АвторТема: Эксперименты Srkz с аутосомами  (Прочитано 147646 раз)

0 Пользователей и 2 Гостей просматривают эту тему.

Оффлайн SrkzАвтор темы

  • Сообщений: 8462
  • Страна: ru
  • Рейтинг +4812/-3
  • Y-ДНК: N-L1025 Y64023
  • мтДНК: U4a1-a C16134T
Re: Эксперименты Srkz с аутосомами
« Ответ #240 : 14 Октябрь 2014, 23:17:05 »
Например в дДНК аутосом древнего англо-саксонца совсем специфический аутосомный набор ... а ведь это уже наша эра ...при этом у него обнаружили около 5% именно восточно-азиатской составляющей (та что у китайцев, а не сибиряков!). Аутосомы бриттов более отличны без капли восточно-азиатской составляющей. А современные бритиши уже опять другие!
А где было про китайские 5%?

Оффлайн Eugene

  • Санктпетербурхъ
  • Сообщений: 6777
  • Страна: th
  • Рейтинг +1081/-41
    • N1c1 Y-DNA Project
  • Y-ДНК: N-BY32524
  • мтДНК: U-C1341T
Re: Эксперименты Srkz с аутосомами
« Ответ #241 : 14 Октябрь 2014, 23:31:53 »
Например в дДНК аутосом древнего англо-саксонца совсем специфический аутосомный набор ... а ведь это уже наша эра ...при этом у него обнаружили около 5% именно восточно-азиатской составляющей (та что у китайцев, а не сибиряков!). Аутосомы бриттов более отличны без капли восточно-азиатской составляющей. А современные бритиши уже опять другие!
А где было про китайские 5%?
По калькулятору K12b насчиталось
The East Asian component in the Anglo-Saxon is clear though, and even more pronounced here (4.8% instead of 2.2%). The best explanation is that the Huns contributed a few percent's of the Anglo-Saxon gene pool, or that this individual came from a family with an especially high Hunnic ancestry. I had theorised before that the Huns were the ones who brought haplogroup Q to Central Europe and Scandinavia. It is also possible that the Anglo-Saxon got some Mongoloid admixture from the Finns or Lapps, but that seems more far-fetched because modern Finns have exclusively Siberian admixture at the K12b, while this Anglo-Saxon guy has three times more East Asian than Siberian, which is an even higher proportion of East Asian than modern Mongols (36% Siberian, 45% East Asian).
http://www.eupedia.com/forum/threads/30542-Autosomal-analysis-of-the-genomes-of-an-Iron-Age-Briton-and-an-Anglo-Saxon

Оффлайн SrkzАвтор темы

  • Сообщений: 8462
  • Страна: ru
  • Рейтинг +4812/-3
  • Y-ДНК: N-L1025 Y64023
  • мтДНК: U4a1-a C16134T
Re: Эксперименты Srkz с аутосомами
« Ответ #242 : 14 Октябрь 2014, 23:42:19 »
У Поляко вышли оба образца без лишней Африки и Азии. Я думаю, там просто некорректности в обработке. Что касается сравнения с современными британцами, явный "эффект калькулятора".

Оффлайн SrkzАвтор темы

  • Сообщений: 8462
  • Страна: ru
  • Рейтинг +4812/-3
  • Y-ДНК: N-L1025 Y64023
  • мтДНК: U4a1-a C16134T
Re: Эксперименты Srkz с аутосомами
« Ответ #243 : 14 Октябрь 2014, 23:48:44 »
Образец 1 (предположительно древний бритт) по K15v2 Поляко:
Least-squares method.

Using 1 population approximation:
1 Orcadian @ 6,310456
2 West_Norwegian @ 7,764778
3 West_Scottish @ 8,003335
4 Danish @ 8,918701
5 North_Dutch @ 9,02229
6 Norwegian @ 9,459345
7 Irish @ 9,498097
8 Southeast_English @ 9,837863
9 Southwest_English @ 10,695088
10 Swedish @ 11,933384
11 North_German @ 13,145591
12 North_Swedish @ 14,602381
13 West_German @ 15,285463
14 South_Dutch @ 15,850018
15 French @ 19,919238
16 East_German @ 22,046491
17 Southwest_Finnish @ 22,255654
18 Finnish @ 25,467684
19 Hungarian @ 27,390931
20 Austrian @ 27,399206
206 iterations.

Using 2 populations approximation:
1 Orcadian+West_Norwegian @ 6,00839
2 Orcadian+Orcadian @ 6,310456
3 West_Norwegian+West_Scottish @ 6,615952
4 Norwegian+Orcadian @ 6,913345
5 Orcadian+West_Scottish @ 6,979403
6 Danish+Orcadian @ 7,206407
7 Southeast_English+West_Norwegian @ 7,270609
8 Irish+West_Norwegian @ 7,286018
9 North_Dutch+Orcadian @ 7,37601
10 Danish+West_Norwegian @ 7,552578
11 Southwest_English+West_Norwegian @ 7,615992
12 Norwegian+West_Scottish @ 7,675767
13 Irish+Orcadian @ 7,726669
14 West_Norwegian+West_Norwegian @ 7,764778
15 North_Dutch+West_Norwegian @ 7,839967
16 Orcadian+Southeast_English @ 7,87283
17 West_Scottish+West_Scottish @ 8,003335
18 Orcadian+Swedish @ 8,066304
19 Orcadian+Southwest_English @ 8,235863
20 Danish+West_Scottish @ 8,256907
21321 iterations.

Using 3 populations approximation:
1 50% Orcadian +25% Orcadian +25% West_Norwegian @ 5,87131
2 50% Orcadian +25% West_Norwegian +25% West_Scottish @ 6,148656
3 50% West_Norwegian +25% Orcadian +25% West_Scottish @ 6,255349
4 50% Orcadian +25% Norwegian +25% Orcadian @ 6,29238
5 50% Orcadian +25% Orcadian +25% Orcadian @ 6,310456
6 50% Orcadian +25% Danish +25% West_Norwegian @ 6,387293
7 50% Orcadian +25% Norwegian +25% West_Norwegian @ 6,427678
8 50% Orcadian +25% Irish +25% West_Norwegian @ 6,508409
9 50% Orcadian +25% Southeast_English +25% West_Norwegian @ 6,528562
10 50% West_Scottish +25% Orcadian +25% West_Norwegian @ 6,538534
11 50% West_Norwegian +25% Orcadian +25% Southeast_English @ 6,549881
12 50% Orcadian +25% North_Dutch +25% West_Norwegian @ 6,550398
13 50% West_Norwegian +25% Irish +25% Orcadian @ 6,57756
14 50% Orcadian +25% Orcadian +25% West_Scottish @ 6,592463
15 50% Orcadian +25% Norwegian +25% West_Scottish @ 6,617475
16 50% Orcadian +25% Danish +25% Orcadian @ 6,628689
17 50% Orcadian +25% Southwest_English +25% West_Norwegian @ 6,680669
18 50% West_Norwegian +25% Danish +25% Orcadian @ 6,680833
19 50% West_Norwegian +25% Orcadian +25% West_Norwegian @ 6,686348
20 50% West_Norwegian +25% Orcadian +25% Southwest_English @ 6,688314
1732261 iterations.

Using 4 populations approximation:
1 Orcadian+Orcadian+Orcadian+West_Norwegian @ 5,87131
2 Orcadian+Orcadian+West_Norwegian+West_Norwegian @ 6,00839
3 Orcadian+Orcadian+West_Norwegian+West_Scottish @ 6,148656
4 Orcadian+West_Norwegian+West_Norwegian+West_Scottish @ 6,255349
5 Norwegian+Orcadian+Orcadian+Orcadian @ 6,29238
6 Orcadian+Orcadian+Orcadian+Orcadian @ 6,310456
7 Danish+Orcadian+Orcadian+West_Norwegian @ 6,387293
8 Norwegian+Orcadian+Orcadian+West_Norwegian @ 6,427678
9 Irish+Orcadian+Orcadian+West_Norwegian @ 6,508409
10 Orcadian+Orcadian+Southeast_English+West_Norwegian @ 6,528562
11 Orcadian+West_Norwegian+West_Scottish+West_Scottish @ 6,538534
12 Orcadian+Southeast_English+West_Norwegian+West_Norwegian @ 6,549881
13 North_Dutch+Orcadian+Orcadian+West_Norwegian @ 6,550398
14 Irish+Orcadian+West_Norwegian+West_Norwegian @ 6,57756
15 Orcadian+Orcadian+Orcadian+West_Scottish @ 6,592463
16 West_Norwegian+West_Norwegian+West_Scottish+West_Scottish @ 6,615952
17 Norwegian+Orcadian+Orcadian+West_Scottish @ 6,617475
18 Danish+Orcadian+Orcadian+Orcadian @ 6,628689
19 Orcadian+Orcadian+Southwest_English+West_Norwegian @ 6,680669
20 Danish+Orcadian+West_Norwegian+West_Norwegian @ 6,680833
21 Orcadian+West_Norwegian+West_Norwegian+West_Norwegian @ 6,686348
22 Orcadian+Southwest_English+West_Norwegian+West_Norwegian @ 6,688314
23 Norwegian+Orcadian+West_Norwegian+West_Scottish @ 6,723611
24 North_Dutch+Orcadian+Orcadian+Orcadian @ 6,749972
25 Orcadian+Orcadian+Orcadian+Swedish @ 6,777274
26 Danish+Orcadian+West_Norwegian+West_Scottish @ 6,780095
27 North_Swedish+Orcadian+Orcadian+Orcadian @ 6,788594
28 North_Dutch+Orcadian+West_Norwegian+West_Norwegian @ 6,872507
29 West_Norwegian+West_Norwegian+West_Norwegian+West_Scottish @ 6,887007
30 North_Dutch+Orcadian+West_Norwegian+West_Scottish @ 6,899021
31 Danish+Norwegian+Orcadian+Orcadian @ 6,903397
32 Southeast_English+West_Norwegian+West_Norwegian+West_Scottish @ 6,904047
33 Irish+Orcadian+West_Norwegian+West_Scottish @ 6,90489
34 Orcadian+Southeast_English+West_Norwegian+West_Scottish @ 6,905945
35 Norwegian+Norwegian+Orcadian+Orcadian @ 6,913345
36 Irish+West_Norwegian+West_Norwegian+West_Scottish @ 6,948192
37 Irish+Orcadian+Orcadian+Orcadian @ 6,959348
38 Irish+Norwegian+Orcadian+Orcadian @ 6,976952
39 Orcadian+Orcadian+West_Scottish+West_Scottish @ 6,979403
40 Orcadian+Orcadian+Swedish+West_Norwegian @ 7,003043
17008667 iterations.

Образец 2 (предположительно англосакс)
Least-squares method.

Using 1 population approximation:
1 Orcadian @ 8,657079
2 West_Norwegian @ 9,467307
3 West_Scottish @ 9,784124
4 Danish @ 11,012201
5 Irish @ 11,212598
6 North_Dutch @ 11,238954
7 Norwegian @ 11,55229
8 Southeast_English @ 12,242563
9 Swedish @ 13,559232
10 Southwest_English @ 13,653885
11 North_German @ 15,297213
12 North_Swedish @ 16,251427
13 West_German @ 18,590953
14 South_Dutch @ 18,953883
15 French @ 23,283676
16 Southwest_Finnish @ 23,750605
17 East_German @ 24,815895
18 Finnish @ 26,988962
19 Austrian @ 29,902255
20 Hungarian @ 30,08349
206 iterations.

Using 2 populations approximation:
1 Orcadian+West_Norwegian @ 8,26628
2 West_Norwegian+West_Scottish @ 8,618453
3 Orcadian+Orcadian @ 8,657079
4 Orcadian+West_Scottish @ 9,061539
5 Irish+West_Norwegian @ 9,247128
6 Norwegian+Orcadian @ 9,345802
7 West_Norwegian+West_Norwegian @ 9,467307
8 Danish+Orcadian @ 9,505607
9 Danish+West_Norwegian @ 9,621495
10 Southeast_English+West_Norwegian @ 9,699445
11 North_Dutch+Orcadian @ 9,717165
12 Irish+Orcadian @ 9,747679
13 West_Scottish+West_Scottish @ 9,784124
14 Norwegian+West_Scottish @ 9,835819
15 North_Dutch+West_Norwegian @ 9,929266
16 Orcadian+Swedish @ 10,16614
17 Danish+West_Scottish @ 10,240949
18 Orcadian+Southeast_English @ 10,30007
19 North_Dutch+West_Scottish @ 10,34457
20 Southwest_English+West_Norwegian @ 10,425652
21321 iterations.

Using 3 populations approximation:
1 50% Orcadian +25% Orcadian +25% West_Norwegian @ 8,255252
2 50% West_Norwegian +25% Orcadian +25% West_Scottish @ 8,396319
3 50% Orcadian +25% West_Norwegian +25% West_Scottish @ 8,40363
4 50% West_Scottish +25% Orcadian +25% West_Norwegian @ 8,64324
5 50% Orcadian +25% Orcadian +25% Orcadian @ 8,657079
6 50% West_Norwegian +25% Orcadian +25% West_Norwegian @ 8,688592
7 50% West_Norwegian +25% Irish +25% Orcadian @ 8,694324
8 50% Orcadian +25% Danish +25% West_Norwegian @ 8,724962
9 50% Orcadian +25% Irish +25% West_Norwegian @ 8,725401
10 50% Orcadian +25% Norwegian +25% Orcadian @ 8,771002
11 50% Orcadian +25% Norwegian +25% West_Norwegian @ 8,786649
12 50% West_Norwegian +25% West_Norwegian +25% West_Scottish @ 8,795077
13 50% Orcadian +25% Orcadian +25% West_Scottish @ 8,816001
14 50% West_Norwegian +25% Danish +25% Orcadian @ 8,860853
15 50% Orcadian +25% North_Dutch +25% West_Norwegian @ 8,88999
16 50% West_Norwegian +25% Orcadian +25% Southeast_English @ 8,923284
17 50% West_Norwegian +25% Irish +25% West_Scottish @ 8,929865
18 50% Orcadian +25% Norwegian +25% West_Scottish @ 8,959103
19 50% West_Scottish +25% West_Norwegian +25% West_Scottish @ 8,96677
20 50% Orcadian +25% Danish +25% Orcadian @ 8,984054
2082343 iterations.

Using 4 populations approximation:
1 Orcadian+Orcadian+Orcadian+West_Norwegian @ 8,255252
2 Orcadian+Orcadian+West_Norwegian+West_Norwegian @ 8,26628
3 Orcadian+West_Norwegian+West_Norwegian+West_Scottish @ 8,396319
4 Orcadian+Orcadian+West_Norwegian+West_Scottish @ 8,40363
5 West_Norwegian+West_Norwegian+West_Scottish+West_Scottish @ 8,618453
6 Orcadian+West_Norwegian+West_Scottish+West_Scottish @ 8,64324
7 Orcadian+Orcadian+Orcadian+Orcadian @ 8,657079
8 Orcadian+West_Norwegian+West_Norwegian+West_Norwegian @ 8,688592
9 Irish+Orcadian+West_Norwegian+West_Norwegian @ 8,694324
10 Danish+Orcadian+Orcadian+West_Norwegian @ 8,724962
11 Irish+Orcadian+Orcadian+West_Norwegian @ 8,725401
12 Norwegian+Orcadian+Orcadian+Orcadian @ 8,771002
13 Norwegian+Orcadian+Orcadian+West_Norwegian @ 8,786649
14 West_Norwegian+West_Norwegian+West_Norwegian+West_Scottish @ 8,795077
15 Orcadian+Orcadian+Orcadian+West_Scottish @ 8,816001
16 Danish+Orcadian+West_Norwegian+West_Norwegian @ 8,860853
17 North_Dutch+Orcadian+Orcadian+West_Norwegian @ 8,88999
18 Orcadian+Southeast_English+West_Norwegian+West_Norwegian @ 8,923284
19 Irish+West_Norwegian+West_Norwegian+West_Scottish @ 8,929865
20 Norwegian+Orcadian+West_Norwegian+West_Scottish @ 8,957412
21 Norwegian+Orcadian+Orcadian+West_Scottish @ 8,959103
22 West_Norwegian+West_Scottish+West_Scottish+West_Scottish @ 8,96677
23 Danish+Orcadian+West_Norwegian+West_Scottish @ 8,968571
24 Irish+Orcadian+West_Norwegian+West_Scottish @ 8,977131
25 Danish+Orcadian+Orcadian+Orcadian @ 8,984054
26 Orcadian+Orcadian+Southeast_English+West_Norwegian @ 8,988461
27 North_Dutch+Orcadian+West_Norwegian+West_Norwegian @ 9,050375
28 Irish+West_Norwegian+West_Norwegian+West_Norwegian @ 9,056929
29 Orcadian+Orcadian+West_Scottish+West_Scottish @ 9,061539
30 Danish+West_Norwegian+West_Norwegian+West_Scottish @ 9,084052
31 Orcadian+Orcadian+Orcadian+Swedish @ 9,090412
32 North_Dutch+Orcadian+West_Norwegian+West_Scottish @ 9,102683
33 North_Dutch+Orcadian+Orcadian+Orcadian @ 9,117708
34 Southeast_English+West_Norwegian+West_Norwegian+West_Scottish @ 9,139368
35 Irish+Orcadian+Orcadian+Orcadian @ 9,146148
36 Orcadian+Orcadian+Swedish+West_Norwegian @ 9,181531
37 Norwegian+Orcadian+West_Norwegian+West_Norwegian @ 9,190102
38 Norwegian+West_Norwegian+West_Scottish+West_Scottish @ 9,212928
39 Orcadian+Southeast_English+West_Norwegian+West_Scottish @ 9,219573
40 North_Swedish+Orcadian+Orcadian+Orcadian @ 9,227525
22966962 iterations.

North_Sea    Atlantic     Baltic     Eastern_Euro     West_Med     West_Asian     East_Med     Red_Sea     South_Asian     Southeast_Asian     Siberian     Amerindian     Oceanian     Northeast_African     Sub-Saharan
Hinxton1 42.96 28.86 6.47 12.22 6.77 1.74 0.01 0.97 0 0 0 0 0 0 0
Hinxton2 45.05 31.08 7.2 12.1 4.19 0.4 0 0 0 0 0 0 0 0 0
Norwegian 39,74 23,47 13,26 11,48 6,36 2,24 0,8 0,14 0,81 0,08 0,5 0,72 0,32 0,06 0,04
Orcadian 39,61 29,00666667 8,613333333 8,083333333 7,37 3,666666667 0,646666667 0,23 1,046666667 0,046666667 0,446666667 0,243333333 0,416666667 0,056666667 0,516666667
Southeast_English 35,52 29,86 9,89 8,36 8,77 3,35 2,5 0,33 0,58 0,03 0,05 0,35 0,31 0,06 0,03
Southwest_English 35,22 28,94 9,69 8,02 11,16 3,55 1,82 0,59 0,54 0,05 0,03 0,07 0,19 0,11 0,03

Более высокий "германский" North_Sea по сравнению с современными выборками. Видимо, с тех пор он подразмылся и поэтому идеального попадания не происходит. Зато добавились "средиземноморские" компоненты. Кстати, и у кельта их больше, чем у англосакса, все логично.

Бедняга Поляко похоже на себе рвет волосы от того, что там нес Maciamo ;D http://eurogenes.blogspot.com.au/2014/10/ancient-genomes-and-calculator-effect.html

« Последнее редактирование: 15 Октябрь 2014, 00:07:33 от Srkz »

Оффлайн Eugene

  • Санктпетербурхъ
  • Сообщений: 6777
  • Страна: th
  • Рейтинг +1081/-41
    • N1c1 Y-DNA Project
  • Y-ДНК: N-BY32524
  • мтДНК: U-C1341T
Re: Эксперименты Srkz с аутосомами
« Ответ #244 : 15 Октябрь 2014, 09:19:46 »
Бедняга Поляко похоже на себе рвет волосы от того, что там нес Maciamo ;D http://eurogenes.blogspot.com.au/2014/10/ancient-genomes-and-calculator-effect.html
Ну Масиама все таки на калькулятор опирался.  :)
Кто ж знал кроме Вас какой наджный кулькулятор, а какой нет ... да еще и в каком случае.

П.С. В общем Вы все интригу с англо-саксом разрушили  ;D

Оффлайн SrkzАвтор темы

  • Сообщений: 8462
  • Страна: ru
  • Рейтинг +4812/-3
  • Y-ДНК: N-L1025 Y64023
  • мтДНК: U4a1-a C16134T
Re: Эксперименты Srkz с аутосомами
« Ответ #245 : 15 Октябрь 2014, 09:36:42 »
Ну Масиама все таки на калькулятор опирался.  :)
Ладно бы человек просто получил некорректные результаты, он потом их упорно защищал, отбрасывая правильные :D

Оффлайн Eugene

  • Санктпетербурхъ
  • Сообщений: 6777
  • Страна: th
  • Рейтинг +1081/-41
    • N1c1 Y-DNA Project
  • Y-ДНК: N-BY32524
  • мтДНК: U-C1341T
Re: Эксперименты Srkz с аутосомами
« Ответ #246 : 15 Октябрь 2014, 11:03:43 »
Сергей,
А что будет если на меньшее число компонент "препарировть" данных англо-сакса и бритта?
Например на 6-10

Оффлайн SrkzАвтор темы

  • Сообщений: 8462
  • Страна: ru
  • Рейтинг +4812/-3
  • Y-ДНК: N-L1025 Y64023
  • мтДНК: U4a1-a C16134T
Re: Эксперименты Srkz с аутосомами
« Ответ #247 : 15 Октябрь 2014, 12:23:06 »
Сергей,
А что будет если на меньшее число компонент "препарировть" данных англо-сакса и бритта?
Например на 6-10
Их, оказывается, выложили на Gedmatch http://www.y-str.org/2014/10/hinxton-dna.html
Первый слишком низкого качества
Второй F999921
Третий F999922

UPD что-то Gedmatch таких китов не видит

Оффлайн SrkzАвтор темы

  • Сообщений: 8462
  • Страна: ru
  • Рейтинг +4812/-3
  • Y-ДНК: N-L1025 Y64023
  • мтДНК: U4a1-a C16134T
Re: Эксперименты Srkz с аутосомами
« Ответ #248 : 15 Октябрь 2014, 12:38:43 »
Сергей,
А что будет если на меньшее число компонент "препарировть" данных англо-сакса и бритта?
Например на 6-10

У Поляко выходило так по бритту:
ANE K7
ANE 16.04
ASE 0.02
WHG-UHG 66.95
East_Eurasian 0
West_African 0.23
East_African 0
ENF 16.76

Более высокий уровень "охотничьего" происхождения, но именно западного, WHG. И ниже примерно на четверть вклад "земледельцев" по сравнению с нашими современниками.


Оффлайн SrkzАвтор темы

  • Сообщений: 8462
  • Страна: ru
  • Рейтинг +4812/-3
  • Y-ДНК: N-L1025 Y64023
  • мтДНК: U4a1-a C16134T
Re: Эксперименты Srkz с аутосомами
« Ответ #249 : 15 Октябрь 2014, 13:33:42 »
Скачал "бритона" и прогнал через свой излюбленный К27. Покрытие 30%
  0.00%  Nilotic-Omotic     
  0.00%  Ancestral-South-Indi
 33.54%  North-European-Balti
  2.60%  Uralic             
  0.32%  Australo-Melanesian
  0.00%  East-Siberean       
  0.00%  Ancestral-Yayoi     
  0.76%  Caucasian-Near-Easte
  0.00%  Tibeto-Burman       
  0.00%  Austronesian       
  0.00%  Central-African-Pygm
  0.00%  Central-African-Hunt
  0.00%  Nilo-Saharian       
  1.79%  North-African       
 11.27%  Gedrosia-Caucasian 
  0.00%  Cushitic           
  0.00%  Congo-Pygmean       
  0.00%  Bushmen             
  0.00%  South-Meso-Amerindia
 36.40%  South-West-European
  0.46%  North-Amerindian   
  2.21%  Arabic             
  0.00%  North-Circumpolar   
  2.83%  Kalash             
  0.54%  Papuan-Australian   
  7.28%  Baltic-Finnic       
  0.00%  Bantu

Все очень правдоподобно, за исключением 0.76%  Caucasian-Near-Eastern, для нашего современника это было бы довольно удивительно. Значения всех снипов гомозиготные, видимо, качество генотипирования низкое (или я где-то недоразбирался). По оракулу ближайшими выходят потомки британских кельтов 8) (и у них же снижен Caucasian-Near-Eastern, хотя и не настолько)

Least-squares method.

Using 1 population approximation:
1 Irish_Scottish_R2 @ 5,431776
2 English_R2 @ 8,616565
3 Norwegian_R4 @ 9,046977
4 French_R1 @ 12,925602
5 German_R3 @ 13,444589
6 Slovak_D @ 22,788576
7 Croatian_S11 @ 25,640148
8 Moldavian_S3 @ 25,712214
9 Carpathian_R1 @ 26,616915
10 Ukrainian_West_R2 @ 27,217534
11 Ukrainian_R2 @ 28,733969
12 Polish_S13 @ 29,221355
13 Bulgarian_S14 @ 29,359325
14 Serbian_R1 @ 29,757815
15 Belarusian_SW_R2 @ 29,962106
16 Tatar_Bashkiria_R3 @ 30,195708
17 Mishar-N_R1 @ 30,596588
18 Russian_South_West_R7 @ 30,807109
19 Russian_Perm_R5 @ 30,866684
20 Ukrainian_East_R4 @ 31,034861
21 Moksha_R3 @ 31,245434
22 Russian_Center @ 31,724668
23 Mishar-D_R2 @ 31,904093
24 Russian_Meshtchyora_R5 @ 31,914269
25 Russian_North_R8 @ 31,936881
26 Erzya_R4 @ 31,978839
27 Tatar_R5 @ 32,027116
28 Russian_South_R3 @ 32,408903
29 Russian_Vyatka_R2 @ 32,735442
30 Romanian_D @ 32,771652
31 Russian_Ladoga_D @ 33,207728
32 Russian_Yaroslavl_R2 @ 33,247047
33 Russian_Novgorod_D @ 33,591558
34 Russian_Smolensk_R2 @ 33,874875
35 Belarusian_SE_R3 @ 34,02561
36 Belarusian_N_SR6 @ 34,557826
37 Russian_Pskov_R4 @ 35,360828
38 Komi_R2 @ 35,46631
39 Udmurt_R1 @ 35,813086
40 Bashkir_R2 @ 37,344386
41 Permyak_D @ 37,592275
42 Balt_R3 @ 37,86581
43 Chuvash_R4 @ 38,03389
44 Estonian_S4 @ 40,687342
45 Ashkenazi_R3 @ 42,044264
46 Sicilian_R2 @ 42,305778
47 Finnish_South_West_R3 @ 43,499317
48 Mansi_D @ 43,921839
49 Mari_R2 @ 44,133975
50 Nogay_D @ 46,442342
68 iterations.

Using 2 populations approximation:
1 Irish_Scottish_R2+Irish_Scottish_R2 @ 5,431776
2 Irish_Scottish_R2+Norwegian_R4 @ 6,499161
3 English_R2+Irish_Scottish_R2 @ 6,765415
4 English_R2+Norwegian_R4 @ 8,143064
5 English_R2+English_R2 @ 8,616565
6 French_R1+Irish_Scottish_R2 @ 8,715801
7 German_R3+Irish_Scottish_R2 @ 8,933535
8 French_R1+Norwegian_R4 @ 8,99228
9 Norwegian_R4+Norwegian_R4 @ 9,046977
10 German_R3+Norwegian_R4 @ 10,479673
11 English_R2+French_R1 @ 10,481321
12 English_R2+German_R3 @ 10,9031
13 French_R1+German_R3 @ 12,658813
14 Irish_Scottish_R2+Slovak_D @ 12,828062
15 French_R1+French_R1 @ 12,925602
16 German_R3+German_R3 @ 13,444589
17 Irish_Scottish_R2+Moldavian_S3 @ 14,499244
18 Croatian_S11+Irish_Scottish_R2 @ 14,583466
19 English_R2+Slovak_D @ 14,861631
20 Irish_Scottish_R2+Ukrainian_West_R2 @ 14,905928
21 Carpathian_R1+Irish_Scottish_R2 @ 14,970335
22 Norwegian_R4+Slovak_D @ 15,268377
23 French_R1+Slovak_D @ 15,383439
24 Irish_Scottish_R2+Ukrainian_R2 @ 15,549827
25 Irish_Scottish_R2+Polish_S13 @ 15,685298
26 Belarusian_SW_R2+Irish_Scottish_R2 @ 15,95349
27 Irish_Scottish_R2+Tatar_Bashkiria_R3 @ 16,059132
28 Irish_Scottish_R2+Russian_Perm_R5 @ 16,143952
29 Irish_Scottish_R2+Mishar-N_R1 @ 16,238117
30 Irish_Scottish_R2+Russian_South_West_R7 @ 16,382759
31 Croatian_S11+Norwegian_R4 @ 16,465627
32 Irish_Scottish_R2+Moksha_R3 @ 16,471891
33 Bulgarian_S14+Irish_Scottish_R2 @ 16,490485
34 Irish_Scottish_R2+Ukrainian_East_R4 @ 16,568684
35 Moldavian_S3+Norwegian_R4 @ 16,662211
36 English_R2+Moldavian_S3 @ 16,674916
37 Croatian_S11+English_R2 @ 16,716123
38 Irish_Scottish_R2+Serbian_R1 @ 16,74497
39 Irish_Scottish_R2+Russian_North_R8 @ 16,765804
40 Irish_Scottish_R2+Russian_Center @ 16,779767
41 English_R2+Ukrainian_West_R2 @ 16,804459
42 Irish_Scottish_R2+Tatar_R5 @ 16,805027
43 Irish_Scottish_R2+Russian_Meshtchyora_R5 @ 16,816087
44 Erzya_R4+Irish_Scottish_R2 @ 16,827587
45 French_R1+Ukrainian_West_R2 @ 16,837018
46 Irish_Scottish_R2+Mishar-D_R2 @ 16,890868
47 French_R1+Polish_S13 @ 16,939933
48 German_R3+Slovak_D @ 17,059075
49 Carpathian_R1+Norwegian_R4 @ 17,06115
50 Carpathian_R1+English_R2 @ 17,100185
2346 iterations.

Using 3 populations approximation:
1 50% Irish_Scottish_R2 +25% Irish_Scottish_R2 +25% Irish_Scottish_R2 @ 5,431776
2 50% Irish_Scottish_R2 +25% Irish_Scottish_R2 +25% Norwegian_R4 @ 5,701966
3 50% Irish_Scottish_R2 +25% English_R2 +25% Irish_Scottish_R2 @ 6,009289
4 50% Irish_Scottish_R2 +25% English_R2 +25% Norwegian_R4 @ 6,408644
5 50% Irish_Scottish_R2 +25% French_R1 +25% Irish_Scottish_R2 @ 6,866882
6 50% Irish_Scottish_R2 +25% French_R1 +25% Norwegian_R4 @ 6,942805
7 50% Irish_Scottish_R2 +25% German_R3 +25% Irish_Scottish_R2 @ 6,951653
8 50% English_R2 +25% Irish_Scottish_R2 +25% Norwegian_R4 @ 7,258164
9 50% Norwegian_R4 +25% English_R2 +25% Irish_Scottish_R2 @ 7,262805
10 50% Irish_Scottish_R2 +25% German_R3 +25% Norwegian_R4 @ 7,460151
11 50% Norwegian_R4 +25% French_R1 +25% Irish_Scottish_R2 @ 7,481274
12 50% Irish_Scottish_R2 +25% English_R2 +25% French_R1 @ 7,626794
13 50% English_R2 +25% English_R2 +25% Irish_Scottish_R2 @ 7,647356
14 50% Norwegian_R4 +25% Irish_Scottish_R2 +25% Norwegian_R4 @ 7,660562
15 50% Irish_Scottish_R2 +25% English_R2 +25% German_R3 @ 7,786756
16 50% English_R2 +25% English_R2 +25% Norwegian_R4 @ 8,206284
17 50% Irish_Scottish_R2 +25% Irish_Scottish_R2 +25% Slovak_D @ 8,340777
18 50% Norwegian_R4 +25% German_R3 +25% Irish_Scottish_R2 @ 8,348693
19 50% Norwegian_R4 +25% French_R1 +25% Norwegian_R4 @ 8,393738
20 50% Norwegian_R4 +25% English_R2 +25% French_R1 @ 8,419339
21 50% Norwegian_R4 +25% English_R2 +25% Norwegian_R4 @ 8,434713
22 50% English_R2 +25% French_R1 +25% Irish_Scottish_R2 @ 8,499049
23 50% English_R2 +25% English_R2 +25% English_R2 @ 8,616565
24 50% Irish_Scottish_R2 +25% French_R1 +25% German_R3 @ 8,62957
25 50% French_R1 +25% Irish_Scottish_R2 +25% Norwegian_R4 @ 8,663366
26 50% English_R2 +25% German_R3 +25% Irish_Scottish_R2 @ 8,71743
27 50% English_R2 +25% French_R1 +25% Norwegian_R4 @ 8,785453
28 50% Norwegian_R4 +25% Norwegian_R4 +25% Norwegian_R4 @ 9,046977
29 50% Irish_Scottish_R2 +25% Irish_Scottish_R2 +25% Ukrainian_West_R2 @ 9,225227
30 50% Norwegian_R4 +25% English_R2 +25% German_R3 @ 9,268799
31 50% Irish_Scottish_R2 +25% Irish_Scottish_R2 +25% Moldavian_S3 @ 9,27876
32 50% Irish_Scottish_R2 +25% English_R2 +25% Slovak_D @ 9,283668
33 50% Irish_Scottish_R2 +25% Norwegian_R4 +25% Slovak_D @ 9,302371
34 50% English_R2 +25% German_R3 +25% Norwegian_R4 @ 9,33937
35 50% Irish_Scottish_R2 +25% Irish_Scottish_R2 +25% Russian_Perm_R5 @ 9,350959
36 50% Irish_Scottish_R2 +25% Croatian_S11 +25% Irish_Scottish_R2 @ 9,401864
37 50% Irish_Scottish_R2 +25% Irish_Scottish_R2 +25% Polish_S13 @ 9,426005
38 50% Irish_Scottish_R2 +25% Irish_Scottish_R2 +25% Ukrainian_R2 @ 9,444935
39 50% English_R2 +25% English_R2 +25% French_R1 @ 9,452598
40 50% Irish_Scottish_R2 +25% Belarusian_SW_R2 +25% Irish_Scottish_R2 @ 9,472776
41 50% Norwegian_R4 +25% German_R3 +25% Norwegian_R4 @ 9,511359
42 50% Irish_Scottish_R2 +25% Irish_Scottish_R2 +25% Tatar_Bashkiria_R3 @ 9,513847
43 50% Irish_Scottish_R2 +25% Carpathian_R1 +25% Irish_Scottish_R2 @ 9,517865
44 50% French_R1 +25% English_R2 +25% Irish_Scottish_R2 @ 9,559586
45 50% German_R3 +25% Irish_Scottish_R2 +25% Norwegian_R4 @ 9,563293
46 50% Irish_Scottish_R2 +25% Irish_Scottish_R2 +25% Mishar-N_R1 @ 9,581362
47 50% Norwegian_R4 +25% French_R1 +25% German_R3 @ 9,587762
48 50% French_R1 +25% English_R2 +25% Norwegian_R4 @ 9,61381
49 50% Irish_Scottish_R2 +25% Irish_Scottish_R2 +25% Moksha_R3 @ 9,618826
50 50% Irish_Scottish_R2 +25% French_R1 +25% Slovak_D @ 9,67605
148100 iterations.

Using 4 populations approximation:
1 Irish_Scottish_R2+Irish_Scottish_R2+Irish_Scottish_R2+Irish_Scottish_R2 @ 5,431776
2 Irish_Scottish_R2+Irish_Scottish_R2+Irish_Scottish_R2+Norwegian_R4 @ 5,701966
3 English_R2+Irish_Scottish_R2+Irish_Scottish_R2+Irish_Scottish_R2 @ 6,009289
4 English_R2+Irish_Scottish_R2+Irish_Scottish_R2+Norwegian_R4 @ 6,408644
5 Irish_Scottish_R2+Irish_Scottish_R2+Norwegian_R4+Norwegian_R4 @ 6,499161
6 English_R2+English_R2+Irish_Scottish_R2+Irish_Scottish_R2 @ 6,765415
7 French_R1+Irish_Scottish_R2+Irish_Scottish_R2+Irish_Scottish_R2 @ 6,866882
8 French_R1+Irish_Scottish_R2+Irish_Scottish_R2+Norwegian_R4 @ 6,942805
9 German_R3+Irish_Scottish_R2+Irish_Scottish_R2+Irish_Scottish_R2 @ 6,951653
10 English_R2+English_R2+Irish_Scottish_R2+Norwegian_R4 @ 7,258164
11 English_R2+Irish_Scottish_R2+Norwegian_R4+Norwegian_R4 @ 7,262805
12 German_R3+Irish_Scottish_R2+Irish_Scottish_R2+Norwegian_R4 @ 7,460151
13 French_R1+Irish_Scottish_R2+Norwegian_R4+Norwegian_R4 @ 7,481274
14 English_R2+French_R1+Irish_Scottish_R2+Irish_Scottish_R2 @ 7,626794
15 English_R2+English_R2+English_R2+Irish_Scottish_R2 @ 7,647356
16 Irish_Scottish_R2+Norwegian_R4+Norwegian_R4+Norwegian_R4 @ 7,660562
17 English_R2+German_R3+Irish_Scottish_R2+Irish_Scottish_R2 @ 7,786756
18 English_R2+French_R1+Irish_Scottish_R2+Norwegian_R4 @ 7,820959
19 English_R2+English_R2+Norwegian_R4+Norwegian_R4 @ 8,143064
20 English_R2+English_R2+English_R2+Norwegian_R4 @ 8,206284
21 Irish_Scottish_R2+Irish_Scottish_R2+Irish_Scottish_R2+Slovak_D @ 8,340777
22 German_R3+Irish_Scottish_R2+Norwegian_R4+Norwegian_R4 @ 8,348693
23 English_R2+German_R3+Irish_Scottish_R2+Norwegian_R4 @ 8,361392
24 French_R1+Norwegian_R4+Norwegian_R4+Norwegian_R4 @ 8,393738
25 English_R2+French_R1+Norwegian_R4+Norwegian_R4 @ 8,419339
26 English_R2+Norwegian_R4+Norwegian_R4+Norwegian_R4 @ 8,434713
27 English_R2+English_R2+French_R1+Irish_Scottish_R2 @ 8,499049
28 English_R2+English_R2+English_R2+English_R2 @ 8,616565
29 French_R1+German_R3+Irish_Scottish_R2+Irish_Scottish_R2 @ 8,62957
30 French_R1+French_R1+Irish_Scottish_R2+Norwegian_R4 @ 8,663366
31 French_R1+French_R1+Irish_Scottish_R2+Irish_Scottish_R2 @ 8,715801
32 English_R2+English_R2+German_R3+Irish_Scottish_R2 @ 8,71743
33 English_R2+English_R2+French_R1+Norwegian_R4 @ 8,785453
34 German_R3+German_R3+Irish_Scottish_R2+Irish_Scottish_R2 @ 8,933535
35 French_R1+German_R3+Irish_Scottish_R2+Norwegian_R4 @ 8,935217
36 French_R1+French_R1+Norwegian_R4+Norwegian_R4 @ 8,99228
37 Norwegian_R4+Norwegian_R4+Norwegian_R4+Norwegian_R4 @ 9,046977
38 Irish_Scottish_R2+Irish_Scottish_R2+Irish_Scottish_R2+Ukrainian_West_R2 @ 9,225227
39 English_R2+German_R3+Norwegian_R4+Norwegian_R4 @ 9,268799
40 Irish_Scottish_R2+Irish_Scottish_R2+Irish_Scottish_R2+Moldavian_S3 @ 9,27876
41 English_R2+Irish_Scottish_R2+Irish_Scottish_R2+Slovak_D @ 9,283668
42 Irish_Scottish_R2+Irish_Scottish_R2+Norwegian_R4+Slovak_D @ 9,302371
43 English_R2+English_R2+German_R3+Norwegian_R4 @ 9,33937
44 Irish_Scottish_R2+Irish_Scottish_R2+Irish_Scottish_R2+Russian_Perm_R5 @ 9,350959
45 Croatian_S11+Irish_Scottish_R2+Irish_Scottish_R2+Irish_Scottish_R2 @ 9,401864
46 Irish_Scottish_R2+Irish_Scottish_R2+Irish_Scottish_R2+Polish_S13 @ 9,426005
47 Irish_Scottish_R2+Irish_Scottish_R2+Irish_Scottish_R2+Ukrainian_R2 @ 9,444935
48 English_R2+English_R2+English_R2+French_R1 @ 9,452598
49 Belarusian_SW_R2+Irish_Scottish_R2+Irish_Scottish_R2+Irish_Scottish_R2 @ 9,472776
50 German_R3+Norwegian_R4+Norwegian_R4+Norwegian_R4 @ 9,511359
51 Irish_Scottish_R2+Irish_Scottish_R2+Irish_Scottish_R2+Tatar_Bashkiria_R3 @ 9,513847
52 Carpathian_R1+Irish_Scottish_R2+Irish_Scottish_R2+Irish_Scottish_R2 @ 9,517865
53 English_R2+French_R1+German_R3+Irish_Scottish_R2 @ 9,549038
54 English_R2+French_R1+French_R1+Irish_Scottish_R2 @ 9,559586
55 German_R3+German_R3+Irish_Scottish_R2+Norwegian_R4 @ 9,563293
56 Irish_Scottish_R2+Irish_Scottish_R2+Irish_Scottish_R2+Mishar-N_R1 @ 9,581362
57 French_R1+German_R3+Norwegian_R4+Norwegian_R4 @ 9,587762
58 English_R2+French_R1+French_R1+Norwegian_R4 @ 9,61381
59 Irish_Scottish_R2+Irish_Scottish_R2+Irish_Scottish_R2+Moksha_R3 @ 9,618826
60 French_R1+Irish_Scottish_R2+Irish_Scottish_R2+Slovak_D @ 9,67605
61 Irish_Scottish_R2+Irish_Scottish_R2+Irish_Scottish_R2+Russian_South_West_R7 @ 9,681189
62 Irish_Scottish_R2+Irish_Scottish_R2+Irish_Scottish_R2+Russian_North_R8 @ 9,715331
63 English_R2+English_R2+English_R2+German_R3 @ 9,71625
64 Irish_Scottish_R2+Irish_Scottish_R2+Irish_Scottish_R2+Tatar_R5 @ 9,729016
65 Erzya_R4+Irish_Scottish_R2+Irish_Scottish_R2+Irish_Scottish_R2 @ 9,777989
66 Irish_Scottish_R2+Irish_Scottish_R2+Irish_Scottish_R2+Russian_Meshtchyora_R5 @ 9,789514
67 Irish_Scottish_R2+Irish_Scottish_R2+Irish_Scottish_R2+Russian_Center @ 9,81976
68 Irish_Scottish_R2+Irish_Scottish_R2+Irish_Scottish_R2+Ukrainian_East_R4 @ 9,82648
69 Irish_Scottish_R2+Irish_Scottish_R2+Irish_Scottish_R2+Udmurt_R1 @ 9,865564
70 Irish_Scottish_R2+Irish_Scottish_R2+Irish_Scottish_R2+Mishar-D_R2 @ 9,889704
71 English_R2+German_R3+German_R3+Irish_Scottish_R2 @ 9,89024
72 Irish_Scottish_R2+Irish_Scottish_R2+Irish_Scottish_R2+Russian_Vyatka_R2 @ 9,906049
73 English_R2+French_R1+German_R3+Norwegian_R4 @ 9,924903
74 Irish_Scottish_R2+Irish_Scottish_R2+Irish_Scottish_R2+Russian_Ladoga_D @ 9,970341
75 French_R1+Irish_Scottish_R2+Irish_Scottish_R2+Russian_Perm_R5 @ 10,098407
76 Irish_Scottish_R2+Irish_Scottish_R2+Irish_Scottish_R2+Russian_Yaroslavl_R2 @ 10,102831
77 Irish_Scottish_R2+Irish_Scottish_R2+Irish_Scottish_R2+Komi_R2 @ 10,116963
78 English_R2+Irish_Scottish_R2+Irish_Scottish_R2+Ukrainian_West_R2 @ 10,133918
79 Irish_Scottish_R2+Irish_Scottish_R2+Moldavian_S3+Norwegian_R4 @ 10,137563
80 Croatian_S11+Irish_Scottish_R2+Irish_Scottish_R2+Norwegian_R4 @ 10,140483
81 Irish_Scottish_R2+Irish_Scottish_R2+Irish_Scottish_R2+Russian_Novgorod_D @ 10,141524
82 Irish_Scottish_R2+Irish_Scottish_R2+Irish_Scottish_R2+Russian_South_R3 @ 10,219194
83 English_R2+Irish_Scottish_R2+Irish_Scottish_R2+Russian_Perm_R5 @ 10,230605
84 Irish_Scottish_R2+Irish_Scottish_R2+Irish_Scottish_R2+Russian_Smolensk_R2 @ 10,23607
85 English_R2+Irish_Scottish_R2+Norwegian_R4+Slovak_D @ 10,251974
86 French_R1+Irish_Scottish_R2+Irish_Scottish_R2+Polish_S13 @ 10,252677
87 English_R2+Irish_Scottish_R2+Irish_Scottish_R2+Polish_S13 @ 10,253918
88 English_R2+Irish_Scottish_R2+Irish_Scottish_R2+Moldavian_S3 @ 10,27581
89 Belarusian_SW_R2+French_R1+Irish_Scottish_R2+Irish_Scottish_R2 @ 10,276179
90 English_R2+English_R2+Irish_Scottish_R2+Slovak_D @ 10,288651
91 Belarusian_SW_R2+English_R2+Irish_Scottish_R2+Irish_Scottish_R2 @ 10,30395
92 Belarusian_SE_R3+Irish_Scottish_R2+Irish_Scottish_R2+Irish_Scottish_R2 @ 10,31405
93 French_R1+Irish_Scottish_R2+Irish_Scottish_R2+Ukrainian_West_R2 @ 10,318143
94 Irish_Scottish_R2+Irish_Scottish_R2+Norwegian_R4+Ukrainian_West_R2 @ 10,342502
95 English_R2+Irish_Scottish_R2+Irish_Scottish_R2+Ukrainian_R2 @ 10,343626
96 Irish_Scottish_R2+Irish_Scottish_R2+Irish_Scottish_R2+Permyak_D @ 10,347102
97 Carpathian_R1+Irish_Scottish_R2+Irish_Scottish_R2+Norwegian_R4 @ 10,351678
98 French_R1+Irish_Scottish_R2+Irish_Scottish_R2+Russian_North_R8 @ 10,356084
99 Bulgarian_S14+Irish_Scottish_R2+Irish_Scottish_R2+Irish_Scottish_R2 @ 10,357118
100 German_R3+Irish_Scottish_R2+Irish_Scottish_R2+Slovak_D @ 10,364705
880423 iterations.

ANE  K7 чуть разошелся с вариантом, опубликованным Поляко:

 16.07%  ANE                 
  0.61%  ASE                 
 65.21%  WHG-UHG             
  0.01%  East_Eurasian       
  0.40%  West_African       
  0.80%  East_African       
 16.90%  ENF

Оффлайн SrkzАвтор темы

  • Сообщений: 8462
  • Страна: ru
  • Рейтинг +4812/-3
  • Y-ДНК: N-L1025 Y64023
  • мтДНК: U4a1-a C16134T
Re: Эксперименты Srkz с аутосомами
« Ответ #250 : 15 Октябрь 2014, 21:40:24 »
В общем, я думаю, что на самом деле эти геномы еще ближе к современным германцам. Дело в том, что файлы содержат практически полностью гомозиготные геномы, в реальности они такими быть не могли. Это больше похоже на фазированный файл, где оставлен (и удвоен) вклад лишь одного родителя. Здесь, скорее всего, какие-то кусочки от одного родителя, какие-то от другого.
Сравните результаты в калькуляторе ANE K7 для моей мамы. Левая колонка - мой фазированный файл, то есть то, что я должен был получить с ее стороны. Правая колонка - ее реальные результаты.

ANE   20.02% 20.30%
ASE   0   2.13%
WHG-UHG   72.61% 60.87%
East_Eurasian   5.08% 6.85%
West_African   0    0.89%
East_African   0    0.85%
ENF   2.30% 8.10%

Наибольшая разница по главному компоненту WHG-UHG, это как "эффект калькулятора", только в обратную сторону. Зато "вклад земледельцев" у фазированного файла сильно упал.
Теперь сравним древнего англо-сакса с усреднением по современным поволжским немцам:

 17.50% 15.0 ANE
  1.43% 1.28 ASE     
 67.25% 60.2 WHG-UHG             
  0.04% 0.94 East_Eurasian       
  0.33% 0.43 West_African       
  1.25% 0.41 East_African       
 12.19% 21.92 ENF

На мой взгляд, картина очень похожа - у англо-сакса слишком большой WHG-UHG, слишком маленький ENF. Если бы эти искажения были исключены, он оказался бы заметно ближе к немцам.

Оффлайн SrkzАвтор темы

  • Сообщений: 8462
  • Страна: ru
  • Рейтинг +4812/-3
  • Y-ДНК: N-L1025 Y64023
  • мтДНК: U4a1-a C16134T
Re: Эксперименты Srkz с аутосомами
« Ответ #251 : 16 Октябрь 2014, 10:06:44 »
IBD-анализ "англосакса" (Hinxton2). Покрытие снипами моего набора для сравнения составляет только 47%, поэтому я снизил настройки фильтра до 2 сМ и 50 снипов на сегмент. Но это бы еще полбеды. Как я уже отмечал, качество прочтения очень низкое и подавляющее большинство сегментов просто разрушено. Похоже, проявляется в основном самый базовый и древний уровень родства, и выборки выстроились приблизительно по наличию "северноевропейского" компонента (разумеется, не отменяя случайных отклонений).
Russian-West 18,19
Balt 17,8
Estonian 17,4
Karelian 17,29
French 17,25
Polish 17,01
Croatian 16,96
Greek_Azov 16,93
Russian-North 16,87
Russian-South 16,79
Belarusian 16,65
Ukrainian-West-and-Center 16,03
German-Austrian 15,9
Komi 15,88
Hungarian 15,8
Basque 15,78
Moksha 15,36
Swedish 15,35
Romanian 15,21
British 15,02
Veps 14,82
Norwegian 14,74
Bulgarian 14,73
Finnish 14,5
Ashkenazi 14,41
Adygei 14,39
Italian 14,38
Chechen 14,35
Ukrainian-East-and-Center 14,34
Erzya 14,13
Tatar-Crimean 14,05
Sardinian 13,9
Greek 13,86
Balkarian 13,73
Nogay 13,29
Turkish 13,28
Tadjik 13,23
Tatar-Kazan 13,23
Lezgin 12,76
Sephard 12,76
Turkmen 12,71
Ossetian 12,68
Kumyk 12,61
Udmurt 12,59
Chuvash 12,54
Saami 12,39
Azerbaijani 12,25
Bashkir 12,16
Mari 12,11
Georgian 12,04
Abkhazian 11,76
Iranian 11,34
Mansi 10,8
Armenian 10,62
Uzbek 9,97
Hakas 9,42
Kazah 9,18
Kirgiz 9,17
Shor 9
Dolgan 8,5
Uygur 8,25
Altaian 8,04
Selkup 7,99
Ket 6,88
Buryat 6,62
Yakut 6,34
Mongol 6,31
Tatar_Lithuanian 6,15
Han-North 5,86
Evenk 5,25
Tuvinian 5,07
Nganassan 5,05
Even 4,85
У "бритта" покрытие еще ниже, не стал его даже запускать, глядя на такие результаты.

Оффлайн пенелопа

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6485
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2714/-13
  • мтДНК: H1b
Re: Эксперименты Srkz с аутосомами
« Ответ #252 : 18 Октябрь 2014, 11:22:05 »
PS наверное, лучше выделить обсуждение происхождения народов Кавказа и Анатолии в отдельную тему, либо перенести в более подходящую из имеющихся. Прошу модераторов так и поступить.

Часть сообщений выделена в отдельную тему "Происхождение народов Кавказа и Анатолии" (по соседству): http://forum.molgen.org/index.php/topic,7442.0.html

Оффлайн FenriR

  • Сообщений: 2050
  • Страна: 00
  • Рейтинг +542/-2
  • Y-ДНК: N1c1-L1025
  • мтДНК: K1a
Re: Эксперименты Srkz с аутосомами
« Ответ #253 : 19 Октябрь 2014, 13:48:33 »
Бедняга Поляко похоже на себе рвет волосы от того, что там нес Maciamo ;D http://eurogenes.blogspot.com.au/2014/10/ancient-genomes-and-calculator-effect.html
Ну Масиама все таки на калькулятор опирался.  :)
Кто ж знал кроме Вас какой наджный кулькулятор, а какой нет ... да еще и в каком случае.

П.С. В общем Вы все интригу с англо-саксом разрушили  ;D

Поляко:
Цитировать
Maciamo at Eupedia reckons that some of these Hinxton samples are similar to eastern Germans from Mecklenburg or thereabouts.

He based his analysis on the calculator results provided by our schizophrenic friend Genetiker.

Comedians, both of them. :)

Оффлайн SrkzАвтор темы

  • Сообщений: 8462
  • Страна: ru
  • Рейтинг +4812/-3
  • Y-ДНК: N-L1025 Y64023
  • мтДНК: U4a1-a C16134T
Re: Эксперименты Srkz с аутосомами
« Ответ #254 : 19 Октябрь 2014, 14:31:14 »
Ну что сказать, упорство Maciamo достойно лучшего применения :) То же можно сказать и про эксперименты EastPole по выведению скандинавов из смеси образцов Hinxton с поляками.

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.