Genome sequence of a 45,000-year-old modern human from western Siberia

[Murzalar]

Ближе чем зеленее?

Зеленее-дальше, то есть башкиры получились одними из (относительно) ближайших родственников.

Еще я так понял киргизы,уйгуры и бвряты.

[Srkz]

Еще я так понял киргизы,уйгуры и бвряты.

Да, может, в горах его родня сохранилась? Мальтинец как-то не очень похож на прямого потомка. Хотя какие горы в ледниковье, ерунда какая-то.

[Murzalar]

Еще я так понял киргизы,уйгуры и бвряты.

Да, может, в горах его родня сохранилась? Мальтинец как-то не очень похож на прямого потомка. Хотя какие горы в ледниковье, ерунда какая-то.

Чудеса. Но кроме как гор, другого фактора действительно не вижу.

[FenriR]

Если и горы то, имхо, горные системы Южной Сибири и Забайкалья + прилегающие земли (в особенности Енисей?), к тому же, на первый взгляд, количество сегментов коррелирует с монголоидностью, это хорошо видно по "краевым" популяциям: узбеки, марийцы, якуты - все обнаруживают усиление монголоидных черт относительно своих соседей. В Европе же, как будто, есть 2 пути: "лесной" (фу-народы: марийцы-эстонцы-карелы-саамы) и "степной" (ногаи-восток Украины-Болгария).
Мне видится маловероятным, чтобы какая-то одна группа смогла сохранить столько, общих с усть-ишимцем, нейтральных мутаций, подвержанных дрейфу, больше чем за 40 (!) тысяч лет. Может быть, там было, как минимум, несколько изолированных, отдрейфовших популяций, сохранивших различные участки генома, которые позже смешались, что и дало "родственников" и количество общих сегментов?

[Valery]

Cудя по дереву yfull  из 1000геномов там 1 телугу(Индия), 5 пекинцев(что никак не говорит о географии внутри Китая - столица!) и 1 хошиминец(Вьетнам). Причём к этому же общему субкладу, обозначенному F2905(эквивалент CTS3252(см. здесь)), по yfull относится и N1b-L732(2 чел. в польском проекте).

Большое-пребольшое спасибо! То есть, по текущим данным, это Китай без определенной локализации, и маааасенький (малой достоверности) намек что эпицентр может быть южнее.

[Valery]

а вот телугу заставил что-то поскрипеть мои мозги ((

[Valery]

Так есть же кураторы гаплогруппы.

Contact People for Haplogroup N: Eugene Matyushonok, Marja Pirttivaara, and Vladimir Volkov

А дальше идет только техническое исполнение.

клево, есть и наши кураторы ))

[Srkz]

Если и горы то, имхо, горные системы Южной Сибири и Забайкалья + прилегающие земли (в особенности Енисей?), к тому же, на первый взгляд, количество сегментов коррелирует с монголоидностью, это хорошо видно по "краевым" популяциям: узбеки, марийцы, якуты - все обнаруживают усиление монголоидных черт относительно своих соседей.

Когда будет время, хочу добавить к сравнению более южные и восточные выборки. Может, где-то там вырисуется эпицентр. Пока на его роль больше нравится киргизско-уйгурское пятно.

"степной" (ногаи-восток Украины-Болгария).

-Италия-Франция ИМХО шум (кроме ногайцев, которым сам бог велел). Хотя...
Eurogenes K15
North_Sea 0.06
Atlantic 11.22
Baltic 0
Eastern_Euro 3.06
West_Med 4.82
West_Asian 0
East_Med 0
Red_Sea 3.36
South_Asian 30.75
Southeast_Asian 15.26
Siberian 2.01
Amerindian 2.19
Oceanian 10.97
Northeast_African 10.1
Sub-Saharan 6.22

Мне видится маловероятным, чтобы какая-то одна группа смогла сохранить столько, общих с усть-ишимцем, нейтральных мутаций, подвержанных дрейфу, больше чем за 40 (!) тысяч лет.

Не обязательно нейтральных, здесь все мутации участвуют, в том числе подверженные отбору.

[Asmat headhunter]

а вот телугу заставил что-то поскрипеть мои мозги ((

Почему?

[FenriR]

Когда будет время, хочу добавить к сравнению более южные и восточные выборки. Может, где-то там вырисуется эпицентр. Пока на его роль больше нравится киргизско-уйгурское пятно.

так и те и другие тоже, примерно, с Южной Сибири)

-Италия-Франция ИМХО шум (кроме ногайцев, которым сам бог велел). Хотя...

может быть и шум, но, чем ближе к степи, тем выше вероятность, что нет, имхо.
Atlantic у него, видимо, следствие недифференцированности, а если так, то Atlantic - древний компонент, как-то связанный с югом (ведь, миграция человека, грубо говоря, проходила с юга на север) а Baltic и North-Sea помоложе)

Не обязательно нейтральных, здесь все мутации участвуют, в том числе подверженные отбору.

нейтральные мутации происходят чаще других, да и т.н. "культурная эволюция" ослабила влияние отбора на человека.

[Srkz]

Когда будет время, хочу добавить к сравнению более южные и восточные выборки. Может, где-то там вырисуется эпицентр. Пока на его роль больше нравится киргизско-уйгурское пятно.

Ну что ж, как и положено настоящему pre-NO, близкому к корню K, эпицентр получился где-то в районе Бирмы

Код: [Выделить]

Munda-South 57 ---//Confidence:medium
Lahu 56,66 ---//Confidence:low
Malayan 55,72 ---//Confidence:very low (это не малайцы, а какие-то два индуса из Кералы)
Nivh 55,08 ---//Confidence:very low
Munda-North 54,39 ---//Confidence:low
Hazara 53,34 ---//Confidence:very high
Burmese 53,33 ---//Confidence:high
Xibo 52,71 ---//Confidence:medium
Bashkir 52,65 ---//Confidence:low
She 52,55 ---//Confidence:medium
Japanese 52,49 ---//Confidence:very high
Cambodian 52,25 ---//Confidence:medium
Kirgiz 52,25 ---//Confidence:very high
Dai 52,11 ---//Confidence:medium
Buryat 51,89 ---//Confidence:high
Miao 51,47 ---//Confidence:medium
Yakut 51,07 ---//Confidence:very high
Yi 50,91 ---//Confidence:medium
Uygur 50,38 ---//Confidence:medium
Kazah 49,77 ---//Confidence:high
Uzbek 49,66 ---//Confidence:high
Melanesian 49,62 ---//Confidence:low
Altaian 49,44 ---//Confidence:high
Ket 49,12 ---//Confidence:very low
Tu 48,75 ---//Confidence:low
Selkup 48,43 ---//Confidence:high
Hakas 47,95 ---//Confidence:medium
Papuan 47,81 ---//Confidence:high
Hezhen 47,69 ---//Confidence:low
Mari 47,58 ---//Confidence:high
Mongola 47,55 ---//Confidence:medium
Evenk 47,15 ---//Confidence:high
Han-North 46,88 ---//Confidence:medium
Dolgan 46,55 ---//Confidence:medium
Paniya 46,53 ---//Confidence:very low
Han 46,52 ---//Confidence:very high
Naxi 46,28 ---//Confidence:low
Gujarati 46,21 ---//Confidence:very high
Turkmen 45,61 ---//Confidence:high
Even 45,2 ---//Confidence:medium
Mongol 44,67 ---//Confidence:medium
Tuvinian 44,47 ---//Confidence:high
Sindhi 44,44 ---//Confidence:very high
Oroqen 44,35 ---//Confidence:medium
Mansi 43,97 ---//Confidence:medium
Halakipikki 43,81 ---//Confidence:very low
Burusho 43,77 ---//Confidence:very high
Pathan 43,72 ---//Confidence:very high
Daur 43,53 ---//Confidence:medium
Tujia 42,14 ---//Confidence:medium
Saami 42,11 ---//Confidence:high
Sakilli 41,74 ---//Confidence:very low
Moksha 41,14 ---//Confidence:very low
Tatar-Kazan 41,02 ---//Confidence:high
Tadjik 40,99 ---//Confidence:high
Udmurt 40,9 ---//Confidence:high
Chuvash 40,89 ---//Confidence:high
Nogay 40,14 ---//Confidence:high
Nganassan 39,89 ---//Confidence:medium
Erzya 39,83 ---//Confidence:medium
North-Kannadi 39,77 ---//Confidence:medium
Finnish 39,75 ---//Confidence:very low
Estonian 39,58 ---//Confidence:high
Chechen 39,56 ---//Confidence:very high
Veps 39,03 ---//Confidence:medium
German-Austrian 38,72 ---//Confidence:very low
Russian-North 37,89 ---//Confidence:very high
Loschbour 37,86 ---//Confidence:very low
Bulgarian 37,56 ---//Confidence:high
Belarusian 37,41 ---//Confidence:high
Komi 37,13 ---//Confidence:high
Brahui 37,12 ---//Confidence:very high
Kalash 37,04 ---//Confidence:very high
Ukrainian-East-and-Center 36,03 ---//Confidence:medium
Norwegian 35,63 ---//Confidence:high
Kumyk 35,48 ---//Confidence:high
Italian 35,46 ---//Confidence:very high
Ossetian 35,44 ---//Confidence:high
Karelian 35,35 ---//Confidence:high
Adygei 35,14 ---//Confidence:high
Makrani 35,13 ---//Confidence:very high
Balt 35,12 ---//Confidence:high
Balochi 34,52 ---//Confidence:very high
Abkhazian 34,39 ---//Confidence:very high
French 33,86 ---//Confidence:very high
Russian-South 33,78 ---//Confidence:very high
Lezgin 33,73 ---//Confidence:very high
Azerbaijani 33,73 ---//Confidence:high
Tatar_Lithuanian 33,4 ---//Confidence:very low
Russian-West 33,3 ---//Confidence:medium
Ashkenazi 33,27 ---//Confidence:high
Tatar-Crimean 33,14 ---//Confidence:low
Turkish 32,47 ---//Confidence:high
Shor 32,46 ---//Confidence:very low
Swedish 32,25 ---//Confidence:high
Hungarian 32,18 ---//Confidence:very high
Polish 32 ---//Confidence:high
Croatian 31,83 ---//Confidence:very high
Balkarian 31,72 ---//Confidence:very high
Iranian 31,6 ---//Confidence:very high
Greek 30,82 ---//Confidence:very high
Romanian 30,66 ---//Confidence:medium
Basque 30,48 ---//Confidence:very high
British 30,28 ---//Confidence:very high
BR2 30,11 ---//Confidence:very low
Maya 29,64 ---//Confidence:very high
Georgian 28,38 ---//Confidence:high
Armenian 28,36 ---//Confidence:high
Sephard 26,59 ---//Confidence:high
Sardinian 26,55 ---//Confidence:very high
Ukrainian-West-and-Center 26,08 ---//Confidence:medium
Greek_Azov 22,62 ---//Confidence:low
Karitiana 20,8 ---//Confidence:medium
LBK 20,65 ---//Confidence:very low
MbutiPygmy 3,22 ---//Confidence:very low
BantuKenia 2,64 ---//Confidence:medium
Yoruba 0,98 ---//Confidence:medium
BiakaPygmy 0,3 ---//Confidence:medium
Ради интереса в сравнение добавлены также три древних генома, выборки африканцев, папуасов, меланезийцев и индейцев. У африканцев практически не нашлось общих сегментов с усть-ишимцем. Это говорит о том, что сегменты все же не случайны. А вот папуасы заняли вполне высокое место.
Melanesian   49,62   ---//Confidence:low   
Papuan   47,81   ---//Confidence:high   
Кроме бирманского пятна и упоминавшихся ранее, добавилось дальневосточное:
Nivh   55,08   ---//Confidence:very   low
Japanese   52,49   ---//Confidence:very   high
Hezhen   47,69   ---//Confidence:low   
И почему-то выделился еще народ Hazara, возможно, это относится к киргизско-уйгурскому пятну.

[Fire]

Ну что ж, как и положено настоящему pre-NO, близкому к корню K, эпицентр получился где-то в районе Бирмы

Для Мальтайца (R*) есть такая же картина со всей Евразией?   
И для Штудгардца (Неолитического)?    

[Srkz]

Для Мальтайца (R*) есть такая же картина со всей Евразией?   
И для Штудгардца (Неолитического)?

Есть только старые варианты здесь
Геном мальтинца слишком низкого качества, а Штутгарт (LBK) откровенно привязан к Южной Европе, ему, наверное, Евразия ничего не даст.

[Fire]

а Штутгарт (LBK) откровенно привязан к Южной Европе, ему, наверное, Евразия ничего не даст.

Почему?
Ведь с Туркменами Таджиками и Уйгурцами у Штудгардца неплохо.

[Srkz]

Наверное, на выходных пересчитаю карты для палеогеномов.