Интересная статья (на Английском) по инбридингу среди древних популяций используя анализ дДНК: https://www.nature.com/articles/s41467-021-25289-w
Дополню:
В древние времена в популяциях разных регионов близкородственные браки были распространены реже, чем в наше время. Более 700 миллионов ныне живущих людей являются потомками родственников (двоюродных братьев-сестер или более близких), а в некоторых регионах частота таких союзов достигает 20-60%. Исторически документировано, что близкородственные браки были распространены в античном Египте, среди правителей инков, в королевских династиях Европы и др.Свой метод исследователи применили к древним геномам 1785 индивидов, их данные были взяты из опубликованной глобальной базы по древней ДНК (Allen Ancient DNA Resource v42.4). Изученные геномы охватывают последние 45 тысяч лет в населении Старого и Нового света. Длина ROH, говорящая о родстве первой степени (545 сМ), найдена только у одного индивида из популяции Леванта медного века.
Анализ современных геномов выявил значительно большую долю длинных гомозиготных участков (у 176 из 1941 индивида). Причем, в то время как древние индивиды с длинными ROH не группировались по кластерам, среди современных авторы выделили несколько кластеров: Ближний Восток, Северная Африка, Центральная и Южная Азия и Южная Америка. Иными словами, в популяциях этих регионов часто встречаются близкородственные браки.
в древних геномах средняя длина гомозиготных участков снижается с переходом от охоты и собирательства к земледелию. Так, в восьми региональных группах Западной Евразии она падает с 13-66 сМ в группах охотников —собирателей до 0-9 сМ в группах земледельцев. В южноамериканских Андах падает с 55,4 сМ у охотников-собирателей до 17,9 сМ у земледельцев. То есть появление производящего хозяйства в неолите снижает частоту близкородственных браков.
Поскольку ранее было показано, что неолитическая революция привела к росту численности населения, то, очевидно, причина именно в этом, переход к земледелию способствует увеличению размера популяции, что снижает вероятность даже случайной встречи родственников при образовании пары. На показатели гомозиготности влияют также и локальные особенности образа жизни: так, у кочевых скотоводческих племен евразийской степи (культуры ямная, афанасьевская, синташта, окуневская, срубная) средний ROH выше (17 – 24 сМ), чем у европейских земледельцев (4,2 сМ).