АвторТема: CTS1460  (Прочитано 21351 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн YaroslavАвтор темы

  • Сообщений: 18704
  • Страна: ru
  • Рейтинг +4679/-14
  • 76% East Europe + 17% Finland
  • Y-ДНК: J1a2b1a ZS3067, ЖМ: I2a1a2b1a1a1a1 FT37540, МЖМ: G2a2b1a1a1a2b2a FT159945
  • мтДНК: K1b1a1 T199C, МЖ: H13a1a1d
Re: CTS1460
« Ответ #15 : 17 Март 2016, 07:31:30 »
Не могу понять, как ты вычислил, что ZS7626 образовался ~5545 лет назад).

5545 это ведь возраст ZS2872 — передковый для ZS7626, а образоваться он мог в любое время. Это мы уже наверное узнаем после интерпретации YFull.  :)

Это не я вычислил, это Виктар вычислил. Я чту закон, и не нарушаю права интеллектуальной собственности ;D

Я тоже раньше думал, что стоящий рядом с узлом возраст - это возраст этого узла. Пока не подсчитал снипы после распада узлов.

Например, возьму для простоты мой субклад с Бечуркаевым ZS3089. Рядом с ним стоит возраст ~7303yBP.



Ты спросишь, это возраст узла ZS3089? Ан нет!

1. Посчитаем количество снипов после его распада: у меня 53 SNPs, у Бечуркаева 55 SNPs. Среднее арифметическое 53+55 / 2 = 54.

2. Умножаем 54 на the Big Y mutation rate 135.24y/SNP based on the work of Iain McDonald, Mar 2015. Получаем 7302,96.

То есть, ~7303yBP - это не возраст ZS3089, а TMRCA у меня с Бечуркаевым. А возраст формирования узла ZS3089 тогда получается - это TMRCA вышестоящего к нему узла Z1842 (когда он распался на два узла: Z18436 и ZS3089).

Оффлайн Arame

  • Сообщений: 959
  • Страна: am
  • Рейтинг +387/-1
  • J1-Z1842
Re: CTS1460
« Ответ #16 : 20 Май 2016, 12:15:16 »
Я J1. Мне предсказали этот снип на основании 12 маркеров.   ;D
 

Оффлайн YaroslavАвтор темы

  • Сообщений: 18704
  • Страна: ru
  • Рейтинг +4679/-14
  • 76% East Europe + 17% Finland
  • Y-ДНК: J1a2b1a ZS3067, ЖМ: I2a1a2b1a1a1a1 FT37540, МЖМ: G2a2b1a1a1a2b2a FT159945
  • мтДНК: K1b1a1 T199C, МЖ: H13a1a1d
Re: CTS1460
« Ответ #17 : 20 Май 2016, 14:21:41 »
Я J1. Мне предсказали этот снип на основании 12 маркеров.   ;D

Поздравляю, Арам!

Судя по Ysearch, у Вас должны быть следующие полные совпаденцы:



Тимаев, кстати, оказался моим односубкладником J1 Z1842+ ZS3089+ Z18436- CTS1460-

Гилагаев предиктуется как J1-Z1842+ Z18436+ CTS1460+ BY100+ ZS2872+ Cluster A.

У Магомадова далёкий от всех гаплотип, даже по 67 попал в J-CTS1460 Unclustered (should order Big Y). Вот, ждём результатов его Big Y.

У Вас есть кто-то ещё из полных совпаденцев на странице Matches по Y в FTDNA?

Планируете апгрейд до оптимальных 67 маркёров, чтобы попытаться определить Вашу ветвь? Скоро, кстати, должен выйти снип-пакет J-Z1842, я давал на него ссылку в одной из тем этого раздела.
« Последнее редактирование: 20 Май 2016, 14:46:49 от Yaroslav »

Оффлайн Arame

  • Сообщений: 959
  • Страна: am
  • Рейтинг +387/-1
  • J1-Z1842
Re: CTS1460
« Ответ #18 : 21 Май 2016, 11:45:27 »
Спасибо Ярослав

Цитировать
У Вас есть кто-то ещё из полных совпаденцев на странице Matches по Y в FTDNA?

Да есть еще Эжиев. Он тоже из Чечни как и все мои полные совпаденцы. Что для меня естественно сюрприз. Мой предок из Западной Армении (Эрзрум, Турция) так что я не ожидал иметь  родственников из Кавказа. Вот эту загадку я и намерен уяснить для себя в ближайшее время.

Цитировать
Планируете апгрейд до оптимальных 67 маркёров, чтобы попытаться определить Вашу ветвь? Скоро, кстати, должен выйти снип-пакет J-Z1842, я давал на него ссылку в одной из тем этого раздела.

Да вот сейчас пытаюсь определится что дальше. Мне советовали 67 маркеров, но я очень хочу знать свои точные снипы. Снип-пакет J-Z1842 звучит заманчиво. Наверное я это выберу. Интересно когда оно выйдет.

В среднесрочной перспективе моя цель это иметь свой профиль в Yfull. Я надеюсь если закажу BigY в ФТДНА то перевод файла на Yfull не будет проблематичным?





Оффлайн YaroslavАвтор темы

  • Сообщений: 18704
  • Страна: ru
  • Рейтинг +4679/-14
  • 76% East Europe + 17% Finland
  • Y-ДНК: J1a2b1a ZS3067, ЖМ: I2a1a2b1a1a1a1 FT37540, МЖМ: G2a2b1a1a1a2b2a FT159945
  • мтДНК: K1b1a1 T199C, МЖ: H13a1a1d
Re: CTS1460
« Ответ #19 : 21 Май 2016, 13:13:11 »
Да есть еще Эжиев. Он тоже из Чечни как и все мои полные совпаденцы. Что для меня естественно сюрприз. Мой предок из Западной Армении (Эрзрум, Турция) так что я не ожидал иметь  родственников из Кавказа. Вот эту загадку я и намерен уяснить для себя в ближайшее время.

Ничего удивительного, как показали ВБОПы, где-то в период свыше 5000 лет назад предки чеченцев J-Z1842 и предки армян J-Z1842 составляли одну популяцию. В одной из тем этого раздела я даже пытался понять, на каком языке они могли разговаривать.

Да вот сейчас пытаюсь определится что дальше. Мне советовали 67 маркеров, но я очень хочу знать свои точные снипы. Снип-пакет J-Z1842 звучит заманчиво. Наверное я это выберу. Интересно когда оно выйдет.

Да, к нам в J-Z1842 лучше заходить с 67 маркёров, тем более, что у Вас скорее всего близких совпаденцев на 37 пока что не намечается. Впрочем, как и у большинства из нас, J-Z1842.

Снип-пакет J-Z1842 уже в стадии завершения: https://docs.google.com/spreadsheets/d/1q8VEffESrdlHGt94TGk2eUgpmJKGvQU52k0LP7sgRQQ/edit#gid=0

Вот снипы, которые он тестирует: https://docs.google.com/spreadsheets/d/1G9AdnmyEMEhbL2I1ckH9NRdnwy95e8Yt9LSya1Q1gvI/edit#gid=0

Можете сверить их со снипами на дереве Виктара Маса: http://genogenea.com/J-M267/tree

Он определит Ваше положение на дереве J-Z1842, но всё равно, снипы моложе 4000-5000 лет не определит. Это пока что порог возрастов найденных субкладов. Как бы то ни было, только Big Y определит максимально возможные для этого теста Ваши снипы. С перспективой появления новых протестированных и дальнейшей проработки Вашей ветки выявлением общих снипов. Поэтому, лучше начать с него, если есть возможность, потому что у нас в J-Z1842 - это конечная цель любого мужчины, увлекающегося ДНК-генеалогией, помимо построения дома, зачатия сына и посадки дерева ;D Субклады пока что ещё доисторические, поэтому всё равно всё упирается в необходимость Бига. А проапгрейдиться до 67 потом уже всегда легче.

Если возможности сразу сделать Big Y нет, имхо, я бы вначале проапгрейдился до 67. Вполне возможно, что это поможет спредиктовать ветвь, а цена вопроса её определения будет 1-2 снипа. Если гаплотип всё-таки окажется удалённым от всех, то тогда конечно, только снип-пакет.

Конечно, YFull при интерпретации Big Y определит массу STRов, которые можно занести в Семаргл. Но Big Y охватывает не все STRы, тестируемые FTDNA. Поэтому для некоторых придётся давать среднее арифметическое, что, как по мне, уже не совсем то пальто...

В среднесрочной перспективе моя цель это иметь свой профиль в Yfull. Я надеюсь если закажу BigY в ФТДНА то перевод файла на Yfull не будет проблематичным?

Без проблем, скинете им ссылку на BAM файл при заказе, всё остальное YFull уже сделают сами.
« Последнее редактирование: 21 Май 2016, 13:24:43 от Yaroslav »

Оффлайн Karen

  • ⚠⚠⚠ Я УШЕЛ С ФОРУМА!!! УВЫ, НЕТ ВОЗМОЖНОСТИ УДАЛИТЬ ПРОФИЛЬ.
  • Сообщений: 381
  • Страна: ru
  • Рейтинг +205/-0
  • Y-ДНК: G-PH488*
Re: CTS1460
« Ответ #20 : 10 Июль 2016, 17:31:56 »
Походу, Hrechdakian появился на дереве YFull

J-Y22035 formed 6300 ybp, TMRCA 3300 ybp

https://www.yfull.com/tree/J-CTS1460/

Оффлайн YaroslavАвтор темы

  • Сообщений: 18704
  • Страна: ru
  • Рейтинг +4679/-14
  • 76% East Europe + 17% Finland
  • Y-ДНК: J1a2b1a ZS3067, ЖМ: I2a1a2b1a1a1a1 FT37540, МЖМ: G2a2b1a1a1a2b2a FT159945
  • мтДНК: K1b1a1 T199C, МЖ: H13a1a1d
Re: CTS1460
« Ответ #21 : 20 Декабрь 2016, 00:22:45 »
Это получается, что CTS1460 самая плодовитая ветка в J1 среди веток-ровесниц?

Да, большинство людей Z1842+ находится на ветке CTS1460. Наверно, где-то между ~7000-5600 л.н. у этого рода произошёл демографический взрыв.

Оффлайн YaroslavАвтор темы

  • Сообщений: 18704
  • Страна: ru
  • Рейтинг +4679/-14
  • 76% East Europe + 17% Finland
  • Y-ДНК: J1a2b1a ZS3067, ЖМ: I2a1a2b1a1a1a1 FT37540, МЖМ: G2a2b1a1a1a2b2a FT159945
  • мтДНК: K1b1a1 T199C, МЖ: H13a1a1d
Re: CTS1460
« Ответ #22 : 20 Декабрь 2016, 00:54:59 »
А в других ветках J1 наблюдается подобное? Имею в виду, что от одного снипа идут нисходящие, превышающие количество - 10.

Бегло просмотрел дерево J1 (может что-то пропустил), в основном везде от корневых ветвей нисходит 2-3 ветки.

Моя ZS3089, если верить разбивке Виктара Маса:

ZS3089 Cluster A
ZS3089 Cluster B
ZS3089 Cluster С
ZS3089 Cluster D
ZS3089 Cluster F
ZS5646

При ближайшем общем предке где-то между ~7300-5000 л.н., почти одинаковым со ВБОПом CTS1460, кстати.

Де факто в YFull пока что три нисходящие ветки от узла ZS3089 (ZS3114):

ZS3114* c хиндустанцем
ZS3114* со мной
B234 со всеми остальными, сделавшими Big Y на сегодняшний день.

Оффлайн YaroslavАвтор темы

  • Сообщений: 18704
  • Страна: ru
  • Рейтинг +4679/-14
  • 76% East Europe + 17% Finland
  • Y-ДНК: J1a2b1a ZS3067, ЖМ: I2a1a2b1a1a1a1 FT37540, МЖМ: G2a2b1a1a1a2b2a FT159945
  • мтДНК: K1b1a1 T199C, МЖ: H13a1a1d
Re: CTS1460
« Ответ #23 : 20 Декабрь 2016, 01:25:17 »
Имею в виду не только в Z1842, а в остальных ветвях J1, есть ли ветка более плодовитее чем CTS1460 с похожим возрастом?  :)

L858, наверно, но она помоложе, ВБОП ~5100-4100 л.н.

https://www.yfull.com/tree/J-Z1884/

Оффлайн YaroslavАвтор темы

  • Сообщений: 18704
  • Страна: ru
  • Рейтинг +4679/-14
  • 76% East Europe + 17% Finland
  • Y-ДНК: J1a2b1a ZS3067, ЖМ: I2a1a2b1a1a1a1 FT37540, МЖМ: G2a2b1a1a1a2b2a FT159945
  • мтДНК: K1b1a1 T199C, МЖ: H13a1a1d
Re: CTS1460
« Ответ #24 : 20 Декабрь 2016, 09:48:13 »
От L858 нисходит только 5 веток, от CTS1460 гораздо больше, также учитывая недавний результат BigY друза, и "ирландский кластер Z18436", – они CTS1460.

Тогда не могу пока сказать, нужно смотреть дерево В. Маса (оно полнее) и таблицу проекта J1. Возможно, что CTS1460 действительно самый плодовитый субклад в данном возрастном диапазоне.

Оффлайн YaroslavАвтор темы

  • Сообщений: 18704
  • Страна: ru
  • Рейтинг +4679/-14
  • 76% East Europe + 17% Finland
  • Y-ДНК: J1a2b1a ZS3067, ЖМ: I2a1a2b1a1a1a1 FT37540, МЖМ: G2a2b1a1a1a2b2a FT159945
  • мтДНК: K1b1a1 T199C, МЖ: H13a1a1d
Re: CTS1460
« Ответ #25 : 21 Декабрь 2016, 17:30:13 »
Ярослав, ты как-то опубликовывал карту распространения CTS1460, что-то не могу ее здесь найти. Не помнишь, какая это была работа?

Если мне мой склероз не изменяет, это была карта частоты J1*, т.е. всех веток P58-

Сейчас не помню, в какой теме её запостил, глянь Figure 1 у Chiaroni et al. 2010: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2987219/

Оффлайн YaroslavАвтор темы

  • Сообщений: 18704
  • Страна: ru
  • Рейтинг +4679/-14
  • 76% East Europe + 17% Finland
  • Y-ДНК: J1a2b1a ZS3067, ЖМ: I2a1a2b1a1a1a1 FT37540, МЖМ: G2a2b1a1a1a2b2a FT159945
  • мтДНК: K1b1a1 T199C, МЖ: H13a1a1d
Re: CTS1460
« Ответ #26 : 22 Декабрь 2016, 00:05:47 »
(c) Interpolated J1* frequency spatial distribution.

Оффлайн YaroslavАвтор темы

  • Сообщений: 18704
  • Страна: ru
  • Рейтинг +4679/-14
  • 76% East Europe + 17% Finland
  • Y-ДНК: J1a2b1a ZS3067, ЖМ: I2a1a2b1a1a1a1 FT37540, МЖМ: G2a2b1a1a1a2b2a FT159945
  • мтДНК: K1b1a1 T199C, МЖ: H13a1a1d
Re: CTS1460
« Ответ #27 : 22 Декабрь 2016, 01:39:03 »
Не понял, почему автор говорит о пике J1* в Заргосе и отмечает на карте Армению?

Карта из статьи контурная, не пойму, там пятно попадает на Загрос, или приходится на район озёр Ван и Урмия?

И вообще, я вот этого никак понять не могу:

Цитировать
Moreover, the previously described J1 (DYS388=13) chromosomes, frequently found in the Caucasus and eastern Anatolian populations, were ancestral to J1e and displayed an expansion time of 9000 years.

Как современные носители J1-Z1842 могут быть предками для современных носителей J1-P58 ???

Оффлайн YaroslavАвтор темы

  • Сообщений: 18704
  • Страна: ru
  • Рейтинг +4679/-14
  • 76% East Europe + 17% Finland
  • Y-ДНК: J1a2b1a ZS3067, ЖМ: I2a1a2b1a1a1a1 FT37540, МЖМ: G2a2b1a1a1a2b2a FT159945
  • мтДНК: K1b1a1 T199C, МЖ: H13a1a1d
Re: CTS1460
« Ответ #28 : 22 Декабрь 2016, 02:13:33 »
То есть северная часть Ирака, западная часть Ирана и восточная Анатолии (далее тянется вверх). Наверное, с этой стороны CTS1460 попала и на Кавказ через Закавказье соотвесенно.

Я вот всё пытаюсь понять, есть ли какие-либо археологические следы такой миграции. Может всё-таки Z1842 и CTS1460 сидели в Закавказье, а их потом оттуда вынесло с экспансией Куро-Аракса?

Вообще, жаль, что авторы помимо частоты не посчитали разнообразия J1*.

Куро-Аракская культура

Оффлайн YaroslavАвтор темы

  • Сообщений: 18704
  • Страна: ru
  • Рейтинг +4679/-14
  • 76% East Europe + 17% Finland
  • Y-ДНК: J1a2b1a ZS3067, ЖМ: I2a1a2b1a1a1a1 FT37540, МЖМ: G2a2b1a1a1a2b2a FT159945
  • мтДНК: K1b1a1 T199C, МЖ: H13a1a1d
Re: CTS1460
« Ответ #29 : 22 Декабрь 2016, 09:12:23 »
Мы ведь не знаем кем были Z1842 и CTS1460. Чтобы делать выводы по следам, для начала нужно узнать чьи они, и кого ищем.  :)  А дДНК по Z1842 пока нет.

Имею в виду, какие миграционные процессы происходили в период неолита и меди в пределах очерченных выше регионов: Тавр, Загрос, Армянское нагорье, Закавказье. Зафиксированы ли миграции из тех мест в Закавказье? В ранней бронзе (Куро-Аракс) движ идёт из Закавказья.

В Закавказье, вероятно, сидели R1b, — предки большинства армян.

Ну, они же там не в гордом одиночестве сидели :)

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.