АвторТема: Мой случай с аутосомами  (Прочитано 985 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн dogslegАвтор темы

  • Сообщений: 52
  • Страна: ru
  • Рейтинг +10/-0
  • Y-ДНК: N-Y39001
  • мтДНК: H1b2
Мой случай с аутосомами
« : 16 Октябрь 2015, 11:08:13 »
Добрый день, уважаемые знатоки!

Хотелось бы услышать ваши комментарии по поводу следующего случая.

Имеется такое дерево, составленное по документальным источникам (если кому важно, то прямоугольники -- мужчины, окружности -- женщины):



При настройках Gedmatch по умолчанию имеем следующее:

1. Между M348760 и F325333

Chr   Start Location   End Location   Centimorgans (cM)   SNPs
12   73,136,950   88,302,368   11.9   1,128
17   14,156,161   75,568,048   88.3   6,121

Largest segment = 88.3 cM
Total of segments > 7 cM = 100.2 cM
Estimated number of generations to MRCA = 3.6

2. Между M262704 и F325333 (это так, скорее из любопытства)

Chr   Start Location   End Location   Centimorgans (cM)   SNPs
17   13,506,540   75,527,356   91.5   6,255

Largest segment = 91.5 cM
Total of segments > 7 cM = 91.5 cM
Estimated number of generations to MRCA = 3.6

3. Между M34860 и F359535

Chr   Start Location   End Location   Centimorgans (cM)   SNPs
1   165,517,640   185,177,214   18.4   1,898

Largest segment = 18.4 cM
Total of segments > 7 cM = 18.4 cM
Estimated number of generations to MRCA = 4.8

4. Между M262704 и F359535, а также F325333 и F359535 общих сегментов >7 cM нет.

Я так понимаю, что до 1855 г. мужская линия точно не прерывалась. Можно ли в данном случае утверждать непрерывность мужской линии до 1822 г., или для этого нужен анализ аутосомной ДНК родственника, общий предок с которым жил раньше? К сожалению, с доказательством непрерывности через Y пока всё сложно (такие родственники пока не найдены)...
« Последнее редактирование: 16 Октябрь 2015, 16:35:08 от dogsleg »

Оффлайн Srkz

  • Сообщений: 5248
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1974/-2
  • Y-ДНК: N1c L1025*
  • мтДНК: U4a1e-pre T16093C T16311T
Re: Мой случай с аутосомами
« Ответ #1 : 16 Октябрь 2015, 15:47:21 »
Цитировать
17   14,156,161   75,568,048   88.3   6,121
Хорошая иллюстрация тезиса, что по чисто мужским линиям обычно передаются более длинные сегменты, хотя и в меньшем количестве.

Можно ли в данном случае утверждать непрерывность мужской линии до 1822 г., или для этого нужен анализ аутосомной ДНК родственника, общий предок с которым жил раньше? К сожалению, с доказательством непрерывности через Y пока всё сложно (такие родственники пока не найдены)...
Мое мнение, что вероятность непрерывности высокая (хотя если предки жили в XIX веке в одной деревне, то мог ведь общий сегмент и по какой-то из других линий проскочить). Расстояние великовато (среднее 4.5-5 поколений до общего предка), на таких дистанциях ответов со 100% уверенностью аутосомное родство уже не дает. Поэтому родственник с еще более древним общим предком уверенности не добавит.

Оффлайн dogslegАвтор темы

  • Сообщений: 52
  • Страна: ru
  • Рейтинг +10/-0
  • Y-ДНК: N-Y39001
  • мтДНК: H1b2
Re: Мой случай с аутосомами
« Ответ #2 : 16 Октябрь 2015, 16:33:51 »
А как объяснить, что у меня с M348760 получилось на 17 хромосоме

14,156,161   75,568,048   88.3   6,121, а с его дочерью там же
13,506,540   75,527,356   91.5   6,255.

Что это, погрешность, неточность выделения сегментов или ей ещё от мамы передалось так, что и у меня такой кусок в этом месте оказался?

Оффлайн dogslegАвтор темы

  • Сообщений: 52
  • Страна: ru
  • Рейтинг +10/-0
  • Y-ДНК: N-Y39001
  • мтДНК: H1b2
Re: Мой случай с аутосомами
« Ответ #3 : 16 Октябрь 2015, 16:40:54 »
Хорошая иллюстрация тезиса, что по чисто мужским линиям обычно передаются более длинные сегменты, хотя и в меньшем количестве.

Кстати, если это интересно, то у меня с Y-бабушкой получилось так:

Chr   Start Location   End Location   Centimorgans (cM)   SNPs
1   72,017   82,208,869   112.9   20,796
1   205,663,107   247,169,190   65.7   11,489
2   115,022,181   138,948,491   24.4   5,149
2   138,964,086   242,683,192   113.5   22,844
3   36,495   59,479,625   78.0   15,905
4   41,054,722   183,827,230   130.1   26,743
6   1,639,007   170,732,528   188.9   45,410
7   28,291,949   158,811,958   144.1   27,663
8   5,482,714   146,255,887   157.0   32,426
9   8,726,813   137,025,382   137.2   26,823
10   7,616,237   70,002,072   63.4   15,449
11   188,510   29,853,673   50.3   9,369
11   126,146,741   134,436,845   19.5   2,761
12   61,880   6,699,733   18.4   2,250
13   17,956,717   41,478,370   43.7   7,143
13   105,191,147   114,108,121   23.9   3,102
14   18,397,823   106,345,097   125.2   22,416
15   18,331,687   84,053,097   88.5   15,238
16   28,165   88,668,978   133.8   21,856
17   75,381,216   78,637,198   7.5   808
18   3,034   52,456,755   81.3   13,446
19   5,685,239   20,439,390   28.5   3,852
19   20,518,462   58,989,046   50.6   7,381
20   47,643,403   62,374,274   39.8   4,919
21   9,849,404   37,105,929   45.4   6,439
22   14,494,244   18,587,825   12.5   972

Largest segment = 188.9 cM
Total of segments > 7 cM = 1,984.0 cM
Estimated number of generations to MRCA = 1.4

А с мт-бабушкой так:

Chr   Start Location   End Location   Centimorgans (cM)   SNPs
1   79,255,005   228,970,118   130.9   31,267
2   8,674   9,747,865   22.4   3,005
2   184,944,106   235,643,910   59.1   11,077
3   36,495   9,338,925   26.4   3,698
3   9,349,170   39,938,681   36.8   8,207
3   191,662,668   199,310,226   16.9   1,652
4   131,317,300   170,003,538   38.4   7,201
5   16,960,538   125,617,360   97.0   21,481
5   163,735,878   180,623,543   36.8   4,852
6   148,878   54,320,964   81.4   20,548
6   117,765,698   153,409,888   39.8   8,273
7   2,024,460   25,641,056   38.1   7,629
7   47,390,611   141,727,798   83.2   18,388
8   154,984   17,184,749   31.5   7,058
8   126,046,673   146,255,887   35.9   5,570
9   36,587   24,501,918   48.1   8,884
9   24,512,869   37,377,218   13.5   3,361
10   82,369,383   135,297,961   73.8   15,503
11   24,848,575   79,640,633   45.2   11,625
11   115,878,661   133,662,283   36.8   5,744
12   61,880   66,072,694   84.6   17,094
13   86,801,947   114,108,121   51.7   8,862
14   83,343,365   106,345,097   43.6   6,080
15   66,436,641   93,725,839   42.0   7,073
17   12,344   45,616,851   76.4   10,973
18   3,034   55,606,041   86.6   14,503
18   55,615,385   76,112,951   42.9   6,344
19   211,912   17,809,861   43.2   4,837
19   52,019,977   63,776,118   37.4   3,695
20   11,244   51,365,788   81.5   13,969
21   9,849,404   46,909,175   70.1   9,833
22   14,494,244   49,528,625   79.1   10,000

Largest segment = 130.9 cM
Total of segments > 7 cM = 1,731.0 cM
Estimated number of generations to MRCA = 1.5

Оффлайн Srkz

  • Сообщений: 5248
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1974/-2
  • Y-ДНК: N1c L1025*
  • мтДНК: U4a1e-pre T16093C T16311T
Re: Мой случай с аутосомами
« Ответ #4 : 16 Октябрь 2015, 16:56:24 »
Что это, погрешность, неточность выделения сегментов или ей ещё от мамы передалось так, что и у меня такой кусок в этом месте оказался?
Вероятно, последнее - микросегмент наложился, их сотни и тысячи раскиданы по геному.

Оффлайн dars

  • Сообщений: 503
  • Страна: se
  • Рейтинг +59/-0
  • Y-ДНК: N1c1-L708
  • мтДНК: U7, ММЖ: U8a1a
Re: Мой случай с аутосомами
« Ответ #5 : 26 Январь 2016, 00:13:48 »
у меня в некоторых линиях схожие ситуации. я в таком случае стараюсь брать днк у представителей других ветвей.. правда гарантию это тоже не дает. а из более старшего поколения чем протестированные никого не осталось (хоть и двоюродных)

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.


Rambler's Top100