АвторТема: Genomic evidence for the Pleistocene and recent population history...  (Прочитано 1254 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн пенелопаАвтор темы

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 5870
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2080/-12
  • мтДНК: H1b
Genomic evidence for the Pleistocene and recent population history of Native Americans

Maanasa Raghavan еt al.

Abstract

How and when the Americas were populated remains contentious. Using ancient and modern genome-wide data, we find that the ancestors of all present-day Native Americans, including Athabascans and Amerindians, entered the Americas as a single migration wave from Siberia no earlier than 23 thousand years ago (KYA), and after no more than 8,000-year isolation period in Beringia. Following their arrival to the Americas, ancestral Native Americans diversified into two basal genetic branches around 13 KYA, one that is now dispersed across North and South America and the other is restricted to North America. Subsequent gene flow resulted in some Native Americans sharing ancestry with present-day East Asians (including Siberians) and, more distantly, Australo-Melanesians. Putative ‘Paleoamerican’ relict populations, including the historical Mexican Pericúes and South American Fuego-Patagonians, are not directly related to modern Australo-Melanesians as suggested by the Paleoamerican Model.

http://www.sciencemag.org/content/early/2015/07/20/science.aab3884

Оффлайн пенелопаАвтор темы

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 5870
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2080/-12
  • мтДНК: H1b

Оффлайн Teresh

  • Сообщений: 392
  • Страна: ru
  • Рейтинг +156/-0
  • Y-ДНК: R1a [YP237+ YP578+]
  • мтДНК: U5a1f
Re: Genomic evidence for the Pleistocene and recent population history...
« Ответ #2 : 22 Июль 2015, 11:44:45 »
bam и vcf файлы скачать можно здесь:
http://www.cbs.dtu.dk/suppl/NativeAmerican/data/
В частности, общий vcf для Y-хромосомы:
http://www.cbs.dtu.dk/suppl/NativeAmerican/data/genotypes/single_sample_dstat/samtools.hg19.combined.allsites.dstat.chrY.public.vcf.gz
В основном гаплогруппы N1c и Q1a. Есть один алтаец R1a-Z93.

Оффлайн magnusX

  • Сообщений: 25
  • Страна: de
  • Рейтинг +7/-0
Re: Genomic evidence for the Pleistocene and recent population history...
« Ответ #3 : 22 Июль 2015, 22:53:27 »
только собрался запостить ссылки, дай думаю проверю, а тут уже обе новые статьи.
Спасибо за оперативность!

Оффлайн Шад

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6315
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1211/-4
  • Ex oriente lux
  • Y-ДНК: Q-Y2750
  • мтДНК: J1c2z
Re: Genomic evidence for the Pleistocene and recent population history...
« Ответ #4 : 26 Июль 2015, 19:21:54 »
bam и vcf файлы скачать можно здесь:
http://www.cbs.dtu.dk/suppl/NativeAmerican/data/
В частности, общий vcf для Y-хромосомы:
http://www.cbs.dtu.dk/suppl/NativeAmerican/data/genotypes/single_sample_dstat/samtools.hg19.combined.allsites.dstat.chrY.public.vcf.gz
В основном гаплогруппы N1c и Q1a. Есть один алтаец R1a-Z93.

YFull планирует использовать эти данные для уточнения дерева снипов?

На самом деле там не так много данных по полным У-сиквенсам (21 образец). Результаты сведены в таблицу S7 на стр. 88 в Supplementary.

 
« Последнее редактирование: 26 Июль 2015, 20:52:19 от Шад »

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.


Rambler's Top100