АвторТема: Genomic structure in Europeans dating back at least 36,200 years  (Прочитано 4288 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн SrkzАвтор темы

  • Сообщений: 6130
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2778/-2
  • Y-ДНК: N-L1025*
  • мтДНК: U4a1e-pre T16093C T16311T
Genomic structure in Europeans dating back at least 36,200 years

http://www.sciencemag.org/content/early/2014/11/05/science.aaa0114

    Abstract

The origin of contemporary Europeans remains contentious. We obtain a genome sequence from Kostenki 14 in European Russia dating to 38,700 to 36,200 years ago, one of the oldest fossils of Anatomically Modern Humans from Europe. We find that K14 shares a close ancestry with the 24,000-year-old Mal’ta boy from central Siberia, European Mesolithic hunter-gatherers, some contemporary western Siberians, and many Europeans, but not eastern Asians. Additionally, the Kostenki 14 genome shows evidence of shared ancestry with a population basal to all Eurasians that also relates to later European Neolithic farmers. We find that Kostenki 14 contains more Neandertal DNA that is contained in longer tracts than present Europeans. Our findings reveal the timing of divergence of western Eurasians and East Asians to be more than 36,200 years ago and that European genomic structure today dates back to the Upper Paleolithic and derives from a meta-population that at times stretched from Europe to central Asia.

Человек с Маркиной горы, как я понимаю? Судя по всему, не "австралоид" он никакой. Хотя вроде его чуть позже датируют, возможно, тут использовали другие останки.

Оффлайн Eugene

  • Санктпетербурхъ
  • Сообщений: 6567
  • Страна: ru
  • Рейтинг +925/-40
    • N1c1 Y-DNA Project
  • Y-ДНК: N-BY32524
  • мтДНК: U-C1341T
Re: Genomic structure in Europeans dating back at least 36,200 years
« Ответ #1 : 07 Ноябрь 2014, 09:12:25 »
А есть ли его сравнительное положение на этноплоте?
А то мы уже знаем как того же IR1 среди армян поместили, при этом написали про влияние с восточной Азии  :)

Оффлайн пенелопа

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 5870
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2081/-12
  • мтДНК: H1b
Re: Genomic structure in Europeans dating back at least 36,200 years
« Ответ #2 : 07 Ноябрь 2014, 09:17:24 »
Человек с Маркиной горы, как я понимаю? Судя по всему, не "австралоид" он никакой. Хотя вроде его чуть позже датируют, возможно, тут использовали другие останки.
Да, похоже это он. Кому статью надо - в личку емейл пишите.

Оффлайн SrkzАвтор темы

  • Сообщений: 6130
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2778/-2
  • Y-ДНК: N-L1025*
  • мтДНК: U4a1e-pre T16093C T16311T
Re: Genomic structure in Europeans dating back at least 36,200 years
« Ответ #3 : 07 Ноябрь 2014, 09:18:08 »
А есть ли его сравнительное положение на этноплоте?
А то мы уже знаем как того же IR1 среди армян поместили, при этом написали про влияние с восточной Азии  :)
Есть Supplementary http://www.sciencemag.org/content/suppl/2014/11/05/science.aaa0114.DC1/Seguin-Orlando.SM.pdf , но пока не имею возможности изучить.

Оффлайн Eugene

  • Санктпетербурхъ
  • Сообщений: 6567
  • Страна: ru
  • Рейтинг +925/-40
    • N1c1 Y-DNA Project
  • Y-ДНК: N-BY32524
  • мтДНК: U-C1341T
Re: Genomic structure in Europeans dating back at least 36,200 years
« Ответ #4 : 07 Ноябрь 2014, 09:30:59 »
А есть ли его сравнительное положение на этноплоте?
А то мы уже знаем как того же IR1 среди армян поместили, при этом написали про влияние с восточной Азии  :)
Есть Supplementary http://www.sciencemag.org/content/suppl/2014/11/05/science.aaa0114.DC1/Seguin-Orlando.SM.pdf , но пока не имею возможности изучить.
Спасибо!
В общем Y-гаплогруппа судя по всему у него CT.

Оффлайн Eugene

  • Санктпетербурхъ
  • Сообщений: 6567
  • Страна: ru
  • Рейтинг +925/-40
    • N1c1 Y-DNA Project
  • Y-ДНК: N-BY32524
  • мтДНК: U-C1341T
Re: Genomic structure in Europeans dating back at least 36,200 years
« Ответ #5 : 07 Ноябрь 2014, 09:57:47 »
Положение

Оффлайн пенелопа

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 5870
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2081/-12
  • мтДНК: H1b
Re: Genomic structure in Europeans dating back at least 36,200 years
« Ответ #6 : 07 Ноябрь 2014, 10:06:17 »
И другие картинки вывешу:







Оффлайн FenriR

  • Сообщений: 2001
  • Страна: 00
  • Рейтинг +525/-2
  • Y-ДНК: N1c1-L1025
  • мтДНК: K1a
Re: Genomic structure in Europeans dating back at least 36,200 years
« Ответ #7 : 07 Ноябрь 2014, 11:03:40 »
главные пункты статьи добавили в комментах к посту Поляко:
Цитировать
Hey guys, I have access to the paper, so AMA.

Here are the main conclusions:
1) Kostenki (K14) shows the most similarity with WHG and lesser with modern day Europeans.
- The greatest affinity by f3 is with loschour, and secondarily with La Brana and Scandinavian HGs.
- The greatest component in ADMIXTURE for K14 is shared with N. and E. Europeans.
- f3 stats show the most affinity with Europeans.
- For pairs of pop incl. European and East Asian, K14 is closer to European.
- f3 results are robust to contamination.

2) All pops other than Oceanians are closer to WHG samples or MA-1 than to K14.
3) ADMIXTURE shows K14 share some protion of a component in Neols and Near Easterns.

4) From 2) + 3), K14 had basal Eurasian.
- East Asian equally distant from K14 and Stuttgart using D-stats (!)

5) Siberians from the Ob and Yenisei closer to European than to K14, but closer to Scandinavian WHG than to European, and closer to Scandinavian WHG than to Mal'ta. The best mix not European + Even Siberians, or Mal'ta + Even Siberians, but Motala + Even Siberians, implying early gene flow prior to Mesolithic.

6) K14 has higher Neanderthal segment length than modern pops and later aDNA. Authors draw same conclusion as those for Ust-Ishim, aka 54kya, OOA.

7) Restricting 'analysis to areas without evidence for neaderthal-introgressed haplotypes in contemporary humans results in 0% estimated ancestry for most individuals except K14, where 0.9+-0.4% Neanderthal ancestry is still detected.' Authors attribute this to selection out or drifting out of neand till modern times, or further neand input into K14. No evidence for introgression from other unknown archaics.

8 ) 'Our results show no close genetic relationship between K14 Australo-Melanesians, and support earlier studies that Australo-Melanesians derive part of their ancestry from an early population divergence that pre-dates the separation of Europeans and East Asians' (!)

Оффлайн SrkzАвтор темы

  • Сообщений: 6130
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2778/-2
  • Y-ДНК: N-L1025*
  • мтДНК: U4a1e-pre T16093C T16311T
Re: Genomic structure in Europeans dating back at least 36,200 years
« Ответ #8 : 07 Ноябрь 2014, 11:13:48 »
5) Siberians from the Ob and Yenisei closer to European than to K14, but closer to Scandinavian WHG than to European, and closer to Scandinavian WHG than to Mal'ta. The best mix not European + Even Siberians, or Mal'ta + Even Siberians, but Motala + Even Siberians, implying early gene flow prior to Mesolithic.
Я думаю, все же их неправильно выводить, как WHG+East Asian, ANE обязательно должны были поучаствовать (сильнее, чем примесь ANE у Motala).

PS Из статьи
Цитировать
The Y-chromosome belongs to haplogroup C M130, the same as in La Braña

Оффлайн FenriR

  • Сообщений: 2001
  • Страна: 00
  • Рейтинг +525/-2
  • Y-ДНК: N1c1-L1025
  • мтДНК: K1a
Re: Genomic structure in Europeans dating back at least 36,200 years
« Ответ #9 : 07 Ноябрь 2014, 11:18:51 »
5) Siberians from the Ob and Yenisei closer to European than to K14, but closer to Scandinavian WHG than to European, and closer to Scandinavian WHG than to Mal'ta. The best mix not European + Even Siberians, or Mal'ta + Even Siberians, but Motala + Even Siberians, implying early gene flow prior to Mesolithic.
Я думаю, все же их неправильно выводить, как WHG+East Asian, ANE обязательно должны были поучаствовать.
скорее всего без ANE там не обошлось, по крайней мере, было бы странно, если бы этот компонент там не участвовал
Цитировать
PS Из статьи
Цитировать
The Y-chromosome belongs to haplogroup C M130, the same as in La Braña
да, вот это - очень интересно)

ЗЫ Reich, вроде как, думает, что образец мог быть загрязнен:
Цитировать
But what I find intriguing is that David Reich suspects this genome might be contaminated, because he's seen Mesolithic genomes from the Samara Valley, which is pretty close to the Kostenki site.

Оффлайн Eugene

  • Санктпетербурхъ
  • Сообщений: 6567
  • Страна: ru
  • Рейтинг +925/-40
    • N1c1 Y-DNA Project
  • Y-ДНК: N-BY32524
  • мтДНК: U-C1341T
Re: Genomic structure in Europeans dating back at least 36,200 years
« Ответ #10 : 07 Ноябрь 2014, 12:14:57 »
Компонента, характерная для негроидов у него зато есть.
С одной стороны в палеолите она могла еще остаться "фоном". С другой тогда странно почему нет восточно-азиатской, которая была даже у Усть-ишимца.

Оффлайн митохондрия

  • Сообщений: 863
  • Страна: 00
  • Рейтинг +98/-1
  • Y-ДНК: супруг:J1, отец: I2a2 'Dinaric-N' (I-CTS10228)
  • мтДНК: H8c- (T152C!) G13711A
Re: Genomic structure in Europeans dating back at least 36,200 years
« Ответ #11 : 07 Ноябрь 2014, 12:24:00 »
А есть ли его сравнительное положение на этноплоте?
А то мы уже знаем как того же IR1 среди армян поместили, при этом написали про влияние с восточной Азии  :)

А мне, как пользователю хотелось бы, чтобы новые данные по древним геномам побыстрее поступали в базу GEDMatch для сравнения.
И плюс к результатам в виде неопределенных сегментов WHG или ANE хотелось бы м.б. какой-то конкретики - если в геноме современного человека есть (вдруг?) похожие сегменты на сегменты конкретного древнего образца, то это бы указывалось. А именно - хромосома и местоположение сегмента.


Оффлайн Eugene

  • Санктпетербурхъ
  • Сообщений: 6567
  • Страна: ru
  • Рейтинг +925/-40
    • N1c1 Y-DNA Project
  • Y-ДНК: N-BY32524
  • мтДНК: U-C1341T
Re: Genomic structure in Europeans dating back at least 36,200 years
« Ответ #12 : 07 Ноябрь 2014, 12:24:12 »
Melanesian у него тоже немного все-таки есть. причем даже больше чем у мальтинца.

Оффлайн SrkzАвтор темы

  • Сообщений: 6130
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2778/-2
  • Y-ДНК: N-L1025*
  • мтДНК: U4a1e-pre T16093C T16311T
Re: Genomic structure in Europeans dating back at least 36,200 years
« Ответ #13 : 07 Ноябрь 2014, 12:27:20 »
Papuan у енго тоже немного все-таки есть. причем даже больше чем у мальтинца.
Помнится, оно и у мезолитчиков находилось в небольших дозах, видимо, что-то базальное.

Оффлайн Eugene

  • Санктпетербурхъ
  • Сообщений: 6567
  • Страна: ru
  • Рейтинг +925/-40
    • N1c1 Y-DNA Project
  • Y-ДНК: N-BY32524
  • мтДНК: U-C1341T
Re: Genomic structure in Europeans dating back at least 36,200 years
« Ответ #14 : 07 Ноябрь 2014, 12:32:16 »
Помнится, оно и у мезолитчиков находилось в небольших дозах, видимо, что-то базальное.
Да, возможно.
Просто смотрю на его состав по K=2 to K=15 из Supplementary и просто не пойму как там увидеть "азиата" или "европейца"... Он же уникален в своем роде, как собственно и Усть-ишимец.
И папусасы и негры - рассматриваются современные...

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.


Rambler's Top100