Субклад YP582

[ochkas]

Заказан BigY для IN35844 Achkasov, предки из Харьковской области. Выражаю огромную признательность администраторам проекта R1a-YP582 & Subclades за помощь в продолжении исследования. Пускай итоговый результат будет интересным и откроет новую ещё неизвестную подветвь)

[Виталий77]

насколько нужно BAM покупать в FTDNA?
Меня жаба душит ) платить 100 usd.

Исследование генетических данных в формате BAM предоставляет более полную информацию по сравнению с анализом файлов VCF. Это можно сравнить с аудиофильским опытом прослушивания музыки в несжатом формате по сравнению с MP3. Хотя многие люди могут не замечать разницы между высококачественным звуком и его сжатой версией, это не означает отсутствие различий. Сжатие в формате MP3 приводит к потере данных, которые могут быть критичны для звуковой детализации.

Рассмотрим более подробно вопрос сжатия в контексте аудиофайлов MP3. MP3 — это популярный формат аудиофайлов, который использует сжатие с потерями для уменьшения размера файла. Сжатие работает путем удаления тех частей звукового спектра, которые считаются менее важными или менее заметными для человеческого уха. Например, некоторые тихие звуки могут быть удалены, если они замаскированы более громкими звуками, процесс известный как аудио маскирование.

Степень сжатия файла MP3 может варьироваться, и чем выше степень сжатия, тем больше потерь качества звука и тем меньше размер файла. Это похоже на ситуацию с файлами BAM и VCF в генетическом секвенировании. BAM файлы содержат полные данные секвенирования, в то время как VCF файлы представляют собой сжатую версию, в которой сохранены только вариации, отфильтрованные определенными алгоритмами. Таким образом, анализируя файлы BAM, исследователи могут идентифицировать мелкие вариации, которые могут быть пропущены в процессе создания VCF.

Компания FTDNA ранее использовала порог в 10 (или 5?) чтений для включения данных в VCF файл, что приводило к потере значительного количества информации. Снижение этого порога позволило сохранить больше данных, но отбор регионов для анализа все еще происходит. Кроме того, алгоритмы могут отвергать определенные снипы, которые другие платформы, например YFull, могут считать значимыми. Это различие в интерпретации может привести к тому, что некоторые снипы, важные для различения близких генетических ветвей, останутся незамеченными при анализе VCF, но будут обнаружены при изучении BAM файлов.

[EWJGF]

Новый образец появился https://www.yfull.com/tree/R-YP5192/

[Andvari]

В свете недавно прозвучавшего доклада Вязова про раннеславянскую генетику, можно немного потеоретизировать. В этом докладе к раннеславянскому кластеру отнесен образец из Виминациума с YP578. Тот, который очень близок к TRMCA. Мне всегда интересно было, как в римский город попал этот образец. В докладе упоминают остатки гвоздей от калиг в его погребении, т.е. он скорее всего был солдатом, мб федератом каким. И также упоминается группа памятников типа Баранды в Банате. Их обычно относят к т.н. "сарматам-лимигантам", чья этническая принадлежность не ясна. Я нагуглил статью Обломского про эту группу памятников. Там делается вывод о близости группы Баранды к памятникам киевской и черняховской культур, а особенно памятникам Поднепровья и Верхнего Дона (Каширки-Сиделки). Т.е. получается занятно - наш предок или брат нашего предка пришел в Банат грубо говоря из Черноземья, где и сейчас живет множество представителей YP582-578. Конечно о преемственности населения с тех пор вряд ли приходится говорить, скорее всего после III века люди из нашей ветки где-то еще тусовались. Наверное их можно связывать в более поздними колочинцами и пеньковцами.

Ну это так, теоретизирование о вероятных вариантах. Верно оно или нет покажет дДНК,