АвторТема: К вопросу о геохронологическом датировании предков якутов  (Прочитано 36117 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн Valery

  • Сообщений: 5522
  • Страна: 00
  • Рейтинг +435/-6
  • Ultimate Matriarchy
Михаил, в данном случае ситуация не зависит от метрики: что бесконечная что пошаговая модели дают одинаковые деревья для этих трех гаплотипов.

Оффлайн Mich Glitch

  • Genus regis
  • Сообщений: 31547
  • Страна: ca
  • Рейтинг +2366/-40
  • Y-ДНК: J2b1
  • мтДНК: H6a1a5
Блин, запутался в трёх соснах.
Или, шёл в комнату и по своему обыкновению попал в другую.
Ну конечно же филип считает всё по матрице.
Как Валерий совершенно справедливо заметил, что посеешь, то и пожнёшь.
Просто используемая мной утилита генерирует для филипа файл только по бесконечной модели. А вот гендистанции может просчитывать разно.
Я как плохой студент на экзамене: помнил, помнил и забыл.  :-[

Оффлайн VovanX

  • Группа: ученые-генетики
  • Сообщений: 76
  • Рейтинг +26/-0
  • пляшите с бубном правильно!
  • Y-ДНК: I2a2-M423
Uvazhaemyj AnTur!
Po povodu kto kogo uchil...
Menia uchili ludi, kotorye prekrasno razbiralis v biostatistike i molecularnoi genetike + mehanizmah vozniknovenija mutacii v STR. I ya byl horoshim uchenikom. Menia priznatsa umiliaet takaja pozicija otricaniya kompetentnogo mnenija specialistov. Tipa vse duraki, a ya vot uzrel istinu. Tak ne to chtoby ne byvaet, no prosto ochen redko i eto sovsem ne tot sluchai. S yakutskim osnovatelem vso davno yasno. On byl 1. Datirovki eto spornyj vopros.

MUTACIJ MEZHDU 3 GAPLOTIPAMI BYLO 2. VSEGO 2 POVTORIAJU ESCHO RAZ.

Otricanie etogo - libo neponiatnyj kich na dannoj arene, libo polnejshee neponimanie elementarnyh osnov v genetike.

Nichego lichnogo, no prosto chtoby ludi v zabluzhdenie ne vpadali.

Оффлайн Valery

  • Сообщений: 5522
  • Страна: 00
  • Рейтинг +435/-6
  • Ultimate Matriarchy
Цитировать
S yakutskim osnovatelem vso davno yasno. On byl 1

А это основано на каких-то еще соображениях, кроме У? Или есть аккуратные филогенетические доказательства что У-ки сходятся внутри якутской популяции?

Оффлайн Mich Glitch

  • Genus regis
  • Сообщений: 31547
  • Страна: ca
  • Рейтинг +2366/-40
  • Y-ДНК: J2b1
  • мтДНК: H6a1a5
А есть что-нибудь по якутам с использованием иллюминовской мультиснип-панели?
АнТюр, вот тут (ссылка на тему) образчики интерпретаций.
Немного другая парадигма. Берётся не одна прямая линия, а целая совокупность, характеризующая суммарный этно-генетический портрет.
Подобно тому, как это делается по STR аутосомным маркерам.
Этно-пулы, очень внятно и логично выраженные, расположены по соседству с родственными этносами.
Кроме того, подобно тому, как происходит количественная оценка степени родства для двух отдельно взятых персон (ссылка, кликайте!), возможна хронологическая оценка разбегания-сходимости этно групп.

Оффлайн АнТюрАвтор темы

  • Сообщений: 597
  • Рейтинг +50/-121
А есть что-нибудь по якутам с использованием иллюминовской мультиснип-панели?
АнТюр, вот тут (ссылка на тему) образчики интерпретаций.
Немного другая парадигма. Берётся не одна прямая линия, а целая совокупность, характеризующая суммарный этно-генетический портрет.
Подобно тому, как это делается по STR аутосомным маркерам.
Этно-пулы, очень внятно и логично выраженные, расположены по соседству с родственными этносами.
Кроме того, подобно тому, как происходит количественная оценка степени родства для двух отдельно взятых персон (ссылка, кликайте!), возможна хронологическая оценка разбегания-сходимости этно групп.

Спасибо за ссылку. Впечатляет.

P/S/
////Вот мой отчет. Этот парень не еврей!////

Вас обманывают. Судя по диаграммам, этот парень левит ашкенази. Об этом свидетельствуе и его высочайший интеллектуальный уровень

Оффлайн Mich Glitch

  • Genus regis
  • Сообщений: 31547
  • Страна: ca
  • Рейтинг +2366/-40
  • Y-ДНК: J2b1
  • мтДНК: H6a1a5
////Вот мой отчет. Этот парень не еврей!////

Вас обманывают. Судя по диаграммам, этот парень левит ашкенази. Об этом свидетельствуе и его высочайший интеллектуальный уровень
:)

Оффлайн Каржавин

  • ...
  • Сообщений: 1936
  • Рейтинг +144/-2
Немного другая парадигма. Берётся не одна прямая линия, а целая совокупность, характеризующая суммарный этно-генетический портрет.
Подобно тому, как это делается по STR аутосомным маркерам.
Этно-пулы, очень внятно и логично выраженные, расположены по соседству с родственными этносами.
Кроме того, подобно тому, как происходит количественная оценка степени родства для двух отдельно взятых персон (ссылка, кликайте!), возможна хронологическая оценка разбегания-сходимости этно групп.
Да-а-а... впечатляет. Давно печенками чую, что будущее за сшивкой данных по гаплогруппам и аутосомам. Но как их совместить в единую методу, пока не совсем ясно. Но способ должен быть, однозначно! Геном ведь един, а это мы делим его на части и изучаем изолированно каждую из них.

Оффлайн Mich Glitch

  • Genus regis
  • Сообщений: 31547
  • Страна: ca
  • Рейтинг +2366/-40
  • Y-ДНК: J2b1
  • мтДНК: H6a1a5
Будущее за полным геномом. Вот и АйБиЭм уже подключилось к гонке за полный тест по 1000 долларов. Пока всё сделают, так и доллар подобесценится.
А сравнение панелек уже вовсю развивается. Как по УПСам, так и по общей похожести.
Годика через три расчёты по игреку будут лишь частным (самым простым и доступным) случаем.

Оффлайн Mich Glitch

  • Genus regis
  • Сообщений: 31547
  • Страна: ca
  • Рейтинг +2366/-40
  • Y-ДНК: J2b1
  • мтДНК: H6a1a5
Аутосомы (STRы) удобны лишь тем, что сам процесс анализа - наипростейший. Выполняется даже на портативной аппаратуре в полевых условиях.
Ну, и конечно база огромная. Больше 5 миллионов у одного только американского ФБР!

Оффлайн Mich Glitch

  • Genus regis
  • Сообщений: 31547
  • Страна: ca
  • Рейтинг +2366/-40
  • Y-ДНК: J2b1
  • мтДНК: H6a1a5
УПСы сейчас считают по следующему выражению:


Объяснялки тут (ссылка).
А аббревиатуру HIR, также как и УПС, придумал наш паровоЗ.
Можно сказать, в историю вошёл.  :o
Все многочисленные клёцки - уже отработанный шлак переходного периода. Три же весёлых буквы (как по-русски, так и по-англицки), ещё долго будут в ходу.

Мо-ло-дец!!! :)

Оффлайн VovanX

  • Группа: ученые-генетики
  • Сообщений: 76
  • Рейтинг +26/-0
  • пляшите с бубном правильно!
  • Y-ДНК: I2a2-M423
Imel v vidu tolko Y. Konkretno -  specifik klaster N1c.
po Illumine u Yakutov svoe oblachko na grafike PC, primerno kak v rabotah po Europe.

Оффлайн Nimissin

  • Сообщений: 2076
  • Рейтинг +526/-0
  • Y-ДНК: N-M178 L839+ P298+ M2019+ M2118+ M1991+ M1988+
  • мтДНК: C4b4
Из абстрактов докладов на
European Human Genetics Conference 2012


Title:  P10.34 - Genetic history of “Yakut” diseases 

Keywords: isolated populations; genetic diversity; ethnic-specific diseases 

Authors: V. A. Stepanov1, N. Maximova2, V. Kharkov1, K. Kurtanov2, A. Marussin1;
1Institute for Medical Genetics, Tomsk, Russian Federation, 2Yakut Scientific Centre, Yakutsk, Russian Federation. 

Abstract: The phenomenon of accumulation of rare genetic diseases in isolated populations with founder effect is well known. French Canadians, Ashkenazi Jews, Finns, Afrikaners are among the examples. In Siberian Russia the Yakut population is characterized by the accumulation of several monogenic disorders with the prevalence in Yakuts more than ten times higher that anywhere in the World. Such diseases as spinocerebellar ataxia 1, myotonic dystrophy, inherited methemoglobinemia, oculopharyngeal muscular dystrophy (OPMD), Yakut short stature syndrome (3M syndrome) and recently described SCOP syndrome belong to the list of “Yakut” diseases.
We have investigated the genetic variability in Yakuts using Y-chromosomal, mtDNA, X-chromosomal markers and genome-wide SNPs, and found reduced genetic diversity associated with the bottleneck effect. This effect, according to phylogeny of specific Yakut Y-chromosomal lineages, is dated back to 11th - 12th centuries.
Haplotype analysis of CUL7 gene in 3M syndrome, NAG gene in SCOP syndrome and PABPN1 gene in OPMD suggested that the accumulation of the disorders in Yakuts was driven by two major events: a bottleneck about 1000 years ago, associated with the initial migration of ancestors of modern Yakuts from south to north;
and population expansion approximately 350 years ago when Yakuts extended from the central part into the territory of their modern settlement.
We suggest that research of Mendelian and common diseases in isolated Siberian populations may provide a new source of understanding of disease genetics, as well as improving the quality of health care to indigenous peoples. 


Бутылочное горлышко около 1000 лет назад у предков якутов подтверждается данными по специфическим генетическим заболеваниям, частота которых у якутов более чем в 10 раз выше среднемирового уровня.
Это четкое подтверждение правильности использования генеалогических скоростей мутаций против "популяционной скорости" 0.00069 на локус на поколение.

Оффлайн mouglley

  • ...
  • Сообщений: 7935
  • Страна: hr
  • Рейтинг +433/-7
  • Я знаю, что познаю всё.
    • Записки Маугли
  • Y-ДНК: N1c1-L1025
  • мтДНК: J1c3
Не. Авторы, наоборот, обосновали время увеличения количества генетических заболеваний датировкой Y-DNA.
Как мы знаем, Владимир Харьков давно уже приглядывался к генеалогическим скоростям.

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.


Rambler's Top100