АвторТема: Возраст субклада G2a  (Прочитано 10259 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн FarroukhАвтор темы

  • Maternal Y-DNA: R1b-L584
  • ...
  • Сообщений: 11261
  • Страна: az
  • Рейтинг +2014/-15
  • Paternal Mt-DNA: M9a1b1
    • Azerbaijan DNA Project
  • Y-ДНК: E-Y37093
  • мтДНК: F2f
Возраст субклада G2a
« : 03 Октябрь 2009, 23:41:12 »
В целях подготовки материала к очередной статье прошу сообщить возраст этой гаплогруппы. Её предположительные носители 3-4 тыс. лет назад - арии, тохары, "древнеевропейцы", хуррито-урарты, хатты.
« Последнее редактирование: 24 Декабрь 2011, 19:48:09 от Михаил Ночевной »

Оффлайн Овод

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 2158
  • Рейтинг +390/-3
  • Omnia mea mecum porto
  • Y-ДНК: R1a-M198
  • мтДНК: U4a
Re: Возраст субклада G2a
« Ответ #1 : 03 Октябрь 2009, 23:45:11 »
Чего бы попроще спросили ... Никто не знает.
 
Разве что Клёсов вроде считал, только не возраст ветви, а ВЖОП. В Европе и на Кавказе.

Оффлайн FarroukhАвтор темы

  • Maternal Y-DNA: R1b-L584
  • ...
  • Сообщений: 11261
  • Страна: az
  • Рейтинг +2014/-15
  • Paternal Mt-DNA: M9a1b1
    • Azerbaijan DNA Project
  • Y-ДНК: E-Y37093
  • мтДНК: F2f
Re: Возраст субклада G2a
« Ответ #2 : 03 Октябрь 2009, 23:47:38 »
Чёрт, понаписано столько статей, а возраст гаплогруппы (вторая по важности характеристика) так никто и не сосчитал... Овод, не в курсе, какое там ВЖОП получилось у Клёсова?

Оффлайн Овод

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 2158
  • Рейтинг +390/-3
  • Omnia mea mecum porto
  • Y-ДНК: R1a-M198
  • мтДНК: U4a
Re: Возраст субклада G2a
« Ответ #3 : 03 Октябрь 2009, 23:55:59 »
На Кавказе получался совсем небольшой, порядка 500 лет (но учтите, что там все G были заперты намертво в ущельях во время тюркской экспансии - то есть был сумашедший дрейф).
 
В Европе постарше - около 1200, по-моему. Ой, боюсь я Вам цифры и субклады  называть по памяти - лучше у Клёсова спросите на Родстве - он нормальный мужик, если с ним по делу. Подождите только чуток.
 
Не сочтите за рекламу сайта.

P.S. А как его считать - истинный возраст гаплогруппы? Нет такой методики. Пыталась Татьяна Карафе считать по основным кладам на множестве снипов...но продолжения это не получило - больно редкие это события.
« Последнее редактирование: 04 Октябрь 2009, 00:02:06 от Овод »

Оффлайн Centurion

  • 100% Earth (Solar System) genofond
  • Администратор
  • *****
  • Сообщений: 10074
  • Страна: ru
  • Рейтинг +566/-2
Re: Возраст субклада G2a
« Ответ #4 : 04 Октябрь 2009, 00:11:40 »
Можно попробывать спросить напрямую у Татьяны Карафет (http://forum.molgen.org/index.php/topic,222.0.html)

у Дениса есть эл. адрес

Оффлайн FarroukhАвтор темы

  • Maternal Y-DNA: R1b-L584
  • ...
  • Сообщений: 11261
  • Страна: az
  • Рейтинг +2014/-15
  • Paternal Mt-DNA: M9a1b1
    • Azerbaijan DNA Project
  • Y-ДНК: E-Y37093
  • мтДНК: F2f
Re: Возраст субклада G2a
« Ответ #5 : 04 Октябрь 2009, 00:13:11 »
Да, и хотелось бы узнать о методе, по какому считали.

Оффлайн Valery

  • Сообщений: 5523
  • Страна: 00
  • Рейтинг +445/-6
  • Ultimate Matriarchy
Re: Возраст субклада G2a
« Ответ #6 : 04 Октябрь 2009, 00:17:04 »
Можно попробывать спросить напрямую у Татьяны Карафет (http://forum.molgen.org/index.php/topic,222.0.html)

у Дениса есть эл. адрес


лучше по-английски, а то ТК не поймет что такое ВЖОП

Оффлайн Овод

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 2158
  • Рейтинг +390/-3
  • Omnia mea mecum porto
  • Y-ДНК: R1a-M198
  • мтДНК: U4a
Re: Возраст субклада G2a
« Ответ #7 : 04 Октябрь 2009, 00:19:42 »
Да, и хотелось бы узнать о методе, по какому считали.

Метод прост - много снипов (тысячи). Возраст ветви - пропорционально количеству снипов на ней. Проблемы с калибровкой - калибровала по возрасту "Адама". Но G2a там нет и в помине, даже G нет. Только некоторые основные клады, наиболее попсовые. Я за ней следил с того момента, но продолжения не видал. Всё-же спросите - может в работе что есть ...
« Последнее редактирование: 04 Октябрь 2009, 00:32:03 от Овод »

Оффлайн Centurion

  • 100% Earth (Solar System) genofond
  • Администратор
  • *****
  • Сообщений: 10074
  • Страна: ru
  • Рейтинг +566/-2
Re: Возраст субклада G2a
« Ответ #8 : 04 Октябрь 2009, 00:23:34 »
CT 70,000
CF 68,900 (64,600–69,900)
DE 65,000 (59,100–68,300)
E 52,500 (44,600–58,900)
E1b1 47,500 (39,300–54,700)
F 48,000 (38,700–55,700)
IJ 38,500 (30,500–46,200)
I 22,200 (15,300–30,000)
K 47,400 (40,000–53,900)
P 34,000 (26,600–41,400)
R 26,800 (19,900–34,300)
R1 18,500 (12,500–25,700)

http://genome.cshlp.org/content/early/2008/04/02/gr.7172008.full.pdf+html

Оффлайн Clavis

  • Сообщений: 1543
  • Страна: ru
  • Рейтинг +102/-0
  • y+mito-search: RK448
    • Семёнов Михаил Юрьевич домашняя страничка
  • Y-ДНК: G2a2b2a1a1a2a (L1264+)
  • мтДНК: HV9, ранее известная как HV3a
Re: Возраст субклада G2a
« Ответ #9 : 04 Октябрь 2009, 18:14:41 »
У меня в одной из подборок G-гаплотипы по 66-69 маркеров расположены в порядке роста расстояния от гаплотипа Сталина. Я посмотрел, где примерно заканчиваются G2a и начинаются G1a, а также G2c. Этот рубеж (он, конечно, размытый) примерно соответствует 0,76 мутаций/маркер, или TMRCA (ВЖОП) 6800-6900 лет. Я считал, взяв у Клесова среднюю по 67 скорость 1 мутация за 460 поколений по 25 лет/маркер, естественно, с учетом обратных, что дает формулу TMRCA (в годах) = 2423,3 x3 +2429 x2 +5754 x,
где x - число мутаций на маркер между Сталиным и его отдаленным родственником.
Конкретно, я провел границу между Giles Mills (G1a) и  Seth Rodgers (G2a), но Вы можете взять у меня файл и провести по своему усмотрению.
« Последнее редактирование: 04 Октябрь 2009, 18:20:42 от Clavis »

Оффлайн FarroukhАвтор темы

  • Maternal Y-DNA: R1b-L584
  • ...
  • Сообщений: 11261
  • Страна: az
  • Рейтинг +2014/-15
  • Paternal Mt-DNA: M9a1b1
    • Azerbaijan DNA Project
  • Y-ДНК: E-Y37093
  • мтДНК: F2f
Re: Возраст субклада G2a
« Ответ #10 : 04 Октябрь 2009, 22:46:42 »
Клавис, вы могли бы примерно дать прогноз, какие субклады G могли быть на Ближнем Востоке 5-6 тыс. лет назад?

Оффлайн Sergey Lutak

  • Сообщений: 1024
  • Страна: 00
  • Рейтинг +62/-0
  • Carpatho-Rusyn-E1b1b1a1b1a and East.Galindian-H1b*
  • Y-ДНК: E1b1b1a1b1a10 (L142.1+, L539+, L542+, L544+, L618+, L930+, M78+, V13+, V36+, FGC11451+, CTS1489-, L17-, L99-, L143-, L241-, L250-, L540-, P65-, V12-, V22-, V27-, FGC11450-)
  • мтДНК: H1b* (16189C, 16356C, 16519C, 263G, 315.1C)
Re: Возраст субклада G2a
« Ответ #11 : 05 Октябрь 2009, 11:00:12 »
Да, и хотелось бы узнать о методе, по какому считали.

Метод прост - много снипов (тысячи). Возраст ветви - пропорционально количеству снипов на ней. Проблемы с калибровкой - калибровала по возрасту "Адама".
...

Как я понимаю, калибровали по возрасту общего предка макрогаплогруппы CT, т.е. "Евразийского Адама".
Во всяком случае так следует из оригинального текста:

"The time to the most recent common ancestral Y chromosome and the estimated ages of 11 major clades are presented in Table 2. To provide estimates of the age of the nodes, we chose to fix the time to the most recent common ancestor of CT (defined by P9.1, M168, and M294) at 70 thousand years ago (Kya), which is consistent with previous estimates from genetic and archaeological data (Lahr and Foley 1998; Hammer and Zegura 2002; Macaulay et al. 2005), and is the chronological approximation given in Jobling et al. (2004) (p250) for the first major human out-of-Africa dispersals. We estimated the times for intermediate nodes by using a linear interpolation. The age estimates in years should be viewed with caution because we do not know if the calibration date chosen above is accurate."

Т.е. "приняли на веру" оценку возраста макрогаплогруппы CT и предполагаемого исхода из Африки некоторых предшествующих авторов и от этого "плясали" назад, к современности, ориентируясь на число мутаций в ветвях.

Оффлайн Овод

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 2158
  • Рейтинг +390/-3
  • Omnia mea mecum porto
  • Y-ДНК: R1a-M198
  • мтДНК: U4a
Re: Возраст субклада G2a
« Ответ #12 : 05 Октябрь 2009, 14:57:48 »
Совершенно справедливое уточнение, уважаемый Сергей. Поэтому и написал - "с калибровкой - проблемы". Так, как возраст ни одного из "Адамов" - африканского, евразийского, или "арийского" или любого другого с достаточной точностью независимыми методами не определяется - привязка к любому из них будет давать систематическое смещение в абюсолютном датировании.
 
Но и относительные возраста у Карафэ подвержены, если не систематической ошибке, то большому статразбросу. Причина - редкость снипов и отсюда - малое их количество в ветвях. Также - ничтожность выборки.
 
Тем не менее, считаю такой подход наиболее перспективным из существующих. Стоимость подробного секвентирования Y-хромосомы стремительно уменьшается, количество обследованных - растёт. Возможно, что уже в ближайшие год-два по этому методу будет возможность посчитать не только возраст самых корневых и попсовых кладов, но и значительно более глубоких.
 
Об STR-филогиении для установления возраста гаплогрупп тогда можно будет забыть, как о страшном сне.

Оффлайн Clavis

  • Сообщений: 1543
  • Страна: ru
  • Рейтинг +102/-0
  • y+mito-search: RK448
    • Семёнов Михаил Юрьевич домашняя страничка
  • Y-ДНК: G2a2b2a1a1a2a (L1264+)
  • мтДНК: HV9, ранее известная как HV3a
Re: Возраст субклада G2a
« Ответ #13 : 05 Октябрь 2009, 16:10:32 »
Клавис, вы могли бы примерно дать прогноз, какие субклады G могли быть на Ближнем Востоке 5-6 тыс. лет назад?
Поскольку у меня в базе один раз мелькнула Иордания (или Саудовская Аравия?), то коммерческая база не дает никакой статистики по Ближнему востоку. Надо искать в научных статьях. Но там другая беда: нет длинных гаплотипов для расчета возраста. А расчет по 6 маркерам - это лучше сделает Клесов.

Оффлайн zastrug

  • ...
  • Сообщений: 10233
  • Страна: tt
  • Рейтинг +1667/-45
  • I2b1c (P78+)=I2a2a1b1a
  • Y-ДНК: I2b1c
  • мтДНК: T2a1a
Re: Возраст субклада G2a
« Ответ #14 : 05 Октябрь 2009, 16:16:47 »
Длинных нет, но по Ближнему Востоку(Сирия, Ливан, Иордания) было не менее 12 маркеров (точно не помню), я оттуда I  отбирал.

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.


Rambler's Top100