Eight thousand years of natural selection in Europe, дубль 2

[rozenblatt]

Теперь надо копать ChHG (Chinese Hunter-Gatherers) Rozenblatt что-то упоминал на эту тему

Именно про Китай я сейчас не могу вспомнить, но команда Виллерслева изучает забайкальского охотника-собирателя возрастом 8000 лет(http://www.kommersant.ru/doc/2682568), японцы вроде бы извлекли ДНК дзёмонцев, но почему-то до сих пор не опубликовали, а корейцы изучают древнейших земледельцев Кореи.

[Yaroslav]

Переношу сюда своё сообщение от 24.11.2015, так как оно больше относится к данной теме:

Карельский охотник вроде J1
https://genetiker.wordpress.com/2015/11/24/more-y-haplogroups-for-prehistoric-eurasian-genomes/

Спасибо, Arame! Эта осень сравнительно богата на урожай J1 Правда, в обоих случаях (у карельского мезолитчика и у грузинского верхнего палеолитчика) авторы работ почему-то не стали проверять положительные снипы ниже уровня J. Прямо, научный заговор какой-то

Все положительные снипы J1 в списке Генетикера (YSC0001267/CTS3401/PF4705, YSC0000074/PF4655, YSC0001262/CTS2667, PF4660, CTS1138/PF4648, CTS7412/PF4742) - это самый первый узел M267 гаплогруппы J1. К сожалению, снипов из ветви J1b, к которой относится грузинский палеолитчик, в списке нет. Поэтому мне пока неясно, то ли это какая-то ещё неизвестная ветвь J1*, то ли он тоже J1b (кстати, в этом субкладе есть финн Салонен).

[Yaroslav]

Виктар Мас, администратор проекта J1, просмотрел ВАМ "карела":

I had a look at his BAM. Unfortunately, it's really of poor quality. and all we know is it's positive for several M267 approximates and negative for YSC65 and no-calls for F4306 and F1614 and their approximates.

Список обнаруженных положительных и отрицательных снипов гаплогруппы J1:

CTS3210 +
CTS7412 +
YSC0001267 +
YSC0001262 +

YSC0000065 -
ZS127 -
ZS3573 -
ZS3601 -
ZS9577 -
ZS9579 -
ZS9580 -

YSC0000065 - это уровень J1a в YFull.

F4306 и F1614 - это уровень J-Y6304 в YFull.

http://yfull.com/tree/J1/

[Srkz]

О, таки да, BAMы появились

[Pre Slav]

10433 / SVP46 (grave 1) Male (confirmed genetically), age 30-35, positioned on his back with raised knees, with a copper ring and a copper bead. His R1a1 haplotype shows that this haplotype was present in the region, although it is not represented later in high-status Yamnaya graves. His U5a1i MtDNA haplotype is part of a U5a1 group well documented in the Samara series.

...это тоже элитное захоронение...

[FenriR]

ктож спорит?)

[FenriR]

С каких это пор колечко и шарик из меди в погребении признак элитности - вот если бы там нашли несколько наложниц и пару десятков "холопов" вот тогда и впрямь можно было твердить о элитарном погребенном.

справедливости ради,
у "классически гиперморфных по структуре" хвалынцев из "самого элитного захоронения" были и холопы ("с уплощенным лицевым отделом" и восточными гг, например Q1a) и наложницы ("суммарная женская группа ... отчетливо продемонстрировала уклонение в сторону морфологически южноевропеоидных форм")
=)

[Semargl]

Не знаю, было или нет. Попросили посмотреть Y образца I0247 (Scythian 380-200 BC) на предмет определения глубокого субклада. Результат на всякий случай выложу тут:

R-Z2123: Z2123+
R-YP4926: YP4926- YP4929-
R-Y20746: Y20746-
R-Y875: PF4879- L856/PF1553-
R-YP4907: YP4912- YP4913- YP4917- YP4920- Y20653-
R-Y2632: Y2632-
R-Y2634: Y2634-
R-YP1532: YP1536-
R-Y615: Y628- Y603- Y935- Y940-
R-YP4973: YP4973-
R-YP520: YP519.1/YP519.2/YP1098/ZS1764- YP523-
R-YP526: YP528-
R-Y19762: Y19762- Y19763- Y19828- Y19765-
R-YP451: FGC22493/YP464- FGC22471/YP452-
R-YP450: FGC22467/YP450- FGC22482/Y4130- FGC22491/Y4129-
R-Y5977: FGC10237/Y5993- FGC10207/Y5978-

Это все что было охвачено ниже Z2123.

[Шад]

Вот у образца I0246 Потаповской культуры даже P1 нашли...

P1 нашли не только в Потаповке (I0246/SVP41), но и в немецких Esperstedt (I1542/ESP33) и Tiefbrunn (RISE434).
Только история умалчивает - что это? Не сохранившиеся среди наших современников ветви P1 или просто недотипированные образцы?
Помучить бы грамотно исходные данные по снипам:)

С P1 никто не разбирался? Может там есть снипы известные YFull, но неизвестные авторам:) ?

[Eugene]

справедливости ради,
у "классически гиперморфных по структуре" хвалынцев из "самого элитного захоронения" были и холопы ("с уплощенным лицевым отделом" и восточными гг, например Q1a) и наложницы ("суммарная женская группа ... отчетливо продемонстрировала уклонение в сторону морфологически южноевропеоидных форм")
=)

Не сходиться насчет "уплощенных холопов". Во-первых Q1a был самый старый (возраст 45-55 лет это очень много для того времени), а это показатель скорее высокого статуса. Для сравнения R1b был 20-30 лет, R1a был 30-35 лет.
Ну и во-вторых хвалынский Q1a не был более остальных уплощенным ))

[FenriR]

справедливости ради,
у "классически гиперморфных по структуре" хвалынцев из "самого элитного захоронения" были и холопы ("с уплощенным лицевым отделом" и восточными гг, например Q1a) и наложницы ("суммарная женская группа ... отчетливо продемонстрировала уклонение в сторону морфологически южноевропеоидных форм")
=)

Не сходиться насчет "уплощенных холопов". Во-первых Q1a был самый старый (возраст 45-55 лет это очень много для того времени), а это показатель скорее высокого статуса. Для сравнения R1b был 20-30 лет, R1a был 30-35 лет.
Ну и во-вторых хвалынский Q1a не был более остальных уплощенным ))

прежде чем пытаться "обличить" пост полугодовалой давности, почитали бы всю тему

...
убиенный хвалынец-Q1a оказался самым "южным" (и, ожидаемо, восточным) образцом из трех, "элитный" R1b - занял промежуточное положение между, по сути EHG, R1a и, схожим по аутосомному профилю с ямниками, Q1a
http://eurogenes.blogspot.de/2015/11/the-khvalynsk-men.html

Individual 10433, belonging to Y-chromosome haplogroup R1a, is almost a pure Eastern hunter-gatherer, which is somewhat surprising, considering he was buried with copper artifacts. On the other hand, sample 10434, the one belonging to haplogroup Q1a, and positioned further east than the other two, appears to have been whacked on the head a few times and simply thrown in a ditch.

PCA: https://drive.google.com/file/d/0B9o3EYTdM8lQVER4S01UQmlEeWM/view

собственно "уплощенность лицевого отдела" относительно других хвалынцев, и "соподчиненное положение" этих скелетов, скорее всего говорит о разном (географическом?) происхождении индивидов в захоронениях: может быть, они  "захватывались в плен", как и обладатель, редкой для региона, Q1a преклонного возраста (который, будучи представителем некой "элиты", по-Вашему мнению, мог отличаться в антропологическом плане). 
Поэтому, у них же, в свою очередь, вполне могли быть и "пленные" хвалынцы.

что касается его "высокого статуса" конкретно у хвалынцев:

0434 / SVP47 (grave 17) Male (confirmed genetically), age 45-55, positioned contracted on his side, with 4 pathological wounds on his skull, one of which probably was fatal. No grave gifts or animal sacrifices accompanied the burial. His Q1a Y-chromosome haplotype is unique in the Samara steppe series, but his U4a2 or U4d MtDNA haplotype are not unusual

Кстати, вспоминая о предполагаемом, генетическом, влиянии Майкопа на степные популяции Бронзы, вполне может оказаться, что некоторые группы, сходные с EHG, могли добираться до Закавказья во времена, предшествующие степным миграциям групп "Ямного генетическо кластера" (обозначение в известной степени условно):
http://eurogenes.blogspot.de/2016/07/the-mother-of-all-treemix-runs-1.html

[Freyr Njörðson]

Видно, что он далек от южноевропеоидного кластера, отчетливо гиперморфен

Подскажите, как Вы эту гиперморфию видите?
Что такое гиперморфность?
Чем она отличается от гипоморфности?

[Mich Glitch]

На картинке мой напарник по работе, друг и свидетель на свадьбе. Ещё вчера был жив. 


*** Тьфу! Дурацкая какая-то шуткулька получилась. Но правда - очень похож.   

[AlexanderK]

*** Тьфу! Дурацкая какая-то шуткулька получилась. Но правда - очень похож.   

Ну так может это его далекий предок? Пусть генетический тест даст, сравнится! 

[Mich Glitch]

Ну так может это его далекий предок? Пусть генетический тест даст, сравнится! 

А что, по черепу есть результаты анализа дДНА?