АвторТема: Гаплогруппы по переносимости лактозы  (Прочитано 6739 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн ШадАвтор темы

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6257
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1134/-4
  • Ex oriente lux
  • Y-ДНК: Q-Y2750
  • мтДНК: J1c2z
Оказывается по устойчивым аллельным значениям снипов, связанных с переносимостью лактозы, можно выделить 6 гаплогрупп.
Цитировать
Today, I want to present 6 haplotypes (ht1-6) I could discover in the Kurdish gene pool.

ht3 represents the "European" haplotype which correlates with lactose tolerance. Individuals with "CT" or "TT" at rs4988235 (also called C/T-13910) are genetically lactose tolerant; at 23andme it is "AG" or "AA" (because MCM6 gene is in minus orientation but 23andme does not address it).
Interestingly, 13910T (rs4988235: "A" at 23andme) and 22018A (rs182549: "T" at 23andme) are strongly linked with one another, at least for ht3, the "European" haplotype. However, this is not always the case. There is some literature about 22018A, see here, here, here, and here.
ht3 itself is derived from ht2, which only carries the 22018A mutation. ht2 is fairly rare and does not provide lactase persistence which explains why 22018A is strongly, but not completely related to lactase persistence.
The origin of the "European" lactose persistence 13910T (rs4988235: "A" at 23andme) can be found in populations where the frequency of 22018A (ht2 + ht3) is higher than 13910T (ht3). 

SNP ht1 ht2 ht3 ht4 ht5 ht6 ht7
rs4988283 C C C C C C C
rs4988262 C C C C C C T
rs2082730 T T T T T T T
rs4988243 T T T T C T T
rs4954492 A A A A A A A
rs41525747 G G G G G G G
rs4988236 G G G G G G G
rs4988235 G G A G G G G
rs41380347 A A A A A A A
rs4988234 C C C C C C C
rs4988233 G G G G G G G
rs2304369 G G G G G G G
rs4988232 G G G G G G G
rs4988226 G G G A A A A
rs309180 A A A G G G G
rs309181 G G G C C C C
rs3213871 C C C T T C C
rs4988203 C C C C C C T
rs182549 C T T C C C C
rs4988199 A A A A A A A
rs4988189 T T T T T T T
rs4988186 G G G G G G G
rs309176 C C C T T T T
rs3087343 T T T T T G T
rs4988177 T T T T T T T
rs3087353 C C C C C C T
rs2289049 G G G G G G A
rs2070068 G G G G G G A
rs1435577 C C C C C G C
rs3769001 A A A A A G A
rs1057031 G G G G G A A


http://kurdishdna.blogspot.ru/2015/02/lactose-intolerance-six-mcm6-variants.html
http://kurdishdna.blogspot.de/2012/06/lactose-tolerance.html

Оффлайн Елена Александровна

  • Сообщений: 2719
  • Страна: by
  • Рейтинг +613/-2
  • U5a1d2a1 Гедматч - M125805
  • Y-ДНК: R1a1a: отец 248308, сын 260304, дед по маме 249367
  • мтДНК: U5a1d2a1 - я; МЖМЖ U5
Re: Гаплогруппы по переносимости лактозы
« Ответ #1 : 26 Февраль 2015, 00:27:24 »
мне эту непероносимоть с возрастом 23andMe напророчил, когда я уже давно молоко не пью...Не могу с лет 36-ти где-то

Оффлайн ШадАвтор темы

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6257
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1134/-4
  • Ex oriente lux
  • Y-ДНК: Q-Y2750
  • мтДНК: J1c2z
Re: Гаплогруппы по переносимости лактозы
« Ответ #2 : 12 Март 2016, 16:44:47 »
Вообще странная это непереносимость.
У меня у всей семьи (кроме тещи) - GG (rs4988235), а никаких проблем с молочными продуктами нет...

Перепроверил по Nature - действительно снип тот.

Цитировать
and the lactase persistence gene in Europeans associated with the T allele at SNP rs4988235

Разводившие коров доисторические европейцы страдали от непереносимости молока.

Древние обитатели Европы страдали от непереносимости лактозы (важного компонента молочных продуктов) спустя 5 тысяч лет после появления сельского хозяйства и даже спустя 4 тысячи лет после первых опытов сыроварения на континенте. О том, как здоровье не поспевало за технологическим развитием, рассказали генетики, авторы статьи в журнале Nature Communications.

Ученые извлекли ДНК из каменистой части височных костей 13 индивидов, чьи останки были обнаружены в одном регионе — в Альфельде, самой большой части Среднедунайской равнины. Это был важный перекресток миграционных путей на протяжении всей древней истории Европы. Скелеты принадлежали разным периодам: от раннего неолита (5700 лет до нашей эры) до железного века (800 лет до нашей эры).

После нескольких лет экспериментов ученые остановили свой выбор на пирамидах височных костей. Прочность тканей этой кости, расположение в глубине черепа делает ее лучшим источником ДНК. Если ископаемые зубы и ребра дают от 0 до 20 процентов ДНК, то каменистая часть височной кости — до 90 процентов.

Выяснилось, что по мере проникновения в регион земледельцев с Ближнего Востока, которые смешивались с местными охотниками-собирателями, цвет кожи местных жителей становился все светлее (о том, что пигментация кожи населения Восточной Европы 5 тысяч лет назад была достаточно темная, уже известно). Однако генетические маркеры непереносимости лактозы никуда не девались. Иными словами, древние европейцы могли уже много столетий разводить коров, овец и коз, оставаясь генетически неприспособленными к потреблению молока животных (в больших количествах).

http://lenta.ru/news/2014/10/21/hypolactasia/
http://www.nature.com/ncomms/2014/141021/ncomms6257/full/ncomms6257.html
http://forum.molgen.org/index.php/topic,7459.msg261256.html#msg261256

Остается понять - что значит "в больших количествах"? Сколько нужно выпить, чтобы почувствовать нетолерантность? :)

Онлайн Eugene

  • Санктпетербурхъ
  • Сообщений: 6447
  • Страна: ru
  • Рейтинг +839/-40
    • N1c1 Y-DNA Project
  • Y-ДНК: N-BY32524
  • мтДНК: U-C1341T
Re: Гаплогруппы по переносимости лактозы
« Ответ #3 : 12 Март 2016, 17:03:20 »
Остается понять - что значит "в больших количествах"? Сколько нужно выпить, чтобы почувствовать нетолерантность? :)
Да, меня тоже этот вопрос интересовал.
У кого вырабатывается лактаза - по идее в неограниченном количестве должен иметь возможность употреблять молоко.
У кого её нет - то нет. Видимо пограничного состояния не существует.
Опять же за счет облигатной микрофлоры возможно определенное количество молока будет переваривать даже у тех, у кого самим организмом фермент лактаза не вырабатывается. А микрофлора у всех разная.

Оффлайн пенелопа

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 5706
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1844/-12
  • мтДНК: H1b
Re: Гаплогруппы по переносимости лактозы
« Ответ #4 : 12 Март 2016, 17:29:35 »
Шад, плохеет и мне, и брату с одного стакана молока ::)

Оффлайн ШадАвтор темы

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6257
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1134/-4
  • Ex oriente lux
  • Y-ДНК: Q-Y2750
  • мтДНК: J1c2z
Re: Гаплогруппы по переносимости лактозы
« Ответ #5 : 12 Март 2016, 17:42:01 »
Шад, плохеет и мне, и брату с одного стакана молока ::)

rs4988235 GG?

Оффлайн пенелопа

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 5706
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1844/-12
  • мтДНК: H1b
Re: Гаплогруппы по переносимости лактозы
« Ответ #6 : 12 Март 2016, 17:59:29 »
Шад, плохеет и мне, и брату с одного стакана молока ::)

rs4988235 GG?
не тестировались. Просто плохеет :)

Оффлайн Ginseng

  • Сообщений: 7
  • Рейтинг +4/-0
Re: Гаплогруппы по переносимости лактозы
« Ответ #7 : 12 Март 2016, 23:58:02 »
Просто плохеет :)
А в чем выражается - аф.шок ?

Оффлайн пенелопа

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 5706
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1844/-12
  • мтДНК: H1b
Re: Гаплогруппы по переносимости лактозы
« Ответ #8 : 13 Март 2016, 06:11:43 »
Просто плохеет :)
А в чем выражается - аф.шок ?
В срочной необходимости посетить клозет :D Это и у всех так.

Оффлайн andronn

  • Сообщений: 424
  • Страна: ua
  • Рейтинг +102/-0
  • 100% European.E.Europe 83%, Finland 14%,S.Europe3%
  • Y-ДНК: R-Z283
Re: Гаплогруппы по переносимости лактозы
« Ответ #9 : 13 Март 2016, 10:35:58 »
Цитировать
В срочной необходимости посетить клозет  Это и у всех так.
Ну прямо в точку ;D. У меня правда все это, как то с годами.До армии и в армии, да до лет 30-ти, переносил нормально.когда бывал в деревне, пил молоко, вот только что надоенное, потом как то все хуже и хуже, сейчас только могу городское пастеризованное молоко.Последний раз когда выпил парное, с желудком творилось страшное.

Оффлайн Don

  • Сообщений: 512
  • Страна: aq
  • Рейтинг +51/-0
Re: Гаплогруппы по переносимости лактозы
« Ответ #10 : 13 Март 2016, 11:16:49 »
У меня Gs101- 77% переносимость лактозы, то бишь - rs182549(Т,С) за переносимость лактозы и rs4988235(G,G) - против.
Раньше: "Лакал молоко густое. Любил простое пустое." Сейчас, увы, молоко не идёт.
У чада Gs100- 77% непереносимость лактозы, rs182549(G,G) - против переносимости лактозы и rs4988235(C,C) - против.
Внук вообще козлёночек. Покупаю ему на рынке козье молоко. Впрочем у него в роду есть азиаты с непереносимостью лактозы.

Оффлайн ШадАвтор темы

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6257
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1134/-4
  • Ex oriente lux
  • Y-ДНК: Q-Y2750
  • мтДНК: J1c2z
Re: Гаплогруппы по переносимости лактозы
« Ответ #11 : 13 Март 2016, 13:50:22 »
rs182549 у всей семьи в значении CC - видимо это и позволяет потреблять молоко без особых проблем

Оффлайн mouglley

  • ...
  • Сообщений: 7904
  • Страна: hr
  • Рейтинг +433/-7
  • Я знаю, что познаю всё.
    • Записки Маугли
  • Y-ДНК: N1c1-L1025
  • мтДНК: J1c3
Re: Гаплогруппы по переносимости лактозы
« Ответ #12 : 13 Март 2016, 15:40:17 »
Остается понять - что значит "в больших количествах"? Сколько нужно выпить, чтобы почувствовать нетолерантность? :)
the lactase persistence означает на английском совсем не то, что на совецкий перевели как "непереносимость лактозы". За чуство отвращения отвечает, похоже, иной снип.

К примеру, у меня lactase persistence абсолютно отрицательна, то есть, мой организм с подросткового возраста не способен переваривать лактозу из сырого молока.
Однако, с того же самого подосткового возраста, ненавидя парное молоко, я, с большим удовольствием, пью холодное молоко и способен выпить его литрами.

Непереносимость же возникает (со всеми последствиями), исключительно, в случаях, когда я запиваю молоко пивом или закусываю жирной сеелёдкой.

Оффлайн Елена Александровна

  • Сообщений: 2719
  • Страна: by
  • Рейтинг +613/-2
  • U5a1d2a1 Гедматч - M125805
  • Y-ДНК: R1a1a: отец 248308, сын 260304, дед по маме 249367
  • мтДНК: U5a1d2a1 - я; МЖМЖ U5
Re: Гаплогруппы по переносимости лактозы
« Ответ #13 : 13 Март 2016, 16:21:18 »
в 23andMe у меня писали непереносимость с возрастом.
Похоже гены и сыновьям эти передала.
Один - любитель молока, уже к 30-ку приближается.
Говорит:"нет бы что хорошее передала" :(

Оффлайн пенелопа

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 5706
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1844/-12
  • мтДНК: H1b
Re: Гаплогруппы по переносимости лактозы
« Ответ #14 : 29 Март 2017, 08:47:26 »
Очередная новость от Генотек. Цифра непереносимости впечатляет... https://russian.rt.com/russia/article/373150-neperenosimost-moloko-alkogol-glyuten-rossiyane

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.


Rambler's Top100