АвторТема: Как понять: кто откуда?  (Прочитано 14330 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн Sergey Lutak

  • Сообщений: 1024
  • Страна: 00
  • Рейтинг +62/-0
  • Carpatho-Rusyn-E1b1b1a1b1a and East.Galindian-H1b*
  • Y-ДНК: E1b1b1a1b1a10 (L142.1+, L539+, L542+, L544+, L618+, L930+, M78+, V13+, V36+, FGC11451+, CTS1489-, L17-, L99-, L143-, L241-, L250-, L540-, P65-, V12-, V22-, V27-, FGC11450-)
  • мтДНК: H1b* (16189C, 16356C, 16519C, 263G, 315.1C)
Re: Как понять: кто откуда?
« Ответ #15 : 31 Май 2009, 23:18:57 »
Доброго всем вечера!
Я наконец-то (спустя год) решился проверить свою прямую женскую линию и пять дней назад заказал в FTDNА mtDNА tеst. Заказал пока только HVR1. Обещают результат в начале июля.
А на днях заглянул на свою страницу и увидел, что FTDNА предоставляет скидку до 5 июня на апгрейд НVR2.
Я плохо себе представляю что это такое и чем это поможет.
Это как в Y-маркерах: чем больше, тем точнее результат?
Знатоки, посоветуйте, надо ли делать это НVR2 и что это даст мне нового и полезного?

Оффлайн Mich Glitch

  • Genus regis
  • Сообщений: 35399
  • Страна: ca
  • Рейтинг +3129/-48
  • Y-ДНК: J2b1
  • мтДНК: H6a1a5a
Re: Как понять: кто откуда?
« Ответ #16 : 31 Май 2009, 23:28:58 »
Знатоки, посоветуйте, надо ли делать это НVR2 и что это даст мне нового и полезного?
Только НVR1 - это ужасно далеко (в смысле точность мала).
Ведь даже полное совпадение по НVR1+НVR2 означает (без учета географического фактора) общего предка где-то 550-600 лет тому назад.
А иногда выплывают разные интересности.
Так у меня Valery и Centurion достаточно точно определели мою гаплогруппу. Снипование, а затем полный сиквенс позволили уточнить субклад - Н6а1а (по самой последней номенклатуре).
По относительно старой работе Н6а1 - преимущественный субклад для мордвы. 11%. О том, речь идёт о мокше или эрзе не уточнялось.
Но учитывая, что линия ползёт из Эрзяни-Рязани, предполагаю пока, что эрзя.
Когда протестирую своих рязанских мужичков, скажу ещё точнее.

Так что, больше тестов! Хороших и разных.
Делайте НVR1 и НVR2!

Оффлайн Sergey Lutak

  • Сообщений: 1024
  • Страна: 00
  • Рейтинг +62/-0
  • Carpatho-Rusyn-E1b1b1a1b1a and East.Galindian-H1b*
  • Y-ДНК: E1b1b1a1b1a10 (L142.1+, L539+, L542+, L544+, L618+, L930+, M78+, V13+, V36+, FGC11451+, CTS1489-, L17-, L99-, L143-, L241-, L250-, L540-, P65-, V12-, V22-, V27-, FGC11450-)
  • мтДНК: H1b* (16189C, 16356C, 16519C, 263G, 315.1C)
Re: Как понять: кто откуда?
« Ответ #17 : 01 Июнь 2009, 00:32:45 »
Спасибо, Мich Glitch!
Завтра закажу НVR2.
Если я правильно понял, HVR1+HVR2 - это СНиПы. А маркеры, как в Y-DNА, в mtDNА есть?

Оффлайн Centurion

  • 100% Earth (Solar System) genofond
  • Администратор
  • *****
  • Сообщений: 10074
  • Страна: ru
  • Рейтинг +567/-2
Re: Как понять: кто откуда?
« Ответ #18 : 01 Июнь 2009, 00:36:51 »
Спасибо, Мich Glitch!
Завтра закажу НVR2.
Если я правильно понял, HVR1+HVR2 - это СНиПы. А маркеры, как в Y-DNА, в mtDNА есть?
Нет, снипы в кодирующей области (CR-анг), а в ГВС1-2 просто код ДНК (регионы). Там нет "маркеров".

Оффлайн Mich Glitch

  • Genus regis
  • Сообщений: 35399
  • Страна: ca
  • Рейтинг +3129/-48
  • Y-ДНК: J2b1
  • мтДНК: H6a1a5a
Re: Как понять: кто откуда?
« Ответ #19 : 01 Июнь 2009, 00:49:04 »
Спасибо, Мich Glitch!
Завтра закажу НVR2.
Если я правильно понял, HVR1+HVR2 - это СНиПы. А маркеры, как в Y-DNА, в mtDNА есть?
Нет, снипы в кодирующей области (CRS-анг), а в ГВС1-2 просто код ДНК (регионы). Там нет "маркеров".
Строго говоря, в мито всё можно обозвать снипами. HVR1, HVR2, CR всё это SNPы, а не STRы. Скажем, либо А, либо Т. То есть не повторы.
Только в HVR1 и HVR2 скорости мутации относительно быстрые, а в Coding Region - медленные.

Диаграммы строятся обычным порядком. Да только без укоренения. Хотя можно и поизгаляться. Valery  в этой теме главный спец.

Оффлайн Sergey Lutak

  • Сообщений: 1024
  • Страна: 00
  • Рейтинг +62/-0
  • Carpatho-Rusyn-E1b1b1a1b1a and East.Galindian-H1b*
  • Y-ДНК: E1b1b1a1b1a10 (L142.1+, L539+, L542+, L544+, L618+, L930+, M78+, V13+, V36+, FGC11451+, CTS1489-, L17-, L99-, L143-, L241-, L250-, L540-, P65-, V12-, V22-, V27-, FGC11450-)
  • мтДНК: H1b* (16189C, 16356C, 16519C, 263G, 315.1C)
Re: Как понять: кто откуда?
« Ответ #20 : 01 Июнь 2009, 01:41:38 »
Спасибо вам, Cеnturion и Mich Glitch. Значит митодеревья строятся по СНиПам? Тогда, они более точны на уровне больших ветвей, но менее точны, если необходимо определить точное расстояние между двумя конкретными персонами?

Оффлайн Mich Glitch

  • Genus regis
  • Сообщений: 35399
  • Страна: ca
  • Рейтинг +3129/-48
  • Y-ДНК: J2b1
  • мтДНК: H6a1a5a
Re: Как понять: кто откуда?
« Ответ #21 : 01 Июнь 2009, 01:57:37 »
Спасибо вам, Cеnturion и Mich Glitch. Значит митодеревья строятся по СНиПам? Тогда, они более точны на уровне больших ветвей, но менее точны, если необходимо определить точное расстояние между двумя конкретными персонами?
В чём основная закавыка?
Имеем всего четыре возможных значения (ну, можно сказать, что иногда 5).
Далее медленная скорость мутаций.
Самое противное - большое количество рассматриваемых маркеров. Употребляю маркер, потому как какая разница какой маркер, если используется скорость его мутаций и общая методика построений?
То есть представьте, что Вы строите филогенетическое деревце по выборке 16000-маркерных гаплотипов.  :o
На самом деле, конечно, не всё так мрачно.
С помощью фила можно построить кладограмму.
А можно даже просто перечесть все имеющиеся в выборке значения, отличные от кебриджской последовательности. И если речь будет идти о согаплогруппниках, то у Вас получится где-то с пяток десятков "маркеров" (помещу всё-таки в кавычки  ;) ) на выборку не больше сотни сэмплов. Можно будет потом даже что-то с укоренением сварганить.
Последнее, что я делал, перед тем как сильно охладеть к мито  :o , строил кладограммы и просчитывал попарно на TMRCA калькуляторе времена до ближайшего окружения.
Так как интересующий меня временной интервал уходит самое большее на 1000 лет вглубь, то мито теперь использую только в качестве вспомогательного инструмента.
Но любящим историю и знающим в ней толк - наверняка будет интересно.

Оффлайн kirill

  • Сообщений: 37
  • Рейтинг +2/-0
  • Y-ДНК: E1b1b1a1
  • мтДНК: J1c2
Как искать совпадения по мт-ДНК?
« Ответ #22 : 31 Август 2009, 02:46:06 »
     Приветствую всех, кто на форуме. Вот сейчас, наряду с Y-, попытался разобраться со своими мт-результатами. По данным HVR1+HVR2 нашел несколько похожих пользователей. Мою гаплогруппу они определили как J*. При этом почему-то указывают и тех, кто относится к J1c. Но тогда почему не только их? И почему они меня не определили точно как J1c, если действительно эти пользователи оказываются мне ближе всего по указанным цифрам (я сам сравнивал). Пока не знаю, насколько эти данные информативны. Ведь они везде в конце предлагают сделать полный сиквенс. К сожалению, весьма недешевый - $400! Наверное, я бы смог это сделать. Но много ли это даст? Они что, без этого субклад определить не могут? Может быть, это было бы для меня весьма интересно в том случае, если обнаружится близкое родство. Дело в том, что в отличие от отцовских свои материнские корни я знаю точно. Моя прапрабабушка была англичанка. А они - народ консервативный и свои корни как правило знают хорошо. Именно этим регионом я и ограничиваю свой поиск. Но напишу только туда, где будет достаточно оснований. Кстати, я попытался аналогично Y- внести свои данные в мт-Search. Но там таблица составлена так, что я просто не понял, как ее заполнять. Ну - G,T,С - это понятно. А что значит рубрика "Мутация"?

Оффлайн Sergey Lutak

  • Сообщений: 1024
  • Страна: 00
  • Рейтинг +62/-0
  • Carpatho-Rusyn-E1b1b1a1b1a and East.Galindian-H1b*
  • Y-ДНК: E1b1b1a1b1a10 (L142.1+, L539+, L542+, L544+, L618+, L930+, M78+, V13+, V36+, FGC11451+, CTS1489-, L17-, L99-, L143-, L241-, L250-, L540-, P65-, V12-, V22-, V27-, FGC11450-)
  • мтДНК: H1b* (16189C, 16356C, 16519C, 263G, 315.1C)
Re: Как понять: кто откуда?
« Ответ #23 : 31 Август 2009, 20:52:44 »
Добрый вечер, Кирилл!
В Mitosearch на своей странице в разделы HVR1 Mutations и HVR2 Mutations Вы вносите значение мутаций ваших митомаркеров из FTDNA-шных данных.

Например.
Допустим, что у вас: 16362C
Этот маркер из участка HVR1.

Вы выбираете на странице Mitosearch раздел HVR1 Mutations. Там приведены только первые две цыфры вашего маркера: 16...
Остальные три вы вносите сами, получается: 16 362
И напротив этой цыфры выбираете ту мутацию, которая у Вас. Допустим, C.
Только вносить надо именно точно  так как вам записали в FTDNA: с точкой, без точки перед буквой и т.д.
Это важно!

Оффлайн kirill

  • Сообщений: 37
  • Рейтинг +2/-0
  • Y-ДНК: E1b1b1a1
  • мтДНК: J1c2
Re: Как понять: кто откуда?
« Ответ #24 : 27 Сентябрь 2009, 01:15:48 »
     Сергей, спасибо за ответ. Я просто сначала несколько растерялся, так как не понял, что цифры с точкой и без находятся в разных ячейках. Сделал это я уже давно, но есть ли какой-то результат, пока не знаю. Пока мне все время регулярно присылают какие-то однотипные послания насчет совпадений. Почему-то чаще всего - с низким разрешением. Какой в этом смысл, если я уже сделал высокое - на hvr1 и hvr2? Я еще раньше заглядывал на страницу совпадений. Там много
народу, но непонятно, какая степень "родства". Что такое +1 или -1? Что даст предлагаемый ими полный сиквенс? И вообще, жаль, что мне до сих пор никто не ответил из тех, кто разбирается в этой теме.

Оффлайн Centurion

  • 100% Earth (Solar System) genofond
  • Администратор
  • *****
  • Сообщений: 10074
  • Страна: ru
  • Рейтинг +567/-2
Re: Как понять: кто откуда?
« Ответ #25 : 27 Сентябрь 2009, 11:55:44 »
Цитировать
И вообще, жаль, что мне до сих пор никто не ответил из тех, кто разбирается в этой теме.
Что-то не нашел в этом топике вопросов от вас.

Опубликуйте, сначало свои данные по митоДНК, что был предмет обсуждения.

Оффлайн Sergey Lutak

  • Сообщений: 1024
  • Страна: 00
  • Рейтинг +62/-0
  • Carpatho-Rusyn-E1b1b1a1b1a and East.Galindian-H1b*
  • Y-ДНК: E1b1b1a1b1a10 (L142.1+, L539+, L542+, L544+, L618+, L930+, M78+, V13+, V36+, FGC11451+, CTS1489-, L17-, L99-, L143-, L241-, L250-, L540-, P65-, V12-, V22-, V27-, FGC11450-)
  • мтДНК: H1b* (16189C, 16356C, 16519C, 263G, 315.1C)
Re: Как понять: кто откуда?
« Ответ #26 : 27 Сентябрь 2009, 14:14:40 »
[Отправлено: Сегодня в 11:55:44
Автор: Centurion
Цитата: Что-то не нашел в этом топике вопросов от вас.
...]

Позволю себе ответить за Кирилла.
Роман, kirill задавал некоторые вопросы по "мито" в этой теме, но проблема в другом, у него просто нет азов знаний по самим принципам мито-ДНК исследований. Думаю Кирилл не обидится на меня за такую фразу, ведь все мы когда-то не знали азов.

Кирилл, у вас есть номер моего мобильного телефона, пожалуйста, можете звонить, чем могу помогу. Чего не знаю, подскажу, к кому обратиться за советом.

В личном общении иногда бывает проще объяснить и понять.
Кирилл, можете звонить сегодня. 


Оффлайн kirill

  • Сообщений: 37
  • Рейтинг +2/-0
  • Y-ДНК: E1b1b1a1
  • мтДНК: J1c2
Re: Как понять: кто откуда?
« Ответ #27 : 28 Сентябрь 2009, 01:02:16 »
     Сергей, спасибо за ответ. Только сейчас прочел оба письма. Вы оба правы и я нисколько не обижаюсь. Я действительно здесь многого не знаю. Насчет Y-ДНК я сначала хотя бы читал статьи на сайте, а потом уже заказал тест. Здесь тоже есть кое-что, если поискать, но из-за занятости руки не доходят. Вообще явно в этой теме материала меньше.  А моих вопросов не видел он потому, что я долго  ничего здесь не писал. Я все свои вопросы задал в предыдущем письме. И рассчитывал, что ответит тот, кто зайдет на эту страницу, если ему близка эта тема. Но потом с удивлением  увидел, что долгое время на этой странице вообще никаких новых комментариев не появляется. Вот тогда я решил написать то же самое вторично. Насчет мобильника - спасибо. Обязательно позвоню. Просто получается так, что когда я подхожу к компьютеру, на улице уже такая глубокая ночь, что не до звонков.

Оффлайн Sergey Lutak

  • Сообщений: 1024
  • Страна: 00
  • Рейтинг +62/-0
  • Carpatho-Rusyn-E1b1b1a1b1a and East.Galindian-H1b*
  • Y-ДНК: E1b1b1a1b1a10 (L142.1+, L539+, L542+, L544+, L618+, L930+, M78+, V13+, V36+, FGC11451+, CTS1489-, L17-, L99-, L143-, L241-, L250-, L540-, P65-, V12-, V22-, V27-, FGC11450-)
  • мтДНК: H1b* (16189C, 16356C, 16519C, 263G, 315.1C)
Re: Как понять: кто откуда?
« Ответ #28 : 28 Сентябрь 2009, 01:54:53 »
Кирилл, зачем звонить сидя перед компьютером? Звоните днём, когда есть время!

А лучше встретиться и пообщаться, что мы периодически и делаем с Wertner'ом и Farroukh'ом.
 
А ещё лучше встретиться в расширенном формате - всем форумчанам, проживающим в Москве и её окрестностях!

Оффлайн kirill

  • Сообщений: 37
  • Рейтинг +2/-0
  • Y-ДНК: E1b1b1a1
  • мтДНК: J1c2
Re: Как понять: кто откуда?
« Ответ #29 : 29 Сентябрь 2009, 00:40:58 »
     Встречу в любом формате приветствую. Надо будет только договориться о времени. Обычно я все время на работе. И занят там так, что даже по телефону поговорить некогда. Дома бываю только до 10.30 или после 22.30. А также в выходные, если не приходится выходить на работу. Мой дом. тел. 499-1281230. Не помню, давал я вам его или нет. Звонить можно в любое время - сколь угодно поздно. А вот сегодня я гриппую и сижу дома. Даже на работу не пошел.   

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.


Rambler's Top100