Разбор результатов мтДНК

[claw]

Приветствую участников форума!
Мне довелось заказать анализ мтДНК (HRV1 + HRV2) в FTDNA. Определили гаплогруппу как T2. Я воспользовался поиском совпаденцев на сайте FTDNA. При поиске по совпадению HRV1 и HRV2 сайт выдает людей с гаплогруппой мтДНК T2b19. Значит ли это, что при апгрейде моего анализа мтДНК до FMS  я получу гаплогруппу T2b19? Или же FMS позволит обнаружить еще какие то другие мутации и моя итоговая гаплогруппа окажется не T2b19? Вообще есть ли смысл делать FMS если совпаденцев по HRV1 и HRV2 меньше 50?
Заранее благодарю за исчерпывающие ответы!

[Farroukh]

При поиске по совпадению HRV1 и HRV2 сайт выдает людей с гаплогруппой мтДНК T2b19. Значит ли это, что при апгрейде моего анализа мтДНК до FMS  я получу гаплогруппу T2b19?

Да. Мито-гаплогруппа определяется по HVR1 и HVR2.

[FELIX]

Если вести поиск по мито, апгрейд нужен (хотя и дороговато).
В результате будут выделены те из субклада, кто наиболее близок или (в идеале) совпадает. А это уже означает предков в более-менее исторические времена, будет, как минимум, общая информация на несколько сот или тысяч лет (территориальная, этническая), что уже не плохо.
Для прикладной генеалогии и относительно малом количестве протестированных КПД невысокое, но... задел на будущее.

[ankr21]

А по мито есть что нибудь наподобие YFull?

[Mich Glitch]

А по мито есть что нибудь наподобие YFull?

А чего там насчитаешь?   
Ведь даже совпадение по полному митосиквенску (FMS), по версии ФТДНА, означает средний ВБОП в 550 лет.     
Признанный специалист по мито Valery, считает, что ещё дальше.

[Semargl]

А по мито есть что нибудь наподобие YFull?

Сообщество и поиск совпаденцев:
http://www.mtdnacommunity.org/
Определитель субклада
http://dna.jameslick.com/mthap/
Ну а дальше смотрим за обновлениями дерева тут:
http://phylotree.org/tree/main.htm

[Mich Glitch]

Не думаю, чтобы ankr21 не знал, где живут митодеревья.   
Показалось, что вопрос именно о датировках.

[df27]

А по мито есть что нибудь наподобие YFull?

Сообщество и поиск совпаденцев:
http://www.mtdnacommunity.org/
Определитель субклада
http://dna.jameslick.com/mthap/
Ну а дальше смотрим за обновлениями дерева тут:
http://phylotree.org/tree/main.htm

mthap version 0.19a (2013-04-08); haplogroup data version PhyloTree Build 16 (2014-02-19)
raw data source MT_YF02191.fasta (16KB)

FASTA format was uploaded. Based on the markers found, assuming the following regions were completely sequenced: HVR1 (16001~16569) HVR2 (1~574) CR (575~16000).

Found 16569 markers at 16569 positions covering 100.0% of mtDNA.

Markers found (shown as differences to rCRS):

HVR2: 73G 146C 153G 263G
CR: 750G 1438G 2706G 4505T 4769G 5302C 6221C 6371T 7028T 8860G 11719A 12063T 12705T 13966G 14470C 14587G 14766T 15106A 15326G 15654C
HVR1: 16104T 16223T 16319A (16519C)

Best mtDNA Haplogroup Matches:

1) X1

Defining Markers for haplogroup X1:
HVR2: 73G 146C 153G 263G
CR: 750G 1438G 2706G 4769G 5302C 6221C 6371T 7028T 8860G 11719A 12705T 13966G 14470C 14587G 14766T 15326G 15654C
HVR1: (16104T) 16189C 16223T

Marker path from rCRS to haplogroup X1 (plus extra markers):
H2a2a1(rCRS) ⇨ 263G ⇨ H2a2a ⇨ 8860G 15326G ⇨ H2a2 ⇨ 750G ⇨ H2a ⇨ 4769G ⇨ H2 ⇨ 1438G ⇨ H ⇨ 2706G 7028T ⇨ HV ⇨ 14766T ⇨ R0 ⇨ 73G 11719A ⇨ R ⇨ 12705T 16223T ⇨ N ⇨ 6221C 6371T 13966G 14470C 16189C 16278T ⇨ X ⇨ 153G ⇨ X1'2'3 ⇨ 146C ⇨ X1'3 ⇨ 5302C 14587G 15654C (16104T) 16278C ⇨ X1 ⇨ 4505T 12063T 15106A 16319A (16519C)

Imperfect Match. Your results contained differences with this haplogroup:
Matches(24): 73G 146C 153G 263G 750G 1438G 2706G 4769G 5302C 6221C 6371T 7028T 8860G 11719A 12705T 13966G 14470C 14587G 14766T 15326G 15654C (16104T) 16223T 16278C
Extras(4): 4505T 12063T 15106A 16319A (16519C)
No-Calls(1): 16189C

2) X1c

Defining Markers for haplogroup X1c:
HVR2: 73G 146C 153G 263G
CR: 750G 1438G 2706G 4769G 5302C 6221C 6371T 7028T 7337A 8860G 9615C 11719A 12705T 13966G 14470C 14587G 14766T 15326G 15654C
HVR1: (16104T) 16189C 16223T

Marker path from rCRS to haplogroup X1c (plus extra markers):
H2a2a1(rCRS) ⇨ 263G ⇨ H2a2a ⇨ 8860G 15326G ⇨ H2a2 ⇨ 750G ⇨ H2a ⇨ 4769G ⇨ H2 ⇨ 1438G ⇨ H ⇨ 2706G 7028T ⇨ HV ⇨ 14766T ⇨ R0 ⇨ 73G 11719A ⇨ R ⇨ 12705T 16223T ⇨ N ⇨ 6221C 6371T 13966G 14470C 16189C 16278T ⇨ X ⇨ 153G ⇨ X1'2'3 ⇨ 146C ⇨ X1'3 ⇨ 5302C 14587G 15654C (16104T) 16278C ⇨ X1 ⇨ 7337A 9615C ⇨ X1c ⇨ 4505T 12063T 15106A 16319A (16519C)

Imperfect Match. Your results contained differences with this haplogroup:
Matches(24): 73G 146C 153G 263G 750G 1438G 2706G 4769G 5302C 6221C 6371T 7028T 8860G 11719A 12705T 13966G 14470C 14587G 14766T 15326G 15654C (16104T) 16223T 16278C
Mismatches(2): 7337G 9615T
Extras(4): 4505T 12063T 15106A 16319A (16519C)
No-Calls(1): 16189C

3) X1a

Defining Markers for haplogroup X1a:
HVR2: 73G 146C 153G 263G
CR: 750G 1438G 2706G 4769G 5302C 6221C 6359G 6371T 7028T 7533T 8140T 8860G 11719A 12705T 13966G 14470C 14587G 14766T 15326G 15654C
HVR1: (16104T) 16189C 16223T

Marker path from rCRS to haplogroup X1a (plus extra markers):
H2a2a1(rCRS) ⇨ 263G ⇨ H2a2a ⇨ 8860G 15326G ⇨ H2a2 ⇨ 750G ⇨ H2a ⇨ 4769G ⇨ H2 ⇨ 1438G ⇨ H ⇨ 2706G 7028T ⇨ HV ⇨ 14766T ⇨ R0 ⇨ 73G 11719A ⇨ R ⇨ 12705T 16223T ⇨ N ⇨ 6221C 6371T 13966G 14470C 16189C 16278T ⇨ X ⇨ 153G ⇨ X1'2'3 ⇨ 146C ⇨ X1'3 ⇨ 5302C 14587G 15654C (16104T) 16278C ⇨ X1 ⇨ 6359G 7533T 8140T ⇨ X1a ⇨ 4505T 12063T 15106A 16319A (16519C)

Imperfect Match. Your results contained differences with this haplogroup:
Matches(24): 73G 146C 153G 263G 750G 1438G 2706G 4769G 5302C 6221C 6371T 7028T 8860G 11719A 12705T 13966G 14470C 14587G 14766T 15326G 15654C (16104T) 16223T 16278C
Mismatches(3): 6359A 7533C 8140C
Extras(4): 4505T 12063T 15106A 16319A (16519C)
No-Calls(1): 16189C
уважаемый Семаргл прокомментируйте пожалуйста мои данные у меня X1, X1c или X1a ?

[ankr21]

Не думаю, чтобы ankr21 не знал, где живут митодеревья.   
Показалось, что вопрос именно о датировках.

Да, конечно. дерево с указанием возрастов хотелось бы. Понимаю что мутации по мито происходят гораздо реже чем по Y. Но на дереве YFull ветки с TMRCA меньше 500 лет тоже не часто встретишь.
Так как результатов по мито пока не имею, вопросом этим не озадачивался.
Есть какой-то GenBank, но забросить туда данные непросто. Да и увидеть себя там на дереве тоже не у всех получается.
Здесь много полезной инфы. Только с колонками еще не разобрался Age Synonymous (Years), Age Coding (Years), Age Full (Years). Может кто пояснит?
http://mtdna.gentis.ru/hg/ages.htm#

[ankr21]

А по мито есть что нибудь наподобие YFull?

Сообщество и поиск совпаденцев:
http://www.mtdnacommunity.org/
Определитель субклада
http://dna.jameslick.com/mthap/
Ну а дальше смотрим за обновлениями дерева тут:
http://phylotree.org/tree/main.htm

mthap version 0.19a (2013-04-08); haplogroup data version PhyloTree Build 16 (2014-02-19)
raw data source MT_YF02191.fasta (16KB)

FASTA format was uploaded. Based on the markers found, assuming the following regions were completely sequenced: HVR1 (16001~16569) HVR2 (1~574) CR (575~16000).

Found 16569 markers at 16569 positions covering 100.0% of mtDNA.

Markers found (shown as differences to rCRS):

HVR2: 73G 146C 153G 263G
CR: 750G 1438G 2706G 4505T 4769G 5302C 6221C 6371T 7028T 8860G 11719A 12063T 12705T 13966G 14470C 14587G 14766T 15106A 15326G 15654C
HVR1: 16104T 16223T 16319A (16519C)

Best mtDNA Haplogroup Matches:

1) X1

Defining Markers for haplogroup X1:
HVR2: 73G 146C 153G 263G
CR: 750G 1438G 2706G 4769G 5302C 6221C 6371T 7028T 8860G 11719A 12705T 13966G 14470C 14587G 14766T 15326G 15654C
HVR1: (16104T) 16189C 16223T

Marker path from rCRS to haplogroup X1 (plus extra markers):
H2a2a1(rCRS) ⇨ 263G ⇨ H2a2a ⇨ 8860G 15326G ⇨ H2a2 ⇨ 750G ⇨ H2a ⇨ 4769G ⇨ H2 ⇨ 1438G ⇨ H ⇨ 2706G 7028T ⇨ HV ⇨ 14766T ⇨ R0 ⇨ 73G 11719A ⇨ R ⇨ 12705T 16223T ⇨ N ⇨ 6221C 6371T 13966G 14470C 16189C 16278T ⇨ X ⇨ 153G ⇨ X1'2'3 ⇨ 146C ⇨ X1'3 ⇨ 5302C 14587G 15654C (16104T) 16278C ⇨ X1 ⇨ 4505T 12063T 15106A 16319A (16519C)

Imperfect Match. Your results contained differences with this haplogroup:
Matches(24): 73G 146C 153G 263G 750G 1438G 2706G 4769G 5302C 6221C 6371T 7028T 8860G 11719A 12705T 13966G 14470C 14587G 14766T 15326G 15654C (16104T) 16223T 16278C
Extras(4): 4505T 12063T 15106A 16319A (16519C)
No-Calls(1): 16189C

2) X1c

Defining Markers for haplogroup X1c:
HVR2: 73G 146C 153G 263G
CR: 750G 1438G 2706G 4769G 5302C 6221C 6371T 7028T 7337A 8860G 9615C 11719A 12705T 13966G 14470C 14587G 14766T 15326G 15654C
HVR1: (16104T) 16189C 16223T

Marker path from rCRS to haplogroup X1c (plus extra markers):
H2a2a1(rCRS) ⇨ 263G ⇨ H2a2a ⇨ 8860G 15326G ⇨ H2a2 ⇨ 750G ⇨ H2a ⇨ 4769G ⇨ H2 ⇨ 1438G ⇨ H ⇨ 2706G 7028T ⇨ HV ⇨ 14766T ⇨ R0 ⇨ 73G 11719A ⇨ R ⇨ 12705T 16223T ⇨ N ⇨ 6221C 6371T 13966G 14470C 16189C 16278T ⇨ X ⇨ 153G ⇨ X1'2'3 ⇨ 146C ⇨ X1'3 ⇨ 5302C 14587G 15654C (16104T) 16278C ⇨ X1 ⇨ 7337A 9615C ⇨ X1c ⇨ 4505T 12063T 15106A 16319A (16519C)

Imperfect Match. Your results contained differences with this haplogroup:
Matches(24): 73G 146C 153G 263G 750G 1438G 2706G 4769G 5302C 6221C 6371T 7028T 8860G 11719A 12705T 13966G 14470C 14587G 14766T 15326G 15654C (16104T) 16223T 16278C
Mismatches(2): 7337G 9615T
Extras(4): 4505T 12063T 15106A 16319A (16519C)
No-Calls(1): 16189C

3) X1a

Defining Markers for haplogroup X1a:
HVR2: 73G 146C 153G 263G
CR: 750G 1438G 2706G 4769G 5302C 6221C 6359G 6371T 7028T 7533T 8140T 8860G 11719A 12705T 13966G 14470C 14587G 14766T 15326G 15654C
HVR1: (16104T) 16189C 16223T

Marker path from rCRS to haplogroup X1a (plus extra markers):
H2a2a1(rCRS) ⇨ 263G ⇨ H2a2a ⇨ 8860G 15326G ⇨ H2a2 ⇨ 750G ⇨ H2a ⇨ 4769G ⇨ H2 ⇨ 1438G ⇨ H ⇨ 2706G 7028T ⇨ HV ⇨ 14766T ⇨ R0 ⇨ 73G 11719A ⇨ R ⇨ 12705T 16223T ⇨ N ⇨ 6221C 6371T 13966G 14470C 16189C 16278T ⇨ X ⇨ 153G ⇨ X1'2'3 ⇨ 146C ⇨ X1'3 ⇨ 5302C 14587G 15654C (16104T) 16278C ⇨ X1 ⇨ 6359G 7533T 8140T ⇨ X1a ⇨ 4505T 12063T 15106A 16319A (16519C)

Imperfect Match. Your results contained differences with this haplogroup:
Matches(24): 73G 146C 153G 263G 750G 1438G 2706G 4769G 5302C 6221C 6371T 7028T 8860G 11719A 12705T 13966G 14470C 14587G 14766T 15326G 15654C (16104T) 16223T 16278C
Mismatches(3): 6359A 7533C 8140C
Extras(4): 4505T 12063T 15106A 16319A (16519C)
No-Calls(1): 16189C
уважаемый Семаргл прокомментируйте пожалуйста мои данные у меня X1, X1c или X1a ?

Здесь точно X1. А далее диагностируется вероятнее всего X1c -  Mismatches(2) два несоответствия. X1a менее вероятна - Mismatches(3) три несоответствия.

[rLin]

Ну вот у меня сделан FMS. HVR1+HVR2 - 94 человека, из них один россиянин, HVR1+HVR2+Coding regions - 3 человека на дистанции 2-3, россиян нет. На HVR1+HVR2 гаплогруппы T2b2 и T2b2-C16304T!, на HVR1+HVR2+Coding regions только T2b2-C16304T!. Так что FMS в смысле определения гаплогруппы мне ничего нового не дало, в смысле поиска предков тоже. Зато если появится какое-нибудь интересное исследование мутаций в мтДНК, то у меня всё готово, надо только найти у себя в файлике и посмотреть.