АвторТема: IBM анализ генома за $1000  (Прочитано 3087 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн mouglleyАвтор темы

  • ...
  • Сообщений: 7904
  • Страна: hr
  • Рейтинг +433/-7
  • Я знаю, что познаю всё.
    • Записки Маугли
  • Y-ДНК: N1c1-L1025
  • мтДНК: J1c3
IBM анализ генома за $1000
« : 06 Октябрь 2009, 09:37:49 »
I.B.M. Joins Pursuit of $1,000 Personal Genome
Цитировать
One of the oldest names in computing is joining the race to sequence the genome for $1,000. On Tuesday, I.B.M. plans to give technical details of its effort to reach and surpass that goal, ultimately bringing the cost to as low as $100, making a personal genome cheaper than a ticket to a Broadway play.

Оффлайн Mich Glitch

  • Genus regis
  • Сообщений: 34948
  • Страна: ca
  • Рейтинг +3045/-47
  • Y-ДНК: J2b1
  • мтДНК: H6a1a5a
Re: IBM анализ генома за $1000
« Ответ #1 : 06 Октябрь 2009, 14:23:55 »
Ждём-с!
Как только - так сразу!!!

Оффлайн mouglleyАвтор темы

  • ...
  • Сообщений: 7904
  • Страна: hr
  • Рейтинг +433/-7
  • Я знаю, что познаю всё.
    • Записки Маугли
  • Y-ДНК: N1c1-L1025
  • мтДНК: J1c3
Re: IBM анализ генома за $1000
« Ответ #2 : 07 Октябрь 2009, 10:02:20 »
Big Blue's DNA-Reading Chips
Цитировать
IBM researchers are developing a chip for cheaper, faster DNA sequencing using fabrication techniques refined through semiconducting manufacturing. The chip uses layered electrodes to control the movement of individual DNA molecules and exploits a technique called nanopore sequencing. The approach could allow DNA to be passed through a sensor that would rapidly read off its genetic code.

Оффлайн Mich Glitch

  • Genus regis
  • Сообщений: 34948
  • Страна: ca
  • Рейтинг +3045/-47
  • Y-ДНК: J2b1
  • мтДНК: H6a1a5a
Re: IBM анализ генома за $1000
« Ответ #3 : 08 Ноябрь 2009, 01:36:29 »
Уже 4.4 тысячи!!!

Стоимость расшифровки генома человека упала до 4,4 тысячи долларов
 
Американская биотехнологическая компания Complete Genomics объявила, что созданная ею технология позволит расшифровать последовательность генома человека всего за 4,4 тысячи долларов. Ранее та же компания называла цифру 5 тысяч долларов. Основной принцип нового метода описан на портале ScienceNOW.
Геном человека содержит около 3 миллиардов "букв" - нуклеотидов. С учетом того, что каждая хромосома представлена в двух копиях, общее число нуклеотидов составляет 6 миллиардов. Расшифровка последовательности ДНК человека позволит исследователям узнать множество индивидуальных особенностей, в том числе, предрасположенность к тем или иным заболеваниям.

Впервые геном Homo sapiens был расшифрован в 2001 году в рамках проекта "Геном человека". Этот процесс занял несколько лет, и в нем приняли участие сотни ученых по всему миру. Общая стоимость расшифровки составила около 3 миллиардов долларов. Постепенно технологии определения последовательности ДНК, или секвенирования, совершенствовались. При этом скорость работ росла, а их стоимость падала.

Метод, разработанный Complete Genomics, использует "классическую" методику секвенирования ДНК, известную как метод Сэнгера. Коротко суть метода можно описать следующим образом: на первой стадии геном разрезается на множество коротких фрагментов длиной в несколько десятков нуклеотидов. Далее определяются последовательности этих кусочков. Затем полученные кусочки сопоставляются друг с другом, и из них при помощи компьютера выстраивается полногеномная последовательность.

По утверждениям специалистов Complete Genomics, новая технология позволит им в ближайшем будущем секвенировать геном одного человека в течение дня. Столь высокая скорость делает метод пригодным для широкого практического применения. Однако анонсирование нового метода вызвало критическую реакцию в научном сообществе. Скептицизм ученых вызвала низкая точность технологии - приблизительно одна ошибка на 100 тысяч оснований. Соответственно, на 3 миллиарда "букв" накопится 30 тысяч ошибок. При том, что многие наследственные заболевания вызываются заменой единичных нуклеотидов, "грубость" новой технологии может свести на нет все ее достоинства.

Для стимуляции исследователей, работающих над поиском новых дешевых и быстрых методов секвенирования ДНК, фонд X-Prize, созданный для поддержки "безумных" научных проектов, объявил о премии в десять миллионов долларов. Приз достанется тому коллективу ученых, который сможет секвенировать сто геномов человека в течение не более чем десяти дней при стоимости не выше десяти тысяч долларов за геном.


Источник (ссылка).


Оффлайн Anode

  • Группа N
  • *
  • Сообщений: 1500
  • Страна: ca
  • Рейтинг +145/-0
  • PS1 -> TT1 -> EE1 -> PS2
  • Y-ДНК: N1c1
  • мтДНК: H10a1, U5b1
Re: IBM анализ генома за $1000
« Ответ #4 : 08 Ноябрь 2009, 06:49:25 »
закон Мура пока работает, т.е. через 2 года - полдня, ещё через 2 года - пару часов, через 10 лет - 15 минут, т.е. 30 долларов. А скорее всего - ещё быстрее, так как экспоненциальный рост идёт сразу на многих уровнях.
Только прочитав Курзвейла (http://en.wikipedia.org/wiki/The_Singularity_Is_Near), я понял, как даже учёные заблуждаются и аппроксимируют всё что касается будущего - всего-лишь линейно (интуитивно).

А может, и алгоритм сделают более эффективным.
Ждём веб-интерфейса для даунлода и аплода всего генотипа.

Оффлайн Шад

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6264
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1140/-4
  • Ex oriente lux
  • Y-ДНК: Q-Y2750
  • мтДНК: J1c2z
Re: IBM анализ генома за $1000
« Ответ #5 : 20 Март 2013, 23:19:00 »
Американская биотехнологическая компания Complete Genomics объявила, что созданная ею технология позволит расшифровать последовательность генома человека всего за 4,4 тысячи долларов. Ранее та же компания называла цифру 5 тысяч долларов. Основной принцип нового метода описан на портале ScienceNOW.
Геном человека содержит около 3 миллиардов "букв" - нуклеотидов. С учетом того, что каждая хромосома представлена в двух копиях, общее число нуклеотидов составляет 6 миллиардов. Расшифровка последовательности ДНК человека позволит исследователям узнать множество индивидуальных особенностей, в том числе, предрасположенность к тем или иным заболеваниям.

Метод, разработанный Complete Genomics, использует "классическую" методику секвенирования ДНК, известную как метод Сэнгера. Коротко суть метода можно описать следующим образом: на первой стадии геном разрезается на множество коротких фрагментов длиной в несколько десятков нуклеотидов. Далее определяются последовательности этих кусочков. Затем полученные кусочки сопоставляются друг с другом, и из них при помощи компьютера выстраивается полногеномная последовательность.

По утверждениям специалистов Complete Genomics, новая технология позволит им в ближайшем будущем секвенировать геном одного человека в течение дня. Столь высокая скорость делает метод пригодным для широкого практического применения. Однако анонсирование нового метода вызвало критическую реакцию в научном сообществе. Скептицизм ученых вызвала низкая точность технологии - приблизительно одна ошибка на 100 тысяч оснований. Соответственно, на 3 миллиарда "букв" накопится 30 тысяч ошибок. При том, что многие наследственные заболевания вызываются заменой единичных нуклеотидов, "грубость" новой технологии может свести на нет все ее достоинства.

Для стимуляции исследователей, работающих над поиском новых дешевых и быстрых методов секвенирования ДНК, фонд X-Prize, созданный для поддержки "безумных" научных проектов, объявил о премии в десять миллионов долларов. Приз достанется тому коллективу ученых, который сможет секвенировать сто геномов человека в течение не более чем десяти дней при стоимости не выше десяти тысяч долларов за геном.[/i]

Источник (ссылка).

А теперь Complete Genomics, этот пионер биотехнологии, перешел под контроль китайской BGI-Shenzhen .
http://www.genengnews.com/gen-news-highlights/next-gen-china-syndrome

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.


Rambler's Top100