть только один образец - этого пенджабца id:HG03767, поэтому все его снипы после расхождения с Z2217 на сегодняшний день пока что являются его приватными и на дереве YFull не показаны. После того, как Вы отправите свой BAM на интерпретацию в YFull, эти снипы (PF7261 и PF7257) появятся на дереве, как ваши общие с ним снипы.

Пришёл ответ от уважаемого Centurion по поводу PF7261 и PF7257 у пенджабца:

PF7261+ 7C
PF7257- 1A

То есть, PF7257 у пенджабца всё-таки отрицателен. Теперь бы понять, почему Виктар перекинул PF7261 в узел PF7257 ??? Жду его ответа в фб группе проекта J1.

Оффлайн AlexanderK

  • Сообщений: 1971
  • Страна: ru
  • Рейтинг +347/-1
  • Y-ДНК: J1-PF7257
  • мтДНК: H11a1
Re: PF7257
« Ответ #22 : 23 Октябрь 2016, 15:16:22 »
После того, как Вы отправите свой BAM на интерпретацию в YFull, эти снипы (PF7261 и PF7257) появятся на дереве, как ваши общие с ним снипы.
...
Пришёл ответ от уважаемого Centurion по поводу PF7261 и PF7257 у пенджабца:
...
То есть, PF7257 у пенджабца всё-таки отрицателен.

Ну то есть даже после того как будет готова интерпретация моего BigY - в дереве YFull появится только PF7261, а PF7257 будет у них считаться моим приватным до тех пор пока  не протестируется еще кто-нибудь с PF7257+ ????   :o

Так а какой FTDNA Kit# этого пенджабца?  Хочу в Семаргле его посмотреть!

Оффлайн YaroslavАвтор темы

  • Я всего лишь уличный повеса, Улыбающийся встречным лицам
  • Сообщений: 11656
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2153/-10
  • 76% East Europe + 17% Finland
  • Y-ДНК: J1a2b1a-ZS3114 > ZS3084, ЖМ: I2a1a2b1a1a1a1-Z16971 > Y159653
  • мтДНК: K1b1a1-T199C, МЖ: H13a1a1d
Re: PF7257
« Ответ #23 : 23 Октябрь 2016, 15:42:26 »
Ну то есть даже после того как будет готова интерпретация моего BigY - в дереве YFull появится только PF7261, а PF7257 будет у них считаться моим приватным до тех пор пока  не протестируется еще кто-нибудь с PF7257+ ????   :o

Тут не всё так просто. Дело в том, что, если взглянуть на дерево Виктара Маса, этот пенджабец делит массу снипов с саудитом Альнасером:

Узел PF7257
PF7257, PF7261, PH20, PH77, PH128, PH152, PH351, PH469, PH629, PH1231, PH1284, PH1413, PH1549, PH1651, PH1689, PH1828, PH2095, PH2107, PH2267, PH2375, PH2478, PH2601, PH3112, PH3132, PH3147, ZS3249, ZS3301, ZS3316, ZS3317, ZS3337, ZS3341, ZS3349, ZS3363, ZS3365, ZS3367, ZS3369, ZS3382, ZS3397, ZS3399, ZS3414, ZS3421, ZS3429, ZS3442, ZS3450, ZS3457, ZS3476, ZS3480, ZS3482, ZS3485, ZS3494, ZS3504 PH3532, PH3547, PH3641, PH3948, PH3965, PH4156, PH4391, PH4422, PH4603, PH4961, PH526

Узел PH1443
PH1443, PH5003

Узел ZS3289
ZS3289, ZS3290, ZS3302, ZS3313, ZS3335-ZS3347, ZS3360, ZS3389, ZS3391, ZS3394, ZS3395, ZS3409, ZS3411, ZS3413, ZS3418, ZS3425, ZS3434, ZS3437-ZS3441, ZS3444, ZS3446, ZS3455, ZS3470, ZS3486, ZS3487

Начинаю вот даже подумывать о нестабильности PF7257.

Так а какой FTDNA Kit# этого пенджабца?  Хочу в Семаргле его посмотреть!

Его нет в FTDNA. Это научный проект 1000 геномов. Делали полногеномные секвенирования по всему миру, но STRы не тестировали. Правда, качество секвенирования не такое, как у FTDNA, но BAMы можно использовать в YFull.

Оффлайн AlexanderK

  • Сообщений: 1971
  • Страна: ru
  • Рейтинг +347/-1
  • Y-ДНК: J1-PF7257
  • мтДНК: H11a1
Re: PF7257
« Ответ #24 : 23 Октябрь 2016, 17:39:29 »
Тут не всё так просто. Дело в том, что, если взглянуть на дерево Виктара Маса, этот пенджабец делит массу снипов с саудитом Альнасером:

Узел PF7257
PF7257, PF7261, ....

Как же они их делят если из YFull ответили что у пенджабца PF7257- ?

А у саудита какой кит №???

Оффлайн Centurion

  • 100% Earth (Solar System) genofond
  • Администратор
  • *****
  • Сообщений: 10080
  • Страна: ru
  • Рейтинг +566/-2
Re: PF7257
« Ответ #25 : 23 Октябрь 2016, 17:45:26 »
у пенджабца всего 1 рид, так что результат можно считать не слишком с болшим уровнем доверия, ну то есть не четким

Оффлайн YaroslavАвтор темы

  • Я всего лишь уличный повеса, Улыбающийся встречным лицам
  • Сообщений: 11656
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2153/-10
  • 76% East Europe + 17% Finland
  • Y-ДНК: J1a2b1a-ZS3114 > ZS3084, ЖМ: I2a1a2b1a1a1a1-Z16971 > Y159653
  • мтДНК: K1b1a1-T199C, МЖ: H13a1a1d
Re: PF7257
« Ответ #26 : 23 Октябрь 2016, 19:56:44 »
Если посмотреть на дерево Виктара Маса, то на ветви PF7257 есть ещё результаты двух человек, из Азербайджана (MK2015#13741/Azerb13 из научной работы Karmin et al., 2015 A recent bottleneck of Y chromosome diversity coincides with a global change in culture) и из Турции (PH2014#tur-16 из Hallast et al., 2014 Y-chromosome tree bursts to leaf), имеющих общие снипы узла PF7257 с пенджабцем и саудитом Альнасером (445137).

Оффлайн AlexanderK

  • Сообщений: 1971
  • Страна: ru
  • Рейтинг +347/-1
  • Y-ДНК: J1-PF7257
  • мтДНК: H11a1
Re: PF7257
« Ответ #27 : 23 Октябрь 2016, 20:57:18 »
Если посмотреть на дерево Виктара Маса, то на ветви PF7257 есть ещё результаты двух человек, из Азербайджана (MK2015#13741/Azerb13 из научной работы Karmin et al., 2015 A recent bottleneck of Y chromosome diversity coincides with a global change in culture) и из Турции (PH2014#tur-16 из Hallast et al., 2014 Y-chromosome tree bursts to leaf), имеющих общие снипы узла PF7257 с пенджабцем и саудитом Альнасером (445137).

Питер мне писал еще месяц назад что PH2014#tur-16 это вот отсюда:
Links: http://mbe.oxfordjournals.org/content/early/2014/12/13/molbev.msu327.short and http://dienekes.blogspot.com/2015/01/y-chromosome-tree-bursts-to-leaf.html and https://www.sciencedaily.com/releases/2015/05/150519121901.htm


Оффлайн AlexanderK

  • Сообщений: 1971
  • Страна: ru
  • Рейтинг +347/-1
  • Y-ДНК: J1-PF7257
  • мтДНК: H11a1
Re: PF7257
« Ответ #28 : 23 Октябрь 2016, 21:12:56 »
Увы, у Виктара в дереве ошибка. У меня DYS537=12, DY438=11, DY578=9, YCAIIa=17 - то есть я должен вроде как попасть в ветку как раз с этим самым туркам, а у неё возраст всего 2700 лет. Я обрадовался и заказал снипы CTS8690 и F2594. Оба оказались с минусом. А вот F999+ это коротенькая веточка слева, как раз та в которую попадает MK2015#13741/Azerb13   



Оффлайн AlexanderK

  • Сообщений: 1971
  • Страна: ru
  • Рейтинг +347/-1
  • Y-ДНК: J1-PF7257
  • мтДНК: H11a1
Re: PF7257
« Ответ #29 : 24 Октябрь 2016, 00:11:16 »
PF7261+ 7C
PF7257- 1A

Спасибо! Значит, PF7257 у него всё-таки в минусе. Это интересно.

Ярослав, у саудита сделавшего BigY (это ведь 445137 Alnasser, правильно?)' похоже то же самое. Гаплогруппа у него J-PF7261 а не J-PF7257. Почему Виктар его записал в  J-PF7257 Cluster B2 - непонятно. На 67 маркерах в Семаргле единственный J-PF7257 совпаденец это N111629 (итальянец Percoco), на расстоянии 34. Остальные 250 "совпаденцев" (а больще семаргл не показывает)    совсем из других гаплогруп.

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.


Rambler's Top100