АвторТема: Гаплотип из данных 23andme  (Прочитано 1589 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн RompecabezaАвтор темы

  • Сообщений: 165
  • Страна: ru
  • Рейтинг +11/-0
  • Y-ДНК: NA
  • мтДНК: U5a1b1
Гаплотип из данных 23andme
« : 14 Июль 2014, 06:06:55 »
Здаравствуйте. Насколько я понимаю, мт-ДНК у меня расшифрована полностью, то есть мне доступен список снипов. Есть ли какие-то базы, сопоставляющие снипы с полиморфизмами, например, такие-то снипы соответствуют  A16129G? Хотелось бы пользоваться проектами в ФТДНА.

Оффлайн rLin

  • Сообщений: 812
  • Страна: ru
  • Рейтинг +267/-0
  • Калуга
  • Y-ДНК: R1a1a-Z92 (Y569+)
  • мтДНК: T2b2-С16304T!
Re: Гаплотип из данных 23andme
« Ответ #1 : 14 Июль 2014, 13:10:08 »
Если вы тестировались в 23andMe, то не полностью. Для версии чипа v3 расшифровано около 2500 из ~16000 снипов.
Я думаю, что для начала вам надо сходить вот сюда: http://dna.jameslick.com/mthap/

Оффлайн rLin

  • Сообщений: 812
  • Страна: ru
  • Рейтинг +267/-0
  • Калуга
  • Y-ДНК: R1a1a-Z92 (Y569+)
  • мтДНК: T2b2-С16304T!
Re: Гаплотип из данных 23andme
« Ответ #2 : 14 Июль 2014, 13:27:03 »
А насчёт 23andMe я не уверен, что у них регионы HVR1 и HVR2 тестируются полностью. Т.е. весьма вероятно, что добавить данные на mitosearch.org (проект ftdna) не удастся. С другой стороны, там совпадений гораздо меньше, чем по аутосомам, например, так что беспокоиться по этому поводу не стоит: лично я пока даже близко не могу представить, как связаны со мной совпаденцы оттуда даже по FMS, видимо общие предки были очень давно.

Оффлайн Valery

  • Сообщений: 5522
  • Страна: 00
  • Рейтинг +435/-6
  • Ultimate Matriarchy
Re: Гаплотип из данных 23andme
« Ответ #3 : 14 Июль 2014, 14:00:44 »
Есть ли какие-то базы, сопоставляющие снипы с полиморфизмами, например, такие-то снипы соответствуют  A16129G?

ничего не понял (( получить иное имя для мито-снипов? типа rs...? Или просто конвертировать данные с чипа в набор снипов? Последнее для 23 имеется в виде скрипта, кажется Энн Тернер делала, он переводит из риференса который использует 23, в rCRS.

Но как выше было сказано, воспользоваться такой конвертацией нельзя либо очень затруднительно, т.к. чип не покрывает всего ГВС.

Оффлайн RompecabezaАвтор темы

  • Сообщений: 165
  • Страна: ru
  • Рейтинг +11/-0
  • Y-ДНК: NA
  • мтДНК: U5a1b1
Re: Гаплотип из данных 23andme
« Ответ #4 : 15 Июль 2014, 01:41:07 »
Понятно. То есть, перехитрить ФТДНА у меня не получится. Ну, я хоть что-нибудь накопаю по ссылке. Неохота мне им из своих скудных студенческих запасов платить.

Оффлайн сармат

  • Сообщений: 5457
  • Страна: ru
  • Рейтинг +383/-34
  • Y-ДНК: J2a1 Z6049 DYS438=7, DYS450=7.
  • мтДНК: U5a1d2b.
Re: Гаплотип из данных 23andme
« Ответ #5 : 27 Июнь 2017, 03:52:52 »
Если вы тестировались в 23andMe, то не полностью. Для версии чипа v3 расшифровано около 2500 из ~16000 снипов.
Я думаю, что для начала вам надо сходить вот сюда: http://dna.jameslick.com/mthap/

А куда можно сходить для конвертации Y-DNA из 23andMe?  :)

Оффлайн FELIX

  • Сообщений: 2134
  • Страна: ru
  • Рейтинг +582/-3
  • Y-ДНК: R-YP569
  • мтДНК: U5a1a1b
Re: Гаплотип из данных 23andme
« Ответ #6 : 27 Июнь 2017, 05:41:28 »
Если вы тестировались в 23andMe, то не полностью. Для версии чипа v3 расшифровано около 2500 из ~16000 снипов.
Я думаю, что для начала вам надо сходить вот сюда: http://dna.jameslick.com/mthap/

А куда можно сходить для конвертации Y-DNA из 23andMe?  :)

А толку? Там ведь не маркеры, а снипы...

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.


Rambler's Top100