АвторТема: Re: Результаты исследований дДНК (обсуждение)  (Прочитано 346900 раз)

0 Пользователей и 2 Гостей просматривают эту тему.

Оффлайн rozenblatt

  • Сообщений: 1368
  • Страна: kg
  • Рейтинг +1701/-0
  • Y-ДНК: C-ZQ31
  • мтДНК: M8a
https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.05.18.101337v1

Kinship, acquired and inherited status, and population structure at the Early Bronze Age Mokrin necropolis in northern Serbia.

Aleksandra Zegarac, Laura Winkelbach, Jens Bloecher, Yoan Diekmann, Marija Kreckovic Gavrilovic, Marko Porcic, Biljana Stojkovic, Lidija Milasinovic, Mona Schreiber, Daniel Wegmann, Krishna R Veeramah, Sofija Stefanovic, Joachim Burger

doi: https://doi.org/10.1101/2020.05.18.101337

Abstract

Twenty-four ancient genomes with an average sequencing coverage of 0.85 were produced from the Mokrin necropolis, an Early Bronze Age (2,100-1,800 BC) Maros culture site in Serbia, to provide unambiguous identification of biological sex, population structure, and genetic kinship between individuals. Of the 24 investigated individuals, 15 were involved in kinship relationships of varying degrees, including 3 parent-offspring relationships. All observed parent-offspring pairs were mother and son. In addition to the absence of biological daughters, we observed a number of young women and girls with no biological relatives in our sample. These observations, together with the high mitochondrial diversity in our sample, are consistent with the practice of female exogamy in the population served by Mokrin. However, moderate-to-high Y-chromosomal diversity suggests a degree of male mobility greater than that expected under strict patrilocality. Individual status differences at Mokrin, as indicated by grave goods, support the inference that females could inherit status, but could not transmit status to all their sons. The case of a son whose grave good richness outstrips that of his biological mother suggests that sons had the possibility to acquire status during their lifetimes. The Mokrin sample resembles a genetically unstructured population, suggesting that the social hierarchies of the community were not accompanied by strict marriage barriers.

Двадцать четыре древних генома со средним покрытием секвенирования 0,85 были получены из некрополя Мокрин, памятника марошской культуры раннего бронзового века (2100–1800 гг. до н.э.) в Сербии, для однозначной идентификации биологического пола, структуры населения и генетического родства между индивидами. Из 24 исследованных особей 15 были вовлечены в родственные отношения различной степени, в том числе 3 пары родитель-ребёнок. Все наблюдаемые пары родитель-отпрыск были матерью и сыном. В дополнение к отсутствию биологических дочерей, мы наблюдали ряд молодых женщин и девушек, у которых в нашей выборке не было биологических родственников. Эти наблюдения, наряду с высоким митохондриальным разнообразием в нашей выборке, согласуются с практикой женской экзогамии в популяции, хоронившей на некрополе Мокрин. Тем не менее, умеренно-высокое разнообразие Y-хромосом свидетельствует о большей степени мужской подвижности, чем ожидалось бы при строгом патрилокальном подходе. Индивидуальные различия в статусе в Мокрине, как видно из погребального инвентаря, подтверждают вывод о том, что женщины могли наследовать статус, но не могли передать его всем своим сыновьям. Случай сына, чье могильное богатство превосходит богатство его биологической матери, позволяет предположить, что сыновья имели возможность получить статус в течение своей жизни. Мокринская выборка напоминает генетически неструктурированную популяцию, что говорит о том, что социальная иерархия общины не сопровождалась жесткими брачными барьерами.

Burial Genetic Sex Age X-fold genomic depth mt haplogr. Y haplogr.
122E XY 6-9 1.09 U5a2b1a I2a1b
122S XX 35-50 0.78 H32 *
161 XX 9-11 1.20 H80 *
163 XY 45-55 1.21 U4a2 J2b
181 XX >18 0.62 U4a2 *
186 XX 8-11 0.33 H1aj *
211 XY 50-55 0.79 U5a2b1a I2a1b
220 XY 15-25 0.64 T2b11 R1b1a2a2c1
223 XX 7-10 0.39 U3a1 *
224 XX 25-40 0.77 T2b *
225 XY 25-35 0.82 J1b1a1 R1b1a2a2c1
228 XX 35-50 0.95 J1c *
237 XX 15-20 0.89 T2b *
243 XY 20-35 1.12 H BT
246 XX 45-50 0.98 H80 *
247 XX 10-12 0.90 H1 *
257 A XX 40-60 0.60 H *
257 B XY inf.I 0.61 K1a4 R1b1a2a2c1a1
260 XY 15-18 0.92 J1c I2a2a1a2a2
282 XY 15-20 1.41 H2b BT
287 XX 20-35 0.81 U5b2a2c *
288 XX 60+ 0.81 HV0e *
295 XY 15-20 0.82 H80 I2a1a
302 XX 20-35 0.89 J1c *

Оффлайн ВадимЗ

  • Сообщений: 284
  • Страна: ru
  • Рейтинг +159/-20
  • Y-ДНК: I-Y4882-A10230-Y152087+
  • мтДНК: H5a2
https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.05.18.101337v1

Kinship, acquired and inherited status, and population structure at the Early Bronze Age Mokrin necropolis in northern Serbia.

Aleksandra Zegarac, Laura Winkelbach, Jens Bloecher, Yoan Diekmann, Marija Kreckovic Gavrilovic, Marko Porcic, Biljana Stojkovic, Lidija Milasinovic, Mona Schreiber, Daniel Wegmann, Krishna R Veeramah, Sofija Stefanovic, Joachim Burger

doi: https://doi.org/10.1101/2020.05.18.101337

Abstract

Twenty-four ancient genomes with an average sequencing coverage of 0.85 were produced from the Mokrin necropolis, an Early Bronze Age (2,100-1,800 BC) Maros culture site in Serbia, to provide unambiguous identification of biological sex, population structure, and genetic kinship between individuals. Of the 24 investigated individuals, 15 were involved in kinship relationships of varying degrees, including 3 parent-offspring relationships. All observed parent-offspring pairs were mother and son. In addition to the absence of biological daughters, we observed a number of young women and girls with no biological relatives in our sample. These observations, together with the high mitochondrial diversity in our sample, are consistent with the practice of female exogamy in the population served by Mokrin. However, moderate-to-high Y-chromosomal diversity suggests a degree of male mobility greater than that expected under strict patrilocality. Individual status differences at Mokrin, as indicated by grave goods, support the inference that females could inherit status, but could not transmit status to all their sons. The case of a son whose grave good richness outstrips that of his biological mother suggests that sons had the possibility to acquire status during their lifetimes. The Mokrin sample resembles a genetically unstructured population, suggesting that the social hierarchies of the community were not accompanied by strict marriage barriers.

Двадцать четыре древних генома со средним покрытием секвенирования 0,85 были получены из некрополя Мокрин, памятника марошской культуры раннего бронзового века (2100–1800 гг. до н.э.) в Сербии, для однозначной идентификации биологического пола, структуры населения и генетического родства между индивидами. Из 24 исследованных особей 15 были вовлечены в родственные отношения различной степени, в том числе 3 пары родитель-ребёнок. Все наблюдаемые пары родитель-отпрыск были матерью и сыном. В дополнение к отсутствию биологических дочерей, мы наблюдали ряд молодых женщин и девушек, у которых в нашей выборке не было биологических родственников. Эти наблюдения, наряду с высоким митохондриальным разнообразием в нашей выборке, согласуются с практикой женской экзогамии в популяции, хоронившей на некрополе Мокрин. Тем не менее, умеренно-высокое разнообразие Y-хромосом свидетельствует о большей степени мужской подвижности, чем ожидалось бы при строгом патрилокальном подходе. Индивидуальные различия в статусе в Мокрине, как видно из погребального инвентаря, подтверждают вывод о том, что женщины могли наследовать статус, но не могли передать его всем своим сыновьям. Случай сына, чье могильное богатство превосходит богатство его биологической матери, позволяет предположить, что сыновья имели возможность получить статус в течение своей жизни. Мокринская выборка напоминает генетически неструктурированную популяцию, что говорит о том, что социальная иерархия общины не сопровождалась жесткими брачными барьерами.

Burial Genetic Sex Age X-fold genomic depth mt haplogr. Y haplogr.
122E XY 6-9 1.09 U5a2b1a I2a1b
122S XX 35-50 0.78 H32 *
161 XX 9-11 1.20 H80 *
163 XY 45-55 1.21 U4a2 J2b
181 XX >18 0.62 U4a2 *
186 XX 8-11 0.33 H1aj *
211 XY 50-55 0.79 U5a2b1a I2a1b
220 XY 15-25 0.64 T2b11 R1b1a2a2c1
223 XX 7-10 0.39 U3a1 *
224 XX 25-40 0.77 T2b *
225 XY 25-35 0.82 J1b1a1 R1b1a2a2c1
228 XX 35-50 0.95 J1c *
237 XX 15-20 0.89 T2b *
243 XY 20-35 1.12 H BT
246 XX 45-50 0.98 H80 *
247 XX 10-12 0.90 H1 *
257 A XX 40-60 0.60 H *
257 B XY inf.I 0.61 K1a4 R1b1a2a2c1a1
260 XY 15-18 0.92 J1c I2a2a1a2a2
282 XY 15-20 1.41 H2b BT
287 XX 20-35 0.81 U5b2a2c *
288 XX 60+ 0.81 HV0e *
295 XY 15-20 0.82 H80 I2a1a
302 XX 20-35 0.89 J1c *
Ещё бы снипы. Чтобы понять, имеет ли хоть какой нибудь из четырёх I2a отношение к динарскому субкладу, вернее как  далеко от него.

Оффлайн скучающий

  • Сообщений: 41
  • Страна: ru
  • Рейтинг +10/-0

Ещё бы снипы. Чтобы понять, имеет ли хоть какой нибудь из четырёх I2a отношение к динарскому субкладу, вернее как  далеко от него.

Если I2a1b это I-M423, то динариками они оказаться могут, нужно проверять нижележащие снипы. Причем у этих двоих (122Е и 211) и Y и мито совпадают, может быть родные братья?
Остальные I2a точно не при делах

Оффлайн Ravnur

  • Сообщений: 545
  • Страна: by
  • Рейтинг +315/-6
  • Y-ДНК: I-Y64438
  • мтДНК: U5b1e1d
Ещё бы снипы. Чтобы понять, имеет ли хоть какой нибудь из четырёх I2a отношение к динарскому субкладу, вернее как  далеко от него.

Ну если они пользовались актуальной номенклатурой ISOGG, то только образец 295 более или менее близок к динарику на уровне P37.2 (TMRCA 18400 согласно YFull) и не помешала бы детализация для понимания насколько он близок в таком широком диапазоне.

С остальными же TRMCA более 20 тыс. лет и в этом контексте они ничем не помогут.

Оффлайн Ravnur

  • Сообщений: 545
  • Страна: by
  • Рейтинг +315/-6
  • Y-ДНК: I-Y64438
  • мтДНК: U5b1e1d
Если I2a1b это I-M423

Такая номенклатура была до начала 2018 года.
Всё возможно, конечно, но всё-таки не думаю, что они, игнорируя актуальную, ей пользовались выпуская статью в середине 2020.

Оффлайн rozenblatt

  • Сообщений: 1368
  • Страна: kg
  • Рейтинг +1701/-0
  • Y-ДНК: C-ZQ31
  • мтДНК: M8a
Если I2a1b это I-M423

Такая номенклатура была до начала 2018 года.
Всё возможно, конечно, но всё-таки не думаю, что они, игнорируя актуальную, ей пользовались выпуская статью в середине 2020.

Э, с научными статьями такое часто случается. Вот недавно вышла статья про палеогенетику Южной Америки(инки и прочее), так там ISOGG от 2016 года используется.

Оффлайн Ravnur

  • Сообщений: 545
  • Страна: by
  • Рейтинг +315/-6
  • Y-ДНК: I-Y64438
  • мтДНК: U5b1e1d
Да, я тоже пару раз такое видел, но согласно моим наблюдениям всё же с большего стараются использовать актуальную, и чем свежее статья, тем более стараются использовать, особенно если нет отсылок к каким-либо старым работам со старой номенклатурой. Попгенетика становится всё динамичнее.
« Последнее редактирование: 20 Май 2020, 15:37:25 от Ravnur »

Оффлайн Arthwr

  • Сообщений: 1184
  • Страна: ua
  • Рейтинг +675/-5
    • r1b-pf7562.blogspot.com
  • Y-ДНК: R1b-PF7563
  • мтДНК: K1c1e
Такая номенклатура была до начала 2018 года.
Всё возможно, конечно, но всё-таки не думаю, что они, игнорируя актуальную, ей пользовались выпуская статью в середине 2020.

Здесь номенклатура 2015 года, ибо R1b1a2a2c1 и R1b1a2a2c1a1 ни до, ни после в ИСОГГ не употреблялось.

В 2015 году это, соответственно, CTS1843/Z2109 и CTS7556.
« Последнее редактирование: 21 Май 2020, 22:02:56 от Arthwr »

Оффлайн Ravnur

  • Сообщений: 545
  • Страна: by
  • Рейтинг +315/-6
  • Y-ДНК: I-Y64438
  • мтДНК: U5b1e1d
Написал им, чтобы не гадать.

Оффлайн Oxon

  • Сообщений: 1317
  • Страна: gb
  • Рейтинг +354/-1
H2b митогруппа.  В Европе в бронзовый век, ого.  Вроде азиатской считается.

Оффлайн albino in the black

  • Сообщений: 859
  • Страна: 00
  • Рейтинг +129/-31
  • Y-ДНК: E-V13
  • мтДНК: H
Из группы Haplogroup I Subclade I2a1 на фейсбуке




 
« Последнее редактирование: 28 Май 2020, 15:33:53 от albino in the black »

Оффлайн Oxon

  • Сообщений: 1317
  • Страна: gb
  • Рейтинг +354/-1
Да это вся мой родня  ;D.  Мой британский муж и материнский дед оба CTS7556, отец I2a1b, а я H2b. 

Оффлайн rozenblatt

  • Сообщений: 1368
  • Страна: kg
  • Рейтинг +1701/-0
  • Y-ДНК: C-ZQ31
  • мтДНК: M8a
https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.05.20.106971v1

A systematic investigation of human DNA preservation in medieval skeletons

Cody Edward Parker, Adam Ben Rohrlach, Susanne Friederich, Sarah Nagel, Matthias Meyer, Johannes Krause, Kirsten I Bos, Wolfgang Haak

doi: https://doi.org/10.1101/2020.05.20.106971

Abstract

Ancient DNA (aDNA) analyses necessitate the destructive sampling of archaeological material. Currently the dense inner portion of the petrous pyramid, the location of the skull that houses the inner ear, is the most sought after skeletal element for molecular analyses of ancient humans as it has been shown to yield high amounts of endogenous DNA. Destructive sampling of the petrous pyramid, assuming its recovery, is often not recommended for highly valued specimens. To investigate alternatives, we present a survey of human aDNA preservation for each of ten skeletal elements in a skeletal collection from Medieval Germany. Through comparison of human DNA content and quality we confirm best performance of the petrous pyramid and identify seven additional sampling locations across four skeletal elements that yield adequate aDNA for most applications in human palaeogenetics. Our study provides a better perspective on DNA preservation across the human skeleton and takes a further step toward the more responsible use of ancient materials in human aDNA studies.

Основной целью препринта является выяснение в каких частях скелета лучше всего сохраняется ДНК. Как и ранее, лучше всего оказалась каменистая часть височной кости, но авторы нашли ещё 4 места где ДНК сохраняется не сильно хуже. Исследовались образцы из Саксонии-Ангальт в Германии, датирующиеся 1050-1402 годами н.э. Митохондриальные ДНК не приведены, а Y-ДНК приведена по версии ISOGG от 26 ноября 2019:

KRA001 R1a1a1b1a1a1c
KRA003 R1a1a1b1a1a1c1
KRA004 I1a2a1a1d
KRA005 E1b1b1a1b1a
KRA008 I2a1a2b1a1a
KRA009 R1a1a1b1a1a1c1
KRA010 J2b2a1a1a1a1a1a

Оффлайн falcon16

  • Сообщений: 244
  • Рейтинг +694/-5
The Neolithic Pitted Ware culture foragers were culturally but not genetically influenced by the Battle Axe culture herders (2020)
 - https://onlinelibrary.wiley.com/doi/full/10.1002/ajpa.24079
Собиратели культуры ямочной керамики находились под культурным, но не генетическим влиянием шнуровиков.
I2a1a1-CTS595   I2a-L460   I2-M438
Аутососмы - https://onlinelibrary.wiley.com/cms/asset/1a504979-ecdd-4c1f-8c73-0c0fc3173e48/ajpa24079-fig-0005-m.jpg



Оффлайн Oxon

  • Сообщений: 1317
  • Страна: gb
  • Рейтинг +354/-1
По Карибам работа.  https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.06.01.126730v1.supplementary-material

Чета они все там одинаковые Q1b1a1a1
 И ABCD по мито.

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.


Rambler's Top100