PF7257

[AlexanderK]

Открыл

Внёс. Вот такие дистанции на 25 локусах (первая цифра - общее количество отличающихся локусов, вторая цифра общая разница в количестве коротких тандемных повторов):

0   0   444725   Randjelovic   J1-M267>YSC65>PF7257
3   3   172507   Kalantarian   J1-M267>YSC65>PF7257
3   3   380929   Kuzmichev   J1-M267>YSC65>PF7257
3   3   291758   Melik-Adamian   J1-M267>YSC65>PF7257
5   5   373675   Alihanov   J1-M267>YSC65>PF7257

Да, интересно. На 37 локусах Кузьмичев от Калантаряна удален на 6/6, от Мелик-Адамяна на 7/10, от Алиханова - на 13/19. То есть увы, по 25 выводы об удаленности делать вообще нельзя

[Yaroslav]

То есть увы, по 25 выводы об удаленности делать вообще нельзя

+1

В большинстве случаев и Y37 недостаточно.

[AlexanderK]

Сделал PH128 на YSeq

BigY Мадатову оплачен, уйдет в батч на следующей неделе. Как будет готов - возможно линейка снипов "меликской ветки" под PF7257 доступных через YSeq  пополнится ещё на 5-6 снипов.

Ну и конечно ждем позиционирования Кузьмичева на дереве, вдруг он со мой или Шаумяном еще одну веточку образует под PF7261 https://yfull.com/tree/J-PF7261/

[Teresh]

Сделал PH128 на YSeq

А кому именно?

BigY Мадатову оплачен, уйдет в батч на следующей неделе. Как будет готов - возможно линейка снипов "меликской ветки" под PF7257 доступных через YSeq  пополнится ещё на 5-6 снипов.

С учетом Azerb13 будет интересно посмотреть на возможные разветвления.

Ну и конечно ждем позиционирования Кузьмичева на дереве, вдруг он со мой или Шаумяном еще одну веточку образует под PF7261 https://yfull.com/tree/J-PF7261/

На YFull.com Кузьмичева оплатил. Добавил его там в группу J1. В группах на YFull.com полезно участвовать. Можно у других участников проверять снипы и смотреть значения STR-маркеров (когда они будут готовы).

[AlexanderK]

Сделал PH128 на YSeq

А кому именно?

Да никому пока, просто заплатил $1 чтобы они его добавили в интернет-магазин, чтобы его можно было кому-нибудь заказать 

[Teresh]

Да никому пока, просто заплатил $1 чтобы они его добавили в интернет-магазин, чтобы его можно было кому-нибудь заказать 

Так я его уже давно там оформил: http://forum.molgen.org/index.php/topic,8559.msg364289.html#msg364289

Может его поэтому и вынесли на дереве YFull.com в заголовок ветви PF7257. Он более надежный, есть на YSeq.net и может когда-нибудь уйдет на уровень кластера В, если вдруг окажется отрицательным для кластера С.

[AlexanderK]

Да никому пока, просто заплатил $1 чтобы они его добавили в интернет-магазин, чтобы его можно было кому-нибудь заказать 

Так я его уже давно там оформил: http://forum.molgen.org/index.php/topic,8559.msg364289.html#msg364289

Может его поэтому и вынесли на дереве YFull.com в заголовок ветви PF7257. Он более надежный, есть на YSeq.net и может когда-нибудь уйдет на уровень кластера В, если вдруг окажется отрицательным для кластера С.

Хм, а с меня $1 они не постеснялись взять

А что за снипы YP5852 - YP5856 , у кого они и зачем?

[AlexanderK]

А, вот смотрю:

https://www.yseq.net/product_info.php?products_id=42591&osCsid=93a2e9ac187dbe531776d39dc1ff835f
- здесь написано что снип PH128 из работы Pille etc all 2014, что он из гаплогруппы J1 и below PF7261

Про снипы YP5852...56
https://www.yseq.net/product_info.php?products_id=42585&osCsid=93a2e9ac187dbe531776d39dc1ff835f
Написано что они добавлены YDNA-community (2016) - но ни гаплогруппы ни положения не указано

Есть ещё три снипа ZS117xxx
https://www.yseq.net/advanced_search_result.php?keywords=PF7257&search_in_description=1&osCsid=93a2e9ac187dbe531776d39dc1ff835f&x=15&y=7
- которые добавлены Виктарам Масам в 2016 и про них написано что они downstream PF7257

И есть ещё 30 снипов ZS329хх.. тоже добавленных Виктаром Максом но в 2014  про которые написано что они: Found in 1kGP sample HG03767; downstream PF7261
https://www.yseq.net/advanced_search_result.php?keywords=PF7261&search_in_description=1&osCsid=93a2e9ac187dbe531776d39dc1ff835f&x=13&y=16

Ну то есть получается что они тоже взяли с тебя $1 за добавление PH128 в то время когда он там уже был?

Ну и надо бы эти добавленные тобой YP585х что- нибудь в YSeq написать, а то ведь иначе никто их поиском не найдёт!

[Teresh]

А что за снипы YP5852 - YP5856 , у кого они и зачем?

Вот здесь про них написано: http://forum.molgen.org/index.php/topic,8559.msg368121.html#msg368121 
Хорошо, что некоторые "ушли" на более высокие уровни. В будущем могут пригодиться снипы уровня PF7257 или только уровня кластера В.
Правда мы пока не знаем, на каком уровне находятся снипы YP5853 и YP5854. Нужен товарищ из кластера С, чтобы выделить общие с ним снипы уровня PF7257.

Ну то есть получается что они тоже взяли с тебя $1 за добавление PH128 в то время когда он там уже был?

Его там не было. У них там поиск есть - можно сначала проверить какие снипы уже есть, а потом добавлять. А деньги они сразу автоматически снимают. Даже если снип не прошел проверку качества и поэтому не добавлен. Можно сказать, что берут деньги за проверку.

[AlexanderK]

А что за снипы YP5852 - YP5856 , у кого они и зачем?

Вот здесь про них написано: http://forum.molgen.org/index.php/topic,8559.msg368121.html#msg368121 
Хорошо, что некоторые "ушли" на более высокие уровни. В будущем могут пригодиться снипы уровня PF7257 или только уровня кластера В.
Правда мы пока не знаем, на каком уровне находятся снипы YP5853 и YP5854. Нужен товарищ из кластера С, чтобы выделить общие с ним снипы уровня PF7257.

Все эти кластеры - пока дело сугубо теоретическое, а практическую пользу какую можно извлечь? Можно ли например порекомендовать Кияшко сделать какие-то снипы на YSeq и что ему это даст? Он пока единственный кого я знаю из кластера кто готов отдать $17 за тест (ну может $35 за два). Остальным это даже при таких суммах не интересно...

[Teresh]

Можно ли например порекомендовать Кияшко сделать какие-то снипы на YSeq и что ему это даст? Он пока единственный кого я знаю из кластера кто готов отдать $17 за тест (ну может $35 за два). Остальным это даже при таких суммах не интересно...

Кияшко из кластера В, но пока не понятно из какой ветви. Сейчас трудно что-то конкретное рекомендовать. Снипы YP5852 и YP5855 скорее всего будут отрицательные.

Если все делать по уму, то надо дождаться результатов анализа YFull.com для  Кузьмичева и Мадатова. А затем собирать панель для кластера В, добавив в нее YP5852, возможные новые общие снипы, и по несколько приватных снипов Шаумяна, Кузьмичева и tur-16. Если с выбором приватных снипов повезет, то при помощи этой панели можно будет проверять разных товарищей на принадлежность к уже известным ветвям кластера В.
Панель на 8 снипов стоит $116, на 10 снипов - $143 и т.д. Причем заранее не понятно, какие из приватных снипов являются  "старыми" и могут быть положительными у других представителей этой ветви. Т.е. можно потратить деньги и ничего не узнать. Иногда лучше подождать новые Big Y или новые научные образцы, чтобы понять, какие снипы вообще следует проверять.

[AlexanderK]

Так интерпретация Кузьмичева уже готова вроде? Или лучше подождать обновления дерева?

Мадатов на дереве появится ещё очень нескоро, месяца через четыре минимум. Я его позавчера оплатил, но в батч он не попал, теперь только на следующей неделе.

[Farroukh]

теперь ветвь обрела новое имя - J-PH128

[AlexanderK]

теперь ветвь обрела новое имя - J-PH128

Ну да, ну да. Если только не найдется армянский мелик еще более дальний от меня чем Шаумян.

Никак не разберусь что мне посмотреть в YFull чтобы определить образуем ли мы с Шаумяном (или Кузьмичевым) еще одну ветку ниже PH128 ...

[Farroukh]

Судя по Y-STR древу, субклад распадается на три разные ветви - Шаумян, Кузьмичёв и все остальные. То есть даже после расфасовки снипов Мадатова эти двое так и останутся базальными J1-PH128*. Зато ветвь во главе с Каталовым и Мадатовым обретёт свой локальный снип.

Чтобы узнать общий снип всей третьей и самой многочисленной ветви нужен БигИгрек Тангиева. (Делаю спекулятивное предположение, что родоначальником этого субклада был кто-то из Мехранидов).