АвторТема: RJGG Vol 6, No 2 2014/Vol 7, No 1 2015  (Прочитано 11528 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн Centurion

  • 100% Earth (Solar System) genofond
  • Администратор
  • *****
  • Сообщений: 10121
  • Страна: ru
  • Рейтинг +565/-2
Re: RJGG Vol 6, No 2 2014/Vol 7, No 1 2015
« Ответ #30 : 25 Февраль 2015, 17:28:47 »
Цитировать
Накопление данных тестирования Big Y, FGC, с одной стороны, публикация сиквенсов Y-хромосомы древних образцов Anzick-1, Ust-Ishim, K14, с другой, дает возможность оценить среднюю скорость однонуклеотидных (SNP) мутаций.
Авторы разработали собственный метод отбора истинных мутаций в современных и древних образцах и несколькими способами определили с высокой точностью константу скорости SNP мутаций - 0.82∙〖10〗^(-9) в год на п.н.о. (95 % CI: (0.70-0.94)∙〖10〗^(-9)).
(формулы некорректно отобразились)
...а в пересчете на одну мутацию в Y-хромосоме в сколько лет это будет?
в статье прочитаете ;)

Оффлайн митохондрия

  • Сообщений: 864
  • Страна: 00
  • Рейтинг +95/-1
  • Y-ДНК: супруг:J1, отец: I2a2 'Dinaric-N' (I-CTS10228)
  • мтДНК: H8c- (T152C!) G13711A
Re: RJGG Vol 6, No 2 2014/Vol 7, No 1 2015
« Ответ #31 : 25 Февраль 2015, 17:33:42 »
Скажите, а вредные мутации не изучали в этих сиквенсах?

Сегодня прочитала занятную статью.

Цитировать
.Так, Y-хромосома мужчин, пару которой составляет слишком непохожая на нее Х-хромосома, не может рекомбинировать с Х-хромосомой, из-за чего в Y-хромосомах постоянно копятся мутации, которые уже сделали неработоспособными многие ее гены, и со временем ситуация может стать еще хуже. Для сравнения: в X-хромосоме 1400 генов, а в Y-хромосоме — меньше 100, а ведь эти хромосомы когда-то произошли от одного предшественника. Из-за того что Y-хромосоме некуда сбросить неблагоприятную мутацию, у нее нет возможности «повернуть назад», восстановив предыдущий вариант хромосомы за счет рекомбинации. Если по случайности погибнут особи с «хорошими» Y-хромосомами, «хорошие» хромосомы уже нельзя будет восстановить из фрагментов плохих. Такое необратимое ухудшение генов в отсутствие рекомбинации называется «храповиком Мёллера
http://elementy.ru/news?newsid=432412

Наверное, у разных гаплогрупп различен груз вредных мутации. Интересно, страдает ли от этого распространенность гаплогрупп?

Оффлайн Centurion

  • 100% Earth (Solar System) genofond
  • Администратор
  • *****
  • Сообщений: 10121
  • Страна: ru
  • Рейтинг +565/-2
Re: RJGG Vol 6, No 2 2014/Vol 7, No 1 2015
« Ответ #32 : 25 Февраль 2015, 18:35:48 »
Скажите, а вредные мутации не изучали в этих сиквенсах?
нет  ;D  ;D  ;D

Оффлайн kaa76

  • Сообщений: 664
  • Страна: ru
  • Рейтинг +213/-0
  • Техред RJGG и Молген-Вики
    • RJGG
  • Y-ДНК: R-L1029
  • мтДНК: U5a2a2
Re: RJGG Vol 6, No 2 2014/Vol 7, No 1 2015
« Ответ #33 : 26 Февраль 2015, 22:22:20 »
Константа скорости SNP мутаций Y-хромосомы по данным полного секвенирования

Дмитрий Адамов, Владимир Гурьянов, Сергей Каржавин, Владимир Таганкин, Вадим Урасин

Цитировать
Накопление данных тестирования BigY, FGC, с одной стороны, публикация сиквенсов Y-хромосомы древних образцов Anzick-1, Ust-Ishim, K14, с другой, дает возможность оценить среднюю скорость однонуклеотидных (SNP) мутаций.  Авторы разработали собственный метод отбора истинных мутаций в современных и древних образцах и несколькими способами определили с высокой точностью константу скорости SNP мутаций - 0.82·10-9 в год на п.н.о. (95% CI: (0.70-0.94) ·10-9).

http://rjgg.molgen.org/index.php/RJGGRE/article/view/150

Благодарю всех за отличную работу!

Оффлайн Fire

  • 100% child of stardust
  • Сообщений: 7185
  • Страна: gr
  • Рейтинг +580/-109
  • Y-dna G2a1a1a1a1a1b1 Z7947
Re: RJGG Vol 6, No 2 2014/Vol 7, No 1 2015
« Ответ #34 : 26 Февраль 2015, 23:58:39 »
Константа скорости SNP мутаций Y-хромосомы по данным полного секвенирования

Дмитрий Адамов, Владимир Гурьянов, Сергей Каржавин, Владимир Таганкин, Вадим Урасин

Цитировать
Накопление данных тестирования BigY, FGC, с одной стороны, публикация сиквенсов Y-хромосомы древних образцов Anzick-1, Ust-Ishim, K14, с другой, дает возможность оценить среднюю скорость однонуклеотидных (SNP) мутаций.  Авторы разработали собственный метод отбора истинных мутаций в современных и древних образцах и несколькими способами определили с высокой точностью константу скорости SNP мутаций - 0.82·10-9 в год на п.н.о. (95% CI: (0.70-0.94) ·10-9).

http://rjgg.molgen.org/index.php/RJGGRE/article/view/150

Благодарю всех за отличную работу!
Спасибо!
На Английском есть?

Оффлайн Centurion

  • 100% Earth (Solar System) genofond
  • Администратор
  • *****
  • Сообщений: 10121
  • Страна: ru
  • Рейтинг +565/-2
Re: RJGG Vol 6, No 2 2014/Vol 7, No 1 2015
« Ответ #35 : 27 Февраль 2015, 00:26:52 »
Константа скорости SNP мутаций Y-хромосомы по данным полного секвенирования

Дмитрий Адамов, Владимир Гурьянов, Сергей Каржавин, Владимир Таганкин, Вадим Урасин

Цитировать
Накопление данных тестирования BigY, FGC, с одной стороны, публикация сиквенсов Y-хромосомы древних образцов Anzick-1, Ust-Ishim, K14, с другой, дает возможность оценить среднюю скорость однонуклеотидных (SNP) мутаций.  Авторы разработали собственный метод отбора истинных мутаций в современных и древних образцах и несколькими способами определили с высокой точностью константу скорости SNP мутаций - 0.82·10-9 в год на п.н.о. (95% CI: (0.70-0.94) ·10-9).

http://rjgg.molgen.org/index.php/RJGGRE/article/view/150

Благодарю всех за отличную работу!

картинки формул совсем не читабельны!

Оффлайн VVR

  • ...
  • Сообщений: 2763
  • Страна: ua
  • Рейтинг +614/-0
  • Y-ДНК: o.R1a1a1b1a2a1a1a1e~-YP569,YP1260+;м.R1a1a1b1a1a1a2~-L260,YP1337+
  • мтДНК: K1c1h
Re: RJGG Vol 6, No 2 2014/Vol 7, No 1 2015
« Ответ #36 : 27 Февраль 2015, 03:05:10 »
Спасибо за интереснейшую статью. Жаль, об оценке возраста Y-Адама(и оценками других авторов) не написали. И с некоторыми моментами по среднему возрасту поколения не совсем согласен, хотя это дискуссионный вопрос.

Оффлайн пенелопаАвтор темы

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 5564
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1681/-11
  • мтДНК: H1b
Re: RJGG Vol 6, No 2 2014/Vol 7, No 1 2015
« Ответ #37 : 27 Февраль 2015, 07:11:17 »
картинки формул совсем не читабельны!
Почему-то на этот раз уважаемые авторы сделали формулы в виде нередактируемых картинок, хотя прошлые "математические" статьи писались с помощью соответствующего, "формульного", приложения в Ворде. Почему так - мне неведомо... Формулы не то чтобы уж совсем нечитабельны, очертания букв и цифр все же угадываются :), но хуже качеством, чем основной текст.

Оффлайн пенелопаАвтор темы

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 5564
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1681/-11
  • мтДНК: H1b
Re: RJGG Vol 6, No 2 2014/Vol 7, No 1 2015
« Ответ #38 : 27 Февраль 2015, 07:11:56 »
На Английском есть?
Будет. Чуть позже.

Оффлайн Mich Glitch

  • Genus regis
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 31547
  • Страна: ca
  • Рейтинг +2366/-40
  • Y-ДНК: J2b1
  • мтДНК: H6a1a5
Re: RJGG Vol 6, No 2 2014/Vol 7, No 1 2015
« Ответ #39 : 27 Февраль 2015, 07:35:38 »
картинки формул совсем не читабельны!

Согласен с Романом,

Нельзя ли это дело как-то подрепетировать.     ::)
 
В английскую версию всё равно ведь придётся вставлять формулы в текстовом, а не графическом формате.


*** Ну, а вообще - с почином.     :)

Оффлайн Nimissin

  • Сообщений: 2076
  • Рейтинг +526/-0
  • Y-ДНК: N-M178 L839+ P298+ M2019+ M2118+ M1991+ M1988+
  • мтДНК: C4b4
Re: RJGG Vol 6, No 2 2014/Vol 7, No 1 2015
« Ответ #40 : 27 Февраль 2015, 08:19:33 »
Замечание о формулах принимается. В английском тексте поправим. Если есть возможность, то можно поправить и в русском варианте.

Оффлайн Nimissin

  • Сообщений: 2076
  • Рейтинг +526/-0
  • Y-ДНК: N-M178 L839+ P298+ M2019+ M2118+ M1991+ M1988+
  • мтДНК: C4b4
Re: RJGG Vol 6, No 2 2014/Vol 7, No 1 2015
« Ответ #41 : 27 Февраль 2015, 08:21:46 »
Жаль, об оценке возраста Y-Адама(и оценками других авторов) не написали.
Когда в YFull появятся образцы A00, тогда можно будет и возраст параотца оценить..

Оффлайн пенелопаАвтор темы

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 5564
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1681/-11
  • мтДНК: H1b
Re: RJGG Vol 6, No 2 2014/Vol 7, No 1 2015
« Ответ #42 : 27 Февраль 2015, 08:23:52 »
Замечание о формулах принимается. В английском тексте поправим. Если есть возможность, то можно поправить и в русском варианте.
Да, но они (формулы) должны быть редактируемыми. В таком виде, как сейчас, их не поправишь :(

Оффлайн Nimissin

  • Сообщений: 2076
  • Рейтинг +526/-0
  • Y-ДНК: N-M178 L839+ P298+ M2019+ M2118+ M1991+ M1988+
  • мтДНК: C4b4
Re: RJGG Vol 6, No 2 2014/Vol 7, No 1 2015
« Ответ #43 : 27 Февраль 2015, 12:07:02 »
Замечание о формулах принимается. В английском тексте поправим. Если есть возможность, то можно поправить и в русском варианте.
Да, но они (формулы) должны быть редактируемыми. В таком виде, как сейчас, их не поправишь :(
Верстка сделана в Word 97-2003. В исходном файле формулы редактируемые (Word 2013).

Оффлайн пенелопаАвтор темы

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 5564
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1681/-11
  • мтДНК: H1b
Re: RJGG Vol 6, No 2 2014/Vol 7, No 1 2015
« Ответ #44 : 27 Февраль 2015, 12:25:29 »
Да, но они (формулы) должны быть редактируемыми. В таком виде, как сейчас, их не поправишь :(
Верстка сделана в Word 97-2003. В исходном файле формулы редактируемые (Word 2013).
Верстала в Word 2010. Все должно совпадать, вне зависимости от версии, в крайнем случае - некорректно отображаться какие-нибудь символы. А получились просто картинки, нередактируемые.

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.


Rambler's Top100