J2, Азербайджан

[Farroukh]

В продолжение этого вопроса. Судя по совпаденцам, это может быть J-CTS900. Глубже/точнее может подсказать только апгрейд.

[Farroukh]

Было бы интересно проверить на вайнахский снип Y3640.

[Sarkhan Bashirov]

В продолжение этого вопроса. Судя по совпаденцам, это может быть J-CTS900. Глубже/точнее может подсказать только апгрейд.

Совпаденцы и приближенцы данного гаплотипа

[Farroukh]

Сархан, мой алгоритм был таким. Посмотрите на список полных (12/12) совпаденцев. Среди них есть представители разных народов, но ареально близких только три - два армянина и один турок. У одного из армян проверен глубокий снип - CTS3261, который по классификации J-CTS900.

Соответственно, можно допустить, что наш подопечный с высокой степенью вероятности тоже CTS900. Я не знаю, разработан ли для J2 SNP pack. Если да, то его можно взять.

[Sarkhan Bashirov]

Спасибо! Что интересно, что у этого гаплотипа в графе гаплогруппа до сих пор стоит прочерк. ФТДНА не указало даже предиктуемую гаплогруппу. Что же касается ареально близких совпаденцев, то один из армян находится на очень большом расстоянии от турка - 21/37.

[Farroukh]

Это нормально. Все они наверняка далеки от европейцев, но между ними самими также приличные расстояния. Очевидно, что турку будет ближе западный (анатолийский) армянин, к нашему подопечному - армянин закавказский.

Тот набор снипов стоит 99 долларов, вполне посильная альтернатива БигИгреку. Ну и апргрейд до 67 маркёров как перспектива.

[Sarkhan Bashirov]

Это нормально.

Это Вы про то, ФТДНА гг не указывает или про что-то другое? А где можно посмотреть какие снипы входят J2 SNP Pack и насколько глубокие снипы в нем присутствуют?

[mikhail a.]

J2-М172 SNP-Pack состоит из 108 снипов и сейчас стоит 119$
Хотя в тех результатах, которые видел я, было по 106 снипов. Может добавили парочку

[Sarkhan Bashirov]

J2-М172 SNP-Pack состоит из 108 снипов и сейчас стоит 119$
Хотя в тех результатах, которые видел я, было по 106 снипов. Может добавили парочку

Спасибо за информацию. А какой снип из этого набора, если так можно выразиться, ближе всех к нашим временам и насколько он ближе?

[mikhail a.]

Насколько ближе, чем что? В принципе, зависит от "проработанности" подветви, но в любом случае возраста в J2а будут более значительные, чем, например, в R1a или I1.

[Sarkhan Bashirov]

Насколько ближе, чем что? В принципе, зависит от "проработанности" подветви, но в любом случае возраста в J2а будут более значительные, чем, например, в R1a или I1.

Ну вот например, если в этом наборе снипы от M172 до Y3460,то как я выразился самый близкий к нашим временам снип это Y3460,  который появился 4100 лет назад, потому что все остальные снипы возникли гораздо раньше.

[mikhail a.]

У меня есть ощущение, что по этой ветке в пакете глубже Z7671 снипов нет. А это 12500 лет.

[Sarkhan Bashirov]

У меня есть ощущение, что по этой ветке в пакете глубже Z7671 снипов нет. А это 12500 лет.

Стоит ли в таком случае заказывать этот набор снипов, если можно заказать более глубокие снипы по отдельности? На сколько это будет рациональнее?

[mikhail a.]

Пакет имеет смысл заказывать в том случае, когда нет уверенности даже в снипах верхнего уровня (типа L26). В противном случае лучше сказывать либо БигУ (предпочтительнее, но дороже), либо отдельные наиболее вероятные  снипы (в целях экономии - в YSeq, если есть возможность повторного забора материала).

[Sarkhan Bashirov]

Пакет имеет смысл заказывать в том случае, когда нет уверенности даже в снипах верхнего уровня (типа L26). В противном случае лучше сказывать либо БигУ (предпочтительнее, но дороже), либо отдельные наиболее вероятные  снипы (в целях экономии - в YSeq, если есть возможность повторного забора материала).

Благодарю, учту.