Разбор случая VladimirSV

[VladimirSV]

Про "следы материнских гаплогрупп - Атавизмы", извините, это бред...

Ну... Может и бред... Так FTDNA пишут: "P-M45 is the parent haplogroupps Q-M242 and R-M207...", "K-M9 is the parent of several haplogroupps...", "F-M89... is the parent of most non-African branches..."
https://my.familytreedna.com/y-dna-migration-map.aspx

Огромное СПАСИБО за ссылку! Буду дальше разбираться.

[smal]

Ну... Может и бред... Так FTDNA пишут: "P-M45 is the parent haplogroupps Q-M242 and R-M207...", "K-M9 is the parent of several haplogroupps...", "F-M89... is the parent of most non-African branches..."

В этом смысле, конечно, дочерняя гаплогруппа наследует все снипы материнской, если не было возвратных мутаций.

[VladimirSV]

В первую очередь надо будет посмотреть эти снипы из новой шкалы:  S1523, PF6658 или Z193???, CTS2617.

Какой выбрать PF6658 или Z193???

К сожалению,  YSEQ DNA Shop  (http://shop.yseq.net/index.php?cPath=1) такие ЭКЗОТИЧЕСКИЕ снипы не делают (((   
Надо ещё где то искать!

Кто-нить знает ГДЕ такое можно сделать

[Farroukh]

Получил результаты Geno 2.0.

Владимир, опубликуйте здесь Ваши результаты. А ещё лучше сразу скопипастьте их в Y-SNP Subclade Predictor. Система сама выдаст Ваш терминальный снип.

[VladimirSV]

Спасибо Farroukh за ссылку. Тока тут какие-то не стыковки (((
В качестве результата Geno 2.0 выдаёт  " 'YLA4W8YL'.csv - файл " из 142122 строк, вот  такого вида:
....
rs999986,14,A,C
rs999987,14,C,C
s10,Y,T,T
s3,Y,C,C
s42,Y,T,T
s47,Y,T,T
SRY2627,Y,G,G
TAT,Y,T,T
U106,Y,C,C
U152,Y,T,T
.....

Smal- спасибо, дал ключь, как - это читать: "....название снипа, № хромосомы, буквы в 1 и 2 гомологичной хромосоме. Для Y обе буквы одинаковы, т.к. гомолога у нее нет."

Но в привычном формате: "M343+, L21+, DF13+, DF23+, M222-" я результат вижу, только в FTDNA на своей странице, после внутренней трансформации туда данных Geno 2.0.

А как работать с файлом - 'YLA4W8YL'.csv  и где его обрабатывать, как из него получить  что-то, типа " M343+, L21+, DF13+, DF23+, M222- " я не понимаю (((

_____________________________

Predictor выдаёт тоже самое, что мы заказывали сами и тоже что выдал Geno 2.0 на своей странице:

     (most likely)  R1b1a2a1a2b  R1b-U152         ----   что соответствует    R1b1a2a1a2b*_U152* (L2-,Z36-,Z56-,dys492=12) -- от "R1b-U152 Project Groups"  By Tibor Fehér
или
     R1b1a2a1a  R1b-L11 (R1b-L151, R1b-YSC0000082)
_________________________

Вот данные с сайта FTDNA (SNPs):

U152+, CTS10168+, CTS10362+, CTS10834+, CTS109+, CTS11358+, CTS11575+, CTS11726+, CTS12478+, CTS125+, CTS12632+, CTS11985+, CTS1996+, CTS2664+, CTS3063+, CTS3135+, CTS3331+, CTS3358+, CTS3431+, CTS3536+, CTS3575+, CTS3654+, CTS3662+, CTS3868+, CTS3996+, CTS4364+, CTS4368+, CTS4437+, CTS4443+, CTS4244+, CTS4740+, CTS5318+, CTS5457+, CTS5884+, CTS6135+, CTS623+, CTS6383+, CTS6907+, CTS5532+, CTS6800+, CTS7933+, CTS8243+, CTS7922+, CTS8728+, CTS8980+, CTS9828+, F1046+, F115+, F1209+, F1704+, F1714+, F1753+, F1767+, F1794+, F180+, F1302+, F1320+, F1329+, F211+, F2142+, F2155+, F2587+, F2688+, F2710+, F2837+, F29+, F295+, F2985+, F2993+, F3111+, F313+, F3136+, F33+, F332+, F3335+, F344+, F3556+, F356+, F359+, F3692+, F378+, F47+, F506+, F556+, F63+, F640+, F647+, F652+, F671+, F719+, F82+, F83+, F93+, L11+, L132+, F2048+, F2075+, F2302+, F2402+, L15+, L150+, L151+, L16+, L23+, L265+, L278+, L350+, L388+, L389+, F4+, L407+, M89+, M94+, P128+, P131+, P132+, P135+, P136+, P138+, P14+, P141+, P145+, P146+, P148+, P151+, P158+, P159+, P160+, P166+, P187+, P207+, P225+, P226+, P228+, P229+, P230+, P232+, P233+, P235+, P236+, P237+, P238+, P240+, P242+, P243+, P244+, P245+, P280+, P281+, P282+, P283+, P284+, P285+, P286+, P295+, P297+, P310+, L468+, L470+, L471+, L478+, L482+, L483+, L498+, L500+, L502+, L506+, L51+, L52+, L747+, L752+, L754+, L761+, L768+, L773+, L774+, L779+, L82+, PAGES00083+, PF1016+, PF1029+, PF1031+, PF1040+, PF1046+, PF1061+, PF1092+, PF1097+, PF110+, PF1203+, PF1269+, PF1276+, PF192+, PF210+, PF212+, PF223+, PF234+, PF500+, PF5465+, PF5466+, PF5468+, PF5471+, PF5851+, PF5853+, PF5854+, PF5865+, PF5869+, PF5871+, PF5882+, PF5886+, PF5887+, PF5888+, PF5953+, PF5956+, PF5957+, PF5964+, PF5965+, PF5982+, PF6063+, PF6091+, PF6145+, PF6246+, PF6249+, PF6250+, PF6263+, PF6265+, PF6270+, PF6271+, PF6272+, PF6404+, PF6409+, PF6411+, PF6424+, PF6425+, PF6430+, PF6432+, PF6434+, PF6438+, PF6443+, PF6463+, PF6494+, PF6495+, PF6498+, PF6500+, PF6506+, PF6507+, PF6509+, PF6524+, M139+, M168+, M207+, M235+, M294+, M343+, M415+, M42+, M45+, M526+, PF258+, PF2591+, PF2593+, PF2599+, PF2608+, PF2611+, PF2615+, PF2624+, PF263+, PF2643+, PF272+, PF2745+, PF2747+, PF2748+, PF2749+, PF2770+, PF278+, PF292+, PF316+, PF325+, PF342+, L585+, L721+, PF719+, PF725+, YSC0000067+, YSC0000075+, YSC0000082+, YSC0000166+, YSC0000176+, YSC0000179+, YSC0000182+, YSC0000186+, YSC0000191+, YSC0000194+, YSC0000201+, YSC0000203+, YSC0000205+, YSC0000207+, YSC0000213+, YSC0000219+, YSC0000224+, YSC0000225+, YSC0000227+, YSC0000230+, YSC0000232+, YSC0000233+, YSC0000251+, YSC0000269+, YSC0000270+, YSC0000279+, YSC0000288+, YSC0000294+, PF779+, PF796+, PF803+, PF815+, PF821+, PF840+, PF844+, PF892+, PF937+, PF951+, PF954+, PF970+, s10+, s3+, U152+, V186+, V189+, V205+, V52+, V9+, PF667+, PF70-, L21-, YSC0000002-, s42-, Z143-, Z145-, Z146-, Z148-, Z149-, Z150-, Z191-, Z192-, Z194-, Z259-, Z276-, Z35-, Z36-, Z367-, Z37-, Z38-, Z383-, Z384-, Z44-, Z46-, Z47-, Z48-, Z49-, Z51-, Z52-, Z54-, Z57-, Z65-, Z70-, Z71-, Z72-, PF7610-, PF7623-, L739-, L671-, PF4363-, PF4367-, PF27-, M75-, PF6610-, PF6652-, PF6653-, PF6654-, PF6659-, PF257-, M126-, L552-, L562-, P329-, P37-, P61-, L466-, F4205-, L4-, L196-, L2-, L20-, F2421-, F2083-, L135-, L144-, F3799-, F3916-, F3372-, F2229-, F1398-, F1643-, F1947-, F1948-, F1993-, F1230-, F1036-, CTS9044-, CTS9193-, CTS8845-, CTS8949-, CTS7925-, CTS8492-, CTS8516-, CTS8684-, CTS7958-, CTS7970-, CTS7983-, CTS8125-, CTS8137-, CTS8178-, CTS6854-, CTS5689-, CTS6911-, CTS6942-, CTS6975-, CTS7010-, CTS7013-, CTS7193-, CTS7325-, CTS7491-, CTS7542-, CTS7618-, CTS6452-, CTS6524-, CTS667-, CTS6286-, CTS5478-, CTS5481-, CTS5531-, CTS5029-, CTS5153-, CTS4333-, CTS4521-, CTS468-, CTS4069-, CTS3936-, CTS3866-, CTS3409-, CTS3413-, CTS319-, CTS3080-, CTS2687-, CTS2752-, CTS278-, CTS2376-, CTS12058-, CTS1595-, CTS1640-, CTS1789-, CTS188-, CTS11874-, CTS1166-, CTS11712-, CTS11381-, CTS11022-, CTS11232-, CTS10855-, CTS10641-, CTS1034-, L4-, CTS10009-

[Farroukh]

(most likely)  R1b1a2a1a2b  R1b-U152

Всё ясно. Остаётся ждать, когда во ФТДНА появится возможность заказать PF6658.

[VladimirSV]

Кто знает ?

Почему U152 называют Unique Event Polymorphism ?  И чё эт за такое супер уникальное событие?

[Farroukh]

Пока никто, но есть два пути. Первый - ждать пока он появится в списке заказов (залазим в свой профиль, потом в Y-DNA-->Haplotree&SNPs-->находим его на древе). Второй - разориться на BigY и уже потом всю оставшуюся жизнь никаких генеалогических ДНК-тестов можно не заказывать.

Почему U152 называют Unique Event Polymorphism ?  И чё эт за такое супер уникальное событие?

Да все снипы так называют, ибо они уникальны - этот снип есть только у потомков того мужика, у кого он появился

[VladimirSV]

Где можно посмотрет состав BigY ??

[Farroukh]

Где можно посмотрет состав BigY ??

Он уникален для каждого. Это будет список снипов от Адама до Вас.

[VladimirSV]

$575 это где то   28000р 

[smal]

FTDNA планирует еще какие-то новые панели снипов, может туда что полезное попадет.

[VladimirSV]

Придётся поискть или ждать:   PF6658,   S1523,   CTS2617.

Пока в продаже есть только это: S20550 (downstream of PF6658/Z193)  http://www.yseq.net/product_info.php?products_id=1836&osCsid=15c845a03aef54a13db210c00779fd3f
                                                  CTS11993 (Extracted from 1000 genomes data. Not qualified.);

Вот ещё накопал в продаже какие-то свежие, которые непонятно куда пришить, т.к. в новом дереве_U152 их нет((:
A274         Downstream of R-U152*
A275         Downstream of R-U152*
A517         Approx. R1b-U152
A518         Approx. R1b-U152
A519         Approx. R1b-U152
A520         Approx. R1b-U152
CTS4542   Syn. with CTS1370; downstream U152
CTS4727   Below U152
 
Есть ешё из этой группы, но они или заведомо отрицательные (т..к принадлежат к L2 & L36) или подтверждённо отрицательные.

[Farroukh]

Напишите им насчёт этих снипов. Я сам заказывал себе снипы, которых в прайсе не было.

[VladimirSV]

О www.yseq.net родили наконец то !!!

"... Z193 is not in a recommended region for testing ...

We have just made Z56 available in the YSEQ shop.
16515046(A/G) = A517
21387964(C/T)  = A274
Those SNPs have been available already.
For 7672136(C/T) we have assigned a new name (A1773) and we'll order primers from our supplier..."

Всё по 35$.