АвторТема: Инбридинг  (Прочитано 9758 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн CenturionАвтор темы

  • 100% Earth (Solar System) genofond
  • Администратор
  • *****
  • Сообщений: 9548
  • Страна: ru
  • Рейтинг +571/-2
Re: Инбридинг
« Ответ #15 : 16 Октябрь 2009, 00:19:46 »
Вывод такой: инбридинг крайне негативный феномен в плане здоровья популяции, однако в определенных местностях - в силу низкой демографической или социальной мобильности -его присутствие в более или менее выраженной форме документально подтверждается.
Как у меня, не жесткий инбридинг. Мой отец приходится своему отцу четвеюродным братом.
http://forum.molgen.org/index.php/topic,594.0.html

Оффлайн Kambic

  • Сообщений: 1460
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1513/-34
  • Y-ДНК: r1b
  • мтДНК: H
Re: Инбридинг
« Ответ #16 : 25 Июль 2018, 22:16:01 »
http://www.dslib.net/genetika/molekuljarno-geneticheskie-osobennosti-giperfenilalaninemij-v-karachaevo-cherkesskoj.html
https://www.kommersant.ru/doc/3475811
https://l.facebook.com/l.php?u=http%3A%2F%2Fwww.med-gen.ru%2Fdocs%2Fa-r_Gundorova%2520(%25D1%2581%2520%25D1%2581%25D0%25B0%25D0%25B9%25D1%2582%25D0%25B0).pdf&h=AT3UlHuxWBh_ID1p7OnOiCzpKTgFWGE3nGOKyc6ATURjBTZnMo562FRFoXbHUCmEfHrbWXqvLFVusHvJG8dWfbGXig3PZMdGOAQtqj69bRe4g3txCXh48h0.
Исследование ДНК 774 жителей КЧР, представляющих различные коренные этносы, на наличие частых мутаций PAH с помощью системы PKU-КЧ1 показало, что высокая частота ГФА обусловлена значительной распространенностью мутаций гена PAH среди карачаевцев. Мажорный вариант R261 встречается с аллельной частотой 55,2% среди всех больных, а среди карачаевцев с диагнозами «ФКУ» и «мГФА» - 67,3%. Среди здоровых карачаевцев каждый 16-ый является носителей мутации R261 , и каждый 10-ый носителем какой-либо мутации гена PAH. Расчетная частота заболевания всех форм РАН-зависимой ГФА среди карачаевцев составила 1:361. Таким образом, при том что карачаевцы составляют лишь 41% населения Карачаево-Черкесии, именно широкое распространение ФКУ в данном этносе является причиной аномально высокой частоты ФКУ в республике в целом. Относительно высокая суммарная частота мягких мутаций гена, и как следствие высокая доля мягких клинических форм заболевания (46% выявленных по неонатальному скринингу больных), вероятно сыграли немаловажную роль в процессе накоплении мутаций среди здорового населения.
Повсеместное распространение варианта R261 среди карачаевцев позволило предположить эффект основателя. Исследование RFLP гаплотипов гена PAH на хромосомах с мутацией R261 показало, что все они имеют общее происхождение. Сочетание вариантов шести SNP и двух локусов тандемных внутригенных повторов VNTR и STR соответствует гаплотипам 8, 10 или 41. Выявленный гаплотип, однако, отличается от всех описанных в литературе гаплотипов для этой мутации, что позволяет предположить его независимое происхождение. Описанные в исторических источниках контакты иранцев с народами, населяющими горы Кавказа, позволяют также предположить общее происхождение мутации в Карачаево-Черкесии и в Иране. Исследование областей тандемных повторов в областях, фланкирующих ген PAH, позволило определить неравновесие по сцеплению этих областей с мутацией R261 и рассчитать время ее распространения среди карачаевцев. Возраст мутации составил gср=10.2±2.7 поколений или 275±73 лет. Вариант начал распространяться около 250-300 лет назад в популяции в период, соответствующий началу экспоненциального роста ее численности.
Таким образом по результатам данной работы было установлено, что в Республике Карачаево-Черкесия аномально высокая частота гиперфенилаланинемий обусловлена главным образом увеличенной частотой носительства мутации R261 гена PAH, распространившейся среди карачаевцев в результате эффекта основателя. Быстрое накопление мутации можно объяснить двумя механизмами, оба из которых имели место быть одновременно. Во-первых, накопление мутации в популяции ограниченной численности и дальнейшее распространение в растущей популяции при преимущественно мононациональных браках. Во-вторых, компенсация тяжелого варианта R261 распространенными мягкими вариантами дает мягкий фенотип, больные ведут полноценную жизнь, передавая мутации PAH 100% своих потомкам.

Оффлайн Vince Adams

  • Сообщений: 101
  • Страна: ca
  • Рейтинг +35/-0
  • Y-ДНК: CTS3402
Re: Инбридинг
« Ответ #17 : 25 Июль 2018, 23:05:36 »
Недавняя статья на эту тему https://www.popsci.com/marrying-cousins-genetics

Вольный перевод заголовка "Не бойтесь жениться на  своей кузине - это может быть не так уж плохо для будущих детей".  Статья, конечно больше популярная чем научная, но приводит несколько интересных фактов. В частности утверждается, что в 1650-1850 годах все супруги в среднем приходились друг другу пятиюродными братьями/сестрами. И ничего.


Оффлайн valera27

  • Сообщений: 732
  • Страна: ru
  • Рейтинг +161/-0
  • Y - R1a1a-YP682(xYP1260,YP612,YP1696); mt - H1a
Re: Инбридинг
« Ответ #18 : 26 Июль 2018, 02:22:53 »
Можно понять такое, когда численность населения была маленькая и мобильность низкая, а какой смысл сейчас жениться на заведомых родственниках, если полно вариантов и без этого?..

Не, ну как... Просто если уж так случилось - не надо отказываться от любви ради мнимых опасностей)))
Если же речь не о любви, а о расчете - то до сих пор существует много закрытых сообществ, которые практикуют эндогамию. Но их и без этой статьи ничем не испугаешь :-)

Оффлайн Kambic

  • Сообщений: 1460
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1513/-34
  • Y-ДНК: r1b
  • мтДНК: H
Re: Инбридинг
« Ответ #19 : 27 Август 2021, 20:11:02 »
В половине геномов жителей Турции нашли следы инбридинга

Генетики проанализировали 2589 полных экзом и 773 генома жителей Турции и обнаружили, что половина образцов содержала свидетельства инбридинга. Браки, заключенные между родственниками, считаются традиционными примерно у 20 процентов населения планеты. В странах Запада этот показатель крайне низок и составляет, например, в Австралии – 0,23 процента, в США – около 0,1–0,2 процента, в Великобритании – 0,2–0,4 процента. В то же время в странах Северной Африки, Западной Азии и Ближнего Востока родственные браки составляют в среднем от 20 до 50 процентов. По данным турецких ученых, в 1990-е годы частота таких союзов в целом по стране немного превышала 21 процент, но при этом в отдельных регионах – более 30 процентов.Эдже Карс (Ece Kars) из Билькентского университета совместно с учеными из Турции, США, Южной Кореи, Франции и Великобритании исследовал генетическую структуру турецкого населения, для чего они проанализировали 2589 полных экзом и 773 геномов. Эти образцы были получены от 3864 человек, участвовавших в исследованиях бокового амиотрофического склероза, атаксии, нарушений фаз сна, эссенциального тремора, ожирения, болезни Паркинсона, синдрома поликистозных яичников, а также различных неврологических и иммунологических расстройств. География происхождения бабушек и дедушек по обеим линиям была сгруппирована в шесть регионов.
В результате исследования генетики обнаружили, что уровень кровнородственных браков в Турции крайне высок и составляет от 22 до 36 процентов, большинство из которых заключаются между двоюродными братьями и сестрами (66,3 процента).

Оффлайн Kambic

  • Сообщений: 1460
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1513/-34
  • Y-ДНК: r1b
  • мтДНК: H
Re: Инбридинг
« Ответ #20 : 28 Август 2021, 09:44:13 »
Известный в Азербайджане генетик Эльхан Расулов еще больше обострил интерес азербайджанской аудитории к медицине. В интервью ресурсу Media.Az Расулов рассказал: распространенные в республике близкородственные или кросскузенные браки — кратчайший путь к появлению на свет детей с неизлечимыми наследственными заболеваниями.
Увы, в Азербайджане высокая частота кровнородственных браков. Основную часть таких браков составляет второй тип — это браки между двоюродными братом и сестрой. Это очень опасно, и они составляют основную часть. Приблизительно, до 20% населения имеют кровное родство второго, третьего, четвертого и дальнего типа родства. Каждый из них по-своему нежелателен», — заявил генетик.
Подробнее: https://eadaily.com/ru/news/2020/03/12/azerbaydzhanskiy-genetik-blizkorodstvennye-braki-opasny-dlya-budushchego-nacii
Сторонники родственных браков утверждают, что такие связи способствуют стабильности внутри семьи. Никто не даст гарантии, что с человеком со стороны можно будет построить длительные отношения. Зато с двоюродной сестрой, которая всегда была на виду, у мужчины больше шансов. К тому же родители невесты, точно знали, в чьи руки они отдают дочь, а родители жениха знали все о будущей жене своего сына
Источник: https://fishki.net/3389174-rodstvennye-svjazi-pochemu-azerbajdzhancy-berut-v-zheny-svoih-sester.html © Fishki.net

Оффлайн 19986

  • Сообщений: 170
  • Страна: us
  • Рейтинг +138/-1
  • Y-ДНК: I1 > M253 > L22 > S19986/Y3603 > S9318* (Нижегородская обл.)
  • мтДНК: J1c2* (Ивановская обл.)
Re: Инбридинг
« Ответ #21 : 18 Сентябрь 2021, 03:58:28 »
Интересная статья (на Английском) по инбридингу среди древних популяций используя анализ дДНК: https://www.nature.com/articles/s41467-021-25289-w

Основные выводы на основании анализа 1785 дДНК со всего мира:
- Только один образец произошёл от смешения близких родственников (брат-сестра или ребёнок-родитель) - 6000-year-old Levantine Copper Age individual I1178. В образцах из соседних могил не обнаружено значительного инбридинга.
- 54 образца (3.0%) имеют гомозиготные сегменты длиной 20 сМ или больше, типичные для потомков двоюродных братьев-сестёр (88%) и иногда троюроджных (20%). Там пометка, что из-за типичных проблем с дДНК они могли пропустить некоторое кол-во образцов, но в целом по их оценке они должны были обнаружить как минимум 60% потомков кузенов-кузин, так что в целом доля должна быть не больше 5-6%.
- Значительное количество таких образцов (11 из 54) - образцы с островов. Единственный кластер, где более трёх таких образцов в одном месте и из одной эпохи - “Iron Age Republican Rome” (3 из 11 всего в кластере).
- При анализе более коротких образцов (4-8 сМ, т.е. для потомков более дальних родственников, чем троюродные братья-сёстры) заметно падение частоты таких сегментов с наступлением Неолитического перехода от охоты и собирательства к земледелию (очевидно, из-за увеличения плотности населения).

Ну и чтобы два раза не вставать, гомозиготные сегменты в ДНК от степени инбридинга по результатам симуляции (не из статьи):
Средняя длина ГЗ сегментов, сМСуммарная длина ГЗ сегментов, сМ
Родитель и ребёнок27.6828.3
Брат с Сестрой21.0817.9
Дядя/тётя-племянница/ник18.0426.3
Полу-брат с полу-сестрой21.9421.7
Двоюродные брат с сестрой14.3197.2
Троюродные брат с сестрой12.553.3

У образца с наибольшей степенью инбридинга насчитали 545 cM гомозиготного ДНК, но как я понял, меньше 800 потому что считали сегменты с длиной более 20 сМ ну и ДНК наверное неполное.
« Последнее редактирование: 18 Сентябрь 2021, 04:16:53 от 19986 »

Оффлайн Kambic

  • Сообщений: 1460
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1513/-34
  • Y-ДНК: r1b
  • мтДНК: H
Re: Инбридинг
« Ответ #22 : 20 Сентябрь 2021, 21:12:34 »
Интересная статья (на Английском) по инбридингу среди древних популяций используя анализ дДНК: https://www.nature.com/articles/s41467-021-25289-w
Дополню:
В древние времена в популяциях разных регионов близкородственные браки были распространены реже, чем в наше время.
Более 700 миллионов ныне живущих людей являются потомками родственников (двоюродных братьев-сестер или более близких),  а в некоторых регионах частота таких союзов достигает 20-60%. Исторически документировано, что близкородственные браки были распространены в античном Египте, среди правителей инков, в королевских династиях Европы и др.Свой метод исследователи применили к древним геномам 1785 индивидов, их данные были взяты из опубликованной глобальной базы по древней ДНК (Allen Ancient DNA Resource v42.4). Изученные геномы охватывают последние 45 тысяч лет в населении Старого и Нового света. Длина ROH, говорящая о родстве первой степени (545 сМ), найдена только у одного индивида из популяции Леванта медного века.
Анализ современных геномов выявил значительно большую долю длинных гомозиготных участков (у 176 из 1941 индивида). Причем, в то время как древние индивиды с длинными ROH не группировались по кластерам, среди современных авторы выделили несколько кластеров: Ближний Восток, Северная Африка, Центральная и Южная Азия и Южная Америка. Иными словами, в популяциях этих регионов часто встречаются близкородственные браки.
в древних геномах средняя длина гомозиготных участков снижается с переходом от охоты и собирательства к земледелию.  Так, в восьми региональных группах Западной Евразии она падает с 13-66 сМ в группах охотников —собирателей до 0-9 сМ в группах земледельцев. В южноамериканских Андах падает с 55,4 сМ у охотников-собирателей до 17,9 сМ у земледельцев. То есть появление производящего хозяйства в неолите снижает частоту близкородственных браков.
   Поскольку ранее было показано, что неолитическая революция  привела к росту численности населения, то, очевидно, причина именно в этом, переход к земледелию  способствует  увеличению размера популяции, что снижает вероятность даже случайной встречи родственников при образовании пары. На показатели гомозиготности влияют также и  локальные особенности образа жизни: так, у кочевых скотоводческих племен евразийской степи (культуры ямная, афанасьевская, синташта, окуневская, срубная) средний ROH выше (17 – 24 сМ), чем у европейских земледельцев (4,2 сМ).

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.