АвторТема: Re: Результаты исследований дДНК (обсуждение)  (Прочитано 312400 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн mikhail a.

  • Сообщений: 1340
  • Страна: ru
  • Рейтинг +372/-0
  • Y-ДНК: J2a-PF5252
  • мтДНК: T2b
Re: Re: Результаты исследований дДНК (обсуждение)
« Ответ #2100 : 25 Февраль 2020, 16:21:57 »
Это работа Фернандеса интересна тем что в Сицилии в бронзовом веке появляется J2 из Греции по аутосомам минойцы.

Было бы интересно узнать более детально про эти J2.

https://www.nature.com/articles/s41559-020-1102-0

Article
Published: 24 February 2020
The spread of steppe and Iranian-related ancestry in the islands of the western Mediterranean
Ссылка на сырые данные в статье имеется, так что вскоре узнаем.

Оффлайн mikhail a.

  • Сообщений: 1340
  • Страна: ru
  • Рейтинг +372/-0
  • Y-ДНК: J2a-PF5252
  • мтДНК: T2b
Re: Re: Результаты исследований дДНК (обсуждение)
« Ответ #2101 : 25 Февраль 2020, 17:19:03 »
Можно где-нибудь увидеть статью в открытом доступе?

Оффлайн Andvari

  • Сообщений: 219
  • Страна: ru
  • Рейтинг +81/-0
  • Y-ДНК: R1a - Y10802 (predicted)

Оффлайн mikhail a.

  • Сообщений: 1340
  • Страна: ru
  • Рейтинг +372/-0
  • Y-ДНК: J2a-PF5252
  • мтДНК: T2b

Оффлайн rozenblatt

  • Сообщений: 1287
  • Страна: kg
  • Рейтинг +1569/-0
  • Y-ДНК: C-ZQ31
  • мтДНК: M8a
Re: Re: Результаты исследований дДНК (обсуждение)
« Ответ #2104 : 26 Февраль 2020, 09:29:56 »
Это работа Фернандеса интересна тем что в Сицилии в бронзовом веке появляется J2 из Греции по аутосомам минойцы.

Было бы интересно узнать более детально про эти J2.

https://www.nature.com/articles/s41559-020-1102-0

Article
Published: 24 February 2020
The spread of steppe and Iranian-related ancestry in the islands of the western Mediterranean

Генетический компонент, связанный со степными скотоводами, достиг Центральной Европы не позже чем в 2500 г. до н.э., в то время как компонент, связанный с иранскими земледельцами, присутствовал в Эгейской Европе, по меньшей мере, в 1900 г. до н.э. Однако распространение этих компонентов в западном Средиземноморье, где они внесли свой вклад во многие современные популяции, остается плохо изученным. Здесь мы сгенерировали геномные данные о древней ДНК с Балеарских островов, Сицилии и Сардинии, увеличив число особей, по которым имеются данные, с 5 до 66. Древнейший индивидуум с Балеарских островов (~2400 г. до н. э.) имел генетический компонент степных скотоводов, который, вероятно, произошел от миграции с запада на восток из Иберии, хотя два более поздних балеарских индивидуумов имели меньший компонент степных скотоводов. На Сицилию генетический компонент степных скотоводов прибыл к 2200 г. до н.э., частично из Иберии; генетический компонент, связанный с Ираном, появился в середине второго тысячелетия до н.э., одновременно с его ранее задокументированным распространением в Эгейском регионе; а после бронзового века произошло крупномасштабное замещение населения. На Сардинии вплоть до первого тысячелетия до нашей эры почти всё население происходило напрямую от ранних земледельцев острова, за исключением отличающегося индивидуума из третьего тысячелетия до н.э., который имел преимущественно североафриканское происхождение и который - наряду с приблизительно современным ему иберийцем - документирует обширный поток генов из Африки в Европу в эпоху халколита. Массивная иммиграция в Сардинию началась в первом тысячелетии до нашей эры, и в настоящее время сардинцы происходит от первых земледельцев острова не более чем на 56–62%. Это значение ниже, чем предыдущие оценки, что указывает на то, что Сардиния, как и все другие регионы Европы, была сценой для крупных перемещений и смешивания людей.

Оффлайн Andvari

  • Сообщений: 219
  • Страна: ru
  • Рейтинг +81/-0
  • Y-ДНК: R1a - Y10802 (predicted)
Re: Re: Результаты исследований дДНК (обсуждение)
« Ответ #2105 : 26 Февраль 2020, 11:36:44 »
https://www.nature.c...1559-020-1106-9

Автоперевод
Высказано предположение, что переход неолита к сельскохозяйственной и скотоводческой экономике способствовал появлению адаптированных к человеку патогенов. Здесь мы обнаружили восемь Salmonella enterica subsp. геномы кишечника из скелетов человека переходных фуражиров, скотоводов и агропасторалистов в Западной Евразии, которым было до 6500 лет. Несмотря на высокое генетическое разнообразие S. enterica, все древние бактериальные геномы сгруппированы в одну ранее нехарактерную ветвь, которая содержит S. enterica, адаптированную к множеству видов млекопитающих. Все древние бактериальные геномы от доисторических (агро) скотоводов попадают в часть этой ветви, которая также включает специфичный для человека S. enterica Paratyphi C, иллюстрирующий эволюцию человеческого патогена за период в 5000 лет. Сравнение геномов бактерий позволяет предположить, что ранние древние штаммы не были специфичными для хозяина, различались по патогенному потенциалу и испытывали конвергентную псевдогенизацию, которая сопровождала их последующую адаптацию к хозяину. Эти наблюдения подтверждают концепцию, что появление адаптированного к человеку S. enterica связано с культурными трансформациями человека.

И кое-что по сэмплам
MUR009 Murzikhinsky II Russia 6,500–6,350 783,054 2.8 8.8 88.9
MUR019 Murzikhinsky II Russia 6,490–6,320 1,405,983 7.8 16.5 90.1
IV3002 Ipatovo 3 Russia 5,580–5,080 761,643 8.9 7.0 88.9
OBP001 Oberbipp Switzerland 5,320–5,070 138,083 0.5 1.2 59.3
IKI003 Ikiztepe Turkey 5,290–5,050 840,560 2.7 8.3 90.0
SUA004 Su Asedazzu Italy 4,300–4,010 2,517,870 11.5 24.0 93.2
MK3001 Marinskaja 3 Russia 2,990–2,870 79,534 0.8 0.7 37.8
ETR001 Chiusi Italy 1,810–1,620 1,977,148 24.5 17.8 93.7
 

We were
able to generate human nuclear and/or mitochondrial DNA data for all S. enterica-positive
individuals except OBP001 (Supplementary Table 1). Their genetic profiles were then compared
against a set of available ancient and modern human genomes. Principal component (PCA;
Extended Data Fig. 1A) and admixture (Extended Data Fig. 1B) analyses showed MUR009 is most
closely represented by Eastern hunter-gatherer (EHG) and lacks any Anatolian farmer genetic
ancestry. While MUR019, from the same Eneolithic archaeological site, did not yield sufficient
nuclear DNA for analysis, its mitochondrial haplogroup U5a1d2, a common EHG haplogroup18, is
8
shared with MUR009 and suggests a (maternal) relationship. Both Bronze Age samples IV3002 and
IKI003 are closely positioned in the PCA and both harbour Iranian and Anatolian farmer ancestry
commonly associated with domesticated animals (pastoralism). The Sardinian Early Bronze Age
individual SUA004 exhibits a similar genetic profile to other European Neolithic farmers. The
remaining samples, MK3001 and ETR001, are younger and represent European genetic ancestry
established after major prehistoric migrations, with MK3001 falling isolated in the PCA due to an
unaccounted East Asian component (Extended Data Fig. 2).
Notably, some individuals that provided high coverage S. enterica genomes poorly performed in
human nuclear DNA recovery while still providing enough mitochondrial DNA fragments. We
hypothesise that this observation is based on the higher copy number of bacterial genomes (when
pathogen load is high) and mitochondrial genomes compared to nuclear human genomes.

Онлайн kardes

  • Сообщений: 608
  • Страна: ru
  • Рейтинг +708/-7
  • Y-ДНК: G2a1
Re: Re: Результаты исследований дДНК (обсуждение)
« Ответ #2106 : 27 Февраль 2020, 03:01:10 »
MUR009; 4550-4404 BC; Murzikhinsky II, Tatarstan, Russia; Eneolithic (Ust-Kama type); Q-L472>F1096>F746*
MK3001; 1044-923 BC; Marinskaya 3, Russia; Iron Age; Q-L56>L53>L54>L330
https://anthrogenica.com/showthread.php?8066-Genetic-Genealogy-amp-Ancient-DNA-in-the-News-(DISCUSSION-ONLY)&p=649184&viewfull=1#post649184
наверно про это ?
http://forum.molgen.org/index.php/topic,70.msg474532.html#msg474532
http://old.kpfu.ru/amku/eneol.htm
валерьянку закупать? :)
в этом деле, значение валерьянки сложно переоценить))
Ну.... давайте же инсайды :)
Davidski уже написал
Цитировать
Davidski said...
@Arza  I don't have all the details, but, as far as I know, the Y-haplogroups will include R1b, R1a, I2, and Q1a, more or less in that order.
Apparently, some of the foragers from Sakhtysh belong to R1b-M269.
December 12, 2019 at 10:35 PM
однако, насколько мне известно, субклады этих гаплогрупп были определены несколько точнее ;)

Оффлайн G-Man

  • Сообщений: 369
  • Страна: ru
  • Рейтинг +206/-1
  • Y-ДНК: G-Z6653
Re: Re: Результаты исследований дДНК (обсуждение)
« Ответ #2107 : 29 Февраль 2020, 10:22:01 »
MK3001 был похоронен в кургане рядом со станицей Марьинской (Ставропольский край).

Цитировать
MK3001, Marinskaya 3, Russia
Dating: 2994 – 2873 calBP (2831±20BP, MAMS29808)
N 43.905354°, E 43.521883°


The excavated mound 1, near the village of Marinskaya, was part of a cemetery of then three visible and several ploughed-over burial mounds on the high terrace of the river Kura. The site is situated in an herb-grass steppe environment, which was formerly intersected by forests. The barrow was more than 4 m high and about 40 m in diameter and surrounded by a circular ditch about 2.5 m deep, which was visible on aerial and satellite images and later partly excavated. The excavation of the mound revealed several phases of construction going back until the Maykop culture. MK3001, sampled from a molar, belongs to the Iron Age and the grave was without any inventory and severely damaged by later intrusion. While absent from the archaeological record, the economic system at that time comprised of intensive farming and a combined mountain agricultural system including animal husbandry and transhumance.

Цитировать
MK3001 falling isolated in the PCA due to an unaccounted East Asian component

Цитировать
MK3001 shows Asian genetic ancestry components represented by Nganasan, Kankanaey, Atayal, and Ami

Как видно, не только Y-DNA указывает на восточные корни.

Оффлайн Andvari

  • Сообщений: 219
  • Страна: ru
  • Рейтинг +81/-0
  • Y-ДНК: R1a - Y10802 (predicted)
Re: Re: Результаты исследований дДНК (обсуждение)
« Ответ #2108 : 29 Февраль 2020, 19:23:54 »
Нашел вот такой инсайд.
Исследованы образцы из погребений КШК и культуры ямочной керамики (охотники Скандинавии) на Готланде - 25 штук. При этом все сэмплы относятся к популяции, связанной с КЯК, но не КШК. В этом случае конкретном случае на Готланде  имеем дело с культурной диффузией.
Интересно, какой там набор гаплогрупп у КЯК? Судя по датам, защита уже состоялась, но текста так и не нашел.
http://uu.diva-portal.org/smash/record.jsf?pid=diva2%3A1370702&dswid=-9990


ЗЫ/ Хотя вот что-то нарыл
https://pdfs.semanticscholar.org/aa13/f8e011cdf946e262e5bbe8e60e7229d84fd0.pdf

Оффлайн Andvari

  • Сообщений: 219
  • Страна: ru
  • Рейтинг +81/-0
  • Y-ДНК: R1a - Y10802 (predicted)
Re: Re: Результаты исследований дДНК (обсуждение)
« Ответ #2109 : 29 Февраль 2020, 19:32:38 »
Аутосомы там есть. Все исследованные по большей части WHG. А вот гаплогрупп не увидел при беглом просмотре.

Оффлайн rozenblatt

  • Сообщений: 1287
  • Страна: kg
  • Рейтинг +1569/-0
  • Y-ДНК: C-ZQ31
  • мтДНК: M8a
https://www.youtube.com/watch?v=HOOVE32-nXI

Руководитель лаборатории естественно-научных методов в гуманитарных науках Екатерина Яцишина об исследованиях древних мумий 20200303

Учёные из Курчатовского института исследовали египетские мумии. Начинаю с 22:03 она говорит про генетический анализ, на 22:49 показаны результаты.

Онлайн kardes

  • Сообщений: 608
  • Страна: ru
  • Рейтинг +708/-7
  • Y-ДНК: G2a1
Всего в наличии 10 целых мумий и 40 фрагментов. Из 10 рарешили взять образцы у пяти, из них получили днк у трёх, и у них выявили 3 мито-линии и 2 игрек-линии.
У курчатовцев это первые дднк игреки? Поздравляю

Оффлайн Farroukh

  • Maternal Y-DNA: R1b-L584
  • ...
  • Сообщений: 12330
  • Страна: az
  • Рейтинг +2570/-15
  • Paternal Mt-DNA: M9a1b1
    • Azerbaijan DNA Project
  • Y-ДНК: E-Y37518
  • мтДНК: F2f
Про нашего парня отписал здесь.
Про второго (R1b-M269) можно строить догадки вплоть до второго пришествия

Онлайн kardes

  • Сообщений: 608
  • Страна: ru
  • Рейтинг +708/-7
  • Y-ДНК: G2a1
https://www.nature.c...1559-020-1106-9


И кое-что по сэмплам
MUR009 Murzikhinsky II Russia 6,500–6,350 783,054 2.8 8.8 88.9
MUR019 Murzikhinsky II Russia 6,490–6,320 1,405,983 7.8 16.5 90.1
IV3002 Ipatovo 3 Russia 5,580–5,080 761,643 8.9 7.0 88.9
OBP001 Oberbipp Switzerland 5,320–5,070 138,083 0.5 1.2 59.3
IKI003 Ikiztepe Turkey 5,290–5,050 840,560 2.7 8.3 90.0
SUA004 Su Asedazzu Italy 4,300–4,010 2,517,870 11.5 24.0 93.2
MK3001 Marinskaja 3 Russia 2,990–2,870 79,534 0.8 0.7 37.8
ETR001 Chiusi Italy 1,810–1,620 1,977,148 24.5 17.8 93.7
 
Ипатовский майкопец на РСА вместе с анатолийцем икизтепе (мито-J1c16)
"The study is now published. Unfortunately IKI003 has low coverage (0.025) but an mtDNA is available (J1c16). "Both Bronze Age samples IV3002 [Russian steppe] and IKI003 are closely positioned in the PCA and both harbour Iranian and Anatolian farmer ancestry commonly associated with domesticated animals (pastoralism)". https://www.nature.com/articles/s41559-020-1106-9

Оффлайн rozenblatt

  • Сообщений: 1287
  • Страна: kg
  • Рейтинг +1569/-0
  • Y-ДНК: C-ZQ31
  • мтДНК: M8a
https://www.biorxiv.org/content/10.1101/849422v1

Gene-flow from steppe individuals into Cucuteni-Trypillia associated populations indicates long-standing contacts and gradual admixture

Alexander Immel, Stanislav Terna, Angela Simalcsik, Julian Susat, Oleg Sarov, Ghenadie Sirbu, Robert Hofmann, Johannes Mueller, Almut Nebel, Ben Krause-Kyora
doi: https://doi.org/10.1101/849422

Abstract

The Cucuteni-Trypillia complex (CTC) flourished in eastern Europe for over two millennia (5100-2800 BCE) from the end of the Neolithic to the Early Bronze Age. Its vast distribution area encompassed modern-day eastern Romania, Moldova and western/central Ukraine. Due to a lack of existing burials throughout most of this time, only little is known about of the people associated with this complex and their genetic composition. Here, we present genome-wide data generated from the skeletal remains of four females that were excavated from two Late CTC sites in Moldova (3500-3100 BCE). All individuals carried a large Neolithicderived ancestry component and were genetically more closely related to Linear Pottery than to Anatolian farmers. Three of the specimens also showed considerable amounts of stepperelated ancestry, suggesting influx into the CTC gene-pool from people affiliated with, for instance, the Ukraine Mesolithic. The latter scenario is supported by archaeological evidence. Taken together, our results confirm that the steppe component had arrived in eastern Europe farming communities maybe as early as 3500 BCE. In addition, they are in agreement with the hypothesis of ongoing contacts and gradual admixture between incoming steppe and local western populations.

Кукутень-Трипольский комплекс (КТК) процветал в Восточной Европе более двух тысяч лет (5100-2800 гг. до н.э.) от конца неолита до раннего бронзового века. Его обширная территория распространения охватывала современную восточную Румынию, Молдову и западную/центральную Украину. В связи с отсутствием захоронений в течение большей части этого времени, о людях, связанных с этим комплексом, и их генетическом составе известно лишь немногое. Здесь мы представляем данные по всему геному, полученные из скелетных останков четырех женщин, которые были раскопаны на двух участках позднего КТК в Молдове (3500–3100 до н.э.). Все индивиды являются носителями крупного неолитического генетического компонента и генетически более тесно связаны с представителями культур линейной керамики, чем с анатолийскими земледельцами. Три образца также показали значительное количество степного компонента, что указывает на приток в генофонд КТК людей, связанных, например, с Украинским мезолитом. Последний сценарий подтверждается археологическими данными. Вместе взятые, наши результаты подтверждают, что степной компонент появился в земледельческих сообществах Восточной Европы, возможно, еще в 3500 году до нашей эры. Кроме того, они согласуются с гипотезой о продолжающихся контактах и постепенной примеси между входящим степным населением и местным западным населением.

4 женщинц, мтДНК - U4,  K1,  T1  и  T2.

Статья официально опубликована: https://www.nature.com/articles/s41598-020-61190-0

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.


Rambler's Top100