Genome sequence of a 45,000-year-old modern human from western Siberia

[Шад]

ОФФ. А кто подскажет что-нить про географию Y*N1d CTS3252/M1831 ?

Плииз!

Cудя по дереву yfull  из 1000геномов там 1 телугу(Индия), 5 пекинцев(что никак не говорит о географии внутри Китая - столица!) и 1 хошиминец(Вьетнам). Причём к этому же общему субкладу, обозначенному F2905(эквивалент CTS3252(см. здесь)), по yfull относится и N1b-L732(2 чел. в польском проекте).

P.S.ISOGG как-то всё больше закостеневает и игнорирует результаты Yfull.

Так есть же кураторы гаплогруппы.

Contact People for Haplogroup N: Eugene Matyushonok, Marja Pirttivaara, and Vladimir Volkov

А дальше идет только техническое исполнение.

[митохондрия]

Номер Усть-Ишимца для анализа в GEDMatch

F999935

Отсюда:
http://www.y-str.org/p/ancient-dna.html

[митохондрия]

Predicted Eye Color for Kit F999935 (F2)

Read rules from top to bottom. In some cases, a rule cancels out results from rules above it.

TT at: rs916977 - Adds melanin. Some darkening.
GG at: rs4778138 - Adds melanin. Adds yellow, amber, or brown. Some darkening. Contributes to brown.
GG at: rs7495174 - Adds melanin. Very slight darkening.
CC at: rs3794604 - Blocks some melanin. Often gives light colored eyes.
CC at: rs9782955 - Blocks some melanin. Often gives light colored eyes.
CC at: rs1129038 - High Melanin production. Brown.
AA at: rs8033448 - Med Brown on Sphincter
AG at: rs10467971 - Penetrance Modifier - Blue
TT at: rs1448485 - Brown
GG at: rs12906280 - Gray ring around outer edge
AA at: rs4778241 - Medium melanin on Anterior Epithelium. Brown.
TT at: rs1470608 - Large amounts of melanin on Anterior Epithelium. Brown.
CC at: rs16891982 - Increased melanin production on Anterior Epithelium. Adds yellow, amber, or brown. Some darkening.
AA at: rs12913832 - High melanin production on Anterior Epithelium. Adds yellow, amber, or brown. Some darkening. Contributes to brown.
CC at: rs2240203 - Large amounts of melanin on Anterior Epithelium. Deep Brown.
CC at: rs1667394 - Increased melanin production on Anterior Epithelium. Adds yellow, amber, or brown. Some darkening.
CC at: rs12203592 - No pigmented Collarette.
CC at: rs4779685 - Flecks (Nevi).

[митохондрия]

http://www.fc.id.au/2014/11/ust-ishim-ancient-dna-analysis.html

Ust'-Ishim Ancient DNA Analysis

[митохондрия]

Felix Chandrakumar  uploaded the Ust'-Ishim kit into FTDNA using their autosomal transfer program. FTDNA database has 1 match.
http://www.fc.id.au/2014/11/ust-ishim-ancient-dna-analysis.html

The kit is locked. If you have a 23andme V3 file or Ancestry autosomal file, please use the below link to transfer into FTDNA database. If 4 such people use the below reference link, the Ust'-Ishim kit in FTDNA database gets unlocked.

Если у кого-то есть V.3 файлы от 23andme, помогите разблокировать файл Ушимца, загруженный в FTDNA. Нужны 4 таких человека.

Autosomal Transfer (Unlocks Ust'-Ishim kit)
https://2.bp.blogspot.com/-W0xxZyGLrYc/VGIfFhzhlhI/AAAAAAAAe6s/RAFDnYOKNP0/s400/Um2.PNG

[Srkz]

Predicted Eye Color for Kit F999935 (F2)
AA at: rs12913832 - High melanin production on Anterior Epithelium. Adds yellow, amber, or brown. Some darkening. Contributes to brown.

Извращенцы, они оказывается "снип светлоглазости" используют в противоположном значении для определения темноглазости

PS почему усть-ишимец в теме о Костенках?

[Srkz]

По Вереничу наиболее схожими с ним получились филиппинские негритосы

Код: [Выделить]

MDLP K23b Oracle Rev 2014 Sep 16

Admix Results (sorted):

# Population Percent
1 South_Indian 28.37
2 Australoid 8.74
3 South_East_Asian 7.00
4 European_Early_Farmers 6.64
5 Austronesian 6.54
6 European_Hunters_Gatherers 5.94
7 East_African 4.83
8 South_Central_Asian 4.78
9 Melano_Polynesian 4.61
10 Archaic_African 4.14
11 Near_East 3.02
12 Subsaharian 2.93
13 North_African 2.57
14 Paleo_Siberian 2.34
15 Tungus-Altaic 2.04
16 Arctic 1.44
17 Ancestral_Altaic 1.28
18 Archaic_Human 1.12
19 Amerindian 1.11


Finished reading population data. 620 populations found.
23 components mode.

--------------------------------

Least-squares method.

Using 1 population approximation:
1 Ayta_AE @ 24.783888
2 Nepalese @ 27.270012
3 Kensiu @ 29.925926
4 Tamil_Singapore @ 29.993927
5 Cochin_Jew @ 30.449663
6 Onge @ 31.218340
7 Pahari @ 31.865376
8 Mumbai_Jew @ 33.207047
9 Dhaka_mixed_popul @ 33.615238
10 Hindi @ 34.281342
11 Uygur-Han @ 34.523560
12 Jatt_Haryana @ 34.819286
13 Tiwari @ 35.455795
14 Pakistani_Pushtun @ 35.725113
15 Marathi @ 35.728867
16 Jatt_Muslim @ 35.853012
17 Mamanawa @ 36.317513
18 Vaish @ 36.851608
19 Brahmins_UP @ 36.884640
20 Spiti @ 37.032146

Using 2 populations approximation:
1 50% Onge +50% Puerto_Rican @ 13.927173


Using 3 populations approximation:
1 50% Ayta_AE +25% Hakkipikki +25% Puerto_Rican @ 9.896082(комбинации по четыре что-то не хочет показывать)

[Asmat headhunter]

По Вереничу наиболее схожими с ним получились филиппинские негритосы

Да опять же какая-то общая "архаика", а не конкретная близость, нэ?

[Srkz]

Да опять же какая-то общая "архаика", а не конкретная близость, нэ?

Да, конечно

[митохондрия]

По Вереничу наиболее схожими с ним получились филиппинские негритосы

С Усть-Ишимцем?

[Srkz]

С Усть-Ишимцем?

Да. Наконец досчиталась для него IBD-карта (хотя не знаю, насколько здесь можно говорить про IBD)

[varang]

С Усть-Ишимцем?

Да. Наконец досчиталась для него IBD-карта (хотя не знаю, насколько здесь можно говорить про IBD)

местный)))

[Srkz]

местный)))

Даже удивительно )). Особых-то и не видно предпосылок для этого (разве что положение на PCA)

[Murzalar]

С Усть-Ишимцем?

Да. Наконец досчиталась для него IBD-карта (хотя не знаю, насколько здесь можно говорить про IBD)

Ближе чем зеленее?

[Srkz]

Ближе чем зеленее?

Зеленее-дальше, то есть башкиры получились одними из (относительно) ближайших родственников.