АвторТема: Среднее Поволжье и дДНК  (Прочитано 1369 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн Аббат БузониАвтор темы

  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 19325
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1374/-56
  • Y-ДНК: I1a2a1a3a1a1a-YP1084+
  • мтДНК: H16
Среднее Поволжье и дДНК
« : 27 Июнь 2015, 22:31:22 »
Genetic substructures among Late Neolithic/Bronze Age Scandinavians

I may have discovered an interesting pattern in the Allentoft et al. data. It seems that during the Late Neolithic/Bronze Age, Scandinavia was populated by two somewhat different populations; one characterized by Y-Chromosome haplogroup R1b and a genome-wide genetic structure typical of present-day Northwestern Europeans, and another by Y-Chromosome haplogroup R1a and a relatively more eastern genome-wide genetic profile.

Below are two Principal Component Analyses (PCA), both featuring ancient Swedish genomes classified as part of the Late Neolithic Battle-Axe archeological culture. However, the first sample clusters near present-day Norwegians and belongs to Y-haplogroup R1b-U106, which is nowadays typically known as a Germanic paternal marker. On the other hand, the second sample clusters among present-day Russians, Erzya and Moksha, from all the way near the Volga, and belongs to Y-haplogroup R1a-Z645, which very likely expanded from Eastern Europe during the Late Neolithic.

-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------

Генетические подструктуры среди скандинавов позднего неолита/бронзы

Я, возможно, обнаружил интересную закономерность в данных Allentoft и др.. Кажется, что во время позднего неолита и бронзы  Скандинавия была заселена двумя несколькими различными группами населения; одна характеризуется Y-гаплогруппой R1b и аутосомной структурой типичного современного Северо-Западного европейца, а другая Y-гаплогруппой R1a и аутосомно ближе к Восточно-европейцам.

Ниже приведены два основных анализа компонент (PCA), оба с участием древних шведских геномов, классифицированные как представители поздне-неолитической археологической культуры "Боевых топоров". Тем не менее, первый образец находится рядом с кластером современных норвежцев и принадлежит Y-гаплогруппе R1b-U106, которая в наши дни, известна как "германский" маркер. С другой стороны, второй образец находится рядом с кластером, где находятся современные русские, эрзя и мокша, и принадлежит Y-гаплогруппе R1a-Z645, которая, скорее всего была распространена в Восточной Европе в позднем неолите.


Оффлайн Аббат БузониАвтор темы

  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 19325
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1374/-56
  • Y-ДНК: I1a2a1a3a1a1a-YP1084+
  • мтДНК: H16
Re: Среднее Поволжье и дДНК
« Ответ #1 : 06 Июль 2015, 00:24:28 »
Спасибо FenriR за информацию.

Поляко сделал тест, который призван измерять степную (/лесостепную) компоненту.

Цитировать
Первые 500 позиций, по мере убывания компонента Steppe. Лидерами из современных популяций, как водится, идут прибалты и северные русские, потом подключается мокша и эрзя, белорусы и восточные украинцы (видно, западные и южные русские тоже где-то там) и крайний северо-запад Европы в лице Норвегии, Исландии и "Оркадии" и прочих, etc. У прибалтов под и за 60%, у восточных европейцев, в среднем, 55-60, а у северо-западных около 55.

RISE_baAfan
RISE_baAfan
RISE_baYam
RISE_baYam
Yamnaya
Yamnaya
Yamnaya
RISE_baYam
Yamnaya
Yamnaya
Yamnaya
RISE_baAfan
RISE_baYam
RISE_baYam
RISE_baStq
Yamnaya
RISE_baAndrov
Corded_Ware_LN
RISE_baAndrov
RISE_baAndrov
RISE_baSin
RISE_baMezh
Corded_Ware_LN
RISE_baKarasuk
Corded_Ware_LN
RISE_baKarasuk
RISE_baAndrov
RISE_baBb
RISE_baSin
RISE_baSin
RISE_baKarasuk
RISE_baMezh
RISE_baCw
RISE_baUne
RISE_baCw
MA1
RISE_baSca
RISE_baKarasuk
RISE_irSca
BenzigerodeHeimburg_LN
Unetice_EBA
BenzigerodeHeimburg_LN
Estonian
Lithuanian
Lithuanian
Lithuanian
RISE_baSca
Lithuanian
Lithuanian
Estonian
Estonian
Estonian
Unetice_EBA
Lithuanian
RISE_baKarasuk
Estonian
Unetice_EBA
Estonian
Estonian
Lithuanian
Estonian
Lithuanian
Finnish
Russian_Kargopol
Estonian
Unetice_EBA
RISE_baOku
Russian_Kargopol
Belarusian
Unetice_EBA
Russian_Kargopol
Belarusian
Russian_Kargopol
Russian_Kargopol
Ukrainian_East
Russian_Kargopol
RISE_baBb
Finnish
Erzya+Moksha_______________________________
Erzya+Moksha_______________________________
Belarusian
Ukrainian_East
Lithuanian
Russian_Kargopol
Erzya+Moksha_______________________________
Finnish
Bell_Beaker_LN
Russian_Kargopol
Lithuanian
Russian_Kargopol
Erzya+Moksha_______________________________
Estonian
Ukrainian_East
Erzya+Moksha_______________________________
Russian_Kargopol
Russian_Kargopol
Erzya+Moksha_______________________________
Belarusian
Belarusian
Russian_Kargopol
Russian_Kargopol
Russian_Kargopol
Russian_Kargopol
Icelandic
Russian_Kargopol
Belarusian
Saami
Erzya+Moksha_______________________________
Russian_Kargopol
Belarusian
Halberstadt_LBA
Finnish
RISE_baSca
Russian_Kargopol
Icelandic
Finnish
Belarusian
Icelandic
Icelandic
Erzya+Moksha_______________________________
Belarusian
Russian_Kargopol
Russian_Kargopol
Finnish
Norwegian
Erzya+Moksha_______________________________
Norwegian
Russian_Kargopol
Icelandic
Orcadian
Erzya+Moksha_______________________________
Norwegian
Ukrainian_East
RISE_baKarasuk
Orcadian
Chuvash
Icelandic
Icelandic
Norwegian
Orcadian
Unetice_EBA
Icelandic
Orcadian
RISE_irAltai
Scottish_Argyll
Icelandic
Czech
Norwegian
Ukrainian_East
Orcadian
Norwegian
Russian_Kargopol
Finnish
Icelandic
Orcadian
Belarusian
RISE_irAltai
Norwegian
Ukrainian_West
Ukrainian_East
Alberstedt_LN
Icelandic
Ukrainian_West
Norwegian
Icelandic
Norwegian
Scottish_Argyll
Czech
Czech
Scottish_Argyll
Orcadian
Bell_Beaker_LN
Norwegian
Orcadian
Czech
Orcadian
Orcadian
Ukrainian_West
Czech
Czech
Hungarian
Orcadian
Czech
Orcadian
Hungarian
RISE_irAltai
Chuvash
Chuvash
Chuvash
Norwegian
Chuvash
English_Kent
Scottish_Argyll
Czech
English_Cornwall
English_Kent
Czech
Chuvash
Hungarian
HungaryGamba_IA
Hungarian
Bell_Beaker_LN
French
Orcadian
Chuvash
English_Cornwall
Hungarian
HungaryGamba_BA
Czech
English_Kent
French
English_Kent
French
Hungarian
Chuvash
Hungarian
Hungarian
Mansi
Chuvash
Hungarian
RISE_baHu
Hungarian
Chuvash
English_Cornwall
RISE_baUne
Bell_Beaker_LN
English_Cornwall
Hungarian
French
Hungarian
Hungarian
Croatian
English_Cornwall
French
Croatian
HungaryGamba_BA
English_Kent
Hungarian
Croatian
Hungarian
Croatian
Mansi
Hungarian
French
Croatian
Hungarian
French
Mansi
French
Hungarian
French
Croatian
Hungarian
French
Hungarian
Even
Croatian
Croatian
French
Mansi
Selkup
RISE_baArm
French
Croatian
Croatian
Mansi
French
French
Mansi
Mansi
French
French
Mansi
French
French
French
Lezgin
Tubalar
French
Tubalar
Tubalar
Bulgarian
Bulgarian
Bulgarian
Bulgarian
Adygei
Tubalar
French
Lezgin
Chechen
RISE_baHu
Kumyk
Selkup
Selkup
Tajik_Pomiri
Tubalar
Bulgarian
Chechen
Lezgin
Lezgin
RISE_baArm
French_South
Tubalar
Bulgarian
Lezgin
Chechen
Lezgin
Tubalar
Tubalar
Chechen
Tajik_Pomiri
Selkup
Lezgin
Tubalar
Lezgin
French
Bulgarian
French
Tajik_Pomiri
Lezgin
Chechen
French
Chechen
Adygei
French
Tubalar
Chechen
Basque_French
Spanish_Pais_Vasco
Balkar
Turkish_Istanbul
Spanish_Cantabria
Basque_French
Tubalar
Spanish_Cataluna
French_South
Basque_French
Tubalar
Basque_French
Adygei
Tubalar
Chechen
Kumyk
Tajik_Pomiri
French_South
Selkup
Basque_French
Adygei
Spanish_Pais_Vasco
Spanish_Aragon
Spanish_Cataluna
Basque_Spanish
Spanish_Pais_Vasco
Spanish_Pais_Vasco
RISE_irRus
Chechen
Kumyk
Albanian
Spanish_Valencia
Tubalar
Greek
Basque_French
Balkar
Adygei
Spanish_Cantabria
Italian_Bergamo
Balkar
RISE_baHu
Basque_Spanish
French_South
Tubalar
Tubalar
Spanish_Castilla_la_Mancha
Turkish_Istanbul
Bulgarian
Spanish_Aragon
Tajik_Pomiri
Tubalar
Basque_French
Tubalar
Spanish_Cataluna
Balkar
Adygei
Yukagir_Forest
French_South
Spanish_Cantabria
Selkup
North_Ossetian
North_Ossetian
Tajik_Pomiri
Nogai
Basque_Spanish
Spanish_Galicia
Basque_Spanish
Adygei
Selkup
Basque_French
Adygei
Basque_Spanish
Turkish_Istanbul
Basque_French
Yukagir_Forest
Balkar
Adygei
North_Ossetian
Basque_Spanish
Italian_Bergamo
Basque_French
Spanish_Pais_Vasco
Greek
Bulgarian
Basque_French
Basque_French
Spanish_Extremadura
Basque_French
Spanish_Baleares
Balkar
Tajik_Pomiri
Basque_French
Basque_French
Adygei
Spanish_Cantabria
Albanian
Basque_Spanish
Tajik_Pomiri
Spanish_Baleares
Adygei
Tubalar
Basque_French
Adygei
Bulgarian
Spanish_Cataluna
North_Ossetian
Adygei
Spanish_Andalucia
Kumyk
Spanish_Castilla_y_Leon
North_Ossetian
North_Ossetian
Spanish_Castilla_la_Mancha
Italian_Bergamo
Spanish_Cataluna
Spanish_Castilla_la_Mancha
Greek
French_South
Nogai
Spanish_Castilla_y_Leon
Spanish_Extremadura
Adygei
Basque_French
Spanish_Galicia
Spanish_Aragon
Spanish_Aragon
Italian_Tuscan
Greek
Spanish_Valencia
Spanish_Galicia
Greek
Kostenki14
Italian_Bergamo
Spanish_Extremadura
Spanish_Murcia
Basque_French
Tubalar
Spanish_Castilla_y_Leon
Spanish_Baleares
Tubalar
Greek
Nogai
Balkar
Yukagir_Forest
Basque_Spanish
Albanian
Basque_French
Basque_Spanish
Spanish_Valencia
Spanish_Castilla_la_Mancha
Kumyk
Balkar
Kumyk
Adygei
North_Ossetian
Abkhasian
North_Ossetian
Basque_French
Spanish_Murcia
Spanish_Castilla_y_Leon
Greek
Spanish_Castilla_y_Leon
Balkar
Balkar
Albanian
Kumyk
Nogai
North_Ossetian
Italian_Bergamo
Spanish_Murcia

http://eurogenes.blogspot.de/2015/07/revised-estimates-of-yamnaya-related.html
https://docs.google.com/spreadsheets/d/1_JwkRSG7VrBPHi0-LG-wEhCxFWCq0vyI5y5gJu8haAw/edit?pli=1#gid=650646573

Оффлайн Srkz

  • Сообщений: 5191
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1902/-2
  • Y-ДНК: N1c L1025*
  • мтДНК: U4a1a
Re: Среднее Поволжье и дДНК
« Ответ #2 : 07 Июль 2015, 18:33:49 »
Поляко сделал тест, который призван измерять степную (/лесостепную) компоненту.
Кстати, я сравнил эти образцы из набора Райха с ранее выложенными Эстонским Биоцентром, те же самые люди. Переводная табличка:
Reich   Yunusbaev/EBC      
Mordovians1   ?   probably Erzya/Moksha
Mordovians4   mordovia1   Erzya   
Mordovians5   -   Erzya   Родственник mordovia1/Mordovians4
Mordovians17   mordovia12   Moksha   
Mordovians22   mordovia13   Erzya   
Mordovians27   mordovia5   Moksha   
Mordovians28   mordovia6   Erzya   
Mordovians30   mordovia7   Erzya   
Mordovians31   mordovia8   Moksha   
Mordovians32   mordovia15   Erzya   

Оффлайн Аббат БузониАвтор темы

  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 19325
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1374/-56
  • Y-ДНК: I1a2a1a3a1a1a-YP1084+
  • мтДНК: H16
Дом, милый дом
« Ответ #3 : 17 Июль 2015, 19:24:34 »
«Шнуровики» как мост между Европами

Авторы статьи обнаружили, что популяция культуры шнуровой керамики промежуточна между популяцией ямной культуры и поздненеолитической Европой и предположили, что она и была мостом, по которому восточноевропейский генофонд втекал в центрально-европейский. На то они и авторы, чтобы выдвигать в качестве гипотезы предположение, наиболее хорошо согласующееся с имеющимися данными. Но на то мы и читатели, чтобы воспринимать гипотезы критически. Одним из аргументов авторов является то, что шнуровики генетически более всего похожи на «ямников» (минимальное Fst расстояние). Ну, судя таблице в статье (Extended Data Table 3) популяция культуры Unetice еще более похожа на шнуровиков. А среди современного населения на шнуровиков похожи самые разные популяции – и венгры, и англичане, и скандинавы, и русские с мокшей и эрзя.

По данным этой таблицы из статьи я построил карты генетических расстояний от основных древних популяций до всех современных. Они читаются так. Чем больше сходство ( то есть чем меньше генетическое расстояние, чем меньше Fst) между популяцией-точкой отсчета и популяцией-точкой на карте, тем более интенсивные зеленые тона. А чем меньше сходста – тем более светлые тона.

Вот карта от шнуровиков: темно-зеленые пятна сходств разбросаны по всей Европе.


А вот карта генетических расстояний от популяции ямной культуры: очень большого (темно-зеленого) сходства нет нигде, а умеренное сходство (ярко-зеленый цвет) – по всей Восточной Европе (изучены русские, мокша, эрзя, лезгины), а прочая Европа генетически еще меньше похожа на ямников. Это не очень-то согласуется с идеей, что именно ямники во многом сформировали генофонд Европы (хотя если говорить о сравнительно небольшом влиянии, то это карте не противоречит).


Взглянем еще на карту расстояний от восточно-европейских охотников-собирателей. Тональность карты – красноватые тона очень больших расстояний (генофонд Европы сейчас совсем иной, чем в мезолите), но все же вклад этого компонента прослеживается на «своей» территории – Восточной Европе — явственнее, чем в Западной Европе. Ну, это ожидаемый результат.

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.


Rambler's Top100